Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
275 |
500.0 |
21685688 |
99.2% |
21512202 |
151.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
1,501,459 |
T→G |
T676P (ACC→CCC) |
mutS ← |
DNA mismatch repair protein MutS |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 1,501,459 | 0 | T | G | 99.4%
| 1820.0
/ NA
| 471 | T676P (ACC→CCC) | mutS | DNA mismatch repair protein MutS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/1); new base G (226/242); total (228/243) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.13e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 476 total aligned reads displayed.
GTGGCGAACAGGGTGAAGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGATATGCGCAAGCAGCACGATCAGCGC > NC_008463/1501311‑1501606
|
gtggCGAACAGGGTGCAGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCACGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCCGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGgtt < 2:6561082/151‑1 (MQ=255)
tggCGAACAGGGTGAAGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTc < 2:2678247/151‑1 (MQ=255)
tggCGAACAGGGTGAAGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTc > 1:147242/1‑151 (MQ=255)
tggCGAACAGGGTGAAGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCCGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTc < 2:9399551/151‑1 (MQ=255)
gCGAACAGGGTGAAGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGc > 2:1602282/1‑151 (MQ=255)
cGAACAGGGTGAAGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCt > 2:1283718/1‑151 (MQ=255)
cGAACAGGGTGAAGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCt > 2:8125773/1‑151 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCa > 1:5076551/1‑151 (MQ=255)
aaCAGGGTGAAGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCa < 2:1427362/151‑1 (MQ=255)
aCAGGGTGAAGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCAt > 1:7843338/1‑151 (MQ=255)
aGGGTGCAGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCGGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCTGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCAtct < 2:6818631/151‑1 (MQ=255)
aGGGTGAAGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCAtct < 1:461762/151‑1 (MQ=255)
tGAAGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTccac > 1:4884834/1‑151 (MQ=255)
gcgcGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGa < 1:839399/151‑1 (MQ=255)
cgAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAgg > 1:9808136/1‑151 (MQ=255)
gAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGt > 1:6060824/1‑151 (MQ=255)
gAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGt > 2:2747018/1‑151 (MQ=255)
cGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGc < 1:2646815/151‑1 (MQ=255)
ggCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCgg < 1:10561873/151‑1 (MQ=255)
ggCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCAGGAAGGTCGAGCgg > 2:5396963/1‑151 (MQ=255)
ggCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGGCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCgg > 1:3540595/1‑151 (MQ=255)
cAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGgccg > 2:4848886/1‑151 (MQ=255)
gTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGccgccg > 1:7994166/1‑151 (MQ=255)
gTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGccgccg < 1:3653503/151‑1 (MQ=255)
gTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGccgccg > 1:5141658/1‑151 (MQ=255)
ccTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGc < 2:1140385/151‑1 (MQ=255)
tCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCaa > 1:6260612/1‑151 (MQ=255)
cGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAg < 2:10763197/151‑1 (MQ=255)
cGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGGTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCCAg > 2:5607822/1‑151 (MQ=255)
gCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGgt > 1:8246281/1‑151 (MQ=255)
gCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGgt < 1:2179581/151‑1 (MQ=255)
gCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGgt < 2:848645/151‑1 (MQ=255)
ccGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGgtc > 1:10079876/1‑151 (MQ=255)
ccGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGgtc > 2:2365164/1‑151 (MQ=255)
ccGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGgtc < 1:1872948/151‑1 (MQ=255)
cTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGgtcgtc > 2:7049601/1‑151 (MQ=255)
ccAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGAc < 2:4175265/151‑1 (MQ=255)
ccAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGAc < 2:1892254/151‑1 (MQ=255)
ccAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGAc < 1:3124960/151‑1 (MQ=255)
aGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGGCGGACGa > 2:7774769/1‑151 (MQ=255)
ccAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGcc < 2:6674980/151‑1 (MQ=255)
cAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCg > 2:1013897/1‑151 (MQ=255)
aGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGa < 1:4460576/151‑1 (MQ=255)
aCAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCg > 1:3187665/1‑151 (MQ=255)
gCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTg > 1:8519222/1‑151 (MQ=255)
cGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATTAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGaa < 2:4648257/151‑1 (MQ=255)
cGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGaa < 1:10013904/151‑1 (MQ=255)
gTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGTCCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCCTCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAg > 2:788942/1‑151 (MQ=255)
gTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAg < 2:9219983/151‑1 (MQ=255)
gTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAg > 1:7799470/1‑151 (MQ=255)
cGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGAt > 2:10559977/1‑151 (MQ=255)
gAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATg > 2:6257792/1‑151 (MQ=255)
gAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATg > 1:10212250/1‑151 (MQ=255)
gAAGGTGCGGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATg > 1:4205147/1‑151 (MQ=255)
aGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCg > 2:8820855/1‑151 (MQ=255)
aGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCg > 1:1178441/1‑151 (MQ=255)
gCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTcc > 1:3838469/1‑151 (MQ=255)
tGGTGCCGCGGCCGACCTCTTCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGCGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGTGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTcctc > 1:7344781/1‑149 (MQ=255)
tGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTccac < 2:719246/151‑1 (MQ=255)
gTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTccacca < 2:5887501/151‑1 (MQ=255)
gCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAgg < 2:5220990/151‑1 (MQ=255)
cgcgGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGa < 1:10297554/151‑1 (MQ=255)
cgGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACa > 1:2299543/1‑151 (MQ=255)
ccGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCCTCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCt > 2:3803914/1‑151 (MQ=255)
cGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTc > 1:6495/1‑151 (MQ=255)
cGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTc < 2:9033974/151‑1 (MQ=255)
gACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCg < 1:2957652/151‑1 (MQ=255)
tCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAgc > 1:8976253/1‑151 (MQ=255)
tCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAgc < 2:4041904/151‑1 (MQ=255)
catcAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCa < 2:3976623/151‑1 (MQ=255)
atcAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAg > 1:5731222/1‑151 (MQ=255)
cAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGcc > 2:8640200/1‑151 (MQ=255)
aGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCg > 2:1569298/1‑151 (MQ=255)
aGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCAGGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCg > 2:3163125/1‑151 (MQ=255)
aCCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGaa < 1:9611360/151‑1 (MQ=255)
ccAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAAc < 2:3348704/151‑1 (MQ=255)
ggCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGaa < 2:9626679/151‑1 (MQ=255)
ggCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGaa < 2:4416347/151‑1 (MQ=255)
ggCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGaa < 1:7635447/151‑1 (MQ=255)
ctTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTg < 2:2276201/151‑1 (MQ=255)
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CCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGAC < SRR18135068.3140546/151‑1 (MQ=60)
GGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAG < SRR18135068.494422/151‑1 (MQ=60)
CCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCC > SRR18135068.4210372/1‑151 (MQ=60)
AGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGA > SRR18135068.6821237/1‑151 (MQ=60)
AGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGA < SRR18135068.4482653/151‑1 (MQ=60)
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GCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGAT < SRR18135068.2213254/151‑1 (MQ=60)
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GTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAG < SRR18135068.10838682/151‑1 (MQ=60)
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CTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTG > SRR18135068.990075/1‑151 (MQ=60)
CTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTG < SRR18135068.7050710/151‑1 (MQ=60)
TTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGC < SRR18135068.1649684/151‑1 (MQ=60)
TTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGC > SRR18135068.5045958/1‑151 (MQ=60)
TTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGC > SRR18135068.1521175/1‑151 (MQ=60)
TTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGC < SRR18135068.4773218/151‑1 (MQ=60)
GTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCG < SRR18135068.8245168/151‑1 (MQ=60)
GTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCG > SRR18135068.10218775/1‑151 (MQ=60)
TCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGA > SRR18135068.8651137/1‑151 (MQ=60)
CAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGANGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGAT < SRR18135068.5712164/151‑1 (MQ=60)
AGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGATA > SRR18135068.732429/1‑151 (MQ=60)
AGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGATA < SRR18135068.9655351/151‑1 (MQ=60)
GGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGATATGC < SRR18135068.4859694/151‑1 (MQ=60)
GCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGATATGCG < SRR18135068.5108695/151‑1 (MQ=60)
GCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGATATGCG > SRR18135068.2999135/1‑151 (MQ=60)
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GTTGTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGATATGCGCA > SRR18135068.10841611/1‑151 (MQ=60)
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GTGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGATATGCGCAAGC < SRR18135068.7068071/151‑1 (MQ=60)
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TGCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGATATGCGCAAGCA > SRR18135068.8115571/1‑151 (MQ=60)
GCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGATATGCGCAAGCAG > SRR18135068.4007298/1‑151 (MQ=60)
GCAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGATATGCGCAAGCAG < SRR18135068.96457/151‑1 (MQ=60)
CAGGATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGATATGCGCAAGCAGC < SRR18135068.6563051/151‑1 (MQ=60)
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GATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGATATGCGCAAGCAGCACG < SRR18135068.6668535/151‑1 (MQ=60)
ATGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGATATGCGCAAGCAGCACGA > SRR18135068.7841461/1‑151 (MQ=60)
TGTTGGCGGGTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGATATGCGCAAGCAGCACGAT > SRR18135068.6495746/1‑151 (MQ=60)
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GTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGATATGCGCAAGCAGCACGATCAGCGCGGT > SRR18135068.6186916/1‑151 (MQ=60)
GTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGATATGCGCAAGCAGCACGATCAGCGCGGT < SRR18135068.7028744/151‑1 (MQ=60)
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GGGTGGCGAACAGGGTGAAGGCGCGAGTCCGGGCCAGGTCCTCGGCCGCTGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTGCCGCGGCCGACCTCATCCATCAGCACCAGGCTCTTGTCAGTGGCGTTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGGCCGCCGGCAAGGTCGTCGGACGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCCACCAGGGACAGCTCGCAGCGCGCAGCCGGAACGAAGCTGCCGATATGCGCAAGCAGCACGATCAGCGCGGT > NC_008463/1501309‑1501609
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
