Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R5
|
781 |
658.8 |
22969755 |
98.0% |
22510359 |
137.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
3,309,691 |
A→G |
intergenic (‑82/+26) |
nlpI ← / ← pnp |
lipoprotein NlpI/polyribonucleotide nucleotidyltransferase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 3,309,691 | 0 | A | G | 99.8%
| 2106.4
/ ‑6.2
| 605 | intergenic (‑82/+26) | nlpI/pnp | lipoprotein NlpI/polyribonucleotide nucleotidyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (276/326); total (277/328) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 605 total aligned reads displayed.
GCAAGCGTAAGTGCTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAG‑C‑CCC‑CACCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGCCCTGGCGATCAACTTCCAGAAC > NZ_CP025268/3309560‑3309827
|
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cAAGCGTAAGTGCTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCg < 2:9575989/140‑1 (MQ=255)
aaGCGTAAGTGCTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAACAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCgg < 2:4118795/140‑1 (MQ=255)
aaGCGTAAGTGCTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCgg < 1:11134634/140‑1 (MQ=255)
aaGCGTAAGTGCTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCgg < 1:9384667/140‑1 (MQ=255)
aaGCGTAAGTGCTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCgg < 1:5815372/140‑1 (MQ=255)
gCGTAAGTGCTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAg > 2:1613805/1‑140 (MQ=255)
aGTGCTGTCGCAACGCAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGACTGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTCACACGGCGTCCTGCCCGGTGACTAG‑CGCCC‑CGCCGCTGCGGAGGGCac > 2:7976978/1‑139 (MQ=255)
aGTGCTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCaa > 1:9132529/1‑140 (MQ=255)
aGTGCTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCaa > 2:9849237/1‑140 (MQ=255)
aGTGCTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCaa > 2:3815143/1‑140 (MQ=255)
aGTGCTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCaa > 2:3563147/1‑140 (MQ=255)
aGTGCTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCaa > 1:618894/1‑140 (MQ=255)
tCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCaa < 1:8227806/140‑1 (MQ=255)
tCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCaa > 1:4748495/1‑140 (MQ=255)
cGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAAc < 1:6948210/140‑1 (MQ=255)
cGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTAc < 2:3433916/140‑1 (MQ=255)
cGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTAc < 2:2061395/140‑1 (MQ=255)
cGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGGTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTAc < 1:8562258/140‑1 (MQ=255)
aaCACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCg < 2:10415382/140‑1 (MQ=255)
acacCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGc > 2:2324915/1‑140 (MQ=255)
cacCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGcc < 2:7766000/140‑1 (MQ=255)
cacCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGcc < 2:8812240/140‑1 (MQ=255)
cacCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGcc < 1:7978811/140‑1 (MQ=255)
cacCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGcc < 2:8221190/140‑1 (MQ=255)
acCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGccc < 1:2693222/140‑1 (MQ=255)
acCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGGTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGccc < 2:6561825/140‑1 (MQ=255)
gcAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTca < 1:1082832/140‑1 (MQ=255)
cAAAAAACGCTTCATAACCCACACCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGATGCTCACAAGGCGACCTGCCCTGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTcag > 2:8533987/1‑140 (MQ=255)
aGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCg < 1:3035686/140‑1 (MQ=255)
aGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTGACTCGCCCTGTTCAGCAGCCg < 2:9432528/140‑1 (MQ=255)
ggCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCgg < 1:11089499/140‑1 (MQ=255)
gCTTCATGTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGa < 2:10895835/140‑1 (MQ=255)
cTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAg > 1:1566571/1‑140 (MQ=255)
tCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCt < 1:5185481/140‑1 (MQ=255)
tCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGGTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCCGCAGCCGGAGCt > 2:11472007/1‑140 (MQ=255)
aTTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTc < 1:8865920/140‑1 (MQ=255)
cACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGtgc > 1:5606355/1‑140 (MQ=255)
tCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGtgctgc > 1:2357130/1‑140 (MQ=255)
tCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGtgctgc > 2:4208401/1‑140 (MQ=255)
ccGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAAc > 1:4424941/1‑98 (MQ=255)
ccGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTgcag < 2:1400892/140‑1 (MQ=255)
ccGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTgcag < 2:5094858/140‑1 (MQ=255)
ccGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTgcag < 1:7496109/140‑1 (MQ=255)
ccGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGGTCCCGGTTGCTAACACGGCGTCCTGCCCGGTTAACAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTgcag < 2:6786902/140‑1 (MQ=255)
aaGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCCACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGcagcag > 2:5877906/1‑140 (MQ=255)
aaGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGcagcag > 1:4952043/1‑140 (MQ=255)
aaGACCACGGTTGAATGAACGACCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGCCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGcagcag > 2:1283107/1‑140 (MQ=255)
cACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTga > 1:3206392/1‑140 (MQ=255)
cACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTga > 1:9641331/1‑140 (MQ=255)
cACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTga > 1:3972395/1‑140 (MQ=255)
cGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTgaga < 1:2052341/140‑1 (MQ=255)
cGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTgaga > 2:4511424/1‑140 (MQ=255)
cGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTgaga > 2:5674716/1‑140 (MQ=255)
cGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTgaga < 1:1952484/140‑1 (MQ=255)
cGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTgaga > 1:1691256/1‑140 (MQ=255)
cGGTTGAATGAACGTCCTGTTCACGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTgaga > 2:2175210/1‑140 (MQ=255)
aCGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCg > 1:10357502/1‑140 (MQ=255)
cGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGc < 2:7356714/140‑1 (MQ=255)
cGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGc < 1:7372474/140‑1 (MQ=255)
cGTCCAGGTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAACTGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGc < 2:10153024/140‑1 (MQ=255)
gTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGct < 1:6596177/140‑1 (MQ=255)
gTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGct > 2:4898163/1‑140 (MQ=255)
tCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGctt < 1:10616026/140‑1 (MQ=255)
cTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCCAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGcttct > 1:7643757/1‑140 (MQ=255)
cTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGcttct > 1:1160120/1‑140 (MQ=255)
tGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGcttctt < 2:4658486/140‑1 (MQ=255)
tGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGcttctt < 1:6669861/140‑1 (MQ=255)
gTTCCCGGATGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAATAG‑C‑CCCACGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCGGACTCGCCCGGGTCTGCAGCCGGAGCGTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGcttcttg > 2:9737094/1‑139 (MQ=255)
ttCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTa > 1:2828346/1‑140 (MQ=255)
ttCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTa < 1:3815143/140‑1 (MQ=255)
cccGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGt > 1:9894571/1‑128 (MQ=255)
ggTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCt > 1:10008655/1‑140 (MQ=255)
ggTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCt > 1:6412890/1‑140 (MQ=255)
tGCTAACCAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCACCCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAg < 2:1113024/140‑1 (MQ=255)
tGCTAACCAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTccg < 2:7040493/140‑3 (MQ=255)
tGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAg < 1:1427963/140‑1 (MQ=255)
tGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAg < 2:618894/140‑1 (MQ=255)
gCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGTGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCTGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGa < 2:2856363/140‑1 (MQ=255)
gCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGa < 2:9063694/140‑1 (MQ=255)
gCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCC‑CCC‑CGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGa < 2:5283508/140‑1 (MQ=255)
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ATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCCC‑CCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCctgtctcttatacacatctccgagcccacga > SRR14920170.4462796/1‑120 (MQ=60)
ATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCCC‑CCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAG < SRR14920170.8533410/151‑1 (MQ=60)
ATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCCC‑CCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAG < SRR14920170.4943892/151‑1 (MQ=60)
ATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCCC‑CCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAC < SRR14920170.5565434/151‑1 (MQ=60)
TTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCCC‑CCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGC < SRR14920170.5584541/151‑1 (MQ=60)
TCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCCC‑CCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAG < SRR14920170.237930/151‑1 (MQ=60)
TCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCCC‑CCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAG > SRR14920170.2545647/1‑151 (MQ=60)
TCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCCC‑CCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAG > SRR14920170.4994108/1‑151 (MQ=60)
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TGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCCC‑CCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTA > SRR14920170.4222274/1‑151 (MQ=60)
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CTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCCC‑CCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGCCC < SRR14920170.11056055/151‑1 (MQ=60)
CTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCCC‑CCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGCCC < SRR14920170.2465819/151‑1 (MQ=60)
CAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCCC‑CCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGCCCTGGC < SRR14920170.9056860/151‑1 (MQ=60)
ACGGCGTCCTGCCCGGTTAACAGCCCC‑CCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGCCCTGGCG < SRR14920170.768571/151‑1 (MQ=60)
AAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCCC‑CCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGCCCTGGCG < SRR14920170.9545288/151‑1 (MQ=60)
AAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCCC‑CCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGCCCTGGCG < SRR14920170.6831305/151‑1 (MQ=60)
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GCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCCC‑CCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGCCCTGGCGATC > SRR14920170.4259185/1‑151 (MQ=60)
GTCCTGCCCGGTTAAAAGCCCC‑CCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGCCCTGGCGATCAA > SRR14920170.8229397/1‑151 (MQ=60)
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C‑CCC‑CCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGCCCTGGCGATCAACTTCCAGAACTTTCACCG > SRR14920170.4782629/1‑151 (MQ=60)
CC‑CCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGCCCTGGCGATCAACTTCCAGAACTTTCACCGGT > SRR14920170.10538480/1‑151 (MQ=60)
CCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGTCGGATACGGCCCTGGCGATCAACTTCCAGAACTTTCACCGGTAC > SRR14920170.8474994/1‑151 (MQ=60)
CCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGCCCTGGCGATCAACTTCCAGAACTTTCACCGGTAC < SRR14920170.8370167/151‑1 (MQ=60)
|
GGAAGTATTACTACATCCTGCAAGCGTAAGTGCTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAG‑CCC‑CCACCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGCCCTGGCGATCAACTTCCAGAACTTTCACCGGTACT > NZ_CP025268/3309541‑3309840
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |