Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R1
|
775 |
316.5 |
10245680 |
97.2% |
9958800 |
138.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
2,482,126 |
G→A |
V82V (GTG→GTA) |
dsdX → |
D‑serine transporter DsdX |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 2,482,126 | 0 | G | A | 100.0%
| 945.3
/ NA
| 248 | V82V (GTG→GTA) | dsdX | D‑serine transporter DsdX |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (147/101); total (147/101) |
Only 100 of 248 total aligned reads displayed.
GCTTCTTCGTGGGAACGATGATGGGCATGGGGCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTGTCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTGGGCGTCGTGCTATTGATT > NZ_CP025268/2481990‑2482258
|
gCTTCTTCGTGGGAACGATGATGGGCATGGGGCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATcc > 1:1908136/1‑140 (MQ=255)
gCTTCTTCGTGGGAACGATGATGGGCATGGGGCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATcc > 2:4726944/1‑140 (MQ=255)
cttcttCGTGGGAACGATGATGGGCATGGGGCCCCTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCg < 2:226473/140‑1 (MQ=255)
ggAACGATGATGGGCATGGGGCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCaga < 1:2425825/140‑1 (MQ=255)
ggAACGATGATGGGCATGGGGCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCaga < 1:4622878/140‑1 (MQ=255)
atgatgGGCCTGGTTCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGTAATTGGCGGAAAGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGCAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAAt < 2:2033489/140‑1 (MQ=255)
atgatgGGCATGGGGCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAAt < 1:1760936/140‑1 (MQ=255)
atgGGCATGGGGCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTgg < 1:33600/140‑1 (MQ=255)
gggCATGGGGCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTc > 1:3121827/1‑140 (MQ=255)
ggCATGGGGCCCCTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCt < 1:2593473/140‑1 (MQ=255)
ggCATGGGGCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCt < 1:1234906/140‑1 (MQ=255)
cATGGGGCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGa < 1:3084178/140‑1 (MQ=255)
cATGGGGCCACTGGAGATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAAGTGGCGGAACGGTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGa < 1:2100285/140‑1 (MQ=255)
ggggCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGacac > 1:3815431/1‑140 (MQ=255)
ggCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACtt > 1:2096330/1‑140 (MQ=255)
ccACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCa < 2:2731387/140‑1 (MQ=255)
cACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCaa > 1:45463/1‑140 (MQ=255)
cACTGGATATGGTAAAGGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCaa < 1:2848117/140‑1 (MQ=255)
aCTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAAc > 1:4323789/1‑140 (MQ=255)
tatGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGcc > 2:1348181/1‑140 (MQ=255)
tatGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGcc > 2:931341/1‑140 (MQ=255)
ggTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGGACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGCCTGACACTTCAACGCTGCCGcc > 2:756419/1‑139 (MQ=255)
gTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTg > 1:859515/1‑140 (MQ=255)
aaTGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCt < 2:2154049/140‑1 (MQ=255)
aTGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCtt > 2:1541300/1‑140 (MQ=255)
aTGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCtt > 2:2095310/1‑140 (MQ=255)
aTGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCtt > 2:3104573/1‑140 (MQ=255)
tGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCttt < 2:3485588/140‑1 (MQ=255)
gCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTc > 1:1370488/1‑140 (MQ=255)
tATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAg < 1:3121431/140‑1 (MQ=255)
atggAAAGTGGAATTTGCGGAACGCGGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTGCAGt > 1:536185/4‑140 (MQ=255)
aTTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGt > 2:4412059/1‑140 (MQ=255)
ttGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGtt > 1:3269788/1‑140 (MQ=255)
ttGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGtt > 2:4984537/1‑140 (MQ=255)
ttGAAAGTGGAATTGGCGGAACGATGTGGTGCCTCGCAGCGGTTATCGGCCATGGCACGATACTGGGAAAAAAGATGGAAGTATCCGGGGTCGTAGACAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGtt > 1:3052645/1‑140 (MQ=255)
gAACGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGa < 2:1140869/140‑1 (MQ=255)
gAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGa < 1:109046/140‑1 (MQ=255)
aGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGt > 2:3047853/1‑140 (MQ=255)
aGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGt > 2:2992276/1‑140 (MQ=255)
aGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGt > 2:165337/1‑140 (MQ=255)
aGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGt < 1:2803931/140‑1 (MQ=255)
aGTGGAATCGGCGGCACGCTGGGGTTCCTCGAAGCGCTCATCGGCATTGGCCCGATACTGGCAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGACGCCGAAAGCATTCGTCTGACCCTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGt < 2:3147954/140‑1 (MQ=255)
tGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCa > 1:4869038/1‑140 (MQ=255)
aaTTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTa < 1:111750/140‑1 (MQ=255)
aaTTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTa < 1:1964268/140‑1 (MQ=255)
aaTTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTa < 1:5086013/140‑1 (MQ=255)
aaTTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTa < 1:3603025/140‑1 (MQ=255)
aaTTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTa < 1:2694108/140‑1 (MQ=255)
aaTTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTa < 2:3626667/140‑1 (MQ=255)
gCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGTAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTTGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTg > 2:4623064/1‑140 (MQ=255)
ggAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCt > 1:2274942/1‑140 (MQ=255)
aaCGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTgg > 1:784454/1‑140 (MQ=255)
aaCGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTgg > 1:709399/1‑140 (MQ=255)
aaCGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTgg < 1:126959/140‑1 (MQ=255)
aCGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGt < 2:1052381/140‑1 (MQ=255)
tGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGc < 2:3762150/140‑1 (MQ=255)
ggTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTg < 2:2592890/140‑1 (MQ=255)
ccTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGAttt > 2:4873445/1‑140 (MQ=255)
cTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTtg < 1:3309171/140‑1 (MQ=255)
cTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTtg < 1:2318383/140‑1 (MQ=255)
cGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTtgtg > 1:2349949/1‑140 (MQ=255)
cAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCTACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGc > 1:4256768/1‑140 (MQ=255)
ggTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCa < 2:3366216/140‑1 (MQ=255)
gTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCAc > 1:4118690/1‑140 (MQ=255)
gTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCAc < 1:4822477/140‑1 (MQ=255)
gTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCAc > 2:2576672/1‑140 (MQ=255)
ttATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACg < 2:2945229/140‑1 (MQ=255)
ttATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACg < 2:2838367/140‑1 (MQ=255)
cGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCtgt < 1:983634/140‑1 (MQ=255)
ggCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCtgtt > 2:2359520/1‑140 (MQ=255)
ttGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCtgtttgtt > 1:3366968/1‑140 (MQ=255)
tGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTttgttg > 2:1377934/1‑140 (MQ=255)
tGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTttgttg > 2:3851164/1‑140 (MQ=255)
ggCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTGTCAGTGGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTGGTGGCATCACGCTGTTTGTTGa > 2:2426052/1‑140 (MQ=255)
cACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAg < 2:534633/140‑1 (MQ=255)
aTACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGt < 1:1604210/86‑1 (MQ=255)
aTACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGt > 2:1604210/1‑86 (MQ=255)
aTACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTggg > 2:3030816/1‑140 (MQ=255)
aCTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTGGGcg < 1:3559605/140‑1 (MQ=255)
aCTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTGGGcg < 1:181709/140‑1 (MQ=255)
gggAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTGGGcgtcg < 2:3467188/140‑1 (MQ=255)
ggAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTGGGcgtcgt > 1:4031771/1‑140 (MQ=255)
gAAAAAGGATGGACGTATCCGTGGCCGCAGAAATAATTGGTCTGCCACTTCAACGCTTCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTCCTGGTTGGCCTGATTCGTGGCCTCACGCTTTTTGTTGCAGTGGGCGTCGTg < 2:1415343/140‑1 (MQ=255)
ccaaaaTCATGGAACTATCCGGGGCCGCAGAAAGAAATGCTCTGACACTTCAACGCTGCCGCCGGCTTTCAGTTGATCTCATTATGGAGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTGGGCGTCGTg < 2:4269305/138‑1 (MQ=255)
aaTGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCt > 2:818160/1‑114 (MQ=255)
aaTGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCt < 1:818160/114‑1 (MQ=255)
aaTGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTGGGCGTCGTGCTAt > 1:2224907/1‑140 (MQ=255)
aaTGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTGGGCGTCGTGCTAt > 2:701379/1‑140 (MQ=255)
aaTGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTGGGCGTCGTGCTAt > 2:3125972/1‑140 (MQ=255)
aaTGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTGGGCGTCGTGCTAt > 2:751388/1‑140 (MQ=255)
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AATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATG < SRR14920169.4899083/151‑1 (MQ=60)
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CTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTG > SRR14920169.407410/1‑151 (MQ=60)
GGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCTACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGC > SRR14920169.4267086/1‑151 (MQ=60)
GGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCA > SRR14920169.396502/1‑151 (MQ=60)
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ATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGACGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTGGGCGTCGTGCTATTGATTCCTCTGGCTTTTTCAATT > SRR14920169.4576459/1‑151 (MQ=60)
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CTGTTGCTGGCCAGCTTCTTCGTGGGAACGATGATGGGCATGGGGCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTGTCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTGGGCGTCGTGCTATTGATTCCTCTGGCTTTTTCAATT > NZ_CP025268/2481977‑2482276
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |