Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F1 I1 R1
|
274 |
511.2 |
22276341 |
99.2% |
22098130 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
1,501,459 |
T→G |
T676P (ACC→CCC) |
mutS ← |
DNA mismatch repair protein MutS |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 1,501,459 | 0 | T | G | 99.8%
| 1695.1
/ ‑4.1
| 437 | T676P (ACC→CCC) | mutS | DNA mismatch repair protein MutS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base G (225/211); total (226/211) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 |
Only 100 of 441 total aligned reads displayed.
TGGCGAACAGGGTGAAGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGATATGCGCAAGCAGCACGATCAGCG > NC_008463/1501312‑1501605
|
tggCGAACAGGGTGAAGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGgtt < 2:2950497/150‑1 (MQ=255)
cGAACAGGGTGAAGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCATGATGTTGGCGGGTTCGc < 1:599239/150‑1 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTc > 1:3930238/1‑150 (MQ=255)
aCAGGGTGAAGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCa > 2:5667551/1‑150 (MQ=255)
aCAGGGTGAAGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCa > 2:781995/1‑150 (MQ=255)
aCAGGGTGAAGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCa < 2:9697355/150‑1 (MQ=255)
gggTGAAGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCAtct < 1:3359076/150‑1 (MQ=255)
ggTGAAGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCAtctc < 1:868579/150‑1 (MQ=255)
tGAAGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGTTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTAAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTcca > 1:10358732/1‑150 (MQ=255)
aGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTccacca < 2:69630/150‑1 (MQ=255)
ggCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCAt < 1:2445685/150‑1 (MQ=255)
cgcgAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGa > 1:3058926/1‑150 (MQ=255)
gcgAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCAGGaa > 2:5864801/1‑150 (MQ=255)
gcgAGGCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCGGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCCTCAGCCCCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGGTGGCGGGTTCGCTCATCTccacccagaa < 2:4751655/150‑6 (MQ=255)
cgAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAg > 1:4497516/1‑150 (MQ=255)
cgAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTGGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAg > 2:2616659/1‑150 (MQ=255)
gAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAgg > 2:319122/1‑150 (MQ=255)
gAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAgg < 1:10058373/150‑1 (MQ=255)
gAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTGGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAgg > 2:1389832/1‑150 (MQ=255)
aGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGt < 2:9382420/150‑1 (MQ=255)
aGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCGGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGAGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGt < 2:4383622/150‑1 (MQ=255)
gTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTc > 2:6996059/1‑150 (MQ=255)
cGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAg < 1:7116045/150‑1 (MQ=255)
gggCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGc > 1:6338201/1‑150 (MQ=255)
ggCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCg > 2:10129295/1‑150 (MQ=255)
gCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCCTCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCAGGAAGGTCGAGCgg > 1:7815678/1‑150 (MQ=255)
ccAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGACGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGATCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGgc < 2:5310315/150‑1 (MQ=255)
ccAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGgc < 2:679543/150‑1 (MQ=255)
cAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGgcc > 2:4588553/1‑150 (MQ=255)
aGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGgccg > 2:8626517/1‑150 (MQ=255)
gTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGgccgcc > 1:6807579/1‑150 (MQ=255)
tCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGccgccg > 1:8759461/1‑150 (MQ=255)
cTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCGTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGGTCGCTCATCTCCACCCTGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGc > 2:8892430/1‑150 (MQ=255)
ccGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGACGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCCCCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGgt < 2:278109/150‑1 (MQ=255)
ccGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCCTCCATCAGCACCAGGCTCTTCTCAGTTGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCAACTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGgt < 2:10333284/150‑1 (MQ=255)
ccGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGgt < 2:3675392/150‑1 (MQ=255)
cGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCATGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCAACATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGgtc > 1:208173/1‑150 (MQ=255)
gCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGgtcg > 2:4903014/1‑150 (MQ=255)
ccAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGa < 2:6159711/150‑1 (MQ=255)
ccAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGa > 2:7570476/1‑150 (MQ=255)
cAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGAc > 2:7932102/1‑150 (MQ=255)
cAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGAc < 1:7892039/150‑1 (MQ=255)
aGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCACATCCAACAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACg > 1:10880375/1‑150 (MQ=255)
ggCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGa > 2:9044856/1‑150 (MQ=255)
ggCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGa > 1:2236972/1‑150 (MQ=255)
ccAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGc > 1:1601609/1‑150 (MQ=255)
cAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGcc > 2:8448549/1‑150 (MQ=255)
aCAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGc < 2:5023378/150‑1 (MQ=255)
aCAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGc < 2:7161565/150‑1 (MQ=255)
cAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCg > 2:6301771/1‑150 (MQ=255)
aGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCgg < 2:4625746/150‑1 (MQ=255)
ggCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCggg < 1:8199042/150‑1 (MQ=255)
gCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGt < 1:6972621/150‑1 (MQ=255)
gTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGaa > 1:7536089/1‑150 (MQ=255)
cGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGa < 2:986043/150‑1 (MQ=255)
cGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGa < 1:9649983/150‑1 (MQ=255)
cGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGa > 1:4107781/1‑150 (MQ=255)
gAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGAt < 1:5158137/150‑1 (MQ=255)
aGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGc > 2:5496919/1‑150 (MQ=255)
aGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGc < 1:4923400/150‑1 (MQ=255)
cTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTcc > 1:526719/1‑150 (MQ=255)
ggTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCTCCGGCAAGGTCGACGGACGAGCCGAAGCGGGTGAAGATGCGGTccac > 2:8347065/1‑150 (MQ=255)
gTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTccacc < 2:8498652/150‑1 (MQ=255)
ccGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAgg < 1:10419164/150‑1 (MQ=255)
gcgGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGa < 1:8948705/150‑1 (MQ=255)
ccGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGc > 1:6166787/1‑150 (MQ=255)
cGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCt > 1:1793338/1‑150 (MQ=255)
cGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCt > 1:5711646/1‑150 (MQ=255)
ccTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGc > 2:6397894/1‑150 (MQ=255)
ccTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGc < 1:7232668/150‑1 (MQ=255)
tCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAg < 1:2822736/150‑1 (MQ=255)
tccatcAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAgcgc > 1:6853756/1‑150 (MQ=255)
catcAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAgcgcgc < 1:116936/150‑1 (MQ=255)
gCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCg > 1:462848/1‑150 (MQ=255)
ggCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGa < 1:9701686/150‑1 (MQ=255)
gCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGaa > 2:1795429/1‑150 (MQ=255)
tctTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGc > 1:7645420/1‑150 (MQ=255)
tctTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGc < 1:9309460/150‑1 (MQ=255)
tctTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGc < 2:7396468/150‑1 (MQ=255)
tCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCg > 2:10997190/1‑150 (MQ=255)
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ttgctttGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCAACAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGACCGAAGCTGCCGatat < 2:2178010/145‑1 (MQ=255)
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CAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCACATCCAACAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACG > SRR18135098.10928674/1‑151 (MQ=60)
GCCAGCGTCAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGC > SRR18135098.1609337/1‑151 (MQ=60)
GCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGC > SRR18135098.1609277/1‑151 (MQ=60)
CAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCG > SRR18135098.8404751/1‑151 (MQ=60)
CGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATG < SRR18135098.678315/151‑1 (MQ=60)
GACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGC > SRR18135098.10446585/1‑151 (MQ=60)
ACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCG < SRR18135098.1899300/151‑1 (MQ=60)
GGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGT < SRR18135098.8236257/151‑1 (MQ=60)
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GTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGT > SRR18135098.8753144/1‑151 (MQ=60)
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GTCAGTGGCGTCGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCG > SRR18135098.7052221/1‑151 (MQ=60)
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GGTGGCGAACAGGGTGAAGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGATATGCGCAAGCAGCACGATCAGCGCGGT > NC_008463/1501310‑1501609
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |