Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R1
|
782 |
581.3 |
19111616 |
98.4% |
18805830 |
139.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
4,354,806 |
A→G |
*99* (TAA→TAG) |
ghoS → |
type V toxin‑antitoxin system endoribonuclease antitoxin GhoS |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 4,354,806 | 0 | A | G | 99.6%
| 960.9
/ NA
| 278 | *99* (TAA→TAG) | ghoS | type V toxin‑antitoxin system endoribonuclease antitoxin GhoS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (76/201); minor base C (0/1); total (76/202) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 278 total aligned reads displayed.
CCTTCGCAATAACGACATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAACCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATATTCGTTTACTTAGTG > NZ_CP025268/4354670‑4354942
|
ccTTCGCAATAACGACATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCa > 1:9288503/1‑140 (MQ=255)
ttCGCAATAACGACATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCagg < 2:2908677/140‑1 (MQ=255)
tCGCAATAACGACATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCagga < 1:1108027/140‑1 (MQ=255)
tCGCAATAACGACATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCagga < 2:887601/140‑1 (MQ=255)
tCGCAATAACGACATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCagga < 2:5136255/140‑1 (MQ=255)
tCGCAATAACGACATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCagga < 2:4531934/140‑1 (MQ=255)
tCGCAATAACGACATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCagga < 2:3776289/140‑1 (MQ=255)
tCGCAATAACGACATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTGAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCagga < 1:4653047/140‑1 (MQ=255)
cGCAATAACGACATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTGGATGACTATTTCCGTCAGTTGTACAAGTAGCCaggaa < 2:6411278/140‑1 (MQ=255)
aTAACGACATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGAt < 2:6963997/140‑1 (MQ=255)
aTAACGACATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGAt < 2:3905723/140‑1 (MQ=255)
aCATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATaagaag < 2:5374582/140‑1 (MQ=255)
ttAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATa < 2:7541543/140‑1 (MQ=255)
tAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATaa > 2:9357522/1‑140 (MQ=255)
cgaaaGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATaaaaaa < 1:3723061/137‑1 (MQ=255)
cGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATaaaaaa < 1:4380227/140‑1 (MQ=255)
cGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATaaaaaa < 2:8738840/140‑1 (MQ=255)
cGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATaaaaaa < 1:881924/140‑1 (MQ=255)
aaGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATgg < 2:6104146/140‑1 (MQ=255)
gTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGCTATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCa < 1:8093912/140‑1 (MQ=255)
gTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCa < 1:6925643/140‑1 (MQ=255)
gTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCa < 1:6956329/140‑1 (MQ=255)
aTCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTAtt < 2:2302991/140‑1 (MQ=255)
aTCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTAtt < 2:2855033/140‑1 (MQ=255)
aGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTa < 1:1414643/140‑1 (MQ=255)
aaTCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAatat > 1:3493191/1‑140 (MQ=255)
aTCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCCAAAATAtt < 1:3208250/140‑1 (MQ=255)
gCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAAttt > 1:5304214/1‑140 (MQ=255)
gCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAAttt > 2:1782676/1‑140 (MQ=255)
gCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAAttt > 2:6321194/1‑140 (MQ=255)
gCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTAACAAGTAGCCAGGAATGATAAGAAGAACATAAAAAATGTCACTATTCTCTAAAATATTAAttt > 1:7697732/1‑140 (MQ=255)
aaTGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTAt < 1:4319152/140‑1 (MQ=255)
aTGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTAtg < 2:3865444/140‑1 (MQ=255)
catAGACGAACCGGATATTGATAATGACCACAACATTATGACAGTTGATGACAATTTCCGACAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGCTAAGAAGAACCTAAAAAATGCCACTAGTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGa < 2:242802/138‑1 (MQ=255)
cTTAGACTTACCGTATATAGTTATTGACCACAACATTCTCTCAGGTTATTACTATTTCCGTCAGTTTTACTACTAGCCATGAATGATAAGAATAACTTAAAAAATGGAAATATTCTCTAAAATATTAACTTTTTATGTGa < 2:7306475/140‑1 (MQ=255)
cTTAGACTTACCGGATCTTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGa < 1:5471079/140‑1 (MQ=255)
cTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGa < 1:5927962/140‑1 (MQ=255)
cTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGa < 2:4439225/140‑1 (MQ=255)
cTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGa < 2:9001358/140‑1 (MQ=255)
cTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGa < 2:3044545/140‑1 (MQ=255)
cTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGa < 2:6899192/140‑1 (MQ=255)
cTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGa < 1:6229221/140‑1 (MQ=255)
cTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGa < 1:6337946/140‑1 (MQ=255)
cTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGa < 1:3782708/140‑1 (MQ=255)
ttAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGAt < 1:8200076/140‑1 (MQ=255)
ttAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGAt < 2:4596/140‑1 (MQ=255)
ttAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGAt < 1:6712379/140‑1 (MQ=255)
ttAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTAGTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGAt < 2:2387513/140‑1 (MQ=255)
tAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGAtt > 2:4703445/1‑140 (MQ=255)
cTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATTACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACTAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGgtg < 2:4921570/140‑1 (MQ=255)
cTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGgtg < 2:8085198/140‑1 (MQ=255)
aCCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGTATaagaa > 1:5288707/1‑83 (MQ=255)
aCCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGa > 2:5042796/1‑140 (MQ=255)
aCCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGa > 2:2510653/1‑140 (MQ=255)
aCCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGa > 2:7771579/1‑140 (MQ=255)
ccGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGaa > 2:2624135/1‑140 (MQ=255)
ccGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGaa < 2:864977/140‑1 (MQ=255)
gATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACat < 2:9121973/140‑1 (MQ=255)
atatTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACata < 1:459107/140‑1 (MQ=255)
tatTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACatat > 1:1076237/1‑140 (MQ=255)
tGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCt < 2:2401520/140‑1 (MQ=255)
tGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCt < 2:6683344/140‑1 (MQ=255)
ttGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTCTTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTc > 1:7379510/1‑140 (MQ=255)
ttGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTc < 2:6946187/140‑1 (MQ=255)
ttGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTc > 1:2018422/1‑140 (MQ=255)
ttGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTc > 1:6032914/1‑140 (MQ=255)
ttGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTc > 1:470963/1‑140 (MQ=255)
cTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTAt < 2:7933961/140‑1 (MQ=255)
cTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTAt < 1:2421574/140‑1 (MQ=255)
cTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTAt < 1:898737/140‑1 (MQ=255)
cTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTAt < 2:7111974/140‑1 (MQ=255)
tCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATc < 2:1846840/140‑1 (MQ=255)
tCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATc < 2:1369352/140‑1 (MQ=255)
cAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCt > 2:8198539/1‑140 (MQ=255)
aCATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTgg < 2:1827858/140‑1 (MQ=255)
tGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTAtc > 1:2552318/1‑140 (MQ=255)
cAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTca < 1:1859457/140‑1 (MQ=255)
cAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTGTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTca > 1:2260859/1‑140 (MQ=255)
gTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTcaca < 2:4307133/140‑1 (MQ=255)
gTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTcaca < 1:3165947/140‑1 (MQ=255)
gTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTcaca < 2:7212851/140‑1 (MQ=255)
gTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTcaca < 1:662092/140‑1 (MQ=255)
ttGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAATGATAAGAATAACATAAAAATTGGCACTATTCTATAAAATATTAATTTTTTATGTGAGTGGTGTGAAGATATCCTGTGTCAGTTTCTGGTTTATCTaactt > 2:6762340/1‑138 (MQ=255)
ttGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTCTAATATTAATTTTTTATGTGATAGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACAt > 2:2949028/1‑140 (MQ=255)
ttGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTcactt > 2:1947958/1‑138 (MQ=255)
ttGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACAt > 1:1819258/1‑140 (MQ=255)
tgaCTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATgaga < 1:5192453/140‑1 (MQ=255)
tttCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAacac > 1:8264007/1‑140 (MQ=255)
tttCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAacac > 1:7114949/1‑140 (MQ=255)
tttCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAacac > 2:3164905/1‑140 (MQ=255)
ccGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACata < 1:3992184/140‑1 (MQ=255)
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ccGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGAGTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACata > 2:1120709/1‑140 (MQ=255)
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CTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAAC < SRR14920174.4349855/151‑1 (MQ=60)
CTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAAC < SRR14920174.4072514/151‑1 (MQ=60)
CATAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACAGTATGACAGTTGATGACTATTTCCCTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTATAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAAC < SRR14920174.3688895/151‑1 (MQ=60)
gatgtgtataagagacagGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACA < SRR14920174.5408585/133‑1 (MQ=60)
TTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACA < SRR14920174.7020071/151‑1 (MQ=60)
TTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACA < SRR14920174.8246332/151‑1 (MQ=60)
TTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACA < SRR14920174.6750569/151‑1 (MQ=60)
GACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATAT > SRR14920174.1082401/1‑151 (MQ=60)
GACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATAT < SRR14920174.8415601/151‑1 (MQ=60)
CTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCC < SRR14920174.5698878/151‑1 (MQ=60)
CTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCC < SRR14920174.3811995/151‑1 (MQ=60)
TTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCT < SRR14920174.1843018/151‑1 (MQ=60)
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GGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTC > SRR14920174.474083/1‑151 (MQ=60)
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GGAGATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTCTTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTC > SRR14920174.7421277/1‑151 (MQ=60)
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ATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCAT < SRR14920174.461805/151‑1 (MQ=60)
TGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATC < SRR14920174.8789102/151‑1 (MQ=60)
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TGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTT < SRR14920174.532849/151‑1 (MQ=60)
CCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATC > SRR14920174.2566923/1‑151 (MQ=60)
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TCACCATTATGACAGTTGATGACTAATTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTC < SRR14920174.6956266/151‑1 (MQ=60)
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ACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACA > SRR14920174.7100161/1‑151 (MQ=60)
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CATTATGACAGTTGATGACTATTTCAGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACAT > SRR14920174.6356930/1‑151 (MQ=60)
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GCCAGGAAGGATAAGAAGANCATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGNGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACAGATTCGTTTACTTAGTGCATTCCTGGTCGGA > SRR14920174.5634455/1‑151 (MQ=60)
GCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAATCACTTATTCGTTTACTTAGTGCATTCGTGGTCGGT > SRR14920174.6656524/1‑151 (MQ=60)
GCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGGCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATAGTCGTGTACTTTGTGCAGTCCGGGTCGGA > SRR14920174.6656584/1‑151 (MQ=60)
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TGAATGAAAACTCCTTCGCAATAACGACATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAACCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATATTCGTTTACTTAGTGCATTCCTGGTCGGA > NZ_CP025268/4354658‑4354956
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |