Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
275 |
500.0 |
21685688 |
99.2% |
21512202 |
151.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
1,598,729 |
C→T |
G125S (GGC→AGC) |
argF ← |
ornithine carbamoyltransferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 1,598,729 | 0 | C | T | 99.2%
| 1959.8
/ NA
| 476 | G125S (GGC→AGC) | argF | ornithine carbamoyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (247/224); minor base G (4/0); total (251/225) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.26e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 476 total aligned reads displayed.
AACTTCAGCGCCGCTTCTATATAGCTGTTGCACATGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCCGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCGGCTCGCCGCGGCCGAGCTGGGTGTCGCGCGG > NC_008463/1598581‑1598876
|
aaCTTCAGCGCCGCTTCTATATAGCTGTTGCACATGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGt < 1:46325/151‑1 (MQ=255)
cTTCAGCGCCGCTTCTATATAGCTGTTGCACATGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTg > 1:3231250/1‑151 (MQ=255)
tCAGCGCCGCGTCTATATAGCTGTTGCACATGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGAt > 1:4473361/1‑151 (MQ=255)
gcgcCGCTTCTATATAGCTGTTGCACATGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCAc < 1:5868334/151‑1 (MQ=255)
gccgcTTCTATATAGCTGTTGCACATGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCg < 1:6740423/151‑1 (MQ=255)
ccgcTTCTATATAGCTGTTGCACATGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCgg < 1:8737954/151‑1 (MQ=255)
ccgcTTCTATATAGCTGTTGCACATGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCgg < 1:9651502/151‑1 (MQ=255)
ccgcTTCTATATAGCTGTTGCACATGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCgg > 1:5626412/1‑151 (MQ=255)
cgcTTCTATATAGCTGTTGCACATGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGc > 2:2338624/1‑151 (MQ=255)
cTTCTATATAGCTGTTGCACATGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCAc < 2:1069611/151‑1 (MQ=255)
cTTCTATATAGCTGTTGCACATGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCAc > 2:6795613/1‑151 (MQ=255)
cTTCTATATAGCTGTTGCACATGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCAc > 1:3915370/1‑151 (MQ=255)
cTTCTATATAGCTGTTGCACATGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCAc < 2:8637268/151‑1 (MQ=255)
tCTATATAGCTGTTGCACATGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCt > 1:1533920/1‑151 (MQ=255)
tCTATATAGCTGTTGCACATGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCt > 2:9566814/1‑151 (MQ=255)
cTATATAGCTGTTGCACATGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCtt < 2:2053928/151‑1 (MQ=255)
tatataGCTGTTGCACATGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTc < 1:944799/151‑1 (MQ=255)
atataGCTGTTGCACATGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCg > 2:5938681/1‑151 (MQ=255)
tataGCTGTTGCACATGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGa > 1:3685168/1‑151 (MQ=255)
tataGCTGTTGCACATGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGa > 1:8343249/1‑151 (MQ=255)
aGCTGTTGCACATGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTg > 2:2270254/1‑151 (MQ=255)
aGCTGTTGCACATGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTg < 2:8282355/151‑1 (MQ=255)
gCTGTTGCACATGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTgc < 1:4799410/151‑1 (MQ=255)
gCTGTTGCACATGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTgc > 2:4234605/1‑151 (MQ=255)
gCTGTTGCACATGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTgc > 2:4483956/1‑151 (MQ=255)
ggtGCACATGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGcgcg < 2:8984806/149‑1 (MQ=255)
gTTGCACATGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGcgcg < 2:7102768/151‑1 (MQ=255)
ttGCACATGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCgcgg < 1:8873070/151‑1 (MQ=255)
agCACATGTTGTTGCCGTCGCCGAACCAGGACACGGTCATGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCgcggc > 2:1673022/2‑151 (MQ=255)
cacaTGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGa < 1:2003416/151‑1 (MQ=255)
caTGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAAt < 1:9124651/151‑1 (MQ=255)
gCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCACCTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGCGTGCGCGGCGAAGTCCGTGAgg > 2:6111352/1‑151 (MQ=255)
cGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGt < 2:7430777/151‑1 (MQ=255)
cGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGt < 2:10466787/151‑1 (MQ=255)
gTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTg > 2:4748656/1‑151 (MQ=255)
tCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTgg > 1:3471797/1‑151 (MQ=255)
cGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGc > 1:1243439/1‑151 (MQ=255)
cGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGGTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGc > 2:7798622/1‑151 (MQ=255)
gCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCg > 1:3113858/1‑151 (MQ=255)
gCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCg > 1:1052382/1‑151 (MQ=255)
gCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCg > 1:8017456/1‑151 (MQ=255)
gATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTgg > 1:10159712/1‑151 (MQ=255)
gATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTgg < 1:2397491/151‑1 (MQ=255)
ccAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCg > 2:3622422/1‑151 (MQ=255)
ggCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAg < 2:3390308/151‑1 (MQ=255)
cccACGCTCTTGCCCGCGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCTGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAgg < 2:8896341/150‑1 (MQ=255)
ccACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGt > 2:4910430/1‑151 (MQ=255)
ccACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGt < 2:3834792/151‑1 (MQ=255)
ccACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGt > 1:10288341/1‑151 (MQ=255)
ttGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGatca < 2:9134405/151‑1 (MQ=255)
ttGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGatca < 2:6857873/151‑1 (MQ=255)
ccTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCAc > 2:255692/1‑151 (MQ=255)
cTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACg < 2:1101057/151‑1 (MQ=255)
gATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCg < 2:5213876/151‑1 (MQ=255)
gATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCg < 2:8423103/151‑1 (MQ=255)
aTGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGt < 2:9456682/151‑1 (MQ=255)
tgctgcCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTc > 2:3088118/1‑151 (MQ=255)
tgctgcCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTc < 2:137982/151‑1 (MQ=255)
gctgcCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCg < 1:9241481/151‑1 (MQ=255)
gctgcCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCg < 1:6098307/151‑1 (MQ=255)
ctgcCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGACGTCGa > 2:2111642/1‑151 (MQ=255)
tgcCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAg < 2:9351861/151‑1 (MQ=255)
ccGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCa > 1:5156768/1‑151 (MQ=255)
gcgGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATc > 1:4206163/1‑151 (MQ=255)
cgGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATcc > 2:572719/1‑151 (MQ=255)
ggTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCcg > 1:8655173/1‑151 (MQ=255)
gTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCcgc < 2:296286/151‑1 (MQ=255)
gTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCcgc > 1:1309614/1‑151 (MQ=255)
gCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGa < 1:5519766/151‑1 (MQ=255)
cGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACAt < 1:576386/151‑1 (MQ=255)
gTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATg > 1:6950472/1‑151 (MQ=255)
ggAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGAc > 1:5352825/1‑151 (MQ=255)
gAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGAcc < 1:6171227/151‑1 (MQ=255)
aGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCg < 1:1666968/151‑1 (MQ=255)
aGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCg < 1:2231858/151‑1 (MQ=255)
ggTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCgg < 1:7476092/151‑1 (MQ=255)
gTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCggg > 2:4619879/1‑151 (MQ=255)
atttCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTTAAGGTCGTCTGAAAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGTCGAATTCCGTCAGGGTGGCGAGGGAGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACAAGACCCGGGCGCTGt > 2:3526838/4‑151 (MQ=255)
tGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTc < 1:9872807/151‑1 (MQ=255)
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GTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCG < SRR18135068.7201078/151‑1 (MQ=60)
TCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGC > SRR18135068.9884872/1‑151 (MQ=60)
TCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGC > SRR18135068.4566894/1‑151 (MQ=60)
TCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGC > SRR18135068.5194631/1‑151 (MQ=60)
CGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCC < SRR18135068.9937087/151‑1 (MQ=60)
CGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCC < SRR18135068.6531604/151‑1 (MQ=60)
CGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCC < SRR18135068.10412913/151‑1 (MQ=60)
CGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCC < SRR18135068.6531674/151‑1 (MQ=60)
GGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCG < SRR18135068.4783697/151‑1 (MQ=60)
GGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCG > SRR18135068.1283360/1‑151 (MQ=60)
GGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCG > SRR18135068.5488931/1‑151 (MQ=60)
GCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGA > SRR18135068.5875756/1‑151 (MQ=60)
GAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATC > SRR18135068.4447323/1‑151 (MQ=60)
GAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATC > SRR18135068.6095472/1‑151 (MQ=60)
GAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATC > SRR18135068.9499576/1‑151 (MQ=60)
GAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATC < SRR18135068.3897869/151‑1 (MQ=60)
AGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCCCGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCG < SRR18135068.3242808/151‑1 (MQ=60)
AGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCG < SRR18135068.1752878/151‑1 (MQ=60)
AGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCG > SRR18135068.4170999/1‑151 (MQ=60)
AGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCG < SRR18135068.534298/151‑1 (MQ=60)
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AACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCGGCT > SRR18135068.6890113/1‑151 (MQ=60)
AACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCGGCT < SRR18135068.10633600/151‑1 (MQ=60)
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ACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCGGCTC > SRR18135068.8147899/1‑151 (MQ=60)
ACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCGGCTC < SRR18135068.5963165/151‑1 (MQ=60)
ACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGACAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCGGCTC < SRR18135068.24346/151‑1 (MQ=60)
TGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCGGCTCGC > SRR18135068.10244494/1‑151 (MQ=60)
TGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCGGCTCGC > SRR18135068.2125780/1‑151 (MQ=60)
GCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCGGCTCGCCG < SRR18135068.1085613/151‑1 (MQ=60)
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TGCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCGGCTCGCCGCGGCCGC < SRR18135068.764833/151‑1 (MQ=60)
GCAGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCGGCTCGCCGCGGCCGAG > SRR18135068.7098982/1‑151 (MQ=60)
AGGTCGTCGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCGGCTCGCCGCGGCCGAGCT < SRR18135068.7066708/151‑1 (MQ=60)
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CGGACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCGGCTCGCCGCGGCCGAGCTGGGTGTC > SRR18135068.8779410/1‑151 (MQ=60)
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GACAGGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCGGCTCGCCGCGGCCGAGCTGGGTGTCGC < SRR18135068.3800836/151‑1 (MQ=60)
GGCTGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCGGCTCGCCGCGGCCGAGCTGGGTGTCGCGCGG < SRR18135068.5837002/151‑1 (MQ=60)
TGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCGGCTCGCCGCGGCCGAGCTGGGTGTCGCGCGGGGA < SRR18135068.1997450/151‑1 (MQ=60)
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CGAACTTCAGCGCCGCTTCTATATAGCTGTTGCACATGTTGTTGCCGTCGCCGATCCAGGCCACGGTCTTGCCCTGGATGCTGCCGCGGTGCTCGTGGAAGGTCTGCATGTCGGCGAGCAACTGGCAGGGGTGCAGGTCGTCGGACAGGCCGTTGATCACCGGCACCTTCGAGTGCGCGGCGAATTCCGTCAGGGTGGCGTGGGCGAAGGTGCGGATCATCACGCCGTCGAGCATCCGCGACATGACCCGGGCGCTGTCGCCGATCGGCTCGCCGCGGCCGAGCTGGGTGTCGCGCGGGGA > NC_008463/1598579‑1598879
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
