Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F1 I1 R1
|
260 |
537.2 |
23268138 |
99.2% |
23081992 |
151.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
2,807,266 |
G→C |
V137L (GTG→CTG) |
PA14_RS13175 → |
leucine‑rich repeat‑containing protein kinase family protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 2,807,266 | 0 | G | C | 99.8%
| 2014.7
/ NA
| 514 | V137L (GTG→CTG) | PA14_RS13175 | leucine‑rich repeat‑containing protein kinase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (257/256); minor base A (0/1); total (257/257) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 532 total aligned reads displayed.
GGCCGACTCCCTGGAGGTGCTCAACCTCAGCGGCAACGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGGTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCGGATTGCCACGCTGCCCGAGGAACTGGGTCGCCGGCCGTTGCAGAAGCTGATGC > NC_008463/2807118‑2807413
|
ggCCGACTCCCTGGAGGTGCTCAACCTCAGCGGCAACGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTg > 1:7100185/1‑151 (MQ=255)
gCCGACTCCCTGGAGGTGCTCAACCTCAGCGGCAACGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGa > 2:3507040/1‑151 (MQ=255)
gCCGACTCCCTGGAGGTGCTCAACCTCAGCGGCAACGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGa < 2:5893764/151‑1 (MQ=255)
gCCGACTCCCTGGAGGTGCTCAACCTCAGCGGCAACGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGa > 1:9048361/1‑151 (MQ=255)
ccTGGAGGTGCTCAACCTCAGCGGCAACGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTc < 1:4041502/151‑1 (MQ=255)
cTGGAGGTGCTCAACCTCAGCGGCAACGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCg > 2:4031809/1‑151 (MQ=255)
tGGAGGTGCTCAACCTCAGCGGCAACGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCgg < 2:3711237/151‑1 (MQ=255)
tGGAGGTGCTCAACCTCAGCGGCAACGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCgg > 2:10599295/1‑151 (MQ=255)
aGGTGCACAACCTCAGCGGCAACGCCCTGGACAGCCAGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCtt < 1:2290137/151‑1 (MQ=255)
ggTGCTCAACCTCAGCGGCAACGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTc < 2:8042590/151‑1 (MQ=255)
gCTCAACCTCAGCGGCAACGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAg < 2:1028473/151‑1 (MQ=255)
gCTCAACCTCAGCGGCAACGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAg > 1:5203659/1‑151 (MQ=255)
gCTCAACCTCAGCGGCAACGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAg > 2:9547999/1‑151 (MQ=255)
gCTCAACCTCAGCGGCAACGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAg < 2:6851562/151‑1 (MQ=255)
cTCAACCTCAGCGGCAACGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGt > 2:7137013/1‑151 (MQ=255)
tCAACCTCAGCGGCAACGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTc > 2:9346478/1‑151 (MQ=255)
tCAACCTCAGCGGCAACGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTc < 2:430127/151‑1 (MQ=255)
ccTCAGCGGCAACGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAAc > 1:3736469/1‑151 (MQ=255)
cTCAGCGGCACCGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCACGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAAcc < 2:1370480/151‑1 (MQ=255)
cTCAGCGGCAACGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAAcc < 2:625869/151‑1 (MQ=255)
gCGGCAACGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCAt < 2:7334569/151‑1 (MQ=255)
cGGCAACGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATc > 1:9797694/1‑151 (MQ=255)
ggCAACGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCg < 1:4156729/151‑1 (MQ=255)
ggCAACGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCg > 1:624146/1‑151 (MQ=255)
ggCAACGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCg < 2:2420766/151‑1 (MQ=255)
gCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCggg < 1:6163455/151‑1 (MQ=255)
gCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCggg > 1:7269724/1‑151 (MQ=255)
cccTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGt > 1:8388665/1‑151 (MQ=255)
cccTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGt < 1:8120605/151‑1 (MQ=255)
ccTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTg < 2:6373075/151‑1 (MQ=255)
cTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTgc < 2:5252729/151‑1 (MQ=255)
cTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTACTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGAGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGAgc > 1:4322106/1‑151 (MQ=255)
gACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCCACTGGCCGTCGCTCGGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACAGCCTCGAGCGGGTgccgg > 2:8469073/1‑151 (MQ=255)
cGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCt > 2:10162573/1‑151 (MQ=255)
ggACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTg > 1:5416294/1‑151 (MQ=255)
gacCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTgccgc < 1:8762040/151‑1 (MQ=255)
gacCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTgccgc > 1:322646/1‑151 (MQ=255)
acCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTgccgcc > 2:9031355/1‑151 (MQ=255)
acCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTgccgcc < 2:5784168/151‑1 (MQ=255)
ccTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGccgccg > 2:11449676/1‑151 (MQ=255)
cggccggcTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCg < 1:9883123/151‑1 (MQ=255)
ggccggcTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGt > 2:2667391/1‑151 (MQ=255)
ggccggcTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACGTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCTGAGCTGAGCATGGTCGGCTGCAAGTCCAACCTCATCGAGCGGGTGACGGCCGCGGACCTGACGCCGTCga > 2:5324954/1‑150 (MQ=255)
gccggcTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGtt < 2:3180522/151‑1 (MQ=255)
cggcTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTgc > 1:9370798/1‑151 (MQ=255)
ggcTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTgcg < 2:1641462/151‑1 (MQ=255)
ggcTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTgcg > 2:9672322/1‑151 (MQ=255)
ggcTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTgcg > 2:4763913/1‑151 (MQ=255)
tGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCgctg < 2:10430357/151‑1 (MQ=255)
tGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCgctg > 1:6838084/1‑151 (MQ=255)
aTCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCgctggct < 1:9420671/151‑1 (MQ=255)
tCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCgctggctg < 1:11234303/151‑1 (MQ=255)
tCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCgctggctg < 2:11538707/151‑1 (MQ=255)
cGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGa < 1:6444113/151‑1 (MQ=255)
tctcAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATc > 2:4589463/1‑151 (MQ=255)
aaGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCa > 1:10965577/1‑151 (MQ=255)
aaGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCa < 1:7455909/151‑1 (MQ=255)
aGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGCGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCAc < 2:8171593/151‑1 (MQ=255)
gTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCg < 2:6166760/151‑1 (MQ=255)
gCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGAc < 2:11361819/151‑1 (MQ=255)
gCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGAc < 2:7713466/151‑1 (MQ=255)
gCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGAc < 1:10011763/151‑1 (MQ=255)
tgttctgttcCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACaa < 2:6703472/151‑1 (MQ=255)
gtctgttcCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAAcc > 1:7925782/2‑151 (MQ=255)
ctgttcCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCgg < 1:456015/151‑1 (MQ=255)
gttcCGCCAACGTCTTCGCCGAAGTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCGGAt < 2:5610694/151‑1 (MQ=255)
ttcCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCGGAtt < 2:5530936/151‑1 (MQ=255)
tcCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCGGATTg > 1:10287291/1‑151 (MQ=255)
tcCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCGGATTg > 1:2841833/1‑151 (MQ=255)
tcCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCGGATTg > 1:4837282/1‑151 (MQ=255)
ccGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCGGATTGc > 1:3610490/1‑151 (MQ=255)
cGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCGGATTGcc < 2:8140957/151‑1 (MQ=255)
gCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCGGATTGCCa > 2:8315931/1‑151 (MQ=255)
gCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCGGATTGCCa < 1:9600453/151‑1 (MQ=255)
aaCGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCGCACCGACAACCGGATTGCCACGc > 1:1915020/1‑151 (MQ=255)
aCTGCGCCGTATTGCCGGCGGCGGTGGGGGACTGTCCGGCGCGGAGCAGGGTCGGCTTCAAGTCCTCGCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGGCGCCGGCGTTGCGGTGGCTGATCCGCTCCGACAACCGGAGTGCCTCGCTGcc > 2:8888757/1‑151 (MQ=255)
ttCGGCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCGGATTGCCACGCTGCCCg > 1:5024431/1‑151 (MQ=255)
ttCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCGGATTGCCACGCTGCCCg < 2:2904477/151‑1 (MQ=255)
ttCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCGGATTGCCACGCTGCCCg > 1:2518650/1‑151 (MQ=255)
tCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCGGATTGCCACGCTGCCCGa > 1:6817235/1‑151 (MQ=255)
cGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGCTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCGGATTGCCACGCTGCCCGAg < 2:6114472/151‑1 (MQ=255)
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TGGCCGACTCCCTGGAGGTGCTCAACCTCAGCGGCAACGCCCTGGACAGCCTGCCGGACGACCTCGGCCGGCTGCATCGTCTCAAGGTGCTGTTCTGTTCCGCCAACGACTTCGCCGAATTGCCGGCGGCGGTGGGCGACTGTCCGGCGGTGAGCATGGTCGGCTTCAAGTCCAACCGCATCGAGCGGGTGCCGGCCGCGGCCCTGCCGCCGGCGTTGCGCTGGCTGATCCTCACCGACAACCGGATTGCCACGCTGCCCGAGGAACTGGGTCGCCGGCCGTTGCAGAAGCTGATGCTGG > NC_008463/2807117‑2807416
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |