Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F1 I1 R1
|
260 |
537.2 |
23268138 |
99.2% |
23081992 |
151.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
2,651,339 |
T→C |
F68L (TTC→CTC) |
PA14_RS12480 → |
MFS transporter |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 2,651,339 | 0 | T | C | 100.0%
| 2025.5
/ NA
| 526 | F68L (TTC→CTC) | PA14_RS12480 | MFS transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (248/278); total (248/278) |
Only 100 of 526 total aligned reads displayed.
GGTGGCGATCATGCTCGGGCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGTTCAAGGGCTGGCTGATCAACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAACTCTACGCGCTGTTCCTGCTGATCGGCCTGCTGGCGC > NC_008463/2651191‑2651486
|
ggtggCGATCATGCTCGGGCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTc > 2:8959777/1‑151 (MQ=255)
ggtggCGATCATGCTCGGGCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTc < 2:3826415/151‑1 (MQ=255)
ggCGATCATGCTCGGGCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAg > 1:3840091/1‑151 (MQ=255)
gATCATGCTCGGGCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGggc < 2:9067158/151‑1 (MQ=255)
aTCATGCTCGGGCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGggct < 2:4372867/151‑1 (MQ=255)
tGCTCGGGCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGggctggct < 1:9404058/151‑1 (MQ=255)
gggCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATcg > 1:10492426/1‑150 (MQ=255)
gggCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATcg < 1:8395860/151‑2 (MQ=255)
gggCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATcg > 2:7528358/1‑150 (MQ=255)
gggCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATcg > 2:7321624/1‑150 (MQ=255)
gCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGAc < 1:572674/151‑1 (MQ=255)
cccACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGAcc > 2:4753243/1‑151 (MQ=255)
cccACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTAATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGAcc > 1:5038741/1‑151 (MQ=255)
cACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGt < 1:4254653/151‑1 (MQ=255)
ccGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTATTCGCACCGATGAGCGCCGAGTTCGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGTCTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTg < 2:2341254/151‑1 (MQ=255)
ggCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTggg < 1:8675339/151‑1 (MQ=255)
tCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGgcgc > 2:10966521/1‑151 (MQ=255)
ccTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGgcgcg > 2:6009242/1‑151 (MQ=255)
ccTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGgcgcg < 1:361097/151‑1 (MQ=255)
ccTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGgcgcg < 2:7629825/151‑1 (MQ=255)
ctgctgAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGgcgcgc > 2:11331476/1‑151 (MQ=255)
gAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGcggcgg > 1:2085916/1‑151 (MQ=255)
acacCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGAc < 2:548221/151‑1 (MQ=255)
cacCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACa > 2:7675/1‑151 (MQ=255)
ccTTCAGTCTGTACATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAAt < 1:1890633/151‑1 (MQ=255)
ttCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCATGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGAGAATGc > 1:7478896/1‑151 (MQ=255)
ttCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGc > 1:9537606/1‑151 (MQ=255)
ttCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGc > 2:7050515/1‑151 (MQ=255)
aGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCg > 2:8617736/1‑151 (MQ=255)
aGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCg > 2:3499526/1‑151 (MQ=255)
tCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCggg < 1:6974689/151‑1 (MQ=255)
ttCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCCCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGa < 2:8445311/151‑1 (MQ=255)
cATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGAcc > 2:9407748/1‑151 (MQ=255)
aTCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGGTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACcg > 1:5856430/1‑151 (MQ=255)
cGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACcgcg < 1:3334709/151‑1 (MQ=255)
gCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCgg > 2:6389004/1‑151 (MQ=255)
gCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCgg > 2:5006171/1‑151 (MQ=255)
cACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGCCCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGc > 2:3393261/1‑151 (MQ=255)
aCCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGTGACCGCGCCGAGGTGTCTTTGCTGGTGACGATGTTCTGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCCAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGcc < 2:190076/151‑1 (MQ=255)
aCCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGcc < 2:5068623/151‑1 (MQ=255)
ccGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGccc > 2:5151844/1‑151 (MQ=255)
cGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCt < 1:1293401/151‑1 (MQ=255)
cGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCt > 1:2872834/1‑151 (MQ=255)
gATGAGCGCCGAGTACGCCTGGTACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGTTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTg > 2:308663/1‑151 (MQ=255)
gATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTg < 1:6331886/151‑1 (MQ=255)
aTGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGt > 2:1646271/1‑151 (MQ=255)
aTGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGt < 2:8816419/151‑1 (MQ=255)
tGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTc < 2:9761046/151‑1 (MQ=255)
tGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTc < 1:2470656/151‑1 (MQ=255)
cgcCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTcgctg > 2:5627564/1‑151 (MQ=255)
gcCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTcgctgc > 2:3141889/1‑151 (MQ=255)
ccGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGGTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTcgctgcc > 2:6108702/1‑151 (MQ=255)
ccGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGGTGCTGGTGACGCTGTTCGGACGGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTcgctgcc < 2:2258512/151‑1 (MQ=255)
cGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTcgctgccg < 2:7994834/151‑1 (MQ=255)
tACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTcgctgccgctgc < 2:1578060/151‑1 (MQ=255)
tACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTcgctgccgctgc > 1:1073951/1‑151 (MQ=255)
tACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTcgctgccgctgc < 2:5878717/151‑1 (MQ=255)
tACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGATGCGGGTGACGCAGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCCGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTcgcagccgctgc < 1:7093289/151‑1 (MQ=255)
tGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGcc < 1:9001902/151‑1 (MQ=255)
ggACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTg < 1:6610681/151‑1 (MQ=255)
ggACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTg < 1:4582188/151‑1 (MQ=255)
ggACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTg > 1:7891058/1‑151 (MQ=255)
gACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTgg < 2:9608402/151‑1 (MQ=255)
gACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTgg > 2:11088326/1‑151 (MQ=255)
gACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTgg > 2:11314941/1‑151 (MQ=255)
gACCGCGCCGAGGTGTCGCTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTgg > 1:2184166/1‑151 (MQ=255)
gcgcCGAGGTGTCGTTGCTGGTGCCGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCAGCACCAGCCCGCTCCAGGGCTGGCCGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTggcggc < 2:10469157/151‑1 (MQ=255)
cgcCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGgcggcg < 1:1530355/151‑1 (MQ=255)
cGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTg < 1:1765502/151‑1 (MQ=255)
gAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGa < 1:5468383/151‑1 (MQ=255)
aGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGaa > 2:2103001/1‑151 (MQ=255)
ggagtCGTTGCTGGAGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAAt < 2:4119746/148‑1 (MQ=255)
ggTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAAt > 1:11469991/1‑151 (MQ=255)
tgtCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGc < 1:3053063/151‑1 (MQ=255)
gtCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACACTGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGATTGcc > 1:724247/1‑151 (MQ=255)
gTGACGCTGTTCGGACGGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAAc > 2:1222033/1‑151 (MQ=255)
gACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAActc > 2:1007278/1‑151 (MQ=255)
cGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAACTCTa < 2:6589867/151‑1 (MQ=255)
cTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAACTCTAcg < 2:4504039/151‑1 (MQ=255)
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TGGTGGCGATCATGCTCGGGCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGTTCAAGGGCTGGCTGATCAACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAACTCTACGCGCTGTTCCTGCTGATCGGCCTGCTGGCGCCAG > NC_008463/2651190‑2651489
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |