Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R1
|
782 |
581.3 |
19111616 |
98.4% |
18805830 |
139.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| JC |
NZ_CP025268 |
4,621,394 |
(GAAAGCGGC)1→2 |
coding (1250/1314 nt) |
deoA → |
thymidine phosphorylase |
|
| |
seq id |
position |
reads (cov) |
reads (cov) |
score |
skew |
freq |
annotation |
gene |
product |
| * |
? |
NZ_CP025268 |
4621379 = | 58 (0.100) | 732 (1.370) |
117/262 |
0.4 |
92.4% |
coding (1235/1314 nt) |
deoA |
thymidine phosphorylase |
| ? | NZ_CP025268 |
= 4621387 |
66 (0.120) | coding (1243/1314 nt) |
deoA |
thymidine phosphorylase |
Only 100 of 751 total aligned reads displayed.
ACGTTTCATATGTTCTCCGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCGCCGCTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NZ_CP025268/4621518‑4621379
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gccgcttTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCGATGGTGTCAGATGCCTGACGGCGTCC < NZ_CP025268/4621387‑4621249
ATATGTTCTCCGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGC > 1:6200922/1‑140
TGTTCTCCGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTC < 1:7695232/140‑1
TTCTCCGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGTCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCT > 2:5320822/1‑140
TTCTCCGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCT > 1:3213303/1‑140
TTCTCCGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCT > 2:4582843/1‑140
CTCCGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCTCCGCTTTCGCCGGTTCCTGg > 1:5953358/1‑139
CTCCGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGC > 2:3141322/1‑140
CTCCGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGC > 1:7853276/1‑140
CTCCGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGC > 1:6659072/1‑140
CTCCGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGC > 1:2910687/1‑140
CTCCGTACTCAGTGCTTCAAATATAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATAAGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCTCCGCTTTCGACGCTTACTGC > 2:8672234/1‑140
CGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAG > 1:577070/1‑140
ACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTG < 1:4830859/140‑1
TCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGC > 1:9016192/1‑132
AGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTT > 1:8039886/1‑140
AGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTT > 2:9493805/1‑140
GTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCTTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTACGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACAGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTC > 1:144680/1‑140
GTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTC > 2:6826466/1‑140
TGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCG > 2:5834910/1‑140
TGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCG > 2:2778275/1‑140
TGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCG > 2:1884602/1‑140
GCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTACGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGT > 2:2228365/1‑140
TTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCT > 2:8290937/1‑140
TTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAAGTGCCGCTTTCACCGCTTGCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCT > 1:2518821/1‑140
ATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCA > 1:4217267/1‑140
AGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCG < 1:7583950/140‑1
TATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGA > 1:5369530/1‑140
ACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGC < 1:4614621/140‑1
CCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTAGCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCT < 2:4324998/140‑1
CGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTG > 1:8284294/1‑140
CGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTG > 1:2064421/1‑140
CGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTG > 2:7807548/1‑140
CGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTG > 1:7018245/1‑140
CGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTG > 2:567423/1‑140
CGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTG > 2:7267905/1‑140
CGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTG > 1:127806/1‑140
GTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGA < 2:7052499/140‑1
TTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCTCCAGCGGACGCTGAC < 2:696206/140‑1
TTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGAC > 1:1563200/1‑140
TTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGAC > 1:8606111/1‑140
TTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGAC > 1:9545768/1‑140
TTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGAC > 2:6310840/1‑140
TTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGAC > 1:2715853/1‑140
TTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGAC > 1:3088910/1‑140
TTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGAC > 1:5319876/1‑140
TATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACC > 2:6156627/1‑140
TTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCNTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGT > 1:5558671/1‑140
TTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGa > 2:3369434/1‑139
TTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGT > 2:4022678/1‑140
TTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGT > 2:8135493/1‑140
TTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGT > 2:4902350/1‑140
TTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGT > 2:3544897/1‑140
TTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGT > 1:1113339/1‑140
TTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGT > 2:1331241/1‑140
TTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGT > 1:8179989/1‑140
CGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCT > 1:448558/1‑140
GCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTA < 2:8880957/140‑1
TGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACC > 2:9208130/1‑140
TGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACC > 2:297312/1‑140
TGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACC > 2:9386812/1‑133
ATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTG > 2:8057498/1‑140
ATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTG > 1:1694639/1‑140
ATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGATTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTG > 2:3853122/1‑140
CGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCC > 1:5045716/1‑140
agcCAGTTGGTGTGCTGTCCGGTGCTGTATCGGCAAGTTTAAGTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGA < 1:7460962/137‑1
AGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGA < 1:2220826/140‑1
AGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGA < 1:5453660/140‑1
AGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGA < 2:8763671/140‑1
AGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCG < 1:6950774/140‑1
GTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGC < 1:3484125/140‑1
GTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGAC < 1:6626097/115‑1
TTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCC > 2:4160474/1‑140
TTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCC > 2:8558481/1‑140
TTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCC > 2:6634455/1‑140
TTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCC > 1:8704432/1‑140
TTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCC < 2:6508395/140‑1
TTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCC > 1:1804722/1‑140
TGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATAT < 1:3801397/140‑1
TGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCA > 2:2072189/1‑140
TTCCTGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAA > 2:3689397/1‑140
TTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAA > 2:5164236/1‑140
TTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAA > 2:2502456/1‑140
TTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAA > 2:7684075/1‑140
GGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCC < 2:7489995/140‑1
TGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCAAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACTCGCCATATCAGTAAAGCCGA > 2:152854/1‑140
CTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACG < 2:5467617/140‑1
CTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACG < 1:3645283/140‑1
TATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTG > 1:9321892/1‑140
GCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATC > 1:6060841/1‑140
AAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCGA < 1:1387791/140‑1
AAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCGA < 2:2676323/140‑1
AAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGGCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCGGTAATCGA < 2:5419204/140‑1
TTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCGATGG > 2:5950600/1‑140
TGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCGATGGTGTCAG > 1:6430654/1‑140
TGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCGATGGTGTCAG < 2:8371969/140‑1
aCCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCGATGGTTGCAGATGCCTGACG > 2:1115568/2‑140
aCCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCGATGGTGTCAGATGCCTGACG < 1:7186482/139‑1
GCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCGATGGTGTCAGATGCCTGACGGCG > 1:1006704/1‑140
TTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCGATGGTGTCAGATGCCTGACGGCGTCC > 1:882497/1‑140
TTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTAGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTACTCGATGGTGTCAGATGCCTGACGGCGTCC > 2:4748360/1‑140
ACGTTTCATATGTTCTCCGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCGCCGCTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NZ_CP025268/4621518‑4621379
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gccgcttTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCGATGGTGTCAGATGCCTGACGGCGTCC < NZ_CP025268/4621387‑4621249
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
|---|
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |
GATK/CNVnator alignment
N/A
