Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R5
|
781 |
658.8 |
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98.0% |
22510359 |
137.9 |
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BRESEQ :: Evidence
|
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mutation |
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| JC |
NZ_CP025268 |
4,621,394 |
(GAAAGCGGC)1→2 |
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deoA → |
thymidine phosphorylase |
|
| |
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reads (cov) |
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skew |
freq |
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gene |
product |
| * |
? |
NZ_CP025268 |
4621379 = | 49 (0.070) | 769 (1.210) |
126/260 |
0.3 |
95.9% |
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deoA |
thymidine phosphorylase |
| ? | NZ_CP025268 |
= 4621387 |
20 (0.030) | coding (1243/1314 nt) |
deoA |
thymidine phosphorylase |
Only 100 of 827 total aligned reads displayed.
TGCACGTTTCATATGTTCTCCGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCGCCGCTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NZ_CP025268/4621521‑4621379
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gccgcttTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCGATGGTGTCAGATGCCTGACGGCGTCC < NZ_CP025268/4621387‑4621249
GCACGTTTCATATGTTCTCCGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGC > 1:3231270/1‑140
GCACGTTTCATATGTTCTCCGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGC > 1:3666691/1‑140
CGTTTCATATGTTCTCCGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTT > 1:2015723/1‑140
CGTTTCATATGTTCTCCGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTT > 1:1744344/1‑140
CGTTTCATATGTTCTCCGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTAATCGCTGCTACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAAGTGCCGCTTTCACCGCTTg > 2:9424024/1‑139
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TCATATGTTCTCCGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCC < 2:5710937/140‑1
CTCCGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATATGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGC > 2:5373560/1‑140
CTCCGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGC > 2:11242337/1‑140
CTCCGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGC > 1:4311952/1‑140
CTCCGTACTCAGTGATTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTAGCTGATACGGCGATAGACAGTTGTTGTGCTTTACGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCATGC > 2:8765258/1‑140
CGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAG > 2:10265197/1‑140
CGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAG > 2:3255293/1‑140
CGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATACGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTGTCGCCGCTTCCTGCCAG > 1:8233761/1‑140
TCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTT > 1:3944228/1‑140
TCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTT > 2:7801572/1‑140
AGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTT > 2:10079894/1‑140
AGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTT > 1:5241312/1‑140
AGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTT > 1:11417505/1‑140
AGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTT > 1:1078457/1‑140
AGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTT > 2:211002/1‑140
AGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACAGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTT > 2:6434207/1‑140
AGTGCTGCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGGTAGTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTT < 1:9341184/140‑1
GTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTC > 1:2692025/1‑140
GTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTC > 1:8694892/1‑140
GTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTC > 1:1609010/1‑140
GTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGGTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCCGGTGTTTTC > 1:9806661/1‑140
GTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTAGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTC > 2:5844293/1‑140
TGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCCGTTGTTTTCG > 1:1451382/1‑140
GCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGT > 2:5570621/1‑140
tgCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTAATCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTATATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCT > 2:4943370/3‑140
TTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCT > 2:1810995/1‑140
CAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTT > 2:5270633/1‑140
AATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGA < 1:3041202/140‑1
TCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACC > 2:8446719/1‑140
TCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAG < 1:10629857/140‑1
TATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGA > 1:7670787/1‑140
CCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTTATTGCCGCTTTCTCCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCT < 1:1110720/140‑1
CCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCT > 2:8215753/1‑140
CCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGAGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTCTAATTGCCGCATTCACCGCTTTCGCCGCTTCCAGCCAGTTGTTTTCGACTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCT < 2:96470/140‑1
CGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTG > 1:6613245/1‑140
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CGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTG > 1:5737402/1‑140
CGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTG > 2:6613515/1‑140
CGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTG > 1:4997850/1‑140
CGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTG < 1:4208101/140‑1
CGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTG > 1:2859108/1‑140
cTTAGTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGA < 1:7946186/139‑1
TTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTTCAGCTTTAACCGCTTTCTCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGAC > 2:8659551/1‑140
TTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGAC > 2:1049373/1‑140
TTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGAC > 2:4817883/1‑140
TTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGAC > 1:10057445/1‑140
TTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGAC > 1:6808288/1‑140
TTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGAC > 2:6813109/1‑140
TTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCGTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTACTGGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGAC < 1:3814782/140‑1
TTATTCGCNGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGATTTATCGGCAAGTNTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGAC > 1:6134445/1‑140
TATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACC < 1:5478886/140‑1
ttaGCTGATACGGCGATAGACATTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTATTTGGCGCTTTCACCGCTTTAGCCGCTTCCTGCCGGTTGTGTGCGTCTGTCGCGTGGATAACCTCCAGCGGACGCTGACCGT > 2:1646915/4‑140
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TTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGT < 1:2253423/140‑1
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TTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGT > 1:4661865/1‑140
TTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGT > 1:4881932/1‑140
TTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGT > 1:59343/1‑140
TTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGT > 2:274796/1‑140
TTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGT > 1:7887965/1‑140
TTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGT > 2:10707514/1‑140
TTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGT > 2:6913097/1‑140
TTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGGCTTTCGCGTGGATAAGCGCCAGCGGACGCTGACCGT > 1:7159983/1‑140
TTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCGTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTGTCTCCGCTTTCGACGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGTTAACCGCCAGCGGACGCTGCCCGg > 2:7308473/1‑139
ATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTG > 1:7413892/1‑140
ATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTACACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTG > 2:6237523/1‑140
ATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCA > 1:9040867/1‑140
AGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGA < 1:965729/140‑1
AGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGA < 2:2596199/140‑1
AGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCTGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTTCCTGGTCGCCCAGACGCG < 2:804821/140‑1
AGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCG < 1:552029/140‑1
GGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCAT < 2:4138115/140‑1
GGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCAACGCTTTCGCCGCTTCCTGCAAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGTACGCTGACCGTCTACCTGGTCTCCCAGACGCGCCAT < 2:1191615/140‑1
GTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATA < 2:4311952/140‑1
GTGTGCGTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATACCCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATA > 2:3805315/1‑140
TTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAA > 1:10423505/1‑140
TTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAA > 1:11285320/1‑140
GTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCG < 2:350752/140‑1
TGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCGGTAAAGCCGA > 1:6506309/1‑140
TGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGA < 1:8567689/140‑1
TGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGA < 1:4423929/140‑1
TGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGA > 2:1430268/1‑140
CTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACG > 1:8339184/1‑140
CTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACG < 1:3487519/140‑1
TTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCT < 1:1355708/140‑1
GGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTGTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCGGACCGTCGACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAAT < 2:3074401/140‑1
ATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCGATGGTGTC < 1:10199881/140‑1
GCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCAGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCGATTGTGTCAGATGC > 1:24406/1‑140
GCTTTCACCGCATTCGCCGCTTCCTTCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGAGGACGCTGACCGTCTCCCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCGATGTTGTCAGATGC > 2:11065387/1‑140
TTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCGATGGTGTCAGATGCCTG < 2:3344104/140‑1
CGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCGATGGTGTCAGATGCCTGACGGC < 2:4580824/140‑1
cgTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATAGAAGTAAAGCCGACGCTGTACTCGATGGTGTCAGATGCCTGACGGCGT > 2:3634695/3‑140
TTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCGATGGTGTCAGATGCCTGACGGCGTCC > 1:6907526/1‑140
TGCACGTTTCATATGTTCTCCGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCGCCGCTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NZ_CP025268/4621521‑4621379
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gccgcttTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCGATGGTGTCAGATGCCTGACGGCGTCC < NZ_CP025268/4621387‑4621249
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
|---|
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |
GATK/CNVnator alignment
N/A
