Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F1 I1 R1
|
260 |
537.2 |
23268138 |
99.2% |
23081992 |
151.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
4,997,786 |
T→C |
K173E (AAG→GAG) |
PA14_RS22840 ← |
DUF853 family protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 4,997,786 | 0 | T | C | 100.0%
| 2186.4
/ NA
| 552 | K173E (AAG→GAG) | PA14_RS22840 | DUF853 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (247/305); total (247/305) |
Only 100 of 552 total aligned reads displayed.
CGCCCCCGCCCGTCCGGCTCGGGGCGGAGGATGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTTGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCGCGGCCTGCTGGCTATCGGTCAACTCCAGGAGGTTGG > NC_008463/4997638‑4997932
|
gcCCCCGCCCGTCCGGCTCGGGGCGGAGGATGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGcc > 2:10860452/1‑151 (MQ=255)
gcCCCCGCCCGTCCGGCTCGGGGCGGAGGATGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGcc < 1:5875889/151‑1 (MQ=255)
gTCCGGCTCGGGGCGGAGGATGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTcc < 1:7957983/151‑1 (MQ=255)
gTCCGGCTCGGGGCGGAGGATGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTACAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGACCAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTcc > 1:393194/1‑151 (MQ=255)
tCCGGCTCGGGGCGGAGGATGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCg < 2:9585568/151‑1 (MQ=255)
tCCGGCTCGGGGCGGAGGATGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCg < 1:2077658/151‑1 (MQ=255)
ccGGCTCGGGGCGGAGGATGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCgg < 1:6647376/151‑1 (MQ=255)
ggCTCGGGGCGGAGGATGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGAt > 1:4103613/1‑151 (MQ=255)
gCTCGGGGCGGAGGATGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGAtt > 1:1563339/1‑151 (MQ=255)
tCGGGGCGGAGGATGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGt < 1:8323860/151‑1 (MQ=255)
cGGGGCGGAGGATGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCGGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTc > 2:6589983/1‑151 (MQ=255)
cGGGGCGGAGGATGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTc < 2:2080266/151‑1 (MQ=255)
cGGGGCGGAGGATGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTc > 2:1128620/1‑151 (MQ=255)
cGGGGCGGAGGATGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTc < 2:4909639/151‑1 (MQ=255)
ggggCGGAGGATGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTcc < 2:5529349/151‑1 (MQ=255)
ggCGGAGGATGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCtg > 1:505847/1‑150 (MQ=255)
gCGGAGGATGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTc < 1:10754984/151‑1 (MQ=255)
cGGAGGATGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCa < 2:1847707/151‑1 (MQ=255)
ggaggaTGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAg > 2:629903/1‑151 (MQ=255)
gaggaTGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGTGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCGCGCCGAGGCACTCCGGCTTGTCCTTCAgg > 2:7885992/1‑151 (MQ=255)
gaggaTGTCTTCCAGGTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAgg < 2:10123236/151‑1 (MQ=255)
ggaTGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAggtg > 1:9121586/1‑151 (MQ=255)
ggaTGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAggtg < 1:11631988/151‑1 (MQ=255)
ggaTGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGACCTTCAggtg < 1:4298598/151‑1 (MQ=255)
gaTGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAggtgg > 1:7310673/1‑151 (MQ=255)
aTGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAggtggt < 2:4270848/151‑1 (MQ=255)
tGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGtt < 2:1484609/151‑1 (MQ=255)
tCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGa < 1:8696731/151‑1 (MQ=255)
gcagggcaggCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGcctt > 1:3140930/1‑151 (MQ=255)
gcagggcaggCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGcctt < 2:8233974/151‑1 (MQ=255)
cagggcaggCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGccttc < 2:204928/151‑1 (MQ=255)
cagggcaggCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGccttc > 1:2626302/1‑151 (MQ=255)
agggcaggCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGccttca > 1:5704096/1‑151 (MQ=255)
ggcaggCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGccttcagg < 2:5142760/151‑1 (MQ=255)
ggcaggCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGccttcagg < 2:8509929/151‑1 (MQ=255)
gCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGccttcaggtcctt < 2:11512065/151‑1 (MQ=255)
tCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGCGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGccttcaggtccttca > 2:8637374/1‑151 (MQ=255)
tCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGccttcaggtccttca < 2:6796680/151‑1 (MQ=255)
tCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGccttcaggtccttca < 1:6229628/151‑1 (MQ=255)
gCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGccttcaggtccttcagg > 1:1784526/1‑151 (MQ=255)
cGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCcttcaggtccttcaggtc < 1:4705445/151‑1 (MQ=255)
cGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCACGGAAGCGCCGGTGACAAGCCCCCGCTCCACGCCGAGCAACTCCGGAATCACCTTCAGGTGGAAGATCAGCGCcttcaggtcagtccggtc > 2:7705386/1‑151 (MQ=255)
aagaagGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGa > 2:9479634/1‑151 (MQ=255)
ggCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGagcagc > 1:10325711/1‑151 (MQ=255)
ccTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGagcagcag > 1:5943484/1‑151 (MQ=255)
cTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGagcagcagc > 1:8845150/1‑151 (MQ=255)
cGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGcagcagcag < 2:11421516/151‑1 (MQ=255)
cGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCGTCAGGTCGAGcagcagcag > 2:7972887/1‑151 (MQ=255)
ggCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAgg > 2:9752648/1‑151 (MQ=255)
gcgcCCTGCTGCTCCCGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGc < 1:10823507/151‑1 (MQ=255)
cgcCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCGTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGcc > 1:3358990/1‑151 (MQ=255)
gcCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCt < 1:10214652/151‑1 (MQ=255)
gcCCAGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCt < 2:10963621/151‑1 (MQ=255)
cccTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCtt > 2:3616072/1‑151 (MQ=255)
cccTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCtt > 1:11073190/1‑151 (MQ=255)
ccTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTc > 1:781965/1‑151 (MQ=255)
ccTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTc > 2:1214291/1‑151 (MQ=255)
gctgctCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCg > 2:8120528/1‑151 (MQ=255)
ctgctCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCgg > 2:4521479/1‑151 (MQ=255)
cAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGcc > 2:701784/1‑151 (MQ=255)
cAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGcc > 1:10993356/1‑151 (MQ=255)
agTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGGTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCAcc > 2:2349637/1‑151 (MQ=255)
tGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTg > 2:5370958/1‑151 (MQ=255)
tGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTg < 1:4581377/151‑1 (MQ=255)
ccAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGaa < 2:7215159/151‑1 (MQ=255)
cAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGacg > 2:5785774/1‑149 (MQ=255)
cAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAg < 1:8002580/151‑1 (MQ=255)
cAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAg > 2:7605661/1‑151 (MQ=255)
aGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAgg < 1:6512027/151‑1 (MQ=255)
aGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAgg > 1:9865347/1‑151 (MQ=255)
ggcgCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAggcggc > 1:3028950/1‑151 (MQ=255)
cgcAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGa < 1:2356070/151‑1 (MQ=255)
gcagcaGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGaa > 1:9516767/1‑151 (MQ=255)
gcagcGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGACCAg > 2:4857670/1‑151 (MQ=255)
gcgcCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAgcgc < 1:6856709/151‑1 (MQ=255)
cgcCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCTGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGcgcg > 2:10645677/1‑151 (MQ=255)
gcCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCGCgg > 1:5404513/1‑151 (MQ=255)
cTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCGCGGcc < 1:3248092/151‑1 (MQ=255)
gCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCGCGGCctg > 1:1051025/1‑151 (MQ=255)
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CAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCC > SRR18135096.11040217/1‑151 (MQ=60)
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TGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTG < SRR18135096.4602530/151‑1 (MQ=60)
GCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGCTCTCCGGGTTGTCGTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCGTGCAGGTCGAGCAGCAGGAGGCCTTCCCGGTCGGCCTCCTGGA > SRR18135096.5551895/1‑151 (MQ=60)
GCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGGGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGGCGGCCACCTGGA > SRR18135096.9541343/1‑151 (MQ=60)
CCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAA > SRR18135096.7836886/1‑151 (MQ=60)
CAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAG < SRR18135096.10240933/151‑1 (MQ=60)
CAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAG < SRR18135096.8037597/151‑1 (MQ=60)
CAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAG < SRR18135096.8037738/151‑1 (MQ=60)
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GGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGC < SRR18135096.9353045/151‑1 (MQ=60)
GGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGC < SRR18135096.9353063/151‑1 (MQ=60)
GGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGC > SRR18135096.3042992/1‑151 (MQ=60)
GGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGC < SRR18135096.1133944/151‑1 (MQ=60)
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CAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGC > SRR18135096.4147128/1‑151 (MQ=60)
AGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCG < SRR18135096.10428398/151‑1 (MQ=60)
GCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCGC < SRR18135096.6887569/151‑1 (MQ=60)
GCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCGC < SRR18135096.5080567/151‑1 (MQ=60)
GCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCGCGG > SRR18135096.5255155/1‑151 (MQ=60)
CCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCGCGGC > SRR18135096.10625598/1‑151 (MQ=60)
CTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCGCGGCC < SRR18135096.446094/151‑1 (MQ=60)
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GCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCTGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCGCGGCATG > SRR18135096.1048961/1‑151 (MQ=60)
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AAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCGCGGCCTGCTGGCT > SRR18135096.5838904/1‑151 (MQ=60)
AAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCGCGGCCTGCTGGCT < SRR18135096.2952282/151‑1 (MQ=60)
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CCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCGCGGCCTGCTGGCTATCGG > SRR18135096.718969/1‑151 (MQ=60)
CGGTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCGCGGCCTGCTGGCTATCGGT < SRR18135096.1316447/151‑1 (MQ=60)
GTGAACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCGCGGCCTGCTGGCTATCGGTCA < SRR18135096.777565/151‑1 (MQ=60)
TGAACCGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCGCGGCCTGCTGGCTATCGGTCAA < SRR18135096.5178433/151‑1 (MQ=60)
ACAGCGCCCGGTCCTCGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCGCGGCCTGCTGGCTATCGGTCAACTC < SRR18135096.10097654/151‑1 (MQ=60)
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TGCGCCCCCGCCCGTCCGGCTCGGGGCGGAGGATGTCTTCCAGTTGCAGGGCAGGCTCGCCGAAGAAGGCCTCGGCGCCCTGCTGCTCCAGAGTGGCCAGGCGGCGCAGCAGCGCCTGCCCGGAAGCGCCGGTGAACAGCGCCCGGTCCTTGCCGAGGATCTCCGGATTGTCCTTCAGGTGGTTGAGCAGCGCCTTCAGGTCCTTCAGGTCGAGCAGCAGCAGGCCTTCCCGGTCGGCCACCTGGAAGGCGGCGAACAGCGCGGCCTGCTGGCTATCGGTCAACTCCAGGAGGTTGGCCAG > NC_008463/4997636‑4997936
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |