Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F1 I1 R1
|
259 |
502.6 |
21734322 |
99.3% |
21582181 |
151.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
2,885,933 |
G→C |
G71G (GGG→GGC) |
gcvH → |
glycine cleavage system protein GcvH |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 2,885,933 | 0 | G | C | 99.8%
| 1915.8
/ ‑4.5
| 502 | G71G (GGG→GGC) | gcvH | glycine cleavage system protein GcvH |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base C (207/294); total (207/295) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.89e-01 |
Only 100 of 502 total aligned reads displayed.
CCGTCGGCATCACCGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGGGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGAAAAGCTGCTCGACCAGGCCGCCTACGACCGCCTG > NC_008463/2885785‑2886080
|
ccGTCGGCATCACCGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGa < 2:7041266/151‑1 (MQ=255)
ccGTCGGCATCACCGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGa < 1:10842605/151‑1 (MQ=255)
cGTCGGCATCACCGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGCTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAg < 2:4609028/151‑1 (MQ=255)
gTCGGCATCACCGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAgg > 2:5952866/1‑151 (MQ=255)
tCGGCATCACCGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGGCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAggt > 2:4719931/1‑151 (MQ=255)
cGGCATCACCGCCTACGCCCCGGACGCCCTCGGTGACGTGGGATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAggtg < 2:3193596/151‑1 (MQ=255)
cGGCATCACCGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAggtg > 2:10719387/1‑151 (MQ=255)
cGGCATCACCGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAggtg < 1:7101376/151‑1 (MQ=255)
gCATCACCGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAggtggt < 1:1350725/151‑1 (MQ=255)
tCACCGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGc < 1:6913288/151‑1 (MQ=255)
tCACCGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGc > 1:2833417/1‑151 (MQ=255)
aCCGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGa > 1:2482419/1‑151 (MQ=255)
ccGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGAt < 2:4023335/151‑1 (MQ=255)
gCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCa < 1:9824903/151‑1 (MQ=255)
ccTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCaa > 1:5533090/1‑151 (MQ=255)
cTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAac > 1:566553/1‑151 (MQ=255)
aCGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAacga < 1:3617597/151‑1 (MQ=255)
cGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAacgac < 1:9778607/151‑1 (MQ=255)
cGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAacgac < 2:1742007/151‑1 (MQ=255)
cGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAacgac > 2:2036181/1‑151 (MQ=255)
gCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAacgacg < 1:4299980/151‑1 (MQ=255)
ccAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGAcgcg < 2:4985167/151‑1 (MQ=255)
aGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCt < 2:5815815/151‑1 (MQ=255)
aCGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGcc > 2:3725725/1‑151 (MQ=255)
cGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCg < 1:3316401/151‑1 (MQ=255)
ccTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGAc < 1:8736372/151‑1 (MQ=255)
ccTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGAc < 2:3300177/151‑1 (MQ=255)
ccTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAACGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGAc < 1:4403419/151‑1 (MQ=255)
ccTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGGTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGAc < 2:6167248/151‑1 (MQ=255)
aCGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGa > 1:8458151/1‑151 (MQ=255)
cGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAg < 1:9043450/151‑1 (MQ=255)
cGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAg > 2:7805605/1‑151 (MQ=255)
gTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGc > 1:7896565/1‑151 (MQ=255)
gTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGc > 2:9071247/1‑151 (MQ=255)
tGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCt < 1:4745534/151‑1 (MQ=255)
ggTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTg > 1:6398436/1‑151 (MQ=255)
ggTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTg < 1:3838364/151‑1 (MQ=255)
tATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGt > 2:4828307/1‑151 (MQ=255)
tATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGt < 2:8600813/151‑1 (MQ=255)
tATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGt > 1:7614301/1‑151 (MQ=255)
tGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCa < 2:2770428/151‑1 (MQ=255)
cAGATGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAgg < 1:8001359/151‑1 (MQ=255)
aGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGa > 1:8672025/1‑151 (MQ=255)
aGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGa > 1:352321/1‑151 (MQ=255)
gTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGAc < 2:1891652/151‑1 (MQ=255)
gTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGAc > 1:1557953/1‑151 (MQ=255)
gAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCg > 2:1388294/1‑151 (MQ=255)
gAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCg > 2:816933/1‑151 (MQ=255)
ggCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAgg < 1:8204255/151‑1 (MQ=255)
cGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGcc > 2:6678865/1‑151 (MQ=255)
gAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCt > 1:5399922/1‑151 (MQ=255)
aaCACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGTCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGATGGTCGGCGAGGTGGTAGCGATCAGCGACGCGCTGCCGGACGCCGCGGAGCTGGTCGCCAAGGACCCACTCGGCGAGGCCTg > 2:10536753/1‑151 (MQ=255)
aaCACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTg > 2:5358470/1‑151 (MQ=255)
acacGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACCTCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTgg < 2:9609342/151‑1 (MQ=255)
acacGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTgg > 1:4608825/1‑151 (MQ=255)
ccgccgGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGttctt < 2:3866094/151‑1 (MQ=255)
gccgGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTcttcc < 2:1168710/151‑1 (MQ=255)
cgGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTcttccgc > 2:7774392/1‑151 (MQ=255)
cgGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTcttccgc < 1:3099355/151‑1 (MQ=255)
ggCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTcttccgct < 1:10464185/151‑1 (MQ=255)
aGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTcttccgcttcc < 2:1463127/151‑1 (MQ=255)
gTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTcttccgcttccg > 1:10316000/1‑151 (MQ=255)
gTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTcttccgcttccg < 1:4059635/151‑1 (MQ=255)
gAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTtccgtc > 1:73107/1‑151 (MQ=255)
aaGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTtccgtcc < 2:2330017/151‑1 (MQ=255)
ggCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGcc < 2:10286250/151‑1 (MQ=255)
ggTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGAc > 2:9248934/1‑151 (MQ=255)
gCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGcc < 1:1160227/151‑1 (MQ=255)
cTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCg < 1:8950480/151‑1 (MQ=255)
ggAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCACCATCCAGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGgc < 1:1931778/151‑1 (MQ=255)
ggAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGgc < 1:2760144/151‑1 (MQ=255)
ggAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGgc < 1:4937567/151‑1 (MQ=255)
tCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCt > 2:2960817/1‑151 (MQ=255)
cGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGCTCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTg < 2:10511487/151‑1 (MQ=255)
cGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTg < 1:6157783/151‑1 (MQ=255)
cGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTg < 2:5250240/151‑1 (MQ=255)
tCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGa < 2:4471672/151‑1 (MQ=255)
aGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGaaaa < 2:10818004/151‑1 (MQ=255)
ccgccAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGTCGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGACTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGAAAAgct < 1:2075593/151‑1 (MQ=255)
gccAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGAAAAgctgc < 1:9299191/151‑1 (MQ=255)
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CGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTG > SRR18135085.1145540/1‑151 (MQ=60)
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TCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGA < SRR18135085.203549/151‑1 (MQ=60)
TCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGA < SRR18135085.3051853/151‑1 (MQ=60)
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AAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGAAA > SRR18135085.5490705/1‑151 (MQ=60)
AAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGAAA > SRR18135085.9088133/1‑151 (MQ=60)
CCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGTCGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGACTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGAAAAGCT < SRR18135085.2083664/151‑1 (MQ=60)
GCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGAAAAGCTGC > SRR18135085.3343119/1‑151 (MQ=60)
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GCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGAAAAGCTGC < SRR18135085.9332320/151‑1 (MQ=60)
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AGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGAAAAGCTGCTCG > SRR18135085.9283941/1‑151 (MQ=60)
AGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGAAAAGCTGCTCG > SRR18135085.4718543/1‑151 (MQ=60)
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TGCCGCTGGACGGCGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGAAAAGCTGCTCGACCAGGCCGCCTA < SRR18135085.7608683/151‑1 (MQ=60)
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GACCGTCGGCATCACCGCCTACGCCCAGGACGCCCTCGGTGACGTGGTATTCGTGCAGTTGCCGGAACTCGGCGAACACGCCGCCGGCAGTGAAGTGGCGGTGCTGGAGTCGGTCAAGGCCGCCAGCAACATCCTGATGCCGCTGGACGGGGAGGTGGTAGCGATCAACGACGCGCTGCCGGACGCCCCGGAGCTGGTCAACCAGGACCCACTCGGCGAGGCCTGGTTCTTCCGCTTCCGTCCGGCCGACGCCGGCGCCTGGGAAAAGCTGCTCGACCAGGCCGCCTACGACCGCCTGCT > NC_008463/2885783‑2886082
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
