Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R3
|
778 |
586.6 |
19747158 |
98.0% |
19352214 |
137.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,161,210 |
A→G |
*270* (TAA→TAG) |
pabC → |
aminodeoxychorismate lyase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,161,210 | 0 | A | G | 99.8%
| 1691.3
/ NA
| 489 | *270* (TAA→TAG) | pabC | aminodeoxychorismate lyase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (288/199); minor base T (1/0); total (289/200) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
Only 100 of 489 total aligned reads displayed.
GAGTCGTTGCAGGCAGATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAATCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATATTTACCCTG > NZ_CP025268/1161073‑1161344
|
gagTCGTTGCAGGCAGTTGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCCGCAACGTTATATGAATATTTATCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTc > 1:1703478/1‑140 (MQ=255)
gTCGTTGCAGGCAGATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGGATGTTCCTGTGGCGATGTCTCCGTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTATCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAAATAGTCAt > 1:5043461/1‑140 (MQ=255)
tCGTTGCAGGCAGATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCAtt > 1:2860381/1‑139 (MQ=255)
gTTGCAGGCAGATGAGATTGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTAAGTGCCTGTGGCGTTTTCTCCTTTTAGTCATCAACGTTATATGTATATTTAGCCCCACATTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATTaa > 2:3919807/1‑140 (MQ=255)
caggcagATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGaaaaaa < 1:6730749/140‑1 (MQ=255)
aggcagATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAg < 1:8948530/140‑1 (MQ=255)
cagATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGTTGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAgtgt > 2:895067/1‑140 (MQ=255)
cagATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAgtgt > 1:2036064/1‑140 (MQ=255)
atgagatgGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTAt > 2:5635921/1‑140 (MQ=255)
atgGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATa > 1:351989/1‑140 (MQ=255)
tgGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATaa > 1:8758441/1‑140 (MQ=255)
ggTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCTTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAAt < 2:7411383/140‑1 (MQ=255)
ggTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAAt < 1:1464662/140‑1 (MQ=255)
tATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCtt > 2:1554776/1‑140 (MQ=255)
tAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTAtt < 1:8103110/140‑1 (MQ=255)
tAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTAtt < 1:5960816/140‑1 (MQ=255)
tAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTAtt < 1:26913/140‑1 (MQ=255)
aTGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGc < 2:1679080/140‑1 (MQ=255)
aTGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGc > 1:6429348/1‑140 (MQ=255)
aTGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGc < 1:7543196/140‑1 (MQ=255)
aTGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGc > 2:2911523/1‑140 (MQ=255)
aTGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGAGAATCTTGTTAGTGc < 2:318761/140‑1 (MQ=255)
tGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCt > 2:8803820/1‑140 (MQ=255)
gCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCtg < 1:3966151/140‑1 (MQ=255)
cGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCtgg < 1:7117006/140‑1 (MQ=255)
cGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCtgg > 1:5423143/1‑140 (MQ=255)
cGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCtgg < 1:1083804/140‑1 (MQ=255)
cGTTAATGCCAGTGAGGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCtgg < 1:3339958/140‑1 (MQ=255)
ttAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCtggtg > 2:2518755/1‑140 (MQ=255)
ttAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCtggtg < 2:5953743/140‑1 (MQ=255)
ttAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCtggtg > 2:1101362/1‑140 (MQ=255)
aTGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTa < 2:7890946/140‑1 (MQ=255)
aTGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGAGAATCTTGTTATTGCTGGTGGTa < 2:2145628/140‑1 (MQ=255)
ccAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTCCTg > 1:7967852/1‑140 (MQ=255)
aGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTggg > 1:4061021/1‑140 (MQ=255)
gTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGt > 2:8026963/1‑140 (MQ=255)
gTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACGGGGt > 1:2822444/1‑140 (MQ=255)
tGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTa > 2:4931564/1‑140 (MQ=255)
tGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTa > 1:8199864/1‑140 (MQ=255)
tGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTa > 1:2378805/1‑140 (MQ=255)
tGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTGTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGGTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTa > 1:5719464/1‑140 (MQ=255)
tGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATACTCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATcg > 1:8465149/1‑140 (MQ=255)
tGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATcg > 1:7701720/1‑140 (MQ=255)
tGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATcg < 1:582441/140‑1 (MQ=255)
tGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATcg > 2:4235932/1‑140 (MQ=255)
cccGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCAGAATTAGTCATGAAAAAATTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATcgcc > 2:6133341/1‑140 (MQ=255)
ccGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATcgccg < 1:6811127/140‑1 (MQ=255)
ccGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATcgccg < 2:8346792/140‑1 (MQ=255)
cGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATcgccgc > 1:1163550/1‑140 (MQ=255)
gCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGtgtg < 1:4379747/140‑1 (MQ=255)
gCCTGTGGCGATGACACCTTCTCGACACCAACGATAGATGACTATTTCGCCCCACTTTGTGACCGCCCGCACTAGACAAGAAAAAAGTGTTCTTGAGAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGtgtg < 2:1302406/140‑1 (MQ=255)
ccTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTgg > 2:9263504/1‑140 (MQ=255)
ccTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTgg > 1:7228323/1‑140 (MQ=255)
ccTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGATGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTgg > 1:2236130/1‑140 (MQ=255)
ccTGTGGCGATGTCTCCTGTTCGTCAGCAACGTTATCTGAATCTTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGATTTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGCGAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTgg > 1:784671/1‑140 (MQ=255)
cTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTggg < 1:1834427/140‑1 (MQ=255)
gtgGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCg > 1:3803258/1‑140 (MQ=255)
tgGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGACACAAGTGTTATTGATAATCGTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCgg > 2:5266526/1‑139 (MQ=255)
tgGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGt > 1:1408155/1‑140 (MQ=255)
tgGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGt > 1:3668529/1‑140 (MQ=255)
aTGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGa < 1:5177802/140‑1 (MQ=255)
tGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGaa < 2:5819186/140‑1 (MQ=255)
tGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGaa < 1:4691204/140‑1 (MQ=255)
gTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAg > 1:6091887/1‑140 (MQ=255)
cTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATNTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCg < 1:6280382/140‑1 (MQ=255)
aGCAACGTTATATGAATATGTAGCCCCACTTTGTGATCGCCCGAATTCGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGc > 2:6708581/1‑140 (MQ=255)
gCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGtgtg < 2:1941387/113‑1 (MQ=255)
aaCGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGa < 2:336001/140‑1 (MQ=255)
cGTTCTATGAATAGTTCGCCCCACTTGGTGAGCGCCCGAAGTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGCGAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGGGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACa > 2:4604692/1‑140 (MQ=255)
cGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACa > 1:8383305/1‑140 (MQ=255)
ttATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGc > 2:5332841/1‑140 (MQ=255)
tGAATATTTAGCCCCACGTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGGATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGACGGTGCGCCATCTTGCCGACAGCAAAtt > 2:946172/1‑140 (MQ=255)
atatTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATTAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCt > 1:4838364/1‑140 (MQ=255)
atatTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATACTCGTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGGTCGCCATCTTGCCGACAGCACATTGCt > 2:4523560/1‑140 (MQ=255)
atatTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCt > 2:5450337/1‑140 (MQ=255)
atatTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCt < 2:6753133/140‑1 (MQ=255)
tatTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCtt > 1:3280681/1‑140 (MQ=255)
tatTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCtt > 1:3086925/1‑140 (MQ=255)
tatTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCtt > 2:9602517/1‑140 (MQ=255)
tatTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCtt > 1:9744882/1‑140 (MQ=255)
tttAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTAt > 2:6503038/1‑140 (MQ=255)
tttAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTAt < 1:6619847/140‑1 (MQ=255)
ttgaGCCCCACTTTGTGAGAGCCCGACTTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCGGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTAt < 2:6906805/137‑1 (MQ=255)
cccACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAaaga < 1:9681218/140‑1 (MQ=255)
aCTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAagaaga > 2:3647877/1‑140 (MQ=255)
aCTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAagaaga > 1:3460656/1‑140 (MQ=255)
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cTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAagag > 1:923032/1‑140 (MQ=255)
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ACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCT > SRR14920172.97450/1‑151 (MQ=60)
ACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCT > SRR14920172.2874837/1‑151 (MQ=60)
CGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACctgtctcttatacacatctccgagcccacgagacgcgtagtaatcgcgtatgccgtcttcgg > SRR14920172.2249772/1‑89 (MQ=60)
CGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTT > SRR14920172.2781963/1‑151 (MQ=60)
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CGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTT > SRR14920172.9489318/1‑151 (MQ=60)
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TTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTAT > SRR14920172.8494/1‑151 (MQ=60)
ATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCCAATTGCGTATCA > SRR14920172.4043037/1‑151 (MQ=60)
ATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCA > SRR14920172.4674798/1‑151 (MQ=60)
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TGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAG > SRR14920172.9323542/1‑151 (MQ=60)
ATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAG < SRR14920172.8178050/151‑1 (MQ=60)
ATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAG > SRR14920172.3743348/1‑151 (MQ=60)
TATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGA > SRR14920172.3487947/1‑151 (MQ=60)
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ATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAG > SRR14920172.4615579/1‑151 (MQ=60)
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TAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACG > SRR14920172.6660628/1‑151 (MQ=60)
TAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACG > SRR14920172.4514829/1‑151 (MQ=60)
GCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGAT > SRR14920172.7101874/1‑151 (MQ=60)
CCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAGTCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATAT < SRR14920172.9758441/151‑1 (MQ=60)
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AGCCTCTCTGGAAGAGTCGTTGCAGGCAGATGAGATGGTTATTTGTAATGCGTTAATGCCAGTGATGCCCGTATGTGCCTGTGGCGATGTCTCCTTTTCGTCAGCAACGTTATATGAATATTTAGCCCCACTTTGTGAGCGCCCGAATTAATCATGAAAAAAGTGTTATTGATAATCTTGTTATTGCTGGTGGTACTGGGTATCGCCGCTGGTGTGGGCGTCTGGAAGGTTCGCCATCTTGCCGACAGCAAATTGCTTATCAAAGAAGAGACGATATTTACCCTGAAGCCAGGGACCGGAC > NZ_CP025268/1161060‑1161360
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |