Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R1
|
782 |
581.3 |
19111616 |
98.4% |
18805830 |
139.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,623,038 |
A→G |
*397* (TAA→TAG) |
ydeA → |
L‑arabinose MFS transporter |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,623,038 | 0 | A | G | 99.5%
| 2181.9
/ NA
| 628 | *397* (TAA→TAG) | ydeA | L‑arabinose MFS transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (301/324); minor base T (1/2); total (302/326) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 634 total aligned reads displayed.
AGGTAATCAGGTGAGTTTGCACTGGTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAATTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCATCAGACGGGAGATCGCTTCAATGCCACCCTTGCCC > NZ_CP025268/1622903‑1623174
|
taATCAGGTGAGTTTGCACTGGTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAg > 1:3421438/1‑140 (MQ=255)
aGTTTGCACTGGTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCgg > 1:2391724/1‑140 (MQ=255)
ttGCACTGGTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGcc < 2:2114375/140‑1 (MQ=255)
ggTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTa > 2:4214295/1‑140 (MQ=255)
ggTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTa > 1:7588624/1‑140 (MQ=255)
gTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGTGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAAGAGTTGAAATGCCCAGTCGGGCCTTTTTTaa > 2:1008435/1‑140 (MQ=255)
gTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCACTAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTaa > 2:1157303/1‑140 (MQ=255)
gTCAATGTCGAGGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTaa < 2:7868676/140‑1 (MQ=255)
gTCAAGGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTGTTGCCGCGTTAATGTGGTCAATCAGTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGTCGCACTAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTaa > 2:3956183/1‑140 (MQ=255)
aTGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGt < 1:4682676/140‑1 (MQ=255)
tGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTa < 1:4766787/140‑1 (MQ=255)
atgatTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGTAGAACAGACGCAATAGTTGAAATGCCCAGTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGttg > 2:5823789/1‑139 (MQ=255)
atgatTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGTACAGACGCTATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGttt > 1:8034427/1‑140 (MQ=255)
atgatTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGttt > 1:2785148/1‑140 (MQ=255)
atgatTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGttt > 2:3413013/1‑140 (MQ=255)
atgatTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATAATTATATATCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGAAGCCATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGttt > 2:8934814/1‑140 (MQ=255)
atgatTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGGTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGttt > 2:232691/1‑140 (MQ=255)
atTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTaa > 1:3903800/1‑140 (MQ=255)
ttGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAAt < 1:6678639/140‑1 (MQ=255)
tGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATg > 2:4376972/1‑140 (MQ=255)
gTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGAt < 2:7070148/140‑1 (MQ=255)
gTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGAt < 2:6653992/140‑1 (MQ=255)
aTGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTc > 2:9154719/1‑140 (MQ=255)
tgGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTATTGGTACGTTTTAATGATTTCCAg > 1:4344605/1‑140 (MQ=255)
gggCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAgg < 1:8749263/140‑1 (MQ=255)
ggCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGa > 1:716671/1‑140 (MQ=255)
cgcgGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATg < 1:4158754/140‑1 (MQ=255)
cgcgGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATg > 2:278480/1‑140 (MQ=255)
cgcgGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATg < 1:2104039/140‑1 (MQ=255)
cgcgGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATGTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATg < 1:9006282/140‑1 (MQ=255)
gcgGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACATACGCAAGAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGc > 2:5429300/1‑140 (MQ=255)
cgGTGCCTGCTTTTGCCGAGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGAAACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCACATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGcc < 2:1758367/140‑1 (MQ=255)
gTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGt < 1:1546600/140‑1 (MQ=255)
gTGCCTGATTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACTCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGACGt < 2:2665714/140‑1 (MQ=255)
cTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGATGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTtaataat > 1:3255562/1‑140 (MQ=255)
ttttGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTTACACTCGAAGAACAGACGCAATCGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTGTTAATGATTTCCAGGATGCCGTtaataata > 2:3021997/1‑140 (MQ=255)
ttttGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTtaataata < 1:4487600/140‑1 (MQ=255)
tGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAAc > 1:5960179/1‑140 (MQ=255)
tGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAAc > 1:4952172/1‑140 (MQ=255)
tGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATAATTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAAc > 2:8070199/1‑140 (MQ=255)
ccGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTg < 2:3258180/140‑1 (MQ=255)
ccGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTg < 1:8628402/140‑1 (MQ=255)
ccGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTg < 1:3215211/140‑1 (MQ=255)
ccGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTg < 1:3569175/140‑1 (MQ=255)
ccGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTg > 2:9408447/1‑140 (MQ=255)
ccGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGATTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTg < 2:4948025/140‑1 (MQ=255)
ccGCGTTAATTTGGTCAATCATTAGATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAAGGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTg < 2:6750249/140‑1 (MQ=255)
gctttAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGca < 2:5266778/137‑1 (MQ=255)
gctttAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGCTACGATTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGca < 2:218971/137‑1 (MQ=255)
gcgTTCACTTGGTCAATCATTCTCGGACGCCGCAGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGACAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTATTAATGATGTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGca < 2:5695636/140‑1 (MQ=255)
gcgTTACTTTGGTCAATCATTATATATCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGca < 1:6214744/140‑1 (MQ=255)
gcgTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGTTTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGca < 1:1896794/140‑1 (MQ=255)
gcgTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGca < 2:3663382/140‑1 (MQ=255)
gcgTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGca < 1:115839/140‑1 (MQ=255)
gcgTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGca < 2:4696705/140‑1 (MQ=255)
gcgTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGca < 1:6413142/140‑1 (MQ=255)
gcgTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGca < 1:5084796/140‑1 (MQ=255)
gcgTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGca < 1:4039489/140‑1 (MQ=255)
gcgTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGca < 1:3694117/140‑1 (MQ=255)
gcgTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGca < 2:8590256/140‑1 (MQ=255)
gcgTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGca < 2:9044495/140‑1 (MQ=255)
gcgTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGGGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGca < 2:2478445/140‑1 (MQ=255)
gTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGcaca < 1:5453537/140‑1 (MQ=255)
gTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCAATCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCAGTTAATAATAAACTGcaca > 2:1383859/1‑140 (MQ=255)
ttAATTTGGTCAATCATTATAATTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCacac < 2:3108772/140‑1 (MQ=255)
ttGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCcata < 2:1527791/140‑1 (MQ=255)
ttGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCAGTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCcata < 1:6484644/140‑1 (MQ=255)
tGGTCAATCATTATAGTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCcatac < 1:9276205/140‑1 (MQ=255)
gTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCcatacat > 2:1984763/1‑140 (MQ=255)
aTTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACACATACATACcagca > 2:7617623/1‑140 (MQ=255)
tataTTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGAAGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAgg < 2:7450970/140‑1 (MQ=255)
tttCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATc > 2:320711/1‑140 (MQ=255)
tCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGTGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCAGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATAACAGCAGGAATcac > 2:8749012/1‑138 (MQ=255)
cgccgcTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATAcc < 1:1022342/127‑1 (MQ=255)
cgccgcTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCTGGAATCCCa > 1:2928780/1‑140 (MQ=255)
cgccgcTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCa < 2:9523013/140‑1 (MQ=255)
cgccgcTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCa > 1:2182840/1‑140 (MQ=255)
cgccgcTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCa > 1:312401/1‑140 (MQ=255)
cgccgcTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCa > 1:5708917/1‑140 (MQ=255)
gccgcTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGca > 1:8418428/1‑112 (MQ=255)
ccgcTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCATc > 1:6886321/1‑140 (MQ=255)
cgcTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAATGGCCCATTCGGGCCTTTTGTAATGGTACGTTTTCATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAAGAATCTGCACACCCATACGTAGCAGCAGGAATcccgtgt > 1:8283096/1‑136 (MQ=255)
cTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACTCCCATACATACCAGCAGGAATCCCATCAGa > 1:2640498/1‑140 (MQ=255)
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TTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGA > SRR14920174.720776/1‑151 (MQ=60)
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TGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGAT < SRR14920174.2551653/151‑1 (MQ=60)
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CTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATCAACTGCACAC > SRR14920174.9234308/1‑151 (MQ=60)
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TCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCA > SRR14920174.288123/1‑151 (MQ=60)
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ATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCATCAGACG > SRR14920174.3265308/1‑151 (MQ=60)
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CGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATACACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCATCAGACGGGAG > SRR14920174.7482896/1‑151 (MQ=60)
GCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAGTTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCATCAGACGGGAGA < SRR14920174.3206371/151‑1 (MQ=60)
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GGCGGGTGCGTTGGTAGGTAATCAGGTGAGTTTGCACTGGTCAATGTCGATGATTGGTTATGTGGGCGCGGTGCCTGCTTTTGCCGCGTTAATTTGGTCAATCATTATATTTCGCCGCTGGCCAGTGACACTCGAAGAACAGACGCAATAATTGAAAGGCCCATTCGGGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCATCAGACGGGAGATCGCTTCAATGCCACCCTTGCCCACCAGCCGCATAAT > NZ_CP025268/1622888‑1623188
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |