Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R2
|
777 |
572.4 |
18918554 |
98.5% |
18634775 |
138.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
2,244,790 |
(C)6→5 |
pseudogene (915/1042 nt) |
galS ← |
HTH‑type transcriptional regulator GalS |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 2,244,785 | 0 | C | . | 99.5%
| 2062.7
/ ‑0.6
| 435 | pseudogene (920/1042 nt) | galS | HTH‑type transcriptional regulator GalS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base . (194/238); minor base T (0/2); total (194/241) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.04e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 478 total aligned reads displayed.
CACAGATTGAAAGCGGTTACATCGCCTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTGCCCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCGAAACCGATGATTGAGAGATGTAACGGAATCG > NZ_CP025268/2244647‑2244920
|
cacaGATTGAAAGCGGTTACCTCGCCTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTGcc < 2:6027280/140‑1 (MQ=255)
cacaGATTGAAAGCGGTTACATCGCCTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTGcc > 1:5279911/1‑140 (MQ=255)
cacaGATTGAAAGCGGTTACATCGCCTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTGcc < 2:2648083/140‑1 (MQ=255)
acaGATTGAAAGCGGTTACATCGCCTGATTTGGTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCTTTCTGGCGTGTAGCGACAGAATGGCGACGCACTAACTTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAAGATTGCCTGCTGccc < 2:1045968/140‑1 (MQ=255)
ttGAAAGCGGTTACATCGCCTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTGccccctgc < 2:5002607/140‑4 (MQ=255)
ttGAAAGCGGTTACATCGCCTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTGccccctgc < 1:1475547/140‑4 (MQ=255)
ttGAAAGCGGTTACATCGCCTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTGccccctgc < 1:5348848/140‑4 (MQ=255)
ttGAAAGCGGTTACATCGCCTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTGccccctgc < 2:9125677/140‑4 (MQ=255)
aaaGCGGTTACATCGCCTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAg > 2:4084451/1‑140 (MQ=255)
aaaGCGGTTACATCGCCTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAg > 2:3272128/1‑140 (MQ=255)
cGGTTACATCGCCTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCGATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCa > 1:8365193/1‑140 (MQ=255)
gTTACATCGCCTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGGATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGt > 1:9389373/1‑140 (MQ=255)
aCATCGCCTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCg < 1:4765924/140‑1 (MQ=255)
ccTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCt > 2:8191194/1‑140 (MQ=255)
ccTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCt > 1:1326750/1‑140 (MQ=255)
ccTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑ACCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCt > 2:7567284/1‑140 (MQ=255)
tgAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCa < 2:8309305/140‑1 (MQ=255)
ttAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGa < 2:5571588/140‑1 (MQ=255)
ttAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGa < 1:8156180/140‑1 (MQ=255)
ttAGTGATCGCCGCCGCATACTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATAGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGa > 2:3151504/1‑140 (MQ=255)
aGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAg < 1:2696148/140‑1 (MQ=255)
tGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCa < 1:2963533/140‑1 (MQ=255)
gATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCATTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCaa < 1:8045199/140‑1 (MQ=255)
gATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCaa < 1:7445711/140‑1 (MQ=255)
gATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCaa < 1:8525323/140‑1 (MQ=255)
gATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCaa < 1:7199761/140‑1 (MQ=255)
gATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCaa < 1:867907/140‑1 (MQ=255)
gATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCaa < 1:1728891/140‑1 (MQ=255)
gATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCaa < 1:1856420/140‑1 (MQ=255)
gATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCaa < 2:8611785/140‑1 (MQ=255)
gATCGCCGCCGCATGCGGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCaa < 2:7192129/140‑1 (MQ=255)
gATCGCCGCAGCTTTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTGGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCTAGGCGAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGTAGCaa < 2:5199235/140‑1 (MQ=255)
cgccgccgcATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATgg > 1:6417324/1‑140 (MQ=255)
cgccgccgcATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATgg > 1:2781225/1‑140 (MQ=255)
ccgccgcATTCTGGCGTGTTGCGCCAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGa < 1:9327874/140‑1 (MQ=255)
ccgccgcATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGa < 1:1167701/140‑1 (MQ=255)
ccgccgcATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGa < 2:2349515/140‑1 (MQ=255)
ccgcATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATaa > 1:4138460/1‑140 (MQ=255)
cgcATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAAc > 2:1270069/1‑140 (MQ=255)
aTTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCa < 2:8769653/140‑1 (MQ=255)
aTTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCa < 2:1874565/140‑1 (MQ=255)
aTTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCa < 2:5511170/140‑1 (MQ=255)
aTTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCa < 2:5331412/140‑1 (MQ=255)
aTTCGGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATAGTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCa < 2:5060243/140‑1 (MQ=255)
gtgtTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGtt < 1:381283/140‑1 (MQ=255)
gtTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTaa > 2:1623935/1‑140 (MQ=255)
ttGCGACAGAATGGCGACGCACTCACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATCTTGCCTGCTG‑CCCCCTGCACGGCCCGGTCGGTGGCTAGTTTCGCCATTGAAGCCATGGGCTAACGCACGGGCGTTAAt > 2:9288015/1‑140 (MQ=255)
ttGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAAt > 1:3469785/1‑140 (MQ=255)
tGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCAGTGAAGCAATGGGATACCGCCCGGTCGTTAAtt > 2:4292856/1‑140 (MQ=255)
gACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCg < 1:4523769/140‑1 (MQ=255)
gACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCg < 2:4720710/140‑1 (MQ=255)
cAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCggg < 1:1016992/140‑1 (MQ=255)
aGAATGGCGACTCACTACCGTCGGCATAAACCAGTGGCTTGCACGAGGATCAATTTTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCTTTTATTGCGGGt < 2:1467266/140‑1 (MQ=255)
aGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGt < 1:4018325/140‑1 (MQ=255)
gAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTc > 2:8725061/1‑140 (MQ=255)
gAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTc < 1:2413468/140‑1 (MQ=255)
gAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTc < 1:6828441/140‑1 (MQ=255)
aaTGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCg > 1:8899852/1‑140 (MQ=255)
gCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGgtgt > 2:651491/1‑140 (MQ=255)
cGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGAGGCTGGCACGAGGATCACTATAGCCTGCTG‑CCCACTGCAAGGCAATTTCGGTGCCTCATATCGCCATTGAAGCAATGGTAAAACGCACGCTCGATAATTGCGTGACTGTGTa < 2:1986467/140‑1 (MQ=255)
gACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTaa < 2:3535775/140‑1 (MQ=255)
gACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTaa < 1:5086854/140‑1 (MQ=255)
gCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACgg < 2:7775143/140‑1 (MQ=255)
cACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGTCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACggg > 2:3863855/1‑140 (MQ=255)
cACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCACTGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACggg > 2:7909351/1‑140 (MQ=255)
cACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACggg > 1:618679/1‑140 (MQ=255)
aCTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGc < 1:7850545/140‑1 (MQ=255)
cTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCg < 1:4343514/140‑1 (MQ=255)
aaCGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGAt < 1:2136186/140‑1 (MQ=255)
aaCGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGAt < 2:7105128/140‑1 (MQ=255)
ggCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAat > 2:4425554/1‑140 (MQ=255)
ggCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAat > 1:3546522/1‑140 (MQ=255)
gCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAata > 1:3137697/1‑140 (MQ=255)
gCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAata > 1:5777156/1‑140 (MQ=255)
gCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAata > 1:9169470/1‑140 (MQ=255)
aaCAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCg > 1:6723470/1‑140 (MQ=255)
aaCAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCg < 1:366438/140‑1 (MQ=255)
cAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCGaa < 2:2877675/140‑1 (MQ=255)
tggctggcACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCGAAAcc > 1:7679769/1‑140 (MQ=255)
ggctggcACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCGAAACCg < 2:5642693/140‑1 (MQ=255)
gctggcACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCGAAACCga < 2:7037047/140‑1 (MQ=255)
ctggcACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCGAAACCgat < 2:539750/140‑1 (MQ=255)
tggcACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCAGTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCGAAACCgatg > 1:8771341/1‑140 (MQ=255)
ggcACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCGAAACCgatga < 2:3690200/140‑1 (MQ=255)
ggcACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCGAAACCgatga > 1:7094782/1‑140 (MQ=255)
ggcACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCGAAACCgatga > 1:7423134/1‑140 (MQ=255)
aCGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCGAAACCGATGATTg < 1:4887212/140‑1 (MQ=255)
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GTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCGAAACCGATGATTGAG < SRR14920173.3899951/151‑1 (MQ=60)
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GCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTATTTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATCTCATCGAAACCGATGATTGAGAGA < SRR14920173.6343163/151‑1 (MQ=60)
GCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCGAAACCGATGATTGAGAGA > SRR14920173.2017099/1‑151 (MQ=60)
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ACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCGAAACCGATGATTGAGAGATGTAAC < SRR14920173.4915596/151‑1 (MQ=60)
ACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCGAAACCGATGATTGAGAGATGTAAC < SRR14920173.4809696/151‑1 (MQ=60)
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CTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCGAAACCGATGATTGAGAGATGTAACGGAATCGCAATGCCATTATCTTTTAAT > SRR14920173.645834/1‑151 (MQ=60)
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TCACTCACAGATTGAAAGCGGTTACATCGCCTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTGCCCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCGAAACCGATGATTGAGAGATGTAACGGAATCGCAATGCCATTATCTTTTAAT > NZ_CP025268/2244642‑2244940
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |