Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R1
|
782 |
581.3 |
19111616 |
98.4% |
18805830 |
139.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,798,989 |
T→C |
*327* (TAA→TAG) |
btuC ← |
vitamin B12 ABC transporter permease BtuC |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,798,989 | 0 | T | C | 99.5%
| 1963.1
/ NA
| 568 | *327* (TAA→TAG) | btuC | vitamin B12 ABC transporter permease BtuC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (320/243); minor base A (1/2); total (322/246) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.81e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 568 total aligned reads displayed.
ACCGGCGAACTTCTCCAGCGTGGTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGTTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGGCGCGCTACAATATCGGCCAGCAGCAATGCGCTCGCCCCTG > NZ_CP025268/1798852‑1799125
|
aCCGGCGAACTTCTCCAGCGTGGTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTa > 1:4558631/1‑140 (MQ=255)
cGGCGAACTTCTCCAGCGTGGTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAAc > 2:7968070/1‑140 (MQ=255)
cGAACTTCTCCAGCGTGGTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTc < 2:3644622/140‑1 (MQ=255)
cGAACTTCTCCAGCGTGGTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTc < 2:3129378/140‑1 (MQ=255)
cGAACTTCTCCAGCGTGGTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTc < 2:1169761/140‑1 (MQ=255)
cGAACTTCTCCAGCGTGGTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCGTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTc < 1:7593925/140‑1 (MQ=255)
cGAACTTCTCCAGCGTGGTCACGTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTc < 1:4334663/140‑1 (MQ=255)
cTTCTCCAGCGTGGTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATAATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGc > 2:282413/1‑140 (MQ=255)
cTTCTCCAGCGTGGTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTATAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGTCTAACGTCCTga > 2:6001090/1‑139 (MQ=255)
ctcCAGCGTGGTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCttt < 1:5634325/140‑1 (MQ=255)
tGGTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATa > 2:784921/1‑140 (MQ=255)
gTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCCGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCCTAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAAc > 1:1359896/1‑140 (MQ=255)
gTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGACTGGAATCTTGCATCGTTTCTCCGGGGTGTGGTCCGTAAAAGTCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTATCAATAAc > 1:3592713/1‑140 (MQ=255)
gTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAAc < 2:1797850/140‑1 (MQ=255)
gTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAAc < 2:2972380/140‑1 (MQ=255)
gTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAAc < 1:4250961/140‑1 (MQ=255)
gTCACTTCACCGTCGATATCGTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAAc < 1:7751106/140‑1 (MQ=255)
tCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAAcc < 1:960841/140‑1 (MQ=255)
gTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAAGAACCAGATAAtcac > 1:3206204/1‑140 (MQ=255)
cGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCg < 2:3361855/140‑1 (MQ=255)
cGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCg > 2:8323837/1‑140 (MQ=255)
cGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCg < 2:2045080/140‑1 (MQ=255)
gATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCCGATAAACACCgg < 1:2108995/140‑1 (MQ=255)
gATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCgg < 1:4111411/140‑1 (MQ=255)
gATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGAGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTATTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCgg < 1:1552619/140‑1 (MQ=255)
gATATCTTACACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCgg < 2:9292728/140‑1 (MQ=255)
atatCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGgc < 1:4699486/140‑1 (MQ=255)
atatCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGgc > 2:2635266/1‑140 (MQ=255)
atatCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGgc < 1:5274955/140‑1 (MQ=255)
atatCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGgc < 1:3487087/140‑1 (MQ=255)
atatCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGgc > 1:296556/1‑140 (MQ=255)
atatCTTTCACTACGGTCGTAAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACAGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGgc > 2:6992093/1‑140 (MQ=255)
atCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGgcgc < 2:5519948/140‑1 (MQ=255)
tCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCa < 2:7297196/140‑1 (MQ=255)
tCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTa > 1:7078678/1‑140 (MQ=255)
tCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTa > 1:268852/1‑140 (MQ=255)
cACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTAAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAAAAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTaa > 1:5659407/1‑140 (MQ=255)
tACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATATACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATCACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGt > 2:7146701/1‑140 (MQ=255)
tACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGt > 1:1019457/1‑140 (MQ=255)
gtcgtcAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCg > 1:8164465/1‑140 (MQ=255)
gtcgtcAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCg > 1:8776257/1‑140 (MQ=255)
gtcgtcAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCg < 2:2340944/140‑1 (MQ=255)
gtcgtcAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCg > 2:6641058/1‑140 (MQ=255)
gtcgtcAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCg < 2:4931222/140‑1 (MQ=255)
gtcgtcAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAAACAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCg > 2:6743436/1‑140 (MQ=255)
tcgtcAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCgg > 2:7602100/1‑140 (MQ=255)
cAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGAc < 1:8649717/140‑1 (MQ=255)
gAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCa < 1:2143980/140‑1 (MQ=255)
tGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGc < 2:5233675/140‑1 (MQ=255)
tGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGc > 1:6111982/1‑140 (MQ=255)
aaTCTTGCTTCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGAACGTC‑TTTTTTCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAAACAGATAAACACCGGCGCACCTAAAGTTGCGGTGACCTCGCCaa > 2:8595157/1‑140 (MQ=255)
tCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATa > 2:8740024/1‑140 (MQ=255)
tGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAgg > 1:203711/1‑140 (MQ=255)
tGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGc > 1:662577/1‑140 (MQ=255)
tGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGc > 1:8886105/1‑140 (MQ=255)
tCGTTTCTACTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGct < 1:5095617/140‑1 (MQ=255)
tctcCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCCGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCg < 2:6495811/140‑1 (MQ=255)
tctcCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCg < 2:2202959/140‑1 (MQ=255)
ctcCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCgg < 1:3679788/140‑1 (MQ=255)
cTGGGTGTGGTGAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTTACGTCCTGCTTTAAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAg < 2:8886997/140‑1 (MQ=255)
cTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAg < 1:1830656/140‑1 (MQ=255)
cTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAg < 1:8501197/140‑1 (MQ=255)
ggTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTa > 2:4312451/1‑140 (MQ=255)
ggTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGcc > 1:5793062/1‑140 (MQ=255)
ggTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGcc > 1:3803346/1‑140 (MQ=255)
ggTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTCTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGcc > 1:7510197/1‑140 (MQ=255)
ggTCAGTAAAAATCTTAGCTGTTAATCATAGACCGTC‑TTTGTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTCACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTATTGcc > 2:1511801/1‑140 (MQ=255)
gTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCa > 1:7362907/1‑140 (MQ=255)
cAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAgg < 2:4611925/140‑1 (MQ=255)
gTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGgcg < 1:8413649/140‑1 (MQ=255)
gTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGgcg < 2:6222950/140‑1 (MQ=255)
gTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGgcg < 1:6964181/140‑1 (MQ=255)
gTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGgcg < 1:9040157/140‑1 (MQ=255)
aaTCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGGCGCGCTa < 1:9303377/140‑1 (MQ=255)
aaTCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGGCGCGCTa < 2:5743389/140‑1 (MQ=255)
cTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGGCGCGCTACaa < 2:5840843/140‑1 (MQ=255)
aGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTCATGCCAGGCGCGCTACAatat > 2:9498725/1‑140 (MQ=255)
aGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGGCGCGCTACAatat > 2:4016125/1‑140 (MQ=255)
aGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGGCGCGCTACAatat > 2:3566872/1‑140 (MQ=255)
tttAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGGCGCGCTACAATATCGGc < 1:5438808/140‑1 (MQ=255)
ttAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGGCGCGCTACAATATCGGcc > 2:4474637/1‑140 (MQ=255)
tAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGGCGCGCTCCAATATCGGCca > 2:3904251/1‑140 (MQ=255)
aTCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGGCGCGCTACAATATCGGCcagc > 2:896729/1‑140 (MQ=255)
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aGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGGCGCGCTACAATATCGGCCAGCAGCaa > 2:8188417/1‑140 (MQ=255)
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TCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGCTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGGCGCGCTACAATATCGGCCAGCAGCAATGCGCTC > SRR14920174.4786448/1‑151 (MQ=60)
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CAACAGCACATTACCGGCGAACTTCTCCAGCGTGGTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTC‑TTTTTGCGGTTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGGCGCGCTACAATATCGGCCAGCAGCAATGCGCTCGCCCCTGCCAGCGCGCAGCC > NZ_CP025268/1798840‑1799138
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
