Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R6
|
776 |
393.9 |
12922803 |
98.2% |
12690192 |
138.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
939,446 |
(A)7→8 |
intergenic (‑289/‑255) |
trxB ← / → lrp |
thioredoxin‑disulfide reductase/leucine‑responsive transcriptional regulator Lrp |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 939,439 | 1 | . | A | 96.5%
| 1511.1
/ 36.8
| 399 | intergenic (‑282/‑262) | trxB/lrp | thioredoxin‑disulfide reductase/leucine‑responsive transcriptional regulator Lrp |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (3/11); new base A (122/261); total (126/273) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.62e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 493 total aligned reads displayed.
CTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑AA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTC > NZ_CP025268/939300‑939572
|
tGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaag‑a > 1:3918560/1‑140 (MQ=255)
tGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaag‑a > 1:6326038/1‑140 (MQ=255)
gCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaag‑aa > 2:4560901/1‑140 (MQ=255)
aCTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑aa‑aaa > 1:4130079/1‑140 (MQ=255)
cTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑aa‑aaaa > 1:2895898/1‑140 (MQ=255)
cTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑aa‑aaaa > 1:790533/1‑140 (MQ=255)
tAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑aa‑aaaaaa > 2:4281961/1‑139 (MQ=255)
tAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑aa‑aaaaaa < 2:2635280/140‑2 (MQ=255)
tAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑aa‑aaaaaa < 1:215687/140‑2 (MQ=255)
tAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑aa‑aaaaaa > 2:490373/1‑139 (MQ=255)
tAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑aa‑aaaaaa < 1:3974434/140‑2 (MQ=255)
tAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑aa‑aaaaaa < 2:749931/140‑2 (MQ=255)
aaaTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑aa‑aaaaaac > 1:4997969/1‑138 (MQ=255)
aaTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑aa‑aaaaaaca < 2:5092811/140‑4 (MQ=255)
aaTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑aa‑aaaaaaca < 2:2076731/140‑4 (MQ=255)
aaTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAAGGATGAATACACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑aa‑aaaaaaca < 1:6029083/140‑4 (MQ=255)
aaTTTACCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGGGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑aa‑aaaaaaca < 2:3644744/140‑4 (MQ=255)
aTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑aa‑aaaaaacag > 1:5806616/1‑136 (MQ=255)
aTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑aa‑aaaaaacag > 2:2022979/1‑136 (MQ=255)
tttCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑aa‑aaaaaacagt < 2:3918721/140‑6 (MQ=255)
ttCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTa > 2:424437/1‑140 (MQ=255)
tCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTAt < 1:2035673/140‑1 (MQ=255)
tttATAAGCCGATTAAATTATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTtat < 1:942569/140‑1 (MQ=255)
tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTtat < 1:424437/140‑1 (MQ=255)
tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTtat < 1:6227868/140‑1 (MQ=255)
tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTtat < 1:1133886/140‑1 (MQ=255)
tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTtat < 2:107400/140‑1 (MQ=255)
tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTtat < 2:2211421/140‑1 (MQ=255)
ttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTtata < 1:5500999/140‑1 (MQ=255)
gCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCa < 1:6122263/140‑1 (MQ=255)
cGATTAAATGATGAAAAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑AACAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATa < 2:650959/140‑1 (MQ=255)
gATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATaa > 2:1499938/1‑140 (MQ=255)
gATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑aa‑aaaaaa < 2:5894539/118‑2 (MQ=255)
ttAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAAcc > 1:3808172/1‑140 (MQ=255)
tAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACca < 2:4997969/140‑1 (MQ=255)
tAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACca < 1:5942626/140‑1 (MQ=255)
tAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACca < 1:882041/140‑1 (MQ=255)
aaTGATGAATATACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 2:4152055/140‑1 (MQ=255)
aaTGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 2:5462408/140‑1 (MQ=255)
aaTGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 1:5572584/140‑1 (MQ=255)
aaTGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 2:6233317/140‑1 (MQ=255)
ttaaTAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGAGCATAACCAGGCATGt < 1:2553938/138‑1 (MQ=255)
gaATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTa > 1:4302443/1‑140 (MQ=255)
tAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAACCATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAAt < 1:5092603/140‑1 (MQ=255)
tAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAAt < 2:5187040/140‑1 (MQ=255)
tAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAAt < 1:1947961/140‑1 (MQ=255)
aaCGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATAc < 1:4510826/140‑1 (MQ=255)
aaCGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATAc < 1:340008/140‑1 (MQ=255)
aaCGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTAATAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTTGTGTTTTGAGAAAACATTCGATGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGAGCATAACCATGCATGTAAATAc < 2:1673284/140‑1 (MQ=255)
ccTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGtt > 1:2336680/1‑140 (MQ=255)
tGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGTGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTa < 2:1367217/140‑1 (MQ=255)
tGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTGTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTa > 2:4964316/1‑140 (MQ=255)
agTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAACAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGAGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTa < 2:5674559/139‑1 (MQ=255)
aTGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCAGGCATGTAAATACCATGTTTACCGTg < 1:365620/140‑1 (MQ=255)
gAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCt > 1:1345522/1‑140 (MQ=255)
aaTATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTAGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGGATTCTTATATGCGCATACCCCTGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTa < 2:2600007/140‑1 (MQ=255)
atatCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAg > 1:1824855/1‑140 (MQ=255)
tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTtat > 2:2885520/1‑94 (MQ=255)
tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTaa > 1:3193260/1‑116 (MQ=255)
tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGa < 2:858425/140‑1 (MQ=255)
tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGa > 2:2309580/1‑140 (MQ=255)
tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGa < 2:4401554/140‑1 (MQ=255)
tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGa > 2:6351207/1‑140 (MQ=255)
tGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGaaa < 2:2480406/140‑1 (MQ=255)
tGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGaaa < 2:1230799/140‑1 (MQ=255)
ggCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTtat > 2:333018/1‑91 (MQ=255)
ggCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAAt < 2:3138707/140‑1 (MQ=255)
gCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATc < 1:2602011/140‑1 (MQ=255)
gCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATc < 1:126689/140‑1 (MQ=255)
cATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCt > 1:3168482/1‑140 (MQ=255)
gttgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTCTTCTTATATGCGCATATCCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACg > 2:1833189/1‑140 (MQ=255)
gttgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACg > 1:1659954/1‑140 (MQ=255)
ttgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGATGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGt < 2:3036267/140‑1 (MQ=255)
ttgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTtat > 2:4650425/1‑85 (MQ=255)
ttgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGt < 2:3767246/140‑1 (MQ=255)
tAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCg < 1:4929394/140‑1 (MQ=255)
aaaaTCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTg > 1:576270/1‑140 (MQ=255)
aaTCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGa < 2:60298/140‑1 (MQ=255)
aaTCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGa > 2:3088673/1‑140 (MQ=255)
cGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAg > 2:2743585/1‑140 (MQ=255)
gATGTTTTGCTTTGACAATCCCCGGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGa < 1:330484/140‑1 (MQ=255)
ttGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTg < 1:4767847/140‑1 (MQ=255)
ccccTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGAt > 2:6164144/1‑140 (MQ=255)
ctgctgTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATACCCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGATATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGc < 2:3483801/140‑1 (MQ=255)
ttttGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 1:3711429/58‑1 (MQ=255)
ttttGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCcac > 1:69163/1‑140 (MQ=255)
ttttGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCcac > 1:1015793/1‑140 (MQ=255)
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ttGCGAAAACATTCGAGGAAGAAA‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGAAAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACaa > 2:5748339/1‑140 (MQ=255)
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ATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAA > SRR14920171.125055/1‑151 (MQ=60)
ATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCNGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAA < SRR14920171.5720140/151‑1 (MQ=60)
TTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAA < SRR14920171.4110104/151‑1 (MQ=60)
TAAATGATGAATACACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAAT < SRR14920171.2353869/151‑1 (MQ=60)
TAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAAT < SRR14920171.5971159/151‑1 (MQ=60)
TAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAAT < SRR14920171.5801274/151‑1 (MQ=60)
cttttcaagcagaagacggcatacgagatgcagcgtagtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATAC < SRR14920171.3728399/80‑1 (MQ=60)
atgtgtataagagacagCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATAC < SRR14920171.28375/134‑1 (MQ=60)
AATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATAC < SRR14920171.2752613/151‑1 (MQ=60)
AATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATAC < SRR14920171.2209948/151‑1 (MQ=60)
AATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATAC < SRR14920171.5138555/151‑1 (MQ=60)
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AATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATAC < SRR14920171.3198518/151‑1 (MQ=60)
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ATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATAC < SRR14920171.2313029/151‑1 (MQ=60)
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TTAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGAGCATAACCAGGCATGTAAATACCATGT < SRR14920171.2565545/151‑1 (MQ=60)
TGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGT < SRR14920171.1332550/151‑1 (MQ=60)
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GAATAAACGCCCCGGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAATCATTCGAGGAAGA‑AAAAAAACAGTCTTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGGT > SRR14920171.6453705/1‑151 (MQ=60)
AATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTT < SRR14920171.3859320/151‑1 (MQ=60)
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TAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGC < SRR14920171.4925915/151‑1 (MQ=60)
AAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCAT > SRR14920171.342788/1‑151 (MQ=60)
AAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCAT > SRR14920171.626555/1‑151 (MQ=60)
AAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCAT > SRR14920171.1887433/1‑151 (MQ=60)
GATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTG < SRR14920171.6256987/151‑1 (MQ=60)
GATGTTTTGCTTTGACAATCCCCGGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTG < SRR14920171.332011/151‑1 (MQ=60)
ATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGA < SRR14920171.6360876/151‑1 (MQ=60)
GTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATG > SRR14920171.6023848/1‑151 (MQ=60)
TTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGT < SRR14920171.3217609/151‑1 (MQ=60)
GCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGAT < SRR14920171.1616407/151‑1 (MQ=60)
TTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGC < SRR14920171.4789704/151‑1 (MQ=60)
TTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGC < SRR14920171.4790331/151‑1 (MQ=60)
TTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGC < SRR14920171.3978302/151‑1 (MQ=60)
TGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCT > SRR14920171.217753/1‑151 (MQ=60)
GACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTG > SRR14920171.401189/1‑151 (MQ=60)
GACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTG > SRR14920171.2720767/1‑151 (MQ=60)
ATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCAC > SRR14920171.69533/1‑151 (MQ=60)
ATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCAC > SRR14920171.69800/1‑151 (MQ=60)
ATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCAC > SRR14920171.1020435/1‑151 (MQ=60)
CCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAA > SRR14920171.3390672/1‑151 (MQ=60)
CTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGC < SRR14920171.4072242/151‑1 (MQ=60)
CTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGC < SRR14920171.6382591/151‑1 (MQ=60)
CTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTNACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGC < SRR14920171.5730215/151‑1 (MQ=60)
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A‑‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTCACCGTAGACCCAGGCAT < SRR14920171.397128/151‑1 (MQ=60)
gaAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTCACCGTAGACCCAGGCA > SRR14920171.209795/3‑151 (MQ=60)
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acAAAAAACAGTAGTCTTCTCTGCGCATACCCATGCAAGTAAATACCATGTGTACCGTGCGAGTGAAATCTACGTCTGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTCACCGTAGACCCAGGCAT < SRR14920171.766962/149‑1 (MQ=60)
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CCTCTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTCACCGTAGACCCAGGCATT > NZ_CP025268/939297‑939590
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |