Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R3
|
779 |
308.9 |
10220750 |
96.7% |
9883465 |
138.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
2,244,790 |
(C)6→5 |
pseudogene (915/1042 nt) |
galS ← |
HTH‑type transcriptional regulator GalS |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 2,244,785 | 0 | C | . | 98.8%
| 1190.4
/ 5.1
| 252 | pseudogene (920/1042 nt) | galS | HTH‑type transcriptional regulator GalS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/1); new base . (110/138); total (112/140) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.88e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 278 total aligned reads displayed.
CACAGATTGAAAGCGGTTACATCGCCTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTGCCCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCGAAACCGATGATTGAGAGATGTAACGGAATCG > NZ_CP025268/2244647‑2244920
|
cacaGATTGAAAGCGGTTACATCGCCTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTGcc < 2:1072875/140‑1 (MQ=255)
cacaGATTGAAAGCGGTTACATCGCCTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCAGTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTGcc < 1:3691540/140‑1 (MQ=255)
acaGATTGAAAGCGGTTACATCGCCTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTGccc < 2:3436432/140‑1 (MQ=255)
acaGATTGAAAGCGGTTACATCGCCTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTGccc < 1:2339823/140‑1 (MQ=255)
aTTGAAAGCGGTTACATCGCCTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTGccccctg > 1:558114/1‑138 (MQ=255)
aTTGAAAGCGGTTACATCGCCTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTGccccctg > 2:3771687/1‑138 (MQ=255)
aTTGAAAGCGGTTACATCGCCTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTAGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTGccccctg > 2:4216973/1‑138 (MQ=255)
tGATAGCGGTTACATCGCCTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTGccccctgca > 2:664856/1‑136 (MQ=255)
aaaGCGGTTACATCGCCTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCGTTCTG‑TCCCCTGCAAg > 2:2847971/1‑140 (MQ=255)
aaaGCGGTTACATCGCCTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAg > 1:1481547/1‑140 (MQ=255)
aaaGCGGTTACATCGCCTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAg > 2:2909164/1‑140 (MQ=255)
aaGCGGTTACATCGCCTGATTTGTTGAGTTAGTG‑TCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGc < 2:3523599/140‑1 (MQ=255)
gTTACATCGCCTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGt > 2:4551880/1‑140 (MQ=255)
ttACATCGCCTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGtt < 2:2345857/140‑1 (MQ=255)
tGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTaa > 1:31245/1‑140 (MQ=255)
ttgttgAGTTAGGGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCTGTGGCTAATTTc < 1:4457143/140‑1 (MQ=255)
gttgAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGc < 1:4393755/140‑1 (MQ=255)
ttgAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGCCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGcc > 2:417200/1‑140 (MQ=255)
ttAGTGATCGTCGTCGCATTCTGCCGTGTTGCGACCGCTTGGCGACGCAGTAACGTCGGCAGAAGACTGTTGCTCGCAGGAAGATCAATTTTGCCTGTTG‑ACCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGa < 2:2021017/140‑1 (MQ=255)
ttAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGa < 1:1978255/140‑1 (MQ=255)
ttAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGa < 1:3379515/140‑1 (MQ=255)
ttAGCGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAAAATGGCGCCGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCCCGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCCAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGa < 2:4268104/140‑1 (MQ=255)
gATCGCCGCCGCATTCTGGCTTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCaa < 2:931186/140‑1 (MQ=255)
gATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCaa < 1:203823/140‑1 (MQ=255)
gATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGGTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCaa < 2:877913/140‑1 (MQ=255)
gATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGCTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCaa < 2:4625961/140‑1 (MQ=255)
ccgccgcATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGa > 1:210056/1‑140 (MQ=255)
ccgccgcATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGa < 2:3195527/140‑1 (MQ=255)
ccgccgcATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGa < 1:1628924/140‑1 (MQ=255)
ccgccgcATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGa < 2:4792769/140‑1 (MQ=255)
ccgccgcATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGa > 1:903377/1‑140 (MQ=255)
ccgccgcATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGa < 1:2621033/140‑1 (MQ=255)
ccgcATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATaa > 2:2464390/1‑140 (MQ=255)
gcATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACg < 2:3237211/140‑1 (MQ=255)
aTTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCa < 2:4860537/140‑1 (MQ=255)
aTTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCa < 1:4997537/140‑1 (MQ=255)
aTTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCa < 1:1515255/140‑1 (MQ=255)
aTTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCa < 2:3567436/140‑1 (MQ=255)
aTTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCa < 2:1433812/140‑1 (MQ=255)
tgtTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTa > 1:1982383/1‑140 (MQ=255)
gtTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTaa > 1:4350846/1‑140 (MQ=255)
ttGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCCATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGACCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGTGATAACGCACGGTCGTTAAt > 2:2284555/1‑140 (MQ=255)
ttGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAAt > 1:615493/1‑140 (MQ=255)
ttGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAAt > 2:3081693/1‑140 (MQ=255)
ttGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAAt > 1:3623476/1‑140 (MQ=255)
aGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGt < 1:1247012/140‑1 (MQ=255)
aGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGt < 1:407980/140‑1 (MQ=255)
aGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGt < 1:2544258/140‑1 (MQ=255)
gAATGGCGACGCGTGAGCGTCGGCATAAAACAGTGGGTTGCACGAGGATCAATGTTGCGTGCTG‑CACCCTGCAAGGCCAGTTCGTTGGCTGATGTCGGGATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTc < 2:4698107/140‑1 (MQ=255)
gAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTc < 2:31203/140‑1 (MQ=255)
gAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTc < 1:3960234/140‑1 (MQ=255)
gAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTc < 1:4697245/140‑1 (MQ=255)
gAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTc < 2:2706257/140‑1 (MQ=255)
gAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTc < 2:120343/140‑1 (MQ=255)
gAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTc < 1:3520982/140‑1 (MQ=255)
gAAGGGCGATGCACGTACGTCGGCATAAAACAGTGGCCGGCACGAGGATCAATAGTGCCTGC‑GCCCCCCTGCAAGGCGAGTTAGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTc < 2:2217743/140‑1 (MQ=255)
aaTGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCCGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGTTCGTTAATTGCGGGTCg < 2:4480376/140‑1 (MQ=255)
aaTAGCGACGCACTACCGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCGTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCCTTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTCATTGCGGGTCg < 1:544836/140‑1 (MQ=255)
cGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATggg > 1:2896568/1‑107 (MQ=255)
cACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACggg > 2:2487847/1‑140 (MQ=255)
aCTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGc < 2:1935753/140‑1 (MQ=255)
cTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCTCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCg < 1:4551880/140‑1 (MQ=255)
aaCGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGTAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGAt < 1:3069631/140‑1 (MQ=255)
aaCGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGAt < 1:1776361/140‑1 (MQ=255)
aaCGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGAt < 1:3783611/140‑1 (MQ=255)
aaCGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGAt < 1:744570/140‑1 (MQ=255)
ggCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGGCAGTTTGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAat > 2:1058280/1‑140 (MQ=255)
ggCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGt < 1:4525681/118‑1 (MQ=255)
ggCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGCTGGGAat > 2:746756/1‑140 (MQ=255)
ggCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAat > 2:1702599/1‑140 (MQ=255)
ggCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAat < 1:2723348/140‑1 (MQ=255)
gCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAata > 1:3192351/1‑140 (MQ=255)
gCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAata > 1:2984283/1‑140 (MQ=255)
gCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAata > 2:1366420/1‑140 (MQ=255)
gCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGGTAATTGCGGGCCGGTGTAACGGGCGATGGGAata > 2:1726498/1‑140 (MQ=255)
cATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAatat > 1:1925160/1‑140 (MQ=255)
aaCAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCg < 1:4216974/140‑1 (MQ=255)
aaCAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCg < 1:3315278/140‑1 (MQ=255)
gTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAAGGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCGAAAc > 1:4147642/1‑140 (MQ=255)
tggctggcACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CTCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGACGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCGAAAcc > 2:643473/1‑140 (MQ=255)
tggctggcACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCGAAAcc > 1:4628349/1‑140 (MQ=255)
tggctggcACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCGAAAcc < 2:3922887/140‑1 (MQ=255)
tggctggcACGAGGATCAATATGGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGCTAATTCCGGGTCGGTGTCACGGGCGATGGGAATCTCCTCGAAAcc > 2:466438/1‑140 (MQ=255)
gggctggcACGACGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGGGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCGAAAcc < 1:1616839/139‑1 (MQ=255)
gctggcACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCGAAACCga > 1:4239794/1‑140 (MQ=255)
ggcACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCGAAACCgatga > 1:3908607/1‑140 (MQ=255)
aCGAGGATCAATATTGCCTGCT‑ACCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTCCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCGAAACCGATGATTg < 2:4013051/140‑1 (MQ=255)
tatgATCATTATTGCCTGCTG‑CCCCCTGTAAGGCCAGTTCGTTGGCCAATTTCGCCATTGAAGCAATCGGATAACGCACGGTCGTTAATTCCGGGTCGGTGTATCGGGCGATGCGAATATCCTCGAAACCGATCATTgag < 2:2797398/137‑1 (MQ=255)
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ACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAAC > SRR14920166.3655578/1‑151 (MQ=60)
ataagagacagGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGG < SRR14920166.4535693/140‑1 (MQ=60)
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AGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGG < SRR14920166.1379601/151‑1 (MQ=60)
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AGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGG < SRR14920166.408912/151‑1 (MQ=60)
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GCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAAT > SRR14920166.2331682/1‑151 (MQ=60)
GCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAAT > SRR14920166.3931587/1‑151 (MQ=60)
CACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATA > SRR14920166.2990615/1‑151 (MQ=60)
CACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATA > SRR14920166.3199252/1‑151 (MQ=60)
ACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATAT > SRR14920166.1929147/1‑151 (MQ=60)
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TAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCA < SRR14920166.4227857/151‑1 (MQ=60)
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GGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAAGGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCGAAAC > SRR14920166.4156724/1‑151 (MQ=60)
GCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCGAAACC > SRR14920166.4638524/1‑151 (MQ=60)
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AAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTG‑CCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCGAAACCGATGA > SRR14920166.3917183/1‑151 (MQ=60)
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tgCCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCGAAACCGATGATTGAGAGATGTAACGGAATCGCAATGCCATTATCT < SRR14920166.1298448/149‑1 (MQ=60)
tgCCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCGAAACCGATGATTGAGAGATGTAACGGAATCGCAATGCCATTATCT < SRR14920166.2982061/149‑1 (MQ=60)
CCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCGAAACCGATGATTGAGAGATGTAACGGAATCGTAATGCCATTATCTTTT > SRR14920166.2847702/1‑151 (MQ=60)
CCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCGAAACCGATGATTGAGAGATGTAACGGAATCGCAATGCCATTATCTTTTAA < SRR14920166.3138633/151‑1 (MQ=60)
CTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCGAAACCGATGATTGAGAGATGTAACtgtctcttatacacatctccgagccca > SRR14920166.1015507/1‑124 (MQ=60)
CTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCGAAACCGATGATTGAGAGATGTAACGGAATCGCAATGCCATTATCTTTTAAT > SRR14920166.1211771/1‑151 (MQ=60)
CTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCGAAACCGATGATTGAGAGATGTAACGGAATCGCAATGCCATTATCTTTTAAT > SRR14920166.2423120/1‑151 (MQ=60)
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TCACTCACAGATTGAAAGCGGTTACATCGCCTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTGCCCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTCGCCATTGAAGCAATGGGATAACGCACGGTCGTTAATTGCGGGTCGGTGTAACGGGCGATGGGAATATCATCGAAACCGATGATTGAGAGATGTAACGGAATCGCAATGCCATTATCTTTTAAT > NZ_CP025268/2244642‑2244940
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |