Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R3
|
778 |
586.6 |
19747158 |
98.0% |
19352214 |
137.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
2,482,126 |
G→A |
V82V (GTG→GTA) |
dsdX → |
D‑serine transporter DsdX |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 2,482,126 | 0 | G | A | 99.3%
| 2302.8
/ NA
| 596 | V82V (GTG→GTA) | dsdX | D‑serine transporter DsdX |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (336/253); minor base C (3/1); total (341/255) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.39e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 597 total aligned reads displayed.
AGCTTCTTCGTGGGAACGATGATGGGCATGGGGCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTGTCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTGGGCGTCGTGCTATTGATTCCTC > NZ_CP025268/2481989‑2482262
|
cttcttCGTGGGAACGATGATGGGCATGGGGCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCg > 1:2888026/1‑140 (MQ=255)
cttcGTGGGATCGATGATGGGCATGGGGCCACTGGATATGGTAACTGCTATTGAAAGTTGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCgggg < 2:6251216/140‑1 (MQ=255)
cGTGGGAACGATGATGGGCATGGGGCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCg < 2:4404282/140‑1 (MQ=255)
ggAACGATGATGGGCATGGGGCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCaga < 2:8165289/140‑1 (MQ=255)
ggAACGATGATGGGCATGGGGCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCaga < 2:1701121/140‑1 (MQ=255)
ggAACGATGATGGGCATGGGGCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCaga > 1:8768594/1‑140 (MQ=255)
ggCATGGGGCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCt < 2:2324444/140‑1 (MQ=255)
cATGGGGCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGa < 1:7090386/140‑1 (MQ=255)
aTGGGGCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGac > 2:8882195/1‑140 (MQ=255)
tGGGGCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGaca > 1:6232700/1‑140 (MQ=255)
ggggCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGacac > 1:7864870/1‑140 (MQ=255)
ggggCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGacac > 2:8530432/1‑140 (MQ=255)
ggggCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGacac > 1:9800804/1‑140 (MQ=255)
aCTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAAc > 2:2089907/1‑140 (MQ=255)
cTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACg > 1:2043237/1‑140 (MQ=255)
tatGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAGAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAAGTGGTCTGACACTTCAACGCTggc > 2:7528306/1‑138 (MQ=255)
tatGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGcc > 2:4732424/1‑140 (MQ=255)
tatGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGcc > 2:872147/1‑140 (MQ=255)
tatGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGcc > 1:4246068/1‑140 (MQ=255)
tGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGc < 2:4884892/140‑1 (MQ=255)
ggTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCt > 1:3816545/1‑140 (MQ=255)
gTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTg > 2:8443050/1‑140 (MQ=255)
gTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTg > 1:6076545/1‑140 (MQ=255)
gTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTg > 2:5210780/1‑140 (MQ=255)
aaTGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCt < 1:5118916/140‑1 (MQ=255)
aTGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCtt > 2:1151031/1‑140 (MQ=255)
aTGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCtt > 1:9642066/1‑140 (MQ=255)
aTGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCtt > 2:599870/1‑140 (MQ=255)
aTGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCtt > 2:9041208/1‑140 (MQ=255)
aTGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCtt > 2:5848939/1‑140 (MQ=255)
aTGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCtt > 2:3416419/1‑140 (MQ=255)
tGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCttt < 1:1011692/140‑1 (MQ=255)
aTTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGt > 2:682642/1‑140 (MQ=255)
aTTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGt < 1:1618698/140‑1 (MQ=255)
aTTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGt > 1:72283/1‑140 (MQ=255)
ttGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAg > 1:5555315/1‑140 (MQ=255)
ttGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGACTTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGtt > 2:939766/1‑140 (MQ=255)
ttGAAAGGGGAATGGGCGGAACGCTGGGGTTCCACGCAGCG‑‑GTTAGCGGCCTTGGCACGATACTGGGAACCATGATGGACGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATAGGTCTGACGCTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGtt > 2:1851672/1‑140 (MQ=255)
gtGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTCTCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAAGTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGtt > 2:147343/2‑140 (MQ=255)
gAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGa < 1:1429930/140‑1 (MQ=255)
gAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGa < 2:6972999/140‑1 (MQ=255)
aGTGGAATTGGCGGAACGCTTGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCTCAGAAAGAATTGGTCTGACACGTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGt > 2:2777593/1‑140 (MQ=255)
aGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGt > 1:6400284/1‑140 (MQ=255)
aGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGt < 1:651912/140‑1 (MQ=255)
aGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGt < 2:3634707/140‑1 (MQ=255)
aGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGt > 1:6650395/1‑140 (MQ=255)
aGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGt > 1:478475/1‑140 (MQ=255)
aGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGt > 2:2665358/1‑140 (MQ=255)
aGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGt > 1:3667880/1‑140 (MQ=255)
ggAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGAGGTCAt > 1:1244734/1‑140 (MQ=255)
aaTTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTa < 1:5787176/140‑1 (MQ=255)
aaTTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTa < 1:3450868/140‑1 (MQ=255)
aaTTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTa > 2:5483359/1‑140 (MQ=255)
aaTTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTa < 1:7387658/140‑1 (MQ=255)
ggCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGt < 1:2516247/140‑1 (MQ=255)
ggCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGt > 1:6733957/1‑140 (MQ=255)
aaCGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACTATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCAGTATGGTGCTgg > 1:2784522/1‑140 (MQ=255)
aCGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGt > 1:8205608/1‑140 (MQ=255)
aCGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGt > 1:931506/1‑140 (MQ=255)
ccTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGAttt > 2:5094579/1‑140 (MQ=255)
ccTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGAttt > 1:3992875/1‑140 (MQ=255)
gCAGCG‑‑GTAATCGGCCAAGGCCCGAGACTGGGAAAAATGATGGAAGGATCCGGGGCCGCAGAAAGAAGTGGTCTGACACGACACCGCTGCCGCTGGCCTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTgg < 2:7864870/140‑1 (MQ=255)
gCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCAt > 1:2633123/1‑140 (MQ=255)
gCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCAt > 2:5783488/1‑140 (MQ=255)
gTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAATGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTGTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATccc > 2:3172968/1‑138 (MQ=255)
gTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCAc > 1:9522358/1‑140 (MQ=255)
gTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCAc < 1:8573069/140‑1 (MQ=255)
gTTATCGCCCAAGCCACGAGACTGCCCAAAAAGACCGAAGTATCCGCTGCCGCAGACATAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTATCAGTTGATGACATTATGGTGCTGGGTGGCCTGAATTGTGGCATCAc < 2:9268418/140‑1 (MQ=255)
ttATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACg > 1:550724/1‑140 (MQ=255)
ttATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACg < 2:1999230/140‑1 (MQ=255)
aTCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCt < 1:5216227/140‑1 (MQ=255)
aTCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCt < 2:388840/140‑1 (MQ=255)
ccTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCtgtttg < 1:1115091/140‑1 (MQ=255)
ccTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCtgtttg < 2:257495/140‑1 (MQ=255)
ccTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCtgtttg < 1:3105619/140‑1 (MQ=255)
ccTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCtgtttg > 1:4435423/1‑140 (MQ=255)
tGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTttgttg > 1:8687907/1‑140 (MQ=255)
ggCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGa > 1:1963395/1‑140 (MQ=255)
cACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAACGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGATGGCTTTCAGTTGAAGACATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCAACACGCTGTTTGTTGAAg < 2:4092547/140‑1 (MQ=255)
aTACTGGGAAAAATGATGTAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAAGTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTGTAAGTTGATGTCATTATGGTGCTGTTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTggg > 2:7993521/1‑140 (MQ=255)
aTACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTggg > 1:2149640/1‑140 (MQ=255)
aTACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTggg > 2:2475817/1‑140 (MQ=255)
aTACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTggg > 1:2395439/1‑140 (MQ=255)
aTACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTggg > 1:8984048/1‑140 (MQ=255)
aTACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTggg > 2:825615/1‑140 (MQ=255)
aCTGGGAAAAATGATGGAAGGATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTGGGcg < 1:7949791/140‑1 (MQ=255)
tGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTGGGcgtc > 2:4382576/1‑140 (MQ=255)
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GGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTT > SRR14920172.6656551/1‑151 (MQ=60)
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ATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTGGGCGTCGTGCTATTGATTCCTCTGGCTTTTTCAATT > SRR14920172.1310852/1‑151 (MQ=60)
|
GCTGTTGCTGGCCAGCTTCTTCGTGGGAACGATGATGGGCATGGGGCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCG‑‑GTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTGTCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTGGGCGTCGTGCTATTGATTCCTCTGGCTTTTTCAATT > NZ_CP025268/2481976‑2482276
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |