Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R2
|
870 |
341.9 |
11209456 |
97.2% |
10895591 |
138.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
3,435,263 |
A→G |
T122A (ACA→GCA) |
fmt → |
methionyl‑tRNA formyltransferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 3,435,263 | 0 | A | G | 99.7%
| 1109.5
/ NA
| 337 | T122A (ACA→GCA) | fmt | methionyl‑tRNA formyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (131/204); total (131/206) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 357 total aligned reads displayed.
ACTGGTCGCCGAACTGCAGGCTGATGTTATGGTCGTCGTCGCCTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTACACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGTA > NZ_CP025268/3435127‑3435398
|
cGCCGAACTGCAGGCTGATGTTATGGTCGTCGTCGCCTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATcc < 1:1961736/140‑1 (MQ=255)
gCCGAACTGCAGGCTGATGTTATGGTCGTCGTCGCCTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCa < 2:3576705/140‑1 (MQ=255)
gAACTGCAGGCTGATGTTATGGTCGTCGTCGCCTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACg < 1:433860/140‑1 (MQ=255)
gAACTGCAGGCTGATGTTATGGTCGTCGTCGCCTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACg < 1:1632288/140‑1 (MQ=255)
gAACTGCAGGCTGATGTTATGGTCGTCGTCGCCTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACg < 2:1535048/140‑1 (MQ=255)
aaCTGCAGGCTGATGTTATGGTCGTCGTCGCCTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGc > 2:4842626/1‑140 (MQ=255)
aCTGCAGGCTGATGTTATGGTCGTCGTCGCCTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCt < 1:1904544/140‑1 (MQ=255)
aCTGCAGGCTGATGTTATGGTCGTCGTCGCCTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCt < 1:1035044/140‑1 (MQ=255)
tGATGTTATGGTCGTCGTCGCCTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATggg > 1:3333603/1‑140 (MQ=255)
ttATGGTCGTCGTCGCCTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGt < 2:2433378/140‑1 (MQ=255)
gtcgtcgtcGCCTATGGTTTTATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGc < 1:1823266/140‑1 (MQ=255)
gtcgtcgtcGCCTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGc < 1:4397792/140‑1 (MQ=255)
tcgtcgtcgCCTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCa < 2:4436280/140‑1 (MQ=255)
gtcgtcgCCTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGGTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGa > 1:4650438/1‑140 (MQ=255)
gtcgtcgCCTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGa > 2:2567625/1‑140 (MQ=255)
gtcgtcgCCTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGa > 2:2309474/1‑140 (MQ=255)
gtcgtcgCCTATGGTCTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCTGCTTATTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGAAGa > 2:5075202/1‑140 (MQ=255)
tcgtcgCCTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGaa > 1:3115970/1‑140 (MQ=255)
cgtcgCCTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGaaa < 2:3287114/140‑1 (MQ=255)
cgtcgCCTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGGCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACAAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGaaa < 2:3144437/140‑1 (MQ=255)
cgCCTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTg > 1:4115530/1‑140 (MQ=255)
gCCTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTgg > 1:3813252/1‑140 (MQ=255)
tATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGgtgt < 1:5568605/140‑1 (MQ=255)
tATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGgtgt < 2:758933/140‑1 (MQ=255)
ggTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGAc < 1:5324012/140‑1 (MQ=255)
tttAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCa < 1:1633441/140‑1 (MQ=255)
ttAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCAt < 2:543342/140‑1 (MQ=255)
tAATTCTGCCGAAAGCAGGGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGTGCGGGGGATGCAGAAACTGGTGTGACCAtt > 2:2827538/1‑140 (MQ=255)
aTTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTAt > 1:3522340/1‑140 (MQ=255)
cTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCa < 1:4213648/140‑1 (MQ=255)
gCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCACGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGGTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCGCCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCaaa > 2:3801066/1‑140 (MQ=255)
ccGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAAt > 1:4279185/1‑140 (MQ=255)
aGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATg < 1:1358924/140‑1 (MQ=255)
aGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATg < 2:554782/140‑1 (MQ=255)
aGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATg > 1:2464580/1‑140 (MQ=255)
gCAGTGGTGGGGATGCTGCGTCTTGGGTGTGTGAAGGTTCATGGTTCACTGCTGCCAGGATGGGGCGGTGCTGTACCAATCCAACGCTCACGATGGGCTGGTGGTGCATAAACTGGTGTGACCATTTGGGAAATGGATGt < 2:1218061/140‑1 (MQ=255)
tGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGt < 1:3051235/140‑1 (MQ=255)
tGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGt > 1:776366/1‑140 (MQ=255)
gagaTGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGa > 1:5182409/1‑140 (MQ=255)
gagaTGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGa > 1:1520118/1‑140 (MQ=255)
gagaTGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGa > 1:3231156/1‑140 (MQ=255)
gagaTGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGa < 1:5034684/140‑1 (MQ=255)
aTGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGacac < 1:3730442/140‑1 (MQ=255)
aTGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGacac < 1:3192410/140‑1 (MQ=255)
aTGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGacac < 1:3909495/140‑1 (MQ=255)
gCCGCGTCTTGGCTGTATCAGCGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGGGATGCAGAAACTGGTGTGAACATTATGCAAAAGGATGTCGGTTTAGACACCg > 2:4158698/1‑140 (MQ=255)
gCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGGACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCg < 2:902730/140‑1 (MQ=255)
gCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCg > 1:5512183/1‑140 (MQ=255)
gCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCg > 1:3463555/1‑140 (MQ=255)
gCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCg > 2:26352/1‑140 (MQ=255)
gCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCg > 2:3197752/1‑140 (MQ=255)
gCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCg > 1:4861957/1‑140 (MQ=255)
gCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCg > 2:3028278/1‑140 (MQ=255)
cgcgTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGt > 2:129690/1‑140 (MQ=255)
cgcgTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGt > 1:4514826/1‑140 (MQ=255)
gcgTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTg > 2:4519273/1‑140 (MQ=255)
gcgTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTg < 2:189895/140‑1 (MQ=255)
gcgTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTg < 1:4971596/140‑1 (MQ=255)
gTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGat < 2:3970888/140‑1 (MQ=255)
tCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGata < 2:639504/140‑1 (MQ=255)
cTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGatat < 1:2088548/140‑1 (MQ=255)
cTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGatat < 2:1784180/140‑1 (MQ=255)
cTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGatat < 2:4598769/140‑1 (MQ=255)
cTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGatat < 1:3636239/140‑1 (MQ=255)
ttGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATg < 1:665754/140‑1 (MQ=255)
ttGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATg < 1:1133715/140‑1 (MQ=255)
ttGGCTGTATCAACGTTCATGGCTCATTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTTGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATg < 2:4399871/140‑1 (MQ=255)
ggCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGct < 1:820937/140‑1 (MQ=255)
gTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCtat < 2:2046225/140‑1 (MQ=255)
aTCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATaa > 1:1566243/1‑140 (MQ=255)
aTCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATaa > 1:2215879/1‑140 (MQ=255)
tCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACGGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAg > 1:4077849/1‑140 (MQ=255)
tCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGAt < 1:2530557/140‑1 (MQ=255)
tCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGAt < 1:4786483/140‑1 (MQ=255)
tCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTGTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGAt > 1:5066360/1‑140 (MQ=255)
tCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGGGACCATTATGCAGATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGAGATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGAt < 2:2804162/140‑1 (MQ=255)
tCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACCCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGAt < 1:5134392/140‑1 (MQ=255)
cACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCGGCCCGAtt > 1:5234884/1‑140 (MQ=255)
aCTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTa < 2:3069886/140‑1 (MQ=255)
gctgcCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTg < 1:206772/140‑1 (MQ=255)
gctgcCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTg < 1:2309474/140‑1 (MQ=255)
tgcCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATCAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCa < 2:1168079/140‑1 (MQ=255)
tgcCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCa > 1:2804559/1‑140 (MQ=255)
tgcCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAAGCCAACGCTCACTATGGGCGGTTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATGATGCAAATGAATGTCGGTTTAGACACCGGTGTTATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCGGGTTACTGCa > 2:4086900/1‑140 (MQ=255)
cgcCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATACGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCa < 2:4354712/139‑1 (MQ=255)
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TCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACCCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAG < SRR14920167.5146128/151‑1 (MQ=60)
TCACTGCTGCAACGCTGGCGCGGTGCTGAACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGCAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGATTTAGACACCGGTGATATGCTCTATACGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAG < SRR14920167.1340086/151‑1 (MQ=60)
ACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGAT < SRR14920167.3204701/151‑1 (MQ=60)
CTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCctgtctcttatacacat > SRR14920167.5048898/1‑134 (MQ=60)
GCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACC < SRR14920167.207292/151‑1 (MQ=60)
GCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACC > SRR14920167.4903030/1‑151 (MQ=60)
GCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACC < SRR14920167.2314290/151‑1 (MQ=60)
TGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAG < SRR14920167.732067/151‑1 (MQ=60)
TGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAG < SRR14920167.362534/151‑1 (MQ=60)
CCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTG < SRR14920167.5313763/151‑1 (MQ=60)
tataagagacaGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGG < SRR14920167.4711597/140‑1 (MQ=60)
CACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGG < SRR14920167.4077166/151‑1 (MQ=60)
CACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGG < SRR14920167.3798252/151‑1 (MQ=60)
ACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGT > SRR14920167.736147/1‑151 (MQ=60)
CGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCCCTATGGGCGCGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCCTTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTATATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGTA < SRR14920167.2578933/151‑1 (MQ=60)
TGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGTACGC < SRR14920167.1670612/151‑1 (MQ=60)
TGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGTACGC < SRR14920167.3520610/151‑1 (MQ=60)
TGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGTACGC < SRR14920167.2050388/151‑1 (MQ=60)
TGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGTACGC < SRR14920167.3271069/151‑1 (MQ=60)
GGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGTCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGTACGCT > SRR14920167.2611828/1‑151 (MQ=60)
GTGCTGCACGAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGTCCGCTGTACGA > SRR14920167.4850832/1‑151 (MQ=60)
GTGCTGCACCAATCTAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGGAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCGCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGTACGCTGTACGA > SRR14920167.1513705/1‑151 (MQ=60)
GTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGTACGCTGTACGA > SRR14920167.953415/1‑151 (MQ=60)
GTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGTACGCTGTACGA > SRR14920167.91447/1‑151 (MQ=60)
GTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGTACGCTGTACGA > SRR14920167.1113430/1‑151 (MQ=60)
GTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGTACGCTGTACGA > SRR14920167.822573/1‑151 (MQ=60)
GTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGTACGCTGTACGA > SRR14920167.775454/1‑151 (MQ=60)
GTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGTACGCTGTACGA > SRR14920167.5072787/1‑151 (MQ=60)
GTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGTACGCTGTACGA > SRR14920167.2325292/1‑151 (MQ=60)
GTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGTACGCTGTACGA > SRR14920167.2715462/1‑151 (MQ=60)
GTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGTACGCTGTACGA > SRR14920167.2763965/1‑151 (MQ=60)
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TGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGTACGCTGTACGAC < SRR14920167.4322390/151‑1 (MQ=60)
TGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGTACGCTGTACGAC < SRR14920167.2250528/151‑1 (MQ=60)
TGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGTACGCTGTACGAC < SRR14920167.4823829/151‑1 (MQ=60)
TGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGTACGCTGTACGAC < SRR14920167.1256675/151‑1 (MQ=60)
TGCACCAATCCCACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGTACGCTGTACGACAAG < SRR14920167.5238291/151‑1 (MQ=60)
TGCACCAATCCAACGCTCACAATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGTAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGTACGCTGTACGACAAG < SRR14920167.4679240/151‑1 (MQ=60)
GCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGTACGCTGTACGACAAGC > SRR14920167.1736431/1‑151 (MQ=60)
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CAAGAAAACCAGCAACTGGTCGCCGAACTGCAGGCTGATGTTATGGTCGTCGTCGCCTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTACACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGTACGCTGTACGACAAGC > NZ_CP025268/3435113‑3435413
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
