Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R1
|
775 |
316.5 |
10245680 |
97.2% |
9958800 |
138.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
3,179,162 |
T→C |
*141* (TAA→TAG) |
yqiB ← |
DUF1249 family protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 3,179,162 | 0 | T | C | 99.6%
| 934.0
/ NA
| 279 | *141* (TAA→TAG) | yqiB | DUF1249 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (145/133); minor base A (0/1); total (145/134) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.80e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 279 total aligned reads displayed.
TGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTTTATTAGGATAATCATACCGCGCTTTGAAGCG > NZ_CP025268/3179026‑3179296
|
tGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCtaa > 1:5034904/1‑140 (MQ=255)
gTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAATAGGTGAGTGTCGGTAATTCGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCtaat > 2:4416286/1‑140 (MQ=255)
gTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCtaat > 1:3956241/1‑140 (MQ=255)
gTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCtaat > 2:4591501/1‑140 (MQ=255)
tttACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCtaata > 1:2764518/1‑140 (MQ=255)
ttACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACCACGCtaataa > 2:2315531/1‑140 (MQ=255)
tACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATaaa > 1:4400799/1‑140 (MQ=255)
cccTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCg > 2:3106809/1‑140 (MQ=255)
tAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGaa > 1:1174633/1‑140 (MQ=255)
tAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGaa > 1:1551164/1‑140 (MQ=255)
tAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGaa > 1:2094847/1‑140 (MQ=255)
tAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGaa > 1:2881588/1‑140 (MQ=255)
aaCTGGGCTTCGTGCTTTCGTGCCAACAGGTGCGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTCGCCTCACCAGACAGAGGACGGGTTAACAGGCTCTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTAACGACGCTAATAAACCGGAAt < 2:181414/140‑1 (MQ=255)
aaCAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAAt < 2:727327/140‑1 (MQ=255)
aaCAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAAt < 1:4047307/140‑1 (MQ=255)
aCAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATc > 2:2854450/1‑140 (MQ=255)
gggCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGcc < 1:2980493/140‑1 (MQ=255)
gggCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGcc < 2:4872618/140‑1 (MQ=255)
gggCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGcc < 1:3665101/140‑1 (MQ=255)
ggCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCa > 2:3963754/1‑140 (MQ=255)
ggCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCa > 1:1974561/1‑140 (MQ=255)
ggCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCa < 2:4672140/140‑1 (MQ=255)
ggCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCa > 1:3917905/1‑140 (MQ=255)
gCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTATCAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCAt > 2:3845038/1‑140 (MQ=255)
gCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCAt > 1:2707803/1‑140 (MQ=255)
gCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCAt > 1:4515703/1‑140 (MQ=255)
gCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGGGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGTCAt > 2:474814/1‑140 (MQ=255)
cTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATc < 1:4263340/140‑1 (MQ=255)
ttCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCg > 2:3465313/1‑140 (MQ=255)
cGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCt > 2:986609/1‑140 (MQ=255)
cGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCt > 1:1231841/1‑140 (MQ=255)
cGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCt > 1:2878231/1‑140 (MQ=255)
cGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCt > 1:3538264/1‑140 (MQ=255)
tGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAACCTCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCCTTCCACATGGTCTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTcc < 2:4627371/140‑1 (MQ=255)
tGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGCCTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTcc < 2:4347123/140‑1 (MQ=255)
tGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTcc < 1:1001823/140‑1 (MQ=255)
tGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTcc < 1:5012262/140‑1 (MQ=255)
tGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTcc < 1:967862/140‑1 (MQ=255)
tGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTcc < 1:4619944/140‑1 (MQ=255)
tGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTcc < 2:2995100/140‑1 (MQ=255)
tGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTcc < 2:3315037/140‑1 (MQ=255)
tGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTcc < 1:1864298/140‑1 (MQ=255)
tGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTcc < 1:1801818/140‑1 (MQ=255)
tGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTcc < 1:3800836/140‑1 (MQ=255)
ttttGTGCAAACAGGTGAGTGTGGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCTAAATGGTGCCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCAtg < 2:4011525/140‑1 (MQ=255)
ttGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCAtgtg < 1:2957584/140‑1 (MQ=255)
cAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTaaa > 2:2485657/1‑140 (MQ=255)
cAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGGTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTaaa < 2:2623558/140‑1 (MQ=255)
aaCAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACa < 1:3763414/140‑1 (MQ=255)
ggTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTAt < 1:1390194/140‑1 (MQ=255)
gTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATc > 1:2552242/1‑140 (MQ=255)
tGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCg > 2:2968953/1‑140 (MQ=255)
tGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCg < 2:2192868/140‑1 (MQ=255)
tGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCg > 2:3685272/1‑140 (MQ=255)
tgtCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAAc > 1:4823012/1‑140 (MQ=255)
cGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAg > 1:797999/1‑140 (MQ=255)
cGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAg > 2:3584677/1‑140 (MQ=255)
ggTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGt < 2:2738014/140‑1 (MQ=255)
ggTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGt < 1:2599200/140‑1 (MQ=255)
ggTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGt < 1:1303402/140‑1 (MQ=255)
ggTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGt < 2:124769/140‑1 (MQ=255)
aTTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTGGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGc > 2:1474906/1‑140 (MQ=255)
tGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGGAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGGGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATACACCGGAATCGCCATCGCTCGATGTGCTACACAGTATCGCCACCAGTCCGCTaa > 2:568145/1‑140 (MQ=255)
tGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTaa > 2:2807147/1‑140 (MQ=255)
gTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTaaa < 1:337053/140‑1 (MQ=255)
tAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTaaaa < 1:3415173/140‑1 (MQ=255)
ggCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTaaa > 2:4946109/1‑100 (MQ=255)
cACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCttt > 2:1062484/1‑140 (MQ=255)
aCCAGCCAGAGGGAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCtttt > 2:5057217/1‑140 (MQ=255)
aCCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCtttt > 1:4985011/1‑140 (MQ=255)
cagAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTcgc > 1:3088971/1‑140 (MQ=255)
gggTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGc > 1:3177129/1‑140 (MQ=255)
gTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCaa > 1:4730673/1‑140 (MQ=255)
aaCAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACtt < 1:2920860/140‑1 (MQ=255)
aaCAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCAAGACGCTAATAACCCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATGGCAACCAGTACGCAAAAAACTGATTAATTTGGTGCTTTTCGTCGCGTTGATTCAACtt > 2:4221142/1‑140 (MQ=255)
aGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACttttt > 2:1372319/1‑140 (MQ=255)
ggCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAACCCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTtta < 1:816507/140‑1 (MQ=255)
gCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTttat < 1:4541756/140‑1 (MQ=255)
gCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTttat < 1:3295965/140‑1 (MQ=255)
gCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTGTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTttat < 2:3715913/140‑1 (MQ=255)
cTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATGGCTCAAGGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTATTCGTCGCGTTGATGCAACTTTttatt > 2:155720/1‑140 (MQ=255)
cTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTttatt > 1:3224091/1‑140 (MQ=255)
cTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTttatt > 2:2171026/1‑140 (MQ=255)
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tttCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTttatta > 1:4841505/1‑140 (MQ=255)
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CCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGTAACTTTTTATTAGGATAATCATACCG > SRR14920169.2489654/1‑151 (MQ=60)
GTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTTTATTAGGATAATCATACCGCGCTTTG > SRR14920169.2017032/1‑151 (MQ=60)
GTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTTTATTAGGATAATCATACCGCGCTTTGAA > SRR14920169.5042517/1‑151 (MQ=60)
TCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTTTATTAGGATAATCATACCGCGCTTTGAAG < SRR14920169.3592876/151‑1 (MQ=60)
TCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTTTATTAGGATAATCATACCGCGCTTTGAAG > SRR14920169.4823493/1‑151 (MQ=60)
CCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTTATGCAACTTTTTATTAGGATAATCATACCGCGCTTTGAAGC > SRR14920169.4580898/1‑151 (MQ=60)
CCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTTTATTAGGATAATCATACCGCGCTTTGAAGC > SRR14920169.3201450/1‑151 (MQ=60)
GGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTTTATTAGGATAATCATACCGCGCTTTGAAGCGAAAA > SRR14920169.3555487/1‑151 (MQ=60)
ACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTTTATTAGGATAATCATACCGCGCTTTGAAGCGAAAAATCTGC < SRR14920169.5018246/151‑1 (MQ=60)
ACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTTTATTAGGATAATCATACCGCGCTTTGAAGCGAAAAATCTGCTGG > SRR14920169.3539720/1‑151 (MQ=60)
GCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTTTATTAGGATAATCATACCGCGCTTTGAAGCGAAAAATCTGCTGGCT > SRR14920169.1294293/1‑151 (MQ=60)
CTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTTTATTAGGATAATCATACCGCGCTTTGAAGCGAAAAATCTGCTGGCTT > SRR14920169.1545087/1‑151 (MQ=60)
CTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTTTATTAGGATAATCATACCGCGCTTTGAAGCGAAAAATCTGCTGGCTT > SRR14920169.4547720/1‑151 (MQ=60)
CTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTTTATTAGGATAATCATACCGCGCTTTGAAGCGAAAAATCTGCTGGCTT > SRR14920169.3768329/1‑151 (MQ=60)
CTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTTTATTAGGATAATCATACCGCGCTTTGAAGCGAAAAATCTGCTGGCTT > SRR14920169.3544625/1‑151 (MQ=60)
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ACTCTCCCAGATGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTTTATTAGGATAATCATACCGCGCTTTGAAGCGAAAAATCTGCTGGCTT > NZ_CP025268/3179015‑3179312
|
| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |