Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R2
|
777 |
572.4 |
18918554 |
98.5% |
18634775 |
138.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
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position |
mutation |
annotation |
gene |
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| RA |
NZ_CP025268 |
939,446 |
(A)7→8 |
intergenic (‑289/‑255) |
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thioredoxin‑disulfide reductase/leucine‑responsive transcriptional regulator Lrp |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 939,439 | 1 | . | A | 96.2%
| 2715.6
/ 74.6
| 713 | intergenic (‑282/‑262) | trxB/lrp | thioredoxin‑disulfide reductase/leucine‑responsive transcriptional regulator Lrp |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (14/13); new base A (205/478); total (220/493) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.99e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 864 total aligned reads displayed.
CTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑A‑AAAAA‑ACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTC > NZ_CP025268/939300‑939572
|
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tGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaag‑‑a > 1:4347058/1‑140 (MQ=255)
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cTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑a‑aa > 2:5852420/1‑140 (MQ=255)
tACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑a‑aaa > 2:5461684/1‑140 (MQ=255)
aCTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑a‑aaaa < 1:1979801/140‑1 (MQ=255)
tAAATTTCCCTCTTTATAAGCCGATTAACTGATTCATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAACAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑a‑aaaaa‑aa < 2:7433299/140‑2 (MQ=255)
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aaTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑a‑aaaaa‑aaca < 1:74761/140‑4 (MQ=255)
aaTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑a‑aaaaa‑aaca < 1:5124295/140‑4 (MQ=255)
aaTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑a‑aaaaa‑aaca < 1:5283442/140‑4 (MQ=255)
aaTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑a‑aaaaa‑aaca < 2:1832679/140‑4 (MQ=255)
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tttCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATAGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑a‑aaaaa‑aacagt < 2:7779624/140‑6 (MQ=255)
tttATAAGCCTATTAAATGATGAATAAACTCCCCTTTTAATTAATATCTGGCATGTTGTACTTAATTTCTATTTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑A‑AAAAA‑ACAGTATTCTtat < 2:7080678/140‑1 (MQ=255)
tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑A‑AAAAA‑ACAGTATTCTtat < 2:6105952/140‑1 (MQ=255)
tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑A‑AAAAA‑ACAGTATTCTtat < 1:1376999/140‑1 (MQ=255)
tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑A‑AAAAA‑ACAGTATTCTtat < 1:1257260/140‑1 (MQ=255)
tataAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑A‑AAAAA‑ACAGTATTCTTatat < 2:3692444/140‑1 (MQ=255)
tataAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑A‑AAAAA‑ACAGTATTCTTatat < 1:1007033/140‑1 (MQ=255)
aaGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑A‑AAAAA‑ACAGTATTCTTATATgcg < 2:1201493/140‑1 (MQ=255)
aaGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑A‑AAAAA‑ACAGTATTCTTATATgcg < 1:6091086/140‑1 (MQ=255)
aGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑A‑AAAAA‑ACAGTATTCTTATATgcgc < 1:7892441/140‑1 (MQ=255)
aGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGATTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑A‑AAAAA‑ACAGTATTCTTATATgcgc < 1:7602182/140‑1 (MQ=255)
gCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑A‑AAAAA‑ACAGTATTCTTATATGCGCa < 1:5614434/140‑1 (MQ=255)
gCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑A‑AAAAA‑ACAGTATTCTTATATGCGCa < 1:7365322/140‑1 (MQ=255)
ccGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑A‑AAAAA‑ACAGTATTCTTATATGCGCAt < 1:4227225/140‑1 (MQ=255)
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gATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑A‑AAAAA‑ACAGTATTCTTATATGCGCATaa > 1:3363153/1‑140 (MQ=255)
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gatgaATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑A‑AAAAA‑ACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatgcat < 1:2562478/140‑1 (MQ=255)
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tatCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑A‑AAAAA‑ACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGt > 2:6726803/1‑116 (MQ=255)
tatCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑A‑AAAAA‑ACAGTATTCTTATATGCGCATAACAATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGt > 1:8404569/1‑140 (MQ=255)
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tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑A‑AAAAA‑ACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTg > 1:2308368/1‑133 (MQ=255)
tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑A‑AAAAA‑ACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGAGCTAGTGa > 1:6506449/1‑140 (MQ=255)
tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑A‑AAAAA‑ACAGTATTCTTATAAGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCGAGTGa > 2:1548850/1‑140 (MQ=255)
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tGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTNGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑A‑AAAAA‑ACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGaaa < 1:6251041/140‑1 (MQ=255)
ggCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAA‑ACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGaaa > 2:1957718/1‑140 (MQ=255)
cATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑A‑AAAAA‑ACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCt < 2:5088867/140‑1 (MQ=255)
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ttgtACTAAAAATCGATGTAATGCATTGACCATCCCCTGGTGTTTTGCGAAATCATTCGACGAAGA‑A‑AAAAA‑ACAGTATTCTTATATGCGCAGAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGt < 2:2813021/140‑1 (MQ=255)
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tttACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑A‑AAAAA‑ACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTa < 2:7974992/138‑1 (MQ=255)
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aCTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑A‑AAAAA‑ACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATgg < 2:3946571/140‑1 (MQ=255)
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TATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGT < SRR14920173.6045105/151‑1 (MQ=60)
TCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTAT < SRR14920173.295902/151‑1 (MQ=60)
TGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGG < SRR14920173.711161/151‑1 (MQ=60)
TGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGG < SRR14920173.8004867/151‑1 (MQ=60)
GCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCG > SRR14920173.6829349/1‑151 (MQ=60)
CATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGT < SRR14920173.2367258/151‑1 (MQ=60)
ATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCctgtctcttatacacatctccga > SRR14920173.7406374/1‑128 (MQ=60)
ATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTG < SRR14920173.6172098/151‑1 (MQ=60)
GTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGA > SRR14920173.3458767/1‑151 (MQ=60)
TTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGAC < SRR14920173.8167179/151‑1 (MQ=60)
TTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGAC < SRR14920173.9300220/151‑1 (MQ=60)
TTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGAC < SRR14920173.180951/151‑1 (MQ=60)
TTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGAC < SRR14920173.551087/151‑1 (MQ=60)
TTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGAC < SRR14920173.8746007/151‑1 (MQ=60)
TGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGANAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACA < SRR14920173.6292262/151‑1 (MQ=60)
TGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACA < SRR14920173.3348374/151‑1 (MQ=60)
TGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACA < SRR14920173.2538550/151‑1 (MQ=60)
GTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAG > SRR14920173.688442/1‑151 (MQ=60)
ACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCctgtctcttatacacatctccgagcccacgagacggagctacatctcgtatgcc > SRR14920173.7641414/1‑97 (MQ=60)
TGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGAT < SRR14920173.3441978/151‑1 (MQ=60)
GTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATG > SRR14920173.8796168/1‑151 (MQ=60)
GTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATG > SRR14920173.8869731/1‑151 (MQ=60)
TTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCG < SRR14920173.917142/151‑1 (MQ=60)
TGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGA > SRR14920173.1024876/1‑151 (MQ=60)
TGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGA > SRR14920173.7143555/1‑151 (MQ=60)
TTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGC < SRR14920173.3509937/151‑1 (MQ=60)
GACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTG > SRR14920173.2671336/1‑151 (MQ=60)
ACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTctgtctcttatacacatctccgagcccacgagacggagc > SRR14920173.4064406/1‑112 (MQ=60)
ATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCAC < SRR14920173.1102249/151‑1 (MQ=60)
ATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCAC > SRR14920173.8135931/1‑151 (MQ=60)
ATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCAC > SRR14920173.2157484/1‑151 (MQ=60)
CCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAA > SRR14920173.66670/1‑151 (MQ=60)
CCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAA > SRR14920173.4100930/1‑151 (MQ=60)
CCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAG < SRR14920173.4291586/151‑1 (MQ=60)
CTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGC < SRR14920173.1382966/151‑1 (MQ=60)
GGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAA > SRR14920173.687395/1‑151 (MQ=60)
GAAAACATTCGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTC < SRR14920173.6382471/151‑1 (MQ=60)
GAAAACATTCGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTC < SRR14920173.4394282/151‑1 (MQ=60)
AAACATTCGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTCAC < SRR14920173.7897262/151‑1 (MQ=60)
ACATTCGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTCACCG > SRR14920173.1228335/1‑151 (MQ=60)
TTCGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTCACCGTAG > SRR14920173.3944960/1‑151 (MQ=60)
CGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTCACCGTAGAC < SRR14920173.3709187/151‑1 (MQ=60)
CGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTCACCGTAGAC < SRR14920173.1855478/151‑1 (MQ=60)
CGAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTCACCGTAGAC < SRR14920173.8250004/151‑1 (MQ=60)
GAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTCACCGTAGACC < SRR14920173.595425/151‑1 (MQ=60)
GAGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTCACCGTAGACC < SRR14920173.1426657/151‑1 (MQ=60)
AGGAA‑GAA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTCACCGTAGACCC < SRR14920173.1709433/151‑1 (MQ=60)
agaA‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTCACCGTAGACCCAGGC < SRR14920173.2069831/148‑1 (MQ=60)
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ACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTActgtctcttatacacatctccgagcccacgagacggagctacatcgcgtatgccgtcttctgcttgaaaagggggggggggg > SRR14920173.3451093/1‑69 (MQ=60)
ACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTCACCGTAGACCCAGGCATTGCGCGC < SRR14920173.1873974/151‑1 (MQ=60)
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ACCTCTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑A‑AA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTCACCGTAGACCCAGGCATTGCGCGC > NZ_CP025268/939296‑939596
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
