Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R6
|
776 |
393.9 |
12922803 |
98.2% |
12690192 |
138.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
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mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
2,828,516 |
+G |
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| |
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position |
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new |
freq |
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reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 2,828,516 | 1 | . | G | 98.4%
| 1249.5
/ 10.4
| 364 | coding (1081/1152 nt) | mltB | lytic murein transglycosylase B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/4); new base G (125/233); total (127/237) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 381 total aligned reads displayed.
TGTCAGTCAAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGTTACT‑TACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCC > NZ_CP025268/2828377‑2828646
|
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tGTCAGTCAAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGctact > 2:2211348/1‑140 (MQ=255)
tGTCAGTCAAAAATTTATGCCGGACAAGAGAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGctact < 2:3479494/140‑1 (MQ=255)
gtcaAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAACAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGctactgtact < 2:2760666/140‑6 (MQ=255)
gtcaAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGctactgtact < 2:2328277/140‑6 (MQ=255)
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aaaGTTATGCCGGACAAGATCGCACTGTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGTTTCAGAAACAAGCGGAGTCGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCGGGTAAATAGCTCCTGTACTCgcgc > 2:1084518/1‑140 (MQ=255)
aaTTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCgcgcc < 2:6070852/140‑1 (MQ=255)
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tGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCgcgccagcg‑cc < 1:6338338/140‑1 (MQ=255)
tGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCgcgccagcg‑cc < 2:4416057/140‑1 (MQ=255)
tGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCgcgccagcg‑cc < 2:6446690/140‑1 (MQ=255)
gACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGc > 1:674067/1‑140 (MQ=255)
gACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGc < 1:3980047/140‑1 (MQ=255)
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aaGAGAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCCGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGACGCTCACGCCCCCCTCTTGTTAAGAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTg < 2:264578/140‑1 (MQ=255)
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tCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGACGCTCACGCCCCCCTCGTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCa > 2:6252021/1‑140 (MQ=255)
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tCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCa > 2:1394181/1‑140 (MQ=255)
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gAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGcc > 2:5475452/1‑140 (MQ=255)
gAAGATGGTGTTGGCGTTGAAATTTTACGAGGAGGATTCAGTAAAAAGCTGATTAGCAAGAGGTAAGCTCACGCCCCCCACTTGTAAATAGATACTGTAATAGCGCCAGCG‑CCACGTC‑TTGTCCTAACTGCAAGACCgac > 2:2083193/1‑138 (MQ=255)
aaGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCa > 2:75881/1‑140 (MQ=255)
aGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGCGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATGAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCAt < 1:2034773/140‑1 (MQ=255)
aGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCAt < 2:1509973/140‑1 (MQ=255)
aGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCAt < 1:2800256/140‑1 (MQ=255)
tGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGc > 2:1946528/1‑140 (MQ=255)
ggTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCg > 1:2116388/1‑140 (MQ=255)
ggTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCg < 1:1230252/140‑1 (MQ=255)
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gCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATggg < 1:4277293/140‑1 (MQ=255)
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tGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCt > 2:3620958/1‑140 (MQ=255)
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gCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGAACACCCCCCCCACTTGTAAATCGCTAAT‑TAC‑CACCCCCCCGCCCCCGGCATTGACATAACTCCCAGACCGCCATGGCTAAATGGTTGAtg > 2:118489/1‑140 (MQ=255)
aTTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTgg < 2:4685978/140‑1 (MQ=255)
ttttACGAGGAGGATTCAGACAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCCCGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGt < 2:2012085/140‑1 (MQ=255)
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aggaTTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGt < 2:5892287/140‑1 (MQ=255)
aggaTTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGt > 2:5231976/1‑140 (MQ=255)
aggaTTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGt < 2:3860462/140‑1 (MQ=255)
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gaTTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGa < 1:2411210/140‑1 (MQ=255)
gaTTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGa < 1:593540/140‑1 (MQ=255)
gaTTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGa < 1:4158514/140‑1 (MQ=255)
ttCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATg > 1:4792496/1‑140 (MQ=255)
gAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGgtgt < 1:2211348/140‑1 (MQ=255)
gATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTACATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCgg < 1:5543143/140‑1 (MQ=255)
gATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCgg < 1:1394313/140‑1 (MQ=255)
gATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCgg < 1:826521/140‑1 (MQ=255)
gATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCgg < 1:2670880/140‑1 (MQ=255)
gATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCgg < 1:3638582/140‑1 (MQ=255)
ttAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCa < 2:1456492/140‑1 (MQ=255)
aGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGa < 1:1826591/140‑1 (MQ=255)
gCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGAc < 2:1591123/140‑1 (MQ=255)
gCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGAc < 1:1435308/140‑1 (MQ=255)
gCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGAc < 2:1677079/140‑1 (MQ=255)
gCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGAc < 2:2893754/140‑1 (MQ=255)
gCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAAGAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGAc < 2:4275583/140‑1 (MQ=255)
agGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTAc > 1:4475778/1‑140 (MQ=255)
agGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTAc < 2:3950502/140‑1 (MQ=255)
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gggAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTAcc < 1:937007/140‑1 (MQ=255)
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gggAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCG‑CCACGGC‑TTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTGGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTAcc > 2:2675692/1‑140 (MQ=255)
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GGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCT < SRR14920171.542494/151‑1 (MQ=60)
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GGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCT > SRR14920171.3023688/1‑151 (MQ=60)
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TGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAANAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAAC < SRR14920171.5705151/151‑1 (MQ=60)
TGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAAC < SRR14920171.1783333/151‑1 (MQ=60)
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GGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAG < SRR14920171.1646706/151‑1 (MQ=60)
GGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAG < SRR14920171.3127433/151‑1 (MQ=60)
GGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGC < SRR14920171.904148/151‑1 (MQ=60)
GGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGC < SRR14920171.44418/151‑1 (MQ=60)
GAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCC < SRR14920171.5594623/151‑1 (MQ=60)
GAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCC < SRR14920171.6274497/151‑1 (MQ=60)
AGCTCACGCCCCCCACTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGG < SRR14920171.1189558/151‑1 (MQ=60)
GCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGT > SRR14920171.2180025/1‑151 (MQ=60)
GCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGT > SRR14920171.429819/1‑151 (MQ=60)
TCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGC < SRR14920171.4431747/151‑1 (MQ=60)
TCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGC < SRR14920171.4783790/151‑1 (MQ=60)
CGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCNTTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAA > SRR14920171.5726731/1‑151 (MQ=60)
CGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCCGTACTGGTAGCCGGTGCCAC > SRR14920171.5880919/1‑151 (MQ=60)
CGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATAGCGTAATCGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAA > SRR14920171.2300578/1‑151 (MQ=60)
CCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACA < SRR14920171.833393/151‑1 (MQ=60)
CCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACA < SRR14920171.862732/151‑1 (MQ=60)
CCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATC > SRR14920171.3755245/1‑151 (MQ=60)
CTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTCCCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAG > SRR14920171.5083252/1‑151 (MQ=60)
CTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAG > SRR14920171.253341/1‑151 (MQ=60)
CTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAG > SRR14920171.2506624/1‑151 (MQ=60)
CTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAG > SRR14920171.5033988/1‑151 (MQ=60)
CTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAG > SRR14920171.4723702/1‑151 (MQ=60)
CTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAG > SRR14920171.5034018/1‑151 (MQ=60)
CTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAG > SRR14920171.4446405/1‑151 (MQ=60)
CTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAG < SRR14920171.1627925/151‑1 (MQ=60)
CTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGAGATGGTGTAGAAGTTCTGCAGACCGTACCAGAACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAG > SRR14920171.6083306/1‑151 (MQ=60)
CTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGctgtctcttatacacatctccg > SRR14920171.4836900/1‑129 (MQ=60)
CTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAGAC > SRR14920171.6044618/1‑151 (MQ=60)
CTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAGAC < SRR14920171.2491750/151‑1 (MQ=60)
CTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAGAC > SRR14920171.2616174/1‑151 (MQ=60)
CTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAGAC < SRR14920171.2622691/151‑1 (MQ=60)
CTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAGAC < SRR14920171.2622643/151‑1 (MQ=60)
CTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAATACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAGAC > SRR14920171.5683562/1‑151 (MQ=60)
TGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGC < SRR14920171.458069/151‑1 (MQ=60)
TGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGAACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGC > SRR14920171.5386915/1‑151 (MQ=60)
GTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCA > SRR14920171.5050984/1‑151 (MQ=60)
AAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGC > SRR14920171.5583060/1‑151 (MQ=60)
AAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGC < SRR14920171.2546398/151‑1 (MQ=60)
AATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAATTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCA > SRR14920171.6079413/1‑151 (MQ=60)
AATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCA > SRR14920171.5889360/1‑151 (MQ=60)
AATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCA > SRR14920171.4401329/1‑151 (MQ=60)
ATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTACTGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCAG < SRR14920171.4955365/151‑1 (MQ=60)
TAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTActgtctcttatacacatctccgagccca > SRR14920171.1048671/1‑123 (MQ=60)
TAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCAGG > SRR14920171.4948218/1‑151 (MQ=60)
TAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCAGG > SRR14920171.2209077/1‑151 (MQ=60)
ACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAGCATCCAGACGCAGCAGGCTGGC > SRR14920171.1740136/1‑151 (MQ=60)
ACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCAGGCTGGC > SRR14920171.3113938/1‑151 (MQ=60)
ACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCAGGCTGGC > SRR14920171.781141/1‑151 (MQ=60)
ACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCAGGCTGGC > SRR14920171.364602/1‑151 (MQ=60)
G‑TACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCAGGCTGGCTTG > SRR14920171.3728889/1‑151 (MQ=60)
G‑TACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCAGGCTGGCTTG < SRR14920171.4491996/151‑1 (MQ=60)
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ATCACAACCTCTGTCAGTCAAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGTTACT‑TACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCAGGCTGGCTTG > NZ_CP025268/2828366‑2828666
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |