Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R2
|
870 |
341.9 |
11209456 |
97.2% |
10895591 |
138.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,161,210 |
A→G |
*270* (TAA→TAG) |
pabC → |
aminodeoxychorismate lyase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,161,210 | 0 | A | G | 100.0%
| 980.8
/ NA
| 292 | *270* (TAA→TAG) | pabC | aminodeoxychorismate lyase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (151/141); total (151/141) |
Only 100 of 292 total aligned reads displayed.
GTCGTTGCAGGCAGATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAATCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATATTTACCCTG > NZ_CP025268/1161075‑1161344
|
gTCGTTGCAGGCAGATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCAt > 1:1758584/1‑140 (MQ=255)
gTCGTTGCAGGCAGATGAGATGGCTAGTTGAAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGAGGTCTCCTTTTCGTCAGCTACGTTAAATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCAt > 1:3358966/1‑140 (MQ=255)
tCGTTGCAGGCAGATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATg > 1:1067146/1‑140 (MQ=255)
tCGTTGCAGGCAGATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATg > 1:3386186/1‑140 (MQ=255)
tCGTTGCAGGCAGATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATg > 2:262380/1‑140 (MQ=255)
gTTGCAGGCAGATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGaa > 2:2665306/1‑140 (MQ=255)
caggcagATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGaaaaaa < 1:3704700/140‑1 (MQ=255)
caggcagATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGaaaaaa < 1:4866483/140‑1 (MQ=255)
caggcagATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGaaaaaa < 1:4831223/140‑1 (MQ=255)
ggcagATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAAGTAGCCATGAAAAAAgg > 1:2560813/1‑139 (MQ=255)
cagATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAgtgt < 1:5203608/140‑1 (MQ=255)
agatgagatgGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGtt < 2:840923/140‑1 (MQ=255)
atgagatgGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTAt > 1:3915717/1‑140 (MQ=255)
tgagatgGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTGTGTGAGCGCCCGAATTAGTGATGAAAAAAGTGTTAtt > 2:4659479/1‑140 (MQ=255)
agatgGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGa < 1:4040415/140‑1 (MQ=255)
tgGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATaa > 1:3614138/1‑140 (MQ=255)
tgGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATaa > 1:4776244/1‑140 (MQ=255)
ttATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCt > 1:1598146/1‑140 (MQ=255)
aTTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTg < 1:3195726/140‑1 (MQ=255)
tGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTa < 1:2252939/140‑1 (MQ=255)
tAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTAtt < 2:5585949/140‑1 (MQ=255)
tAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTAtt < 2:898912/140‑1 (MQ=255)
aTGCGTTAATGCCAGTTATGTCCGTTTGTGCCTGTGTCGATGTCTCCTTTTCGTCAGAAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGTTCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGc < 2:1202449/140‑1 (MQ=255)
aTGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGc > 1:506529/1‑140 (MQ=255)
aTGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGc < 1:365105/140‑1 (MQ=255)
aTGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGc > 1:763674/1‑140 (MQ=255)
aTGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGc > 1:3268862/1‑140 (MQ=255)
tGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTGTGTGCCTGTGGCGATGTCTATTTTTCGTCAGCAACGTTATATGTATATTTAGGTCCACGTTGTGAGCGCCCGAATTAGTGATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCt > 2:1663182/1‑140 (MQ=255)
cGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATTTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCtgg < 1:5349855/140‑1 (MQ=255)
cGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCtgg < 1:2979339/140‑1 (MQ=255)
cGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCtgg < 1:1201086/140‑1 (MQ=255)
cGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCtgg < 1:1131571/140‑1 (MQ=255)
cGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGACCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCtgg < 1:1644999/140‑1 (MQ=255)
ttAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCtggtg < 2:1849694/140‑1 (MQ=255)
ttAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCtggtg > 2:823728/1‑140 (MQ=255)
tGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAACAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTAc < 2:5477716/140‑1 (MQ=255)
aGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTggg > 1:4590583/1‑140 (MQ=255)
aGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTggg > 2:4519189/1‑140 (MQ=255)
gTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGt < 1:5534001/140‑1 (MQ=255)
tGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTa > 1:2090072/1‑140 (MQ=255)
gATGCCTCTATGTCCCTGTGGCGATGTCCCCTCTTCGTCAGCAACGTAATATGAATCTTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGACTTAGTCATGAACAAAGTGTTCTTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACCGGGTAt < 2:721138/140‑1 (MQ=255)
gATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTAt < 1:5283167/140‑1 (MQ=255)
gATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTAt < 2:4994389/140‑1 (MQ=255)
caTGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGACCCACTTTGTGAGCGCCAGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTAt < 1:4937539/139‑1 (MQ=255)
gCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATcgc > 1:1029027/1‑140 (MQ=255)
gCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATcgc > 1:4962662/1‑140 (MQ=255)
cccGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATcgcc > 1:88580/1‑140 (MQ=255)
cccGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATcgcc > 1:3426458/1‑140 (MQ=255)
cccGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGGGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATcgcc > 2:511704/1‑140 (MQ=255)
ccGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCATTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATcgccg < 2:270639/140‑1 (MQ=255)
cGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATcgccgc < 1:629055/140‑1 (MQ=255)
tgCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCtgg > 2:4113883/1‑115 (MQ=255)
tgCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCtgg < 1:4113883/115‑1 (MQ=255)
tgCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGgtgt < 2:5532001/140‑1 (MQ=255)
ccTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTgg > 1:2951255/1‑140 (MQ=255)
ccTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGACAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTGGTTATTTCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTgg > 2:3955252/1‑140 (MQ=255)
cTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTggg < 1:3004025/140‑1 (MQ=255)
tgtgGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACGTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCGGCTGGTGTGGGc > 1:2904455/1‑140 (MQ=255)
tgtgGCGATGTATCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGTGc > 2:3946638/1‑140 (MQ=255)
tgGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGCATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATACTCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGt > 2:1068166/1‑140 (MQ=255)
tgGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGt > 2:4922937/1‑140 (MQ=255)
tgGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGt > 1:1273488/1‑140 (MQ=255)
tgGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGt > 2:1591861/1‑140 (MQ=255)
tgGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGt > 1:2721771/1‑140 (MQ=255)
tgGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAAGGTTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCgg > 2:2159856/1‑139 (MQ=255)
ggCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTc > 2:2053455/1‑140 (MQ=255)
aTGTCTCCTTTTCGTGAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAGGTGTTATTGATCATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGa < 2:3997256/140‑1 (MQ=255)
tGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGaa > 1:3132091/1‑140 (MQ=255)
tctcCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAgg > 1:2442571/1‑140 (MQ=255)
tttCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGcc < 2:4778543/140‑1 (MQ=255)
gCAGCGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTATTGAAAAAAGTGTTATTGATAATCGTGTTATTGCTGGTAGTGCTGGGTATGGGTGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGGCATCTTGcc > 2:3170739/1‑140 (MQ=255)
gCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGcc > 2:1012109/1‑140 (MQ=255)
cGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACa > 2:1705384/1‑140 (MQ=255)
tatGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCaaa < 2:2815650/140‑1 (MQ=255)
tatGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCaaa < 2:1334995/140‑1 (MQ=255)
gAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTg < 1:1404258/140‑1 (MQ=255)
atatTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCt > 2:5391468/1‑140 (MQ=255)
atTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTa > 2:622256/1‑140 (MQ=255)
atTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTa > 2:2910272/1‑140 (MQ=255)
tttAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTAt > 1:4701732/1‑140 (MQ=255)
aGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCaa > 2:2556457/1‑140 (MQ=255)
ccccACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAaag > 2:3483035/1‑140 (MQ=255)
cccACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAaaga < 2:4302284/140‑1 (MQ=255)
cACTTTGTGAGCGCCCGCATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATGATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAaagaag > 2:5047060/1‑140 (MQ=255)
cTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAagag > 1:1811100/1‑140 (MQ=255)
tttGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAgaga < 1:545210/140‑1 (MQ=255)
ttGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTCTTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGAc < 1:4418997/140‑1 (MQ=255)
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ttGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGAc < 1:980821/140‑1 (MQ=255)
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CGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAACGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGT < SRR14920167.3378539/151‑1 (MQ=60)
GTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTA > SRR14920167.2987334/1‑151 (MQ=60)
GTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTA > SRR14920167.2094458/1‑151 (MQ=60)
AATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCG > SRR14920167.90131/1‑151 (MQ=60)
ATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGC < SRR14920167.5317951/151‑1 (MQ=60)
ATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGC < SRR14920167.2133700/151‑1 (MQ=60)
ATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGC > SRR14920167.4974085/1‑151 (MQ=60)
ATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGC > SRR14920167.1031146/1‑151 (MQ=60)
ATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCAGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGC < SRR14920167.1473344/151‑1 (MQ=60)
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TGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCC > SRR14920167.5353069/1‑151 (MQ=60)
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TGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCC > SRR14920167.3434038/1‑151 (MQ=60)
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AATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCAGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTG < SRR14920167.4949637/151‑1 (MQ=60)
GCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGG > SRR14920167.3638251/1‑151 (MQ=60)
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GTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGG > SRR14920167.27557/1‑151 (MQ=60)
TGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGA > SRR14920167.5268805/1‑151 (MQ=60)
GCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAA < SRR14920167.781446/151‑1 (MQ=60)
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CCTGTGGCGATGGCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAG < SRR14920167.1190883/151‑1 (MQ=60)
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ATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCAT < SRR14920167.2641442/151‑1 (MQ=60)
GTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCT > SRR14920167.641082/1‑151 (MQ=60)
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CACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATATTT > SRR14920167.1994994/1‑151 (MQ=60)
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CTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATATTTAC > SRR14920167.3313148/1‑151 (MQ=60)
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TTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATATTTACCC < SRR14920167.2211584/151‑1 (MQ=60)
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TTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATATTTACCC < SRR14920167.2514452/151‑1 (MQ=60)
TTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATATTTACCC < SRR14920167.2518401/151‑1 (MQ=60)
TTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATATTTACCC < SRR14920167.982873/151‑1 (MQ=60)
TTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATATTTACCC < SRR14920167.982915/151‑1 (MQ=60)
TTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATATTTACCC < SRR14920167.2867506/151‑1 (MQ=60)
GCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATATTTACCCTGAAGC < SRR14920167.2172038/151‑1 (MQ=60)
AATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATATTTACCCTGAAGCCAGGGAC > SRR14920167.373109/1‑151 (MQ=60)
AATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATATTTACCCTGAAGCCAGGGAC > SRR14920167.4189001/1‑151 (MQ=60)
AATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATATTTACCCTGAAGCCAGGGAC < SRR14920167.2982628/151‑1 (MQ=60)
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CCTCTCTGGAAGAGTCGTTGCAGGCAGATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAATCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATATTTACCCTGAAGCCAGGGAC > NZ_CP025268/1161062‑1161355
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |