Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
275 |
500.0 |
21685688 |
99.2% |
21512202 |
151.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
2,651,339 |
T→C |
F68L (TTC→CTC) |
PA14_RS12480 → |
MFS transporter |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 2,651,339 | 0 | T | C | 100.0%
| 1831.8
/ NA
| 472 | F68L (TTC→CTC) | PA14_RS12480 | MFS transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (237/235); total (237/235) |
Only 100 of 472 total aligned reads displayed.
GTGGCGATCATGCTCGGGCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGTTCAAGGGCTGGCTGATCAACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAACTCTACGCGCTGTTCCTGCTGATCGGCCTGCTGGCGC > NC_008463/2651192‑2651486
|
gCGATCATGCTCGGGCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAgg < 2:8584301/151‑1 (MQ=255)
tCATGCTCGGGCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGggctg > 1:9670614/1‑151 (MQ=255)
aTGCTCGGGCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGCGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCGGGTGACGCTGTGCGGCCTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCACGggctggc > 2:10553460/1‑151 (MQ=255)
tGCTCGGGCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGggctggct < 1:7844800/151‑1 (MQ=255)
gCTCGGGCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGgctggctg < 1:8369409/151‑1 (MQ=255)
gCTCGGGCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGgctggctg < 1:4144597/151‑1 (MQ=255)
cTCGGGCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGa < 2:2268083/151‑1 (MQ=255)
cGGGCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGCTGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATc > 2:6121588/1‑151 (MQ=255)
cGGGCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATc < 1:6732578/151‑1 (MQ=255)
gggCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATcg > 2:4709600/1‑150 (MQ=255)
gCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGAc < 1:2215832/151‑1 (MQ=255)
cACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGt < 2:1882539/151‑1 (MQ=255)
ccGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTg > 1:3471896/1‑151 (MQ=255)
cGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTgg < 2:1191764/151‑1 (MQ=255)
ggCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTggg < 2:6680863/151‑1 (MQ=255)
gCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTgggg > 1:480891/1‑151 (MQ=255)
cATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGgc < 2:259226/151‑1 (MQ=255)
aTCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGgcg > 1:3498785/1‑151 (MQ=255)
tCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGgcgc > 1:4898178/1‑151 (MQ=255)
ccTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGgcgcg > 1:2830628/1‑151 (MQ=255)
ctgctgAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGgcgcgc > 2:220228/1‑151 (MQ=255)
tgctgAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGcgcgcg < 2:8183687/151‑1 (MQ=255)
tgAACACCTTCTGTCTGTTCATCGCACGGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACGGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGGTGGATGATCGACGGTTGGGGCGCgcggcg < 2:6396470/151‑1 (MQ=255)
cacCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACa < 1:238201/151‑1 (MQ=255)
cacCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACa > 1:9554066/1‑151 (MQ=255)
cAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCCCCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTc < 1:10469424/151‑1 (MQ=255)
cAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTc > 2:2769252/1‑151 (MQ=255)
aGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCg < 2:139071/151‑1 (MQ=255)
tGTTCAGCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGGGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCACGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCt < 2:10764885/151‑1 (MQ=255)
gTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTg > 1:4333195/1‑151 (MQ=255)
cATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACGGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGAcc < 2:9453849/151‑1 (MQ=255)
tCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACcgc > 2:7846140/1‑151 (MQ=255)
cGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACcgcg < 2:3663118/151‑1 (MQ=255)
gCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGGTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCgg > 2:2999630/1‑151 (MQ=255)
ccGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGccc > 2:2706359/1‑151 (MQ=255)
ccGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGccc < 1:1823595/151‑1 (MQ=255)
gATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTg < 2:9177036/151‑1 (MQ=255)
aGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTcgc > 2:200887/1‑151 (MQ=255)
gcgcCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTcgct < 2:5262967/151‑1 (MQ=255)
gcgcCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTcgct < 1:7518335/151‑1 (MQ=255)
cgcCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTcgctg < 1:6855608/151‑1 (MQ=255)
ccGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTcgctgcc > 2:9829008/1‑151 (MQ=255)
ccGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTcgctgcc < 1:5324915/151‑1 (MQ=255)
gAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTcgctgccgc > 1:7415400/1‑151 (MQ=255)
gTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTcgctgccgctg > 1:1308663/1‑151 (MQ=255)
gTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGAAGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTcgctgccgctg > 2:4868356/1‑151 (MQ=255)
gTACGCCGGGGCCCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCCAGGGCTGGCTGAGCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACACTGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGGcgctgccgctg < 2:9135636/151‑1 (MQ=255)
aCGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCgctgct < 2:7742995/151‑1 (MQ=255)
gCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCg > 2:8303042/1‑151 (MQ=255)
gCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCg > 1:5546101/1‑151 (MQ=255)
gCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCGGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTGGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCg > 2:6800848/1‑151 (MQ=255)
cTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGc > 2:7590045/1‑151 (MQ=255)
gggACCGCGCCGCGGTGTCGGTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCt < 2:5873654/151‑1 (MQ=255)
gggACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCt > 1:5800898/1‑151 (MQ=255)
cgcgCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTggcgg < 1:10806458/151‑1 (MQ=255)
cgcgCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTggcgg > 2:10037688/1‑151 (MQ=255)
cgcgCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTggcgg > 2:5772174/1‑151 (MQ=255)
gcgcCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTggcggc < 1:7631195/151‑1 (MQ=255)
cgcCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGgcggcg < 2:5402296/151‑1 (MQ=255)
cgcCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGgcggcg < 1:5052862/151‑1 (MQ=255)
gcCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGcggcgg > 2:725886/1‑151 (MQ=255)
gcCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGcggcgg > 1:2707522/1‑151 (MQ=255)
gAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGa < 1:7074079/151‑1 (MQ=255)
aGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGaa < 1:8803976/151‑1 (MQ=255)
ggTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAAt < 2:4353067/151‑1 (MQ=255)
ggTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAAt < 2:2364638/151‑1 (MQ=255)
gtgtCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATg > 1:8517702/1‑151 (MQ=255)
gtCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGcc > 1:10323967/1‑151 (MQ=255)
tCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCg < 1:1932977/151‑1 (MQ=255)
tGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCTCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGTCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTg < 2:3758787/151‑1 (MQ=255)
cTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGACGTCTGGc > 1:6557045/1‑151 (MQ=255)
tGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAAct < 1:6400784/151‑1 (MQ=255)
aCGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCTAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAActct < 1:10087947/151‑1 (MQ=255)
cGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAACTCTa > 2:1719263/1‑151 (MQ=255)
gCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAACTCTAc > 2:7894058/1‑151 (MQ=255)
gCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCGCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAACTCTAc > 1:9815094/1‑151 (MQ=255)
cTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAACTCTAcg < 1:808284/151‑1 (MQ=255)
tGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAACTCTAcgc < 1:9264182/151‑1 (MQ=255)
tGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAACTCTAcgc < 1:10612567/151‑1 (MQ=255)
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gTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGAGCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAACTCTAcgcg < 1:9967410/151‑1 (MQ=255)
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CAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTC > SRR18135068.5042278/1‑151 (MQ=60)
CAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTC < SRR18135068.9302671/151‑1 (MQ=60)
GTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCACGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGC < SRR18135068.1565269/151‑1 (MQ=60)
TCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGG > SRR18135068.2042722/1‑151 (MQ=60)
CTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGC > SRR18135068.1975831/1‑151 (MQ=60)
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GTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTG > SRR18135068.4263131/1‑151 (MQ=60)
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CACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGC > SRR18135068.3155359/1‑151 (MQ=60)
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CTGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGT < SRR18135068.4029122/151‑1 (MQ=60)
TGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTC < SRR18135068.8862044/151‑1 (MQ=60)
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AGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCT > SRR18135068.5406731/1‑151 (MQ=60)
GTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTG > SRR18135068.1315464/1‑151 (MQ=60)
TACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGC > SRR18135068.7552421/1‑151 (MQ=60)
TACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGC > SRR18135068.7552427/1‑151 (MQ=60)
CGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTC < SRR18135068.6551209/151‑1 (MQ=60)
CGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTC < SRR18135068.6551579/151‑1 (MQ=60)
GCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCG > SRR18135068.4919721/1‑151 (MQ=60)
GCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCG > SRR18135068.5573757/1‑151 (MQ=60)
GCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCG > SRR18135068.1670876/1‑151 (MQ=60)
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GTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATG > SRR18135068.8558179/1‑151 (MQ=60)
GTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATG < SRR18135068.9966243/151‑1 (MQ=60)
TGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGC < SRR18135068.1834586/151‑1 (MQ=60)
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GTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCC > SRR18135068.10372454/1‑151 (MQ=60)
TCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCG < SRR18135068.1942792/151‑1 (MQ=60)
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CTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGC > SRR18135068.7660886/1‑151 (MQ=60)
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GGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAA > SRR18135068.766411/1‑151 (MQ=60)
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TGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAACT < SRR18135068.6432148/151‑1 (MQ=60)
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GTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAACTCTACGCG > SRR18135068.2233218/1‑151 (MQ=60)
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GTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGAGCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAACTCTACGCG < SRR18135068.10014095/151‑1 (MQ=60)
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ACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGATGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAACGCTACGCGCTGTTC > SRR18135068.1909600/1‑151 (MQ=60)
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GCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAACTCTACGCGCTGTTCCTGC > SRR18135068.10615627/1‑151 (MQ=60)
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CGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAACTCTACGCGCTGTTCCTGCTGATCGGCCTGCTGGCGCC < SRR18135068.3180846/151‑1 (MQ=60)
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CTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAACTCTACGCGCTGTTCCTGCTGATCGGCCTGCTGGCGCCAG < SRR18135068.3157295/151‑1 (MQ=60)
CTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAACTCTACGCGCTGTTCCTGCTGATCGGCCTGCTGGCGCCAG > SRR18135068.3120865/1‑151 (MQ=60)
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TGGTGGCGATCATGCTCGGGCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGTTCAAGGGCTGGCTGATCAACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAACTCTACGCGCTGTTCCTGCTGATCGGCCTGCTGGCGCCAG > NC_008463/2651190‑2651489
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |