Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R2
|
870 |
341.9 |
11209456 |
97.2% |
10895591 |
138.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
3,179,162 |
T→C |
*141* (TAA→TAG) |
yqiB ← |
DUF1249 family protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 3,179,162 | 0 | T | C | 98.8%
| 1137.1
/ NA
| 348 | *141* (TAA→TAG) | yqiB | DUF1249 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); major base C (179/163); minor base A (0/4); total (179/169) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.33e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 348 total aligned reads displayed.
GTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTTTATTAGGATAATCATACCGCGCTTTGAAGCGAA > NZ_CP025268/3179027‑3179298
|
gTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCtaat > 1:5064057/1‑140 (MQ=255)
gTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCtaat > 2:2162369/1‑140 (MQ=255)
gTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCtaat > 1:939104/1‑140 (MQ=255)
tttACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCtaata < 1:4702877/140‑1 (MQ=255)
tACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATaaa > 1:3614125/1‑140 (MQ=255)
tACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATaaa > 1:1444577/1‑140 (MQ=255)
cTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGa > 1:2674014/1‑140 (MQ=255)
tAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGaa > 1:236377/1‑140 (MQ=255)
tAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGaa > 1:393298/1‑140 (MQ=255)
tAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGaa > 1:5326116/1‑140 (MQ=255)
tAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGaa > 2:1355519/1‑140 (MQ=255)
tAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGaa > 2:2775287/1‑140 (MQ=255)
aCAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATc > 2:3437154/1‑140 (MQ=255)
gggCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGcc < 1:3645356/140‑1 (MQ=255)
gggCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGcc < 2:968567/140‑1 (MQ=255)
gCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCAt > 1:2260502/1‑140 (MQ=255)
gCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCAt > 1:2466276/1‑140 (MQ=255)
gCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCAt > 2:2645368/1‑140 (MQ=255)
gCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCAt < 2:909197/140‑1 (MQ=255)
cgtCGTGCTTGTGTGCAAACACGTGAGTGTCGGTAATTTGTCAGATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTGAACAGGCTTTCCGAATGGCGTCCTTAGCTTTCACGCCGCTAATAAACCGGCATCGCCATc < 2:2073441/138‑1 (MQ=255)
cTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTACAATCCTGACTCGGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCGAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCagc < 2:3769578/140‑3 (MQ=255)
ttCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATGTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCg < 1:1300286/140‑1 (MQ=255)
cGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCt > 2:403414/1‑140 (MQ=255)
cGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCt > 1:304735/1‑140 (MQ=255)
tGCTTTTGTGCCAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAACCCTGACTCTGGCCTCCCCAGCCAGCGCAAGGGTCAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTTGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTcc < 2:2510553/140‑1 (MQ=255)
tGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTcc < 1:3223725/140‑1 (MQ=255)
tGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTcc < 2:3821371/140‑1 (MQ=255)
tGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTcc < 2:4435227/140‑1 (MQ=255)
tGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTcc < 1:626973/140‑1 (MQ=255)
tGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTcc < 1:2923393/140‑1 (MQ=255)
ttttGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCAtg > 2:3278726/1‑140 (MQ=255)
ttGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGTCTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTCAGATTTCACGACGATAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCAtgtg < 2:2901615/140‑1 (MQ=255)
ttGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCAtgtg < 1:2410563/140‑1 (MQ=255)
tgtgCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGc < 2:3614125/140‑1 (MQ=255)
tgCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTa < 2:1471010/140‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTaaa > 1:1542427/1‑140 (MQ=255)
cAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTaaa < 2:2801146/140‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTGGTAAAATCCTGACTCGGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTaaa < 2:4211831/140‑1 (MQ=255)
gcccggcgAGTGTCGGTAAGCCGTCCACTCCTGCCTGTCGCCTCACCAGCCAGAGGACGCGTTAACAGGCTTTCCAAATGCTGCCGTTCGGTGTAACGACGCTAATAAACCGGACTCGCCATGGCTCCTTGTGCTAACCa < 2:1402866/133‑1 (MQ=255)
gTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGGTAAACAGTATc > 2:2922765/1‑140 (MQ=255)
gTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCGTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATc > 1:4434822/1‑140 (MQ=255)
tGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCg > 2:2999110/1‑140 (MQ=255)
ggTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGt < 1:756208/140‑1 (MQ=255)
ggactttGTTAAGTCCTGCCTTTGGTCTTACCATCCAGAGGACAGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGCTTCACGACGCTAATCCACCGTCATCGGCATCGCTCCATGTACTAAACACTATCGCAACGAGTc > 2:3203822/5‑140 (MQ=255)
gTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTc > 1:561689/1‑140 (MQ=255)
gTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTc > 2:5002163/1‑140 (MQ=255)
gTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTc > 1:2586821/1‑140 (MQ=255)
ttGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTa > 1:2785656/1‑140 (MQ=255)
ttGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTa > 2:1261313/1‑140 (MQ=255)
aaTCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACt > 1:3761188/1‑140 (MQ=255)
tCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGa < 1:3502086/140‑1 (MQ=255)
ggCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGAt > 1:388024/1‑140 (MQ=255)
ggCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGAt > 1:5230351/1‑140 (MQ=255)
ggCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGAt > 1:2871755/1‑140 (MQ=255)
ggCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGAt > 2:2410182/1‑140 (MQ=255)
ggCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGAt > 1:1875827/1‑140 (MQ=255)
gCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATg > 1:1682090/1‑140 (MQ=255)
aCCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCt > 2:3869732/1‑115 (MQ=255)
aCCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCtttt > 2:1828656/1‑140 (MQ=255)
aCCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCtttt > 2:3065478/1‑140 (MQ=255)
agGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGtt > 1:2138572/1‑140 (MQ=255)
gggTTAACATGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAAACGCAAGCGCCAGCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCGGATAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCCTtgctgc > 2:552779/1‑140 (MQ=255)
gggTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAACCAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGc < 1:4284263/140‑1 (MQ=255)
gggTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGc > 2:3153597/1‑140 (MQ=255)
ggTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCa > 2:5240476/1‑140 (MQ=255)
gCTTTCCAAATGGTGTCCTTCGGTTTCACGACGCTAATCAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAGCAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTGTCGTCGCGTTGATGCAACTTTttat < 2:2020859/140‑1 (MQ=255)
gCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTttat < 1:1920670/140‑1 (MQ=255)
gCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTttat < 1:3969285/140‑1 (MQ=255)
gCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTttat > 1:536369/1‑140 (MQ=255)
gCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTttat < 1:4357909/140‑1 (MQ=255)
ccTTTCCAAATGGCCTACTTAGGTTTCCCGACGCCCATCAACCGGCATCGCCATCGCTCCATGTTCTATACAGTACCCCACCCAGTCCGCTAACAACTGATTAATTTCATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTtgat < 2:2299406/139‑1 (MQ=255)
ctgtCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACGTTttatt < 1:4578709/137‑1 (MQ=255)
cTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTttatt < 2:1565078/140‑1 (MQ=255)
cTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTttatt > 1:1728988/1‑140 (MQ=255)
cTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGATCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTttatt < 1:2961472/140‑1 (MQ=255)
ttCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCTGTCCTCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTTTATTAg < 2:3015733/140‑1 (MQ=255)
ttCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGt > 1:426570/1‑83 (MQ=255)
ttCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTTTATTAg < 2:3248150/140‑1 (MQ=255)
ttCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTTTATTAg < 1:5416257/140‑1 (MQ=255)
ttCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTTTATTAg < 1:1609834/140‑1 (MQ=255)
ttCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTTTATTAg < 1:5121378/140‑1 (MQ=255)
ttCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTTTATTAg < 2:809266/140‑1 (MQ=255)
ttCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTTTATTAg > 1:411329/1‑140 (MQ=255)
tcgaattGGTGTACTTTGGATTCCCGACGCTAAGGAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAAGAGTATCGCAACCAGTACGCTAAAATCTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCATCTTTTTATTAgg < 2:3926477/134‑1 (MQ=255)
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GACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTTTATTAGGATAATCATACCGCGCTTTGAAGCG‑AAAATCTGCTGG < SRR14920167.4161110/151‑1 (MQ=60)
CTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTTTATTAGGATAATCATACCGCGCTTTGAAGCGAAAAATCTGCTGGCTT > SRR14920167.1870221/1‑151 (MQ=60)
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CTCTCCCAGATGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTTTATTAGGATAATCATACCGCGCTTTGAAGCGAAAAATCTGCTGGCTT > NZ_CP025268/3179016‑3179312
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |