Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F1 I1 R1
|
258 |
516.3 |
22354760 |
99.3% |
22198276 |
151.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
5,116,457 |
G→A |
A482V (GCC→GTC) |
ftsI ← |
peptidoglycan D,D‑transpeptidase FtsI |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 5,116,457 | 0 | G | A | 85.3%
| 2023.2
/ 237.8
| 586 | A482V (GCC→GTC) | ftsI | peptidoglycan D,D‑transpeptidase FtsI |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (38/48); new base A (269/231); total (307/279) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.03e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.72e-01 |
Only 100 of 597 total aligned reads displayed.
AGCCCGCCTTGCTCGGCTCGTCGATCACCACGACCATCGCGATGCGCGGATCGGTGGCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGGCGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTGGAAGCCACTTCCGGCGAGATCACCTGCACGCCATCCGGCACGCGGTCGACTCGGGTCATGCTCAGCGGCA > NC_008463/5116308‑5116607
|
cccGCCTTGCTCGGCTCGTCGATCACCACGACCATCGCGATGCGCGGATCGGTGGCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCcgacgg > 1:1181883/1‑151 (MQ=255)
gCCTTGCTCGGCTCGTCGATCACCACGACCATCGCGATGCGCGGATCGGTGGCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGt > 1:1636322/1‑151 (MQ=255)
ccTTGCTCGGCTCGTCGATCACCACGACCATCGCGATGCGCGGATCGGTGGCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTg > 1:4189863/1‑151 (MQ=255)
cTTGCTCGGCTCGTCGATCACCACGACCATCGCGATGCGCGGATCGGTGGCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTgg > 1:3095802/1‑151 (MQ=255)
ttGCTCGGCTCGTCGATCACCACGACCATCGCGATGCGCGGATCGGTGGCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGt < 1:9252348/151‑1 (MQ=255)
tGCTCGGCTCGTCGATCACCACGACCATCGCGATGCGCGGATCGGTGGCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTa > 2:4077602/1‑151 (MQ=255)
gctcggctcgTCGATCACCACGACCATCGCGATGCGCGGATCGGTGGCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATCGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGCCCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGGCGGCGTGGTaa > 2:6833771/1‑151 (MQ=255)
gctcggctcgTCGATCACCACGACCATCGCGATGCGCGGATCGGTGGCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGGCGGCGTGGTaa > 1:4052699/1‑151 (MQ=255)
ggctcgTCGATCACCACGACCATCGCGATGCGCGGATCGGTGGCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCg > 1:8748197/1‑151 (MQ=255)
ggctcgTCGATCACCACGACCATCGCGATGCGCGGATCGGTGGCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCg < 2:3099180/151‑1 (MQ=255)
gctcgTCGATCACCACGACCATCGCGATGCGCGGATCGGTGGCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCgg < 2:8846681/151‑1 (MQ=255)
gctcgTCGATCACCACGACCATCGCGATGCGCGGATCGGTGGCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCgg > 2:5720066/1‑151 (MQ=255)
tcgtcgATCACCACGACCATCGCGATGCGCGGATCGGTGGCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCa > 1:8582459/1‑151 (MQ=255)
gtcgATCACCACGACCATCGCGATGCGCGGATCGGTGGCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCAcc > 1:3701801/1‑151 (MQ=255)
tcgATCACCACGACCATCGCGATGCGCGGATCGGTGGCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCt > 1:1859952/1‑151 (MQ=255)
gATCACCACGACCATCGCGATGCGCGGATCGGTGGCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGGAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTgg < 2:8299152/151‑1 (MQ=255)
aCCATCGCGATGCGCGGATCGGTGGCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGGCGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAaca < 1:9810008/151‑1 (MQ=255)
aCCATCGCGATGCGCGGATCGGTGGCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAaca > 1:6050377/1‑151 (MQ=255)
ccATCGCGATGCGCGGATCGGTGGCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAacac > 2:1526164/1‑151 (MQ=255)
ccATCGCGATGCGCGGATCGGTGGCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAacac > 1:7304957/1‑151 (MQ=255)
cATCGCGATGCGCGGATCGGTGGCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACAcc > 1:666902/1‑151 (MQ=255)
tCGCGATGCGCGGATCGGTGGCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACAcccc < 1:4737788/151‑1 (MQ=255)
tCGCGATGCGCGGATCGGTGGCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACAcccc < 1:639504/151‑1 (MQ=255)
cgcgATGCGCGGATCGGTGGCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCg > 1:2480537/1‑151 (MQ=255)
cgATGCGCGGATCGGTGGCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGcc > 1:5252602/1‑151 (MQ=255)
gATGCGCGGATCGGTGGCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGGCGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGccc > 2:672010/1‑151 (MQ=255)
aTGCGCGGATCGGTGGCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGGCGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCt < 1:11119178/151‑1 (MQ=255)
aTGCGCGGATCGGTGGCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCt > 1:803556/1‑151 (MQ=255)
gcgcGGATCGGTGGCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTgg > 1:6581944/1‑151 (MQ=255)
gcgGATCGGTGGCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGc < 1:7952006/151‑1 (MQ=255)
gcgGATCGGTGGCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGc > 2:2848459/1‑151 (MQ=255)
gATCGGTGGCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTc < 1:4366308/151‑1 (MQ=255)
aTCGGTGGCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCg < 2:2178157/151‑1 (MQ=255)
gCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACtt > 1:4453959/1‑151 (MQ=255)
cGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCTGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACttgt > 2:6044510/1‑151 (MQ=255)
cGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACttgt > 2:5329415/1‑151 (MQ=255)
gggCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACttgttg < 2:7430015/151‑1 (MQ=255)
gCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTgca < 2:4838609/151‑1 (MQ=255)
gAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGGCGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTgcagc < 1:2933134/151‑1 (MQ=255)
gAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTgcagc < 1:498555/151‑1 (MQ=255)
aaaCCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGGCGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTgcagca < 1:7006064/151‑1 (MQ=255)
aaCCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGGCGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCAt < 2:5065719/151‑1 (MQ=255)
aaCCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCAt < 1:5572943/151‑1 (MQ=255)
aaCCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCAt > 2:7220090/1‑151 (MQ=255)
ccGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGc < 1:10175121/151‑1 (MQ=255)
ggCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGccc > 1:9510971/1‑151 (MQ=255)
gCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGGCGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCt < 2:467706/151‑1 (MQ=255)
gAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGc > 1:8169531/1‑151 (MQ=255)
cAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACg > 2:1754044/1‑151 (MQ=255)
cAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACg < 2:1930434/151‑1 (MQ=255)
gcgagcgaTAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGt > 1:7174851/1‑151 (MQ=255)
cgagcgaTAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTg > 2:426083/1‑151 (MQ=255)
gagcgaTAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTgg > 1:3473275/1‑151 (MQ=255)
agcgaTAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGGCGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTGGa > 2:10172351/1‑151 (MQ=255)
cgaTAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTGGAAg > 1:8862818/1‑151 (MQ=255)
aTAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTGGAAGcc > 2:7657258/1‑151 (MQ=255)
aGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTGGAAGCCAc > 2:5205370/1‑151 (MQ=255)
aGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTGGAAGCCAc > 2:805037/1‑151 (MQ=255)
aGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTGGAAGCCAc > 2:6376561/1‑151 (MQ=255)
ggCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTGGAAGCCACt > 1:9975274/1‑151 (MQ=255)
gCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTGGAAGCCACtt < 1:969965/151‑1 (MQ=255)
ttttCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTGGAAGCCACTTCCg < 1:3575102/151‑1 (MQ=255)
tttCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTGGAAGCCACTTCCgg < 2:10622760/151‑1 (MQ=255)
ttCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTGGAAGCCACTTCCGGc > 1:10970198/1‑151 (MQ=255)
ccGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTGGAAGCCACTTCCGGCgag > 2:4317258/1‑151 (MQ=255)
cGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTGGAAGCCACTTCCGGCgaga < 1:4892844/151‑1 (MQ=255)
gTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTGGAAGCCACTTCCGGCGAGATc < 2:9393963/151‑1 (MQ=255)
gTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTGGAAGCCACTTCCGGCGAGATc > 2:11101774/1‑151 (MQ=255)
gTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTGGAAGCCACTTCCGGCGAGATc > 2:8620778/1‑151 (MQ=255)
gTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTGGAAGCCACTTCCGGCGAGATc > 1:10063498/1‑151 (MQ=255)
tAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGGCGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTGGAAGCCACTTCCGGCGAGATCa < 1:744265/151‑1 (MQ=255)
tAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTGGAAGCCACTTCCGGCGAGATCa < 1:9141636/151‑1 (MQ=255)
gCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGGCGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTGGAAGCCACTTCCGGCGAGATCAcc < 1:10400216/151‑1 (MQ=255)
cccTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTGGAAGCCACTTCCGGCGAGATCACCt < 2:341921/151‑1 (MQ=255)
ccTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTGGAAGCCACTTCCGGCGAGATCACCTg > 2:1244342/1‑151 (MQ=255)
ttGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTGGAAGCCACTTCCGGCGAGATCACCTGCa < 1:8414217/151‑1 (MQ=255)
tGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTGGAAGCCACTTCCGGCGAGATCACCTGCAc < 1:3200520/151‑1 (MQ=255)
ggTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTGGAAGCCACTTCCGGCGAGATCACCTGCACg > 2:2448102/1‑151 (MQ=255)
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gTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTGGAAGCCACTTCCGGCGAGATCACATGCACGc > 2:9171989/1‑151 (MQ=255)
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CGCGGATCGGTGGCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGG < SRR18135069.2433149/151‑1 (MQ=60)
CGCGGATCGGTGGCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGG < SRR18135069.772791/151‑1 (MQ=60)
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GAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGC > SRR18135069.8482985/1‑151 (MQ=60)
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GTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTGGAAGCCACTTCCGGCGAGATC > SRR18135069.4453485/1‑151 (MQ=60)
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TAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTGGAAGCCACTTCCGGCGAGATCA > SRR18135069.199944/1‑151 (MQ=60)
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AGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTGGAAGCCACTTCCGGCGAGATCAC < SRR18135069.7601193/151‑1 (MQ=60)
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CCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTGGAAGCCACTTCCGGCGAGATCACCT > SRR18135069.10033528/1‑151 (MQ=60)
CCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGGCGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTGGAAGCCACTTCCGGCGAGATCACCTG > SRR18135069.1773567/1‑151 (MQ=60)
CCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTGGAAGCCACTTCCGGCGAGATCACCTG < SRR18135069.1119767/151‑1 (MQ=60)
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CCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGACGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTGGAAGCCACTTCCGGCGAGATCACCTGCACGCCAT > SRR18135069.10907751/1‑151 (MQ=60)
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TAGCCCGCCTTGCTCGGCTCGTCGATCACCACGACCATCGCGATGCGCGGATCGGTGGCCGGGGCGAAACCGGCGAACAGCGAGCGATAGGCGTTTTCCCGGTAGCCCTTGGTGCCGACCGAGACCTTGCGCGCGGTCCCGCTCTTGCCGGCGGCGTGGTAACCCGGCACCTGGGCGCGGAACACCCCGCCCTGGGCCTCGACCACTTGTTGCAGCATGCCCTGCACGGTGGAAGCCACTTCCGGCGAGATCACCTGCACGCCATCCGGCACGCGGTCGACTCGGGTCATGCTCAGCGGCA > NC_008463/5116307‑5116607
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
