Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
258 |
497.4 |
21541912 |
99.2% |
21369576 |
151.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
2,040,296 |
(G)10→11 |
coding (148/1017 nt) |
PA14_RS09495 → |
glycosyltransferase family 4 protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 2,040,286 | 1 | . | G | 94.9%
| 1106.0
/ 43.4
| 295 | coding (138/1017 nt) | PA14_RS09495 | glycosyltransferase family 4 protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (11/4); new base G (135/145); total (146/149) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.72e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 339 total aligned reads displayed.
AGCATCAACAATAATGAACTTCTGGTTTTGGCTTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GT‑‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCTTGGCTTTCTAGACGATCATGGCC > NC_008463/2040136‑2040431
|
aacaaTAATGAACTTCTGGTTTTGGCTTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GT‑‑gggggg < 2:9542281/151‑1 (MQ=255)
acaaTAATGAACTTCTGGTTTTGGCTTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GT‑‑ggggggg < 2:5592500/151‑1 (MQ=255)
acaaTAATGAACTTCTGGTTTTGGCTTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GT‑‑ggggggg > 1:3515755/1‑151 (MQ=255)
caaTAATGAAATTCTGGTTTTGGCGTCCAGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACAGGAGTTCTGCGAAGATACGCTTATGCTCGAAGATTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTATCTCTCACTATGTACCTACACCCC‑GT‑‑gggtgggg > 2:5193048/1‑151 (MQ=255)
aataatGAACTTCTGGTTTTGGCTTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GT‑‑ggggggggg < 2:552407/151‑1 (MQ=255)
aataatGAACTTCTGGTTTTGGCTTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GT‑‑ggggggggg > 2:8593442/1‑151 (MQ=255)
ataatGAACTTCTGGTTTTGGCTTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GT‑‑gggggggggg < 2:935671/151‑1 (MQ=255)
atGAACTTCTGGTTTTGGCTTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGACCGTAGCTCTCACTCGGTACCTAAACCAC‑GT‑‑gggggggggggtg > 2:7057587/1‑148 (MQ=255)
tGAACTTCTGGTTTTGGCTTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GT‑‑gggggggggggtgg > 1:6116805/1‑147 (MQ=255)
aCTTCTGGTTTTGGCTTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTGGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTa > 1:3012509/1‑151 (MQ=255)
cTTCTGGTTTTGGCTTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTAt > 1:7252516/1‑151 (MQ=255)
tCTGGTTTTGGCTTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGCTACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTACCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCg > 2:3847166/1‑151 (MQ=255)
tCTGGTTTTGGCTTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCg > 1:9815202/1‑151 (MQ=255)
tCTGGTTTTGGCTTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCg > 2:8208436/1‑151 (MQ=255)
tCTGGTTTTGGCTTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCg > 1:629834/1‑151 (MQ=255)
gTTTTGGCTTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTAt > 2:9088408/1‑151 (MQ=255)
gTTTTGGCTTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTAt > 1:4060153/1‑151 (MQ=255)
ttttGGCTTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATg > 2:7478504/1‑151 (MQ=255)
ttGGCTTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAg > 1:1526252/1‑151 (MQ=255)
ggCTTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCATTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGtt < 2:10095599/151‑1 (MQ=255)
cTTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGACCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACACC‑GTG‑GGGGGGGGGGTGGGCAATCGTTATGAGtta > 2:7217932/1‑150 (MQ=255)
tCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTAATGAGTTTCCt > 2:5732763/1‑151 (MQ=255)
tCCCGGAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTGTGGCGCGTAGCTTGATGGACGGTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTACt > 2:10385196/1‑151 (MQ=255)
ccGTATTTATGGGGCTTTCATTAGTCTTGACCGGCGGTCTGCGTCGTTACGCGTTGGCGCGTTGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACACGGTACCTACACCCCGGG‑‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTAc < 2:2539368/151‑1 (MQ=255)
cGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACt > 1:3348741/1‑151 (MQ=255)
cGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACt > 1:6977885/1‑151 (MQ=255)
gTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTg > 2:4299220/1‑151 (MQ=255)
gTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTg > 1:494625/1‑151 (MQ=255)
gTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTg > 2:9032328/1‑151 (MQ=255)
tAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTgg < 2:5048237/151‑1 (MQ=255)
aGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGt < 2:7638143/151‑1 (MQ=255)
aGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGt > 1:5972048/1‑151 (MQ=255)
ttATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGttt > 1:9550824/1‑151 (MQ=255)
tGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGCTGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCCCTCGGTACCTCCACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGc < 2:2080347/151‑1 (MQ=255)
tGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGCAGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGc < 2:9113032/151‑1 (MQ=255)
gCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGAt < 2:605139/151‑1 (MQ=255)
ctttctttAGTCTTTACCGGAGGTCTGCGTCGATCCGCTTGGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCATGGCCCTTAGCTCCCACCCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGAtt < 2:4537329/151‑1 (MQ=255)
ctttctttAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGAtt < 1:2225784/151‑1 (MQ=255)
tttctttAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTc > 1:1920543/1‑151 (MQ=255)
tctttAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTg > 1:7421548/1‑151 (MQ=255)
tAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTggcgg < 1:476347/151‑1 (MQ=255)
aGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTgggggc > 2:4998445/1‑151 (MQ=255)
ttGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCtt < 1:2614055/151‑1 (MQ=255)
tGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGGG‑‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTg > 1:948824/1‑151 (MQ=255)
tGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTg < 2:638396/151‑1 (MQ=255)
aCCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGt > 1:5148743/1‑151 (MQ=255)
ccGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTAATGGTTTTGCTGATTATGGCGGCCCTTGGTc > 2:9464565/1‑151 (MQ=255)
ggAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCaa > 1:1467477/1‑151 (MQ=255)
aGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGt > 2:3285073/1‑151 (MQ=255)
aGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGt < 2:9768061/151‑1 (MQ=255)
ggTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTg < 1:9101608/151‑1 (MQ=255)
gTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGa > 1:883592/1‑151 (MQ=255)
tCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAg > 1:995543/1‑151 (MQ=255)
cTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGc > 1:7922651/1‑151 (MQ=255)
tGCGTCTATACGCTTTGGCGCGTATCTTGATGGACGTTCCCATTGCCCGTAGCTCTACATCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCt < 2:10543538/151‑1 (MQ=255)
tGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCt > 1:1078289/1‑151 (MQ=255)
tGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCt < 2:1341981/151‑1 (MQ=255)
tGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCt > 1:10212379/1‑151 (MQ=255)
cGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTgg > 1:4663427/1‑151 (MQ=255)
gTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATTAGTTTACTACTGGTTTTGCTGATTATTGCGGCCCATGGTCAAGTGAGCTggg > 1:8764217/1‑151 (MQ=255)
gTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTggg > 1:8165992/1‑151 (MQ=255)
gATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCCGGG‑‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACt > 1:1650610/1‑151 (MQ=255)
gATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACt > 1:5037050/1‑151 (MQ=255)
aTACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCATACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACta > 2:9256557/1‑151 (MQ=255)
tccGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACtat < 2:6883577/149‑1 (MQ=255)
tACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACtat > 1:4376138/1‑151 (MQ=255)
aCGCTTTGGCGCGTCGCTTGAGGGACGGTCCCACTGCCCGTAGCTCACAACCGGTAACTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACtata < 2:6570771/151‑1 (MQ=255)
cGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATAc < 1:3826394/151‑1 (MQ=255)
cTTTGTCTCGTAGCTTGATGGCCGGTCCAATTTCCCGTAGCTCTCTCTCGTTAACTAAACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTGTCCTACTGGTTTGGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGt < 2:473831/151‑1 (MQ=255)
cTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGt > 1:3211886/1‑151 (MQ=255)
tttGGCGCGTAGCTTGATGTAGGTTCCCAAGGCCCGTTGCTCACACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTg < 2:7966345/151‑1 (MQ=255)
tttGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTg < 1:9052392/151‑1 (MQ=255)
cgcgTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGGTATGAGTTTCCTACTGGGTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGGGAGCTGGGACTATAGGTGGGCGt > 2:4356837/1‑151 (MQ=255)
cgTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTg > 2:3702068/1‑151 (MQ=255)
tAGCTTGATGGCCGTTCCCAATGCCCGTTGCTCCCCCCCGGTACCCACACCCC‑GTGGGGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGc < 1:690026/151‑1 (MQ=255)
aGCTTGATGGCCGTTCCCAATGACCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTa < 2:3201855/151‑1 (MQ=255)
tGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGATAGGTg < 1:8246037/151‑1 (MQ=255)
ggACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTgg > 1:6033546/1‑151 (MQ=255)
gACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACGCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGt < 2:2300202/151‑1 (MQ=255)
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tCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGT‑GGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTgg < 1:8541756/151‑1 (MQ=255)
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TTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCT > SRR18135086.3183981/1‑151 (MQ=60)
TTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCT > SRR18135086.8034785/1‑151 (MQ=60)
TCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTG > SRR18135086.1376939/1‑151 (MQ=60)
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TCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTG > SRR18135086.6589824/1‑151 (MQ=60)
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TTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGC < SRR18135086.9978237/151‑1 (MQ=60)
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TAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGG < SRR18135086.478711/151‑1 (MQ=60)
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GTAGCTCTCACTCGGTACCGACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTC < SRR18135086.8299339/151‑1 (MQ=60)
TTGCTCACACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCT < SRR18135086.914296/151‑1 (MQ=60)
AGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCTT < SRR18135086.2600650/151‑1 (MQ=60)
AGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCTT < SRR18135086.820994/151‑1 (MQ=60)
AGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCTT > SRR18135086.8241095/1‑151 (MQ=60)
CTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCTTGG > SRR18135086.10402416/1‑151 (MQ=60)
CTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGAATATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCTTGG > SRR18135086.3751102/1‑151 (MQ=60)
TCACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCTTGGCTT > SRR18135086.6467394/1‑151 (MQ=60)
CACTCGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCTTGGCTTT < SRR18135086.8822683/151‑1 (MQ=60)
CGGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCTTGGCTTTCTAG > SRR18135086.5794321/1‑151 (MQ=60)
GGTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCTTGGCTTTCTAGA < SRR18135086.3944142/151‑1 (MQ=60)
GTACCTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCTTGGCTTTCTAGAC > SRR18135086.5352572/1‑151 (MQ=60)
CTACACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCTTGGCTTTCTAGACGATC > SRR18135086.4341281/1‑151 (MQ=60)
ACCCC‑GTG‑GGGGGGGGGGTGGCAATCGTTATGAGTTTACTACAGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTTCTAGGTGCTGGTATTGGCATTTCGGTTCGTGGCGTTATAGACGATCATGG > SRR18135086.3266654/1‑151 (MQ=60)
CCC‑GTG‑GGGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCTTGGCTTTCTAGACGATCATGGCC > SRR18135086.2246092/1‑151 (MQ=60)
C‑GTG‑GGGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTAAACGTGGGCGTTTCTAGGTGCTGGTATTGGCAATGCGGTTCTTGGCTTTCTAGACGATCATGGCCAT > SRR18135086.4787821/1‑151 (MQ=60)
gtgGGGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCTTGGCTTTCTAGACGATCATGGCCATA < SRR18135086.5429987/148‑1 (MQ=60)
tgGGGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCTTGGCTTTCTAGACGATCATGGCCATAT < SRR18135086.1900022/149‑1 (MQ=60)
GGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCTTGGCTTTCTAGACGATCATGGCCATATCGCAGCA < SRR18135086.5409939/151‑1 (MQ=60)
GGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCTTGGCTTTCTAGACGATCATGGCCATATCGCAGCA > SRR18135086.3174747/1‑151 (MQ=60)
GGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCTTGGCTTTCTAGACGATCATGGCCATATCGCAGCAC < SRR18135086.2506134/151‑1 (MQ=60)
GGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCTTGGCTTTCTAGACGATCATGGCCATATCGCAGCACG > SRR18135086.10364506/1‑151 (MQ=60)
GGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCTTGGCTTTCTAGACGATCATGGCCATATCGCAGCACGC > SRR18135086.6970602/1‑151 (MQ=60)
GGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCTTGGCTTTCTAGACGATCATGGCCATATCGCAGCACGC > SRR18135086.8775305/1‑151 (MQ=60)
GGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCTTGGCTTTCTAGACGATCATGGCCATATCGCAGCACGC > SRR18135086.8096563/1‑151 (MQ=60)
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TAATGAACTTCTGGTTTTGGCTTCCCGTAGTTATGGGGCTTTCTTTAGTCTTGACCGGAGGTCTGCGTCGATACGCTTTGGCGCGTAGCTTGATGGACGTTCCCAATGCCCGTAGCTCTCACTCGGTACCTACACCCC‑GT‑‑GGGGGGGGGGTGGCTATCGTTATGAGTTTCCTACTGGTTTTGCTGATTCTGGCGGCCCTTGGTCAAGTGAGCTGGGACTATACGTGGGCGTTGCTAGGTGCTGGTATTGGCATTGCGGTTCTTGGCTTTCTAGACGATCATGGCCATATCGCAGCACGC > NC_008463/2040147‑2040445
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |