Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R5
|
781 |
658.8 |
22969755 |
98.0% |
22510359 |
137.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,626,362 |
A→G |
N71D (AAC→GAC) |
ydeE → |
efflux MFS transporter YdeE |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,626,362 | 0 | A | G | 99.7%
| 2024.8
/ NA
| 594 | N71D (AAC→GAC) | ydeE | efflux MFS transporter YdeE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (323/268); minor base T (0/2); total (324/270) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.07e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 599 total aligned reads displayed.
CTACGCTGCCATTTATGACCATTTACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCAACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTTTTGCTACCGT > NZ_CP025268/1626225‑1626498
|
cTACGCTGCCATTTATGACCATTTACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTcgac < 1:6390180/140‑1 (MQ=255)
cGCTGCCATTTATGACCATTTACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAg < 1:5741392/140‑1 (MQ=255)
cGCTGCCATTTATGACCATTTACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAg < 1:4779129/140‑1 (MQ=255)
gCTGCCATTTATGACCATTTACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGa < 1:7914136/140‑1 (MQ=255)
tGCCATTTATGACCATTTACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGaaa < 2:4914852/140‑1 (MQ=255)
tGCCATTTATGACCATTTACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGaaa > 1:2354198/1‑140 (MQ=255)
ccATTTATGACCATTTACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACg < 1:10005494/140‑1 (MQ=255)
ccATTTATGACCATTTACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACg > 2:6833015/1‑140 (MQ=255)
ccATTTATGACCATTTACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACg > 2:3302428/1‑140 (MQ=255)
ccATTTATGACCATTTACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACg > 2:1691051/1‑140 (MQ=255)
ccATTTATGACCATTTACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACg < 1:712761/140‑1 (MQ=255)
ccATTTATGACCATTTACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACg > 1:2689108/1‑140 (MQ=255)
ccATTTATGACCATTTACTTGAGTCGCCAGTACAGCCGGAGTGTCGATCTCATCGGTGATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTGAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACg < 2:2604390/140‑1 (MQ=255)
aTTTATGACCATTTACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGAGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCt < 2:1792304/140‑1 (MQ=255)
tATGACCATTTACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCtata > 2:7214861/1‑140 (MQ=255)
tttACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCTTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCATGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTg > 2:9146330/1‑140 (MQ=255)
tttACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTATCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTg > 1:4320984/1‑140 (MQ=255)
tttACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTg > 2:2987757/1‑140 (MQ=255)
tatACTTGAGTCGACAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGAAGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACTAGAAACGCTATATGTTACTg > 2:3730268/3‑140 (MQ=255)
tACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTCTTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGc > 2:10252431/1‑140 (MQ=255)
aGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTAc > 2:8384182/1‑140 (MQ=255)
tCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCg > 2:9077028/1‑140 (MQ=255)
ccTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCg > 2:8497160/1‑140 (MQ=255)
ccTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCg > 2:6355098/1‑140 (MQ=255)
ccTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCg > 2:2262034/1‑140 (MQ=255)
ccTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACAGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCg > 1:5313689/1‑140 (MQ=255)
ccTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCAGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACAGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCg > 1:5601352/1‑140 (MQ=255)
ccTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTGTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGTTACGGTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCg > 2:11066175/1‑140 (MQ=255)
ccTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTGTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCGATATGTTACTGGCAATTAACGCCTTAGCCAGCg > 1:1067931/1‑140 (MQ=255)
ccTGAGTGTCGATCTAATAGGTTATGCGATGAGTATTGCGCTCACTCTTGGGGTCGTTTTTAGCGTCGGGTTTGGTGTCCTGGCGGTTTAGTTCGTCAAGTAACGGGTTGGGGTACTGGGAATTTGCGCCTTCGCCAGCg > 2:611623/1‑140 (MQ=255)
cTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGAGGTCAATTGCGCTCACTAGTGGCGTCGTTTTTAGCGTCGGTTTTGGTTTCCTGGCGGATTAGGTGGACAAGTAGCGGGTGGGGTTACTGGGAATGTCCGCCTTCGCCAgggg > 2:2444530/1‑140 (MQ=255)
tGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTAGTCAAGAAACGCTATATGTTAATGGCAATTAACGCCGTCGCCAGCGGt > 1:4063182/1‑140 (MQ=255)
aGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGttt > 2:5354314/1‑140 (MQ=255)
aGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGttt > 2:4622926/1‑140 (MQ=255)
gtgtCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGtttt > 2:7530560/1‑140 (MQ=255)
gtgtCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGtttt > 1:7439424/1‑140 (MQ=255)
gtgtCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCAGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGtttt > 1:3603047/1‑140 (MQ=255)
gtgtCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTAAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCATCGCCAGCGGtttt < 2:7689182/140‑1 (MQ=255)
tgtCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTa < 1:2542560/140‑1 (MQ=255)
gtCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTAt < 2:1612048/140‑1 (MQ=255)
gATCTAATCGGTTATGCGATGACACTTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGGATCCTGTCGGATAAGTACGACAAGAAACGCTATATGGTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGc < 2:1266940/140‑1 (MQ=255)
gATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTATCCTCGGTTTTTGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAAAGCTATATGTTACTGGCAATTAACGCCTTAGCCAGCGGTTTTAtttc > 1:4453983/1‑138 (MQ=255)
gATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGc < 1:3729739/140‑1 (MQ=255)
gATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCGATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGc > 1:5003632/1‑140 (MQ=255)
gATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGGCGGTTTTAGCATCGGTTTTGGTTTCGTGGCGGGTGTGTTCGGCAAGAAAGGCGAGTTGTTACTGGCCATTAGCGCCGTCGCCAGCGGTGTTATTGc > 2:3920226/1‑140 (MQ=255)
aTCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTGTTTAGCCTCGGGTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCGATTTGTTACAGGCAATTACCGCCGTCGCCAGCGGTGTTATTGcc > 2:1002470/1‑140 (MQ=255)
tCTTATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGATTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCa < 1:11442918/140‑1 (MQ=255)
aaTCGGTTATGCGATGACACTTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTa < 1:7837973/140‑1 (MQ=255)
aaTCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTTTCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTa < 1:2158825/140‑1 (MQ=255)
aTCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCGCGGTTTTGGTATACTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCAtttc > 1:1350787/1‑138 (MQ=255)
tCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACt < 2:7907408/140‑1 (MQ=255)
tCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACt < 1:799286/140‑1 (MQ=255)
cGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACtt < 2:673356/140‑1 (MQ=255)
ggTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACttt < 1:2814489/140‑1 (MQ=255)
gTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTa < 1:5874928/140‑1 (MQ=255)
ttATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAg > 1:10296141/1‑140 (MQ=255)
ttATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAg > 2:10765870/1‑140 (MQ=255)
tATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCCAGTACCGCCTTCGCCCGCGGTTTTATTGCCATTACGTTAGt > 1:7634821/1‑140 (MQ=255)
gCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGaa < 2:11385153/140‑1 (MQ=255)
gCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGaa < 1:8663536/140‑1 (MQ=255)
gCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTAGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGaa < 2:4974973/140‑1 (MQ=255)
cccaTTGCGCTCACTATGGGCGTCGTTTTTAGCCTCGCTTACGCTATCCTGGCGGAGAAGTTCGACCAGAAACGCAATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGATTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGt < 2:11142877/137‑1 (MQ=255)
aCAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCCGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGTATAACGt > 1:1795189/1‑140 (MQ=255)
aCAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGt > 1:6468035/1‑140 (MQ=255)
aCAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTAACGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGt > 1:9714199/1‑140 (MQ=255)
aCAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTGTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCCGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGt > 1:4608170/1‑140 (MQ=255)
ttGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCTGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACg < 2:6600031/140‑1 (MQ=255)
ttGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGaag > 2:7025204/1‑138 (MQ=255)
tCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGtt > 1:2973122/1‑140 (MQ=255)
aCTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCAGGCGGATAAGTTCGACAAGAAAAGCTATATGTTACATGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTTCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTtgt > 1:3251154/1‑140 (MQ=255)
tATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAATAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCGTCGCCAGCGGGGTTATTGCCATTACGTTAGTGAATAACGTGACGCGGGTtgtgg > 1:3537812/1‑139 (MQ=255)
gCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCttt > 2:4514088/1‑140 (MQ=255)
tcgtTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCtttttt > 2:10583336/1‑140 (MQ=255)
tcgtTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACATTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTGtttttt > 1:681947/1‑140 (MQ=255)
tcgtTTTTAGCCACGGTTTTGGTATCCAGGCGGATAAGTTCGACAAGAAAAGCTATATGTTAATTGCAATTAACGCCATCGCCAGCGGTTTTATTTCCATTACTTTAGTGTATAAAGTGTCGCTGGTTGTGCTCtttttt > 1:9001207/1‑140 (MQ=255)
cgtTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTg < 1:8231147/140‑1 (MQ=255)
cgtTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTg < 1:10972472/140‑1 (MQ=255)
cgtTTAGAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGTTAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTGACTGGAAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGCTGTGCTCtttggtg < 2:1884947/140‑5 (MQ=255)
gtTTTTTGCGTCGGTTTTGGTATACTGGCGGATTAGGTCGCCAAGATAGGCGTTATGTTACTGGCAATTACCGGCTGCGCCAGCGGTTGTATTGCCATTACTTTAGTGAATTGCGTGAGGGTGGTTGGGCTGGTTTTTgg > 2:8884372/1‑139 (MQ=255)
gtTTTTAGCCTCGGTTTTGGTCTCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTGTTATTGCCATTACTTTAGTGAAAAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGc > 2:5619808/1‑140 (MQ=255)
gtTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTTGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGc > 2:2759844/1‑140 (MQ=255)
gtTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTa > 2:8264548/1‑105 (MQ=255)
gtTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGc > 2:9888976/1‑140 (MQ=255)
gtTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGc > 1:9213769/1‑140 (MQ=255)
gattttAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAAAGCTATATTTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGc > 2:4278515/3‑140 (MQ=255)
tttttAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATTAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCAAGCGGTTTTATTGCGATTACTTTAGTGAATAACGTGTCGCTGGTTTTGCTCTTTTTTGcc < 1:1577608/140‑1 (MQ=255)
tAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCa < 2:9631032/140‑1 (MQ=255)
tAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCa < 1:9498859/140‑1 (MQ=255)
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cGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATAAGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACt > 1:6142688/1‑140 (MQ=255)
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GCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATACTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTAACGCCGTCGCCAGCGGTTTTATTGC > SRR14920170.10749238/1‑151 (MQ=60)
GCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGGTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGC > SRR14920170.11041890/1‑151 (MQ=60)
GTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCGCGGTTTTGGTATACTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTTC > SRR14920170.1362399/1‑151 (MQ=60)
GTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGATTTTAGACTAGGTTTTGGTATCCATGCGGATAATTTCGACAAGAAACGCTATAatttaatttcaattacagccttcgccacccgttattttgccaatac > SRR14920170.4357740/1‑105 (MQ=60)
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TGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACT < SRR14920170.1206412/151‑1 (MQ=60)
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CGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAAC < SRR14920170.2996464/151‑1 (MQ=60)
CGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAAC < SRR14920170.10662621/151‑1 (MQ=60)
CGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAAC < SRR14920170.10594078/151‑1 (MQ=60)
CGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAAC < SRR14920170.4490418/151‑1 (MQ=60)
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GTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACT > SRR14920170.9734220/1‑151 (MQ=60)
GTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATAAGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACT > SRR14920170.6195591/1‑151 (MQ=60)
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TTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTACTCTTTTTTGCCCTCATTAACTG < SRR14920170.4615551/151‑1 (MQ=60)
TTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGC < SRR14920170.5453463/151‑1 (MQ=60)
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CGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCT > SRR14920170.5670789/1‑151 (MQ=60)
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GGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTG < SRR14920170.11256667/151‑1 (MQ=60)
GTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGT > SRR14920170.2865335/1‑151 (MQ=60)
GTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGT > SRR14920170.314240/1‑151 (MQ=60)
GTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGT > SRR14920170.3619411/1‑151 (MQ=60)
TTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTTT > SRR14920170.10623730/1‑151 (MQ=60)
TTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTTT > SRR14920170.5014169/1‑151 (MQ=60)
GGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTTTTG > SRR14920170.10251690/1‑151 (MQ=60)
GGTATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTTTTG > SRR14920170.1137024/1‑151 (MQ=60)
ATCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTTTTGCTA > SRR14920170.8878430/1‑151 (MQ=60)
TCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTTTTGCTAC < SRR14920170.10634103/151‑1 (MQ=60)
TCCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTTTTGCTAC > SRR14920170.10610678/1‑151 (MQ=60)
CCTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTTTTGCTACC > SRR14920170.3578374/1‑151 (MQ=60)
CTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTTTTGCTACCG < SRR14920170.9071011/151‑1 (MQ=60)
CTGGCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTTTTGCTACCG < SRR14920170.9556132/151‑1 (MQ=60)
GCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTTTTGCTACCGTGC < SRR14920170.3517395/151‑1 (MQ=60)
GCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTTTTGCTACCGTGC < SRR14920170.9762447/151‑1 (MQ=60)
GCGGATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTTTTGCTACCGTGC > SRR14920170.8987598/1‑151 (MQ=60)
GATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTTTTGCTACCGTGCTGA > SRR14920170.6037841/1‑151 (MQ=60)
GATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTTTTGCTACCGTGCTGA > SRR14920170.10186025/1‑151 (MQ=60)
GATAAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTTTTGCTACCGTGCTGA > SRR14920170.1985715/1‑151 (MQ=60)
AAGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTTTTGCTACCGTGCTGAAAG < SRR14920170.6508873/151‑1 (MQ=60)
AGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTTTTGCTACCGTGCTGAAAGC > SRR14920170.4970384/1‑151 (MQ=60)
AGTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTTTTGCTACCGTGCTGAAAGC < SRR14920170.2528243/151‑1 (MQ=60)
GTTCGACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTTTTGCTACCGTGCTGAAAGCC < SRR14920170.5904444/151‑1 (MQ=60)
GACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTTTTGCTACCGTGCTGAAAGCCTGGT < SRR14920170.9236636/151‑1 (MQ=60)
GACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTTTTGCTACCGTGCTGAAAGCCTGGT > SRR14920170.8667602/1‑151 (MQ=60)
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ATCGGACGCGGCGCTACGCTGCCATTTATGACCATTTACTTGAGTCGCCAGTACAGCCTGAGTGTCGATCTAATCGGTTATGCGATGACAATTGCGCTCACTATTGGCGTCGTTTTTAGCCTCGGTTTTGGTATCCTGGCGGATAAGTTCAACAAGAAACGCTATATGTTACTGGCAATTACCGCCTTCGCCAGCGGTTTTATTGCCATTACTTTAGTGAATAACGTGACGCTGGTTGTGCTCTTTTTTGCCCTCATTAACTGCGCCTATTCTGTTTTTGCTACCGTGCTGAAAGCCTGGT > NZ_CP025268/1626212‑1626512
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
