| ALE, Flask, Isolate | Predicted Mutations | Mean Coverage | Total Reads | Percent Mapped | Mapped Reads | Average Read Length |
|---|---|---|---|---|---|---|
| A1 F50 I1 R2 | 870 | 341.9 | 11209456 | 97.2% | 10895591 | 138.9 |
| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NZ_CP025268 | 4,579,872 | T→C | M1M (ATG→GTG) † *460* (TAA→TAG) |
mcrC ← mcrB ← |
5‑methylcytosine‑specific restriction endonuclease system specificity protein McrC 5‑methylcytosine‑specific restriction endonuclease subunit McrB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 4,579,872 | 0 | T | C | 99.6% | 878.5 / NA | 264 | M1M (ATG→GTG) † *460* (TAA→TAG) | mcrC mcrB | 5‑methylcytosine‑specific restriction endonuclease system specificity protein McrC 5‑methylcytosine‑specific restriction endonuclease subunit McrB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (179/84); minor base A (0/1); total (179/85) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.22e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 264 total aligned reads displayed.
AATACATACCCCAGGATATCAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCATTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGGTGCCATC > NZ_CP025268/4579736‑4580006 | tcatacCCCATGATATCAAGTAGATTGTTACCGGCTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCACATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACCCGTCTCACGGGCTGTTCCACTATGAg < 2:3075935/139‑1 (MQ=255) acattcACCAGGATATAAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATTACGTGCTGTTCCACTATGAg < 2:2000598/140‑1 (MQ=255) acatccCCCATGATATCAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAg < 1:3932476/140‑1 (MQ=255) acatacCCCAGGATATCAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTGCAAGGTGTGCCTGCTTAATTTCCTGTCAATAACCGCATGCGTAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGGCAGGGATCACGGGCTGTTCCACTATGAg < 2:1373979/140‑1 (MQ=255) 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GCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAA > SRR14920167.5341493/1‑151 (MQ=60) GCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAA > SRR14920167.3043729/1‑151 (MQ=60) CTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAG > SRR14920167.5283817/1‑151 (MQ=60) TTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGA < SRR14920167.3481259/151‑1 (MQ=60) TTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTC < SRR14920167.1340527/151‑1 (MQ=60) TTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACGATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTC < SRR14920167.3616444/151‑1 (MQ=60) GCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTGATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGGTCATCAGAGAAATATTCTTCGAG > SRR14920167.4481111/1‑151 (MQ=60) GCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGT > SRR14920167.650810/1‑151 (MQ=60) GCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGT < SRR14920167.526853/151‑1 (MQ=60) TTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAA < SRR14920167.3337616/151‑1 (MQ=60) AATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAG < SRR14920167.2178507/151‑1 (MQ=60) ATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGG < SRR14920167.3821910/151‑1 (MQ=60) TTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGG < SRR14920167.858481/151‑1 (MQ=60) CCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCG > SRR14920167.3808610/1‑151 (MQ=60) CCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCG > SRR14920167.4143043/1‑151 (MQ=60) CTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGA < SRR14920167.4117977/151‑1 (MQ=60) GTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATA > SRR14920167.953021/1‑151 (MQ=60) GTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATA > SRR14920167.2687495/1‑151 (MQ=60) AAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATC > SRR14920167.2683664/1‑151 (MQ=60) AAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATC < SRR14920167.499317/151‑1 (MQ=60) AAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATC > SRR14920167.2683689/1‑151 (MQ=60) AAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATC < SRR14920167.498172/151‑1 (MQ=60) ACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCA > SRR14920167.2033539/1‑151 (MQ=60) ACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCA > SRR14920167.2405105/1‑151 (MQ=60) CCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCAT > SRR14920167.4493346/1‑151 (MQ=60) CCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCAT > SRR14920167.1383159/1‑151 (MQ=60) CCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCAT > SRR14920167.3526873/1‑151 (MQ=60) ATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACA > SRR14920167.3405899/1‑151 (MQ=60) ATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACA > SRR14920167.4209749/1‑151 (MQ=60) ATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACA > SRR14920167.4210033/1‑151 (MQ=60) GCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTCTA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAAT > SRR14920167.3999072/1‑151 (MQ=60) GCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAAT > SRR14920167.5580005/1‑151 (MQ=60) GCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GCGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAAT > SRR14920167.3999958/1‑151 (MQ=60) ATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTT < SRR14920167.342338/151‑1 (MQ=60) GGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCAT > SRR14920167.2256614/1‑151 (MQ=60) GGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCAT > SRR14920167.2228907/1‑151 (MQ=60) GGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCAT > SRR14920167.2703933/1‑151 (MQ=60) GGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCAT > SRR14920167.2668096/1‑151 (MQ=60) GGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCAT < SRR14920167.3267150/151‑1 (MQ=60) GGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCAT > SRR14920167.2668067/1‑151 (MQ=60) GGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGGAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCAT > SRR14920167.4117564/1‑151 (MQ=60) TAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTA < SRR14920167.2850553/151‑1 (MQ=60) TAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTA < SRR14920167.2850552/151‑1 (MQ=60) GCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGctgtctcttatacacatctccgagcccacgagactac > SRR14920167.1505140/1‑114 (MQ=60) GCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGC > SRR14920167.5480728/1‑151 (MQ=60) 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GTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATT > SRR14920167.2065263/1‑151 (MQ=60) GTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATT > SRR14920167.2389873/1‑151 (MQ=60) GTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATT > SRR14920167.4880694/1‑151 (MQ=60) AGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTA > SRR14920167.3254051/1‑151 (MQ=60) ATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATC < SRR14920167.3053385/151‑1 (MQ=60) 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GACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGG > SRR14920167.3183099/1‑151 (MQ=60) GACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGG > SRR14920167.3183820/1‑151 (MQ=60) GACAGCTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGTGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGG < SRR14920167.2787215/151‑1 (MQ=60) AGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGGTGC < SRR14920167.868251/151‑1 (MQ=60) GGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGGTGCC > SRR14920167.3955039/1‑151 (MQ=60) GGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGGTGCC > SRR14920167.3802500/1‑151 (MQ=60) GGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGGTGCC > SRR14920167.3564984/1‑151 (MQ=60) GGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGGTGCC > SRR14920167.552195/1‑151 (MQ=60) GGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCGAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGGTGCC > SRR14920167.2277454/1‑151 (MQ=60) GGATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTGAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGGTGCCA > SRR14920167.4516902/1‑151 (MQ=60) ATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGGTGCCATC > SRR14920167.892757/1‑151 (MQ=60) CACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGGTGCCATCTT > SRR14920167.56847/1‑151 (MQ=60) gacaGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGGTGCCATCTTC < SRR14920167.3242907/147‑1 (MQ=60) CTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGTAGAGGTGCCATCTTCCAACC > SRR14920167.2230988/1‑151 (MQ=60) CTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGGTGCCATCTTCCAACC < SRR14920167.4128645/151‑1 (MQ=60) TGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGGTGCCATCTTCCAACCC < SRR14920167.2458482/151‑1 (MQ=60) TGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGGTGCCATCTTCCAACCC < SRR14920167.2228662/151‑1 (MQ=60) TGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGGTGCCATCTTCCAACCC < SRR14920167.2458536/151‑1 (MQ=60) GTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGGTGCCATCTTCCAACCCA > SRR14920167.487649/1‑151 (MQ=60) GTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGGTGCCATCTTCCAACCCA > SRR14920167.2126669/1‑151 (MQ=60) GTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGGTGCCATCTTCCAACCCA > SRR14920167.485520/1‑151 (MQ=60) GTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGGTGCCATCTTCCAACCCA > SRR14920167.4846967/1‑151 (MQ=60) GTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGGTGCCATCTTCCAACCCA > SRR14920167.1157928/1‑151 (MQ=60) CCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGGTGCCATCTTCCAACCCACAG > SRR14920167.2951450/1‑151 (MQ=60) CACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGGTGCCATCTTCCAACCCACAGC > SRR14920167.5450944/1‑151 (MQ=60) CACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGGTGCCATCTTCCAACCCACAGC > SRR14920167.5450958/1‑151 (MQ=60) ACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGGTGCCATCTTCCAACCCACAGCA > SRR14920167.2077213/1‑151 (MQ=60) ACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGGTGCCATCTTCCAACCCACAGCA > SRR14920167.3331991/1‑151 (MQ=60) CTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGGTGCCATCTTCCAACCCACAGCAG > SRR14920167.929383/1‑151 (MQ=60) | AAACCCCTTTATTTAATACATACCCCAGGATATCAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCATTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATA‑GGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGGTGCCATCTTCCAACCCACAGCAG > NZ_CP025268/4579722‑4580022 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |