Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R6
|
776 |
393.9 |
12922803 |
98.2% |
12690192 |
138.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,623,038 |
A→G |
*397* (TAA→TAG) |
ydeA → |
L‑arabinose MFS transporter |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,623,038 | 0 | A | G | 100.0%
| 1429.4
/ NA
| 407 | *397* (TAA→TAG) | ydeA | L‑arabinose MFS transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (185/222); total (185/222) |
Only 100 of 409 total aligned reads displayed.
AGGTAATCAGGTGAGTTTGCACTGGTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAATTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCATCAGACGGGAGATCGCTTCAATGCCACCCTTGCCC > NZ_CP025268/1622903‑1623174
|
aggtaATCAGGTGAGTTTGCACTGGTCAATGTCGATGATTGGTTCTGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGa < 1:4909577/140‑1 (MQ=255)
aggtaATCAGGTGAGTTTGCACTGGTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGa < 1:3984130/140‑1 (MQ=255)
aggtaATCAGGTGAGTTTGCACTGGTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAAGTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGa > 2:320159/1‑140 (MQ=255)
taATCAGGTGAGTTTGCACTGGTCAATGTCGATGATTGGTTATGGGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTACTTTGGGCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATCGTTGAAAg > 2:1961348/1‑140 (MQ=255)
aaTCAGGTGAGTTTGCACTGGTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAgg < 2:5035012/140‑1 (MQ=255)
aTCAGGTGAGTTTGCACTGGTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGc > 1:3147779/1‑140 (MQ=255)
tCAGGTGAGTTTGCACTGGTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCACTAGTTGAAAGGcc > 1:1889379/1‑140 (MQ=255)
tCAGGTGAGTTTGCACTGGTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGcc > 2:394121/1‑140 (MQ=255)
aGTTTGCACTGGTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCgg > 2:181729/1‑140 (MQ=255)
ttGCACTGGTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGcc < 1:1380176/140‑1 (MQ=255)
ggTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTa > 2:4171754/1‑140 (MQ=255)
ggTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTa > 1:5582657/1‑140 (MQ=255)
gTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTaa > 2:3588699/1‑140 (MQ=255)
gTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTaa > 1:1284101/1‑140 (MQ=255)
gTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTaa > 1:3411425/1‑140 (MQ=255)
gTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTaa > 1:755283/1‑140 (MQ=255)
gTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTa < 1:3652285/139‑1 (MQ=255)
aTGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATggg < 2:2542814/140‑2 (MQ=255)
aTGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGt < 1:4562658/140‑1 (MQ=255)
aTGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGt < 1:611611/140‑1 (MQ=255)
tGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTa < 1:3039632/140‑1 (MQ=255)
atgatTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGttt > 2:5385646/1‑140 (MQ=255)
atgatTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGttt > 1:4803731/1‑140 (MQ=255)
atgatTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGttt > 1:4974888/1‑140 (MQ=255)
tGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATg < 2:5611845/140‑1 (MQ=255)
tGGGTATGGGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTACTTTGGGCCGGCATTATGTTGCGCCGCGGGCCAGTGACACTCGCAGAACCGACGCACTAGTTGTATGGCCCGGTCGGGCCTTTTGTGATGGGCCGTTTTAATg > 2:1245915/1‑140 (MQ=255)
gTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGAt < 1:3256443/140‑1 (MQ=255)
gTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGACGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGAt > 2:1399398/1‑140 (MQ=255)
tgtgGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTcc > 2:3602607/1‑140 (MQ=255)
tgtgGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTcc > 1:5725708/1‑140 (MQ=255)
gtgGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCa < 1:5430163/140‑1 (MQ=255)
tgGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCCGTGACACTCGAAGAACAGACGCATTAGTTGAATGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTcctg > 2:917153/1‑138 (MQ=255)
tgGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAg > 1:1476330/1‑140 (MQ=255)
gggCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAgg < 2:2203132/140‑1 (MQ=255)
gggCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAgg < 2:3669200/140‑1 (MQ=255)
gggCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAgg < 2:755283/140‑1 (MQ=255)
ggCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGa < 2:2423754/140‑1 (MQ=255)
ggCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGa > 1:793275/1‑140 (MQ=255)
cgcgGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATg > 1:3881956/1‑140 (MQ=255)
ggTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCg > 1:2725320/1‑140 (MQ=255)
gTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTCCGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGt > 1:5965292/1‑140 (MQ=255)
gTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGt < 1:4838101/140‑1 (MQ=255)
gTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGt < 2:1938864/140‑1 (MQ=255)
gTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGt < 1:306324/140‑1 (MQ=255)
gTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGt < 2:108894/140‑1 (MQ=255)
cTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTtaat > 1:11847/1‑140 (MQ=255)
tGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTtaata > 2:1003988/1‑140 (MQ=255)
tGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTtaata < 1:1946261/140‑1 (MQ=255)
cTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTtaataat < 2:1410754/140‑1 (MQ=255)
ttttGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTtaataata < 1:2362724/140‑1 (MQ=255)
ttGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGACAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATaaa < 2:3389798/140‑1 (MQ=255)
tGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCATTAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTATTGGTACGTTTTAATGATTTCCTGGTTGCCGTtaataataatc > 1:5799914/1‑138 (MQ=255)
tGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAAc > 1:3317166/1‑140 (MQ=255)
ccGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTg < 1:253823/140‑1 (MQ=255)
ccGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTg < 2:4072571/140‑1 (MQ=255)
ccGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTg < 1:5042509/140‑1 (MQ=255)
cgcgTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGc < 1:5385646/140‑1 (MQ=255)
gcgTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGca < 2:5163961/140‑1 (MQ=255)
gcgTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGca < 1:2426749/140‑1 (MQ=255)
gcgTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGca < 2:5681219/140‑1 (MQ=255)
gcgTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGca < 2:2725320/140‑1 (MQ=255)
gcgTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGca < 2:1672592/140‑1 (MQ=255)
gcgTTAAATTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGca < 1:1995788/140‑1 (MQ=255)
gcgGTACTTTGGTCACTCATTATCTGTCGCCGCTGGCCAGTGCCACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAACGGCCCATACGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGca < 2:6116937/140‑1 (MQ=255)
cgTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGcac < 2:4459215/140‑1 (MQ=255)
gTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGcaca < 2:4654006/140‑1 (MQ=255)
ttAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCacac < 1:5327435/140‑1 (MQ=255)
ttGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCcata < 2:4383222/140‑1 (MQ=255)
gTCAATCATGATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGACCAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATGTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCcatacat > 2:693290/1‑140 (MQ=255)
aTTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACcagca < 1:85676/140‑1 (MQ=255)
ttCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATcc < 1:882223/140‑1 (MQ=255)
tCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATccc > 1:2060129/1‑140 (MQ=255)
tCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATccc > 1:6347775/1‑140 (MQ=255)
tCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATccc > 2:1903871/1‑140 (MQ=255)
tCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCAGTCGGGCCTTTTTTATTGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATccc > 2:4968735/1‑140 (MQ=255)
cgccgcTGGCCAGTGACACTCGAAGAACATACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCa < 2:2668354/140‑1 (MQ=255)
cgccgcTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGTCGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCa > 2:3760945/1‑140 (MQ=255)
cgccgcTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTg > 2:5859138/1‑111 (MQ=255)
cgccgcTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTg < 1:5859138/111‑1 (MQ=255)
cgccgcTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCa < 1:1714439/140‑1 (MQ=255)
cgccgcTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCa > 1:4145281/1‑140 (MQ=255)
cgccgcTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCa > 2:1507208/1‑140 (MQ=255)
gccgcTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCAt < 2:228154/140‑1 (MQ=255)
ccgcTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCATc < 1:1814359/140‑1 (MQ=255)
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GCGGGTGCGTTGGTAGGTAATCAGGTGAGTTTGCACTGGTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAATTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCATCAGACGGGAGATCGCTTCAATGCCACCCTTGCCCACCAGCCGCATAAT > NZ_CP025268/1622889‑1623188
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |