Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F21 I1 R6
|
776 |
393.9 |
12922803 |
98.2% |
12690192 |
138.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
RA |
NZ_CP025268 |
3,098,977 |
A→G |
*97* (TAA→TAG) |
yggU → |
DUF167 family protein YggU |
|
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
* | NZ_CP025268 | 3,098,977 | 0 | A | G | 99.1%
| 761.9
/ NA
| 223 | *97* (TAA→TAG) | yggU | DUF167 family protein YggU |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (88/133); minor base T (1/1); total (89/134) |
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 239 total aligned reads displayed.
GTGAAGTTTCTCGGTAAGCAATTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAAGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGATTCCGCTGAAGAAACCGGC > NZ_CP025268/3098840‑3099113
|
gTGAAGTTTCTCGGTAAGCAATTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGt > 2:5681734/1‑140 (MQ=255)
aaGTTTCTCGGTAAGCAATTCCGGGTTTCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATc > 1:3631200/1‑140 (MQ=255)
aaGTTTCTCGGTAAGCAATTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATc > 1:3119038/1‑140 (MQ=255)
aaGTTTCTCGGTAAGCAATTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATc > 1:6227858/1‑140 (MQ=255)
aaGTTTCTCGGTAAGCAATTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATc > 1:1787834/1‑140 (MQ=255)
aGTTTCTCGGTAAGCAATTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTTGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGTCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACACATCCCTCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTATGTATcc < 2:2945243/140‑1 (MQ=255)
aGTTTCTCGGTAAGCAATTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATcc < 2:5349337/140‑1 (MQ=255)
ctcGGTAAGCAATTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGc < 2:833456/140‑1 (MQ=255)
tcGGTAAGCAATTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCa < 2:4296518/140‑1 (MQ=255)
tcGGTAAGCAATTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCa > 1:5173453/1‑140 (MQ=255)
ggTAAGCAATTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCaaa < 1:4324697/140‑1 (MQ=255)
tAAGCAATTCCGGGTTGCCAACAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCaaaaa < 1:2121016/140‑1 (MQ=255)
gCAATTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGtt < 1:5121334/140‑1 (MQ=255)
aTTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTc > 1:1401812/1‑140 (MQ=255)
cGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCg < 1:5297236/140‑1 (MQ=255)
ggTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGNAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCa < 1:6460338/140‑1 (MQ=255)
ggTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCa < 2:5198800/140‑1 (MQ=255)
ggTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCa < 1:4229394/140‑1 (MQ=255)
ggTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCa < 1:821083/140‑1 (MQ=255)
ggTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTGGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCa < 1:5819126/140‑1 (MQ=255)
ccAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCgg > 2:670134/1‑140 (MQ=255)
ccAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCgg < 1:5189597/140‑1 (MQ=255)
ccAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCgg > 2:4033119/1‑140 (MQ=255)
cAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGc < 1:6294254/140‑1 (MQ=255)
cAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGc < 2:1955459/140‑1 (MQ=255)
accgCCAGGTGGTTCATGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTACCCTCAGTAATCCGCAACACATCCCGCCCGACCGCGCGGCGATAATTCATAAGGGCTCCGCGCCAACAAGTGGGCCTCGCACCCGGCaa < 2:4846566/137‑1 (MQ=255)
aaaGCCAGGTTGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCTTTTATACGCAACAAATCACGCCTGATATCGCTGCGTTAATTAATTTGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCTGcta < 2:6228220/140‑3 (MQ=255)
aaaGCCAGGTGGTTATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAAATAAAATCAATAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCaa < 2:5281030/140‑1 (MQ=255)
aaaGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTTATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCaa < 1:5263602/140‑1 (MQ=255)
aaaGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCaa < 2:4438707/140‑1 (MQ=255)
aaaGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCaa < 2:3459751/140‑1 (MQ=255)
aaaGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCaa < 1:3905806/140‑1 (MQ=255)
aaaGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCaa < 1:3415715/140‑1 (MQ=255)
aaaGACAGTTTGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGTCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCTCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATTCAAACAGTTGTAATCGCAACCGGCaa < 2:574108/140‑1 (MQ=255)
aaGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAAt < 2:5501471/140‑1 (MQ=255)
aGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATg < 1:6152754/140‑1 (MQ=255)
ggtggtGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAATCAAATTAAAATCATTAATCCGCTACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAGAATGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCggg > 2:3540151/1‑139 (MQ=255)
ggtggtGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGt > 1:1086341/1‑140 (MQ=255)
ggtggtGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGt > 1:1060652/1‑140 (MQ=255)
ggtggtGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGt > 2:5926599/1‑140 (MQ=255)
ggtggtGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGt > 1:270801/1‑140 (MQ=255)
tgATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGt > 2:3037757/1‑140 (MQ=255)
tgATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGt > 1:2982585/1‑140 (MQ=255)
tgAGTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGGCACAAACAATGTAAAATAATTAATCCGCAACTAATCCCGGCAGAAATCGCGGCGTGAAGTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGAAACCGGCAATGTCGGTAAAgg > 2:2435328/1‑139 (MQ=255)
aTTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCCGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAGAGTTGTCCTCGCAACCGGCACTGTCGGTCAAGTGc > 2:6025246/1‑140 (MQ=255)
aTTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGGTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGc > 2:2843635/1‑140 (MQ=255)
ttGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCATATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCTTCAATGTCGGTAAAGTGCg < 2:1596971/140‑1 (MQ=255)
aaaaGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAATTCATTAATACTCAACAAATCACGCAAGAAATCTCGGCGTTAAGTAGTTAGGTATCCAATGCAAAATGGTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCTGTAAAGTGCGTGAg > 2:6436798/1‑140 (MQ=255)
aaGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTACAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCt < 2:4742693/140‑1 (MQ=255)
ggCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAACTCGCGGCGTTAATTAGTTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTgg < 1:1970452/140‑1 (MQ=255)
cGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCg > 1:4024455/1‑140 (MQ=255)
gAACTTGGCCGCCACAAACACATTAAAATCATTAATCCGCAACAACTCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGt < 2:1125105/140‑1 (MQ=255)
gAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGt < 1:627089/140‑1 (MQ=255)
aCTTGGCCGCCACAAACAAATTCAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCg < 2:1617432/140‑1 (MQ=255)
aCTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCg > 1:5975916/1‑140 (MQ=255)
aCTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCg < 2:2098030/140‑1 (MQ=255)
aCTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCg < 2:2549341/140‑1 (MQ=255)
gccgccACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCgctgct > 1:5304941/1‑140 (MQ=255)
cacaAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCg > 2:4075540/1‑140 (MQ=255)
cacaAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCg > 1:1156989/1‑140 (MQ=255)
caaacaaaTTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGAc > 2:3029638/1‑140 (MQ=255)
aaacaaaTTAAAATCCTTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACt < 2:3717050/140‑1 (MQ=255)
aacaaaTTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACtt < 2:2376953/140‑1 (MQ=255)
aacaaaTTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACtt < 1:69155/140‑1 (MQ=255)
aacaaaTGAAAATCATTAATCCGCAACANATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACtt < 1:5667081/140‑1 (MQ=255)
acaaaTTAAAATCCACAATCCGCAACAAATCCCGCCAGACATCGCGGCGTTAAATAATTAGCTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAACTGCGTGAGCCGGCGTCGCTGCTTACCGACtac < 2:3993518/140‑3 (MQ=255)
acaaaTTAAAATCATTAATCCGCCACAAATCCCGACAGAAATCCCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTc < 2:6232052/140‑1 (MQ=255)
aaTTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGt < 1:4261572/140‑1 (MQ=255)
aTTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTc > 1:4525998/1‑140 (MQ=255)
aTTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTc > 1:3285987/1‑140 (MQ=255)
aaaTCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGa > 2:3200087/1‑140 (MQ=255)
cATTACTCCGCACCACCTCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTACTTAATTAGGTTTCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATc < 2:4962691/140‑1 (MQ=255)
cATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATc < 2:5895952/140‑1 (MQ=255)
cATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATc < 1:1282911/140‑1 (MQ=255)
cATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATc < 2:1404899/140‑1 (MQ=255)
cATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTGAATTAATTAGGTAACCTATGCACAAAGTTGTCCTCGCACCCGGCAATGTCGGTACAGGGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCATGATATc < 2:4447974/140‑1 (MQ=255)
aaTCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTgg < 1:3679862/140‑1 (MQ=255)
aaTCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTAGCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCGTGATATCGTgg > 2:4659872/1‑140 (MQ=255)
tCCGCAAAAAATCCCGCCAGAAATCGCGTCGTTAATTAATTAGGTATACAATGCAAAAAGATGTCCTAGCAACCTGCAATGTATGTAAAGTTCGTGAGCTGGCGTCGCTGATTAGCGACTTAGATCTTGATATCGTGGca > 2:329881/1‑139 (MQ=255)
gCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAAAGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCaa > 1:2873977/1‑140 (MQ=255)
caacaaATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCaaa > 2:4618681/1‑140 (MQ=255)
caacaaATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCaaa > 1:2837875/1‑140 (MQ=255)
aacaaATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAAc > 1:1692623/1‑140 (MQ=255)
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AAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAG < SRR14920171.3923691/151‑1 (MQ=60)
AAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAG < SRR14920171.5182333/151‑1 (MQ=60)
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AAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCGATGCACACAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAG < SRR14920171.3552251/151‑1 (MQ=60)
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CCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCG < SRR14920171.5280387/151‑1 (MQ=60)
CAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGT > SRR14920171.260867/1‑151 (MQ=60)
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ATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGATTCCGCTGAAGAAACCGGCCTGACC < SRR14920171.786834/151‑1 (MQ=60)
TTAATTAGGTATCCGATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGAAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGATTCCGCTGAAGAAACCGGCCTGACCT > SRR14920171.592137/1‑151 (MQ=60)
TAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGATTCCGCTGAAGAAACCGGCCTGACCTT > SRR14920171.3391653/1‑151 (MQ=60)
TTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGATTCCGCTGAAGAAACCGGCCTGACCTTTAT > SRR14920171.1213450/1‑151 (MQ=60)
TAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGGTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGATTCCGCTGAAGAAACCGGCCTGACCTTTATC > SRR14920171.5770480/1‑151 (MQ=60)
TAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGATTCCGCTGAAGAAACCGGCCTGACCTTTATC > SRR14920171.2135511/1‑151 (MQ=60)
TAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGATTCCGCTGAAGAAACCGGCCTGACCTTTATC > SRR14920171.3240444/1‑151 (MQ=60)
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TAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGATTCCGCTGAAGAAACCGGCCTGACCTTTATC > SRR14920171.4844050/1‑151 (MQ=60)
TAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGATTCCGCTGAAGAAACCGGCCTGACCTTTATC > SRR14920171.475809/1‑151 (MQ=60)
AGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGATTCCGCTGAAGAAACCGGCCTGACCTTTATCG < SRR14920171.2016096/151‑1 (MQ=60)
GGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGATTCCNCTGAAGAAACCGGCCTGACCTTTATCGA > SRR14920171.5687424/1‑151 (MQ=60)
GGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGATTCCGCTGAAGAAACCGGCCTGACCTTTATCGA > SRR14920171.3010872/1‑151 (MQ=60)
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AACAGTCATCTGGTGAAGTTTCTCGGTAAGCAATTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAAGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGATTCCGCTGAAGAAACCGGCCTGACCTTTATCGA > NZ_CP025268/3098828‑3099127
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |