Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F1 I1 R1
|
255 |
512.9 |
22386308 |
99.2% |
22207217 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
RA |
NC_008463 |
2,594,659 |
Δ1 bp |
coding (1007/1350 nt) |
nuoF ← |
NADH‑quinone oxidoreductase subunit NuoF |
|
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
* | NC_008463 | 2,594,657 | 0 | G | . | 98.7%
| 2536.4
/ 18.9
| 529 | coding (1009/1350 nt) | nuoF | NADH‑quinone oxidoreductase subunit NuoF |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/6); new base . (266/254); total (268/261) |
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.53e-02 |
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 546 total aligned reads displayed.
CCTTCGCCACGCTCTAGGGCGCGCAGCAGCTTCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCAGGGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCAGGGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCATGGGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGCCTTGAGCTGGAAGCCGTCGCGCATGCCGCCG > NC_008463/2594506‑2594802
|
ccTTCGCCACGCTCTAGGGCGCGCAGCAGCTTCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCATg < 2:5011454/150‑1 (MQ=255)
tCGCCACGCTCTAGGGCGCGCAGCAGCTTCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGAGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCATggcc < 2:919025/150‑3 (MQ=255)
aCGCTCTAGGGCGCGCAGCAGCTTCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGcc > 1:1630440/1‑150 (MQ=255)
cGCTCTAGGGCGCGCAGCAGCTTCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCg < 2:10813014/150‑1 (MQ=255)
cGCTCTAGGGCGCGCAGCAGCTTCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCg > 1:6843418/1‑150 (MQ=255)
ctctAGGGCGCGCAGCAGCTTCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGt < 2:8955139/150‑1 (MQ=255)
tctAGGGCGCGCAGCAGCTTCCCGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTg < 2:1602247/150‑1 (MQ=255)
tctAGGGCGCGCAGCAGCTACACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTg > 1:2749241/1‑150 (MQ=255)
ctAGGGCGCGCAGCAGCTTCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGc > 2:1750105/1‑150 (MQ=255)
tAGGGCGCGCAGCAGCTTCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGcc > 2:11181559/1‑150 (MQ=255)
aGGGCGCGCAGCAGCTTCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGccc > 2:3954774/1‑150 (MQ=255)
cgcgcAGCAGCTTCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATcc > 1:8009876/1‑150 (MQ=255)
gcgcAGCAGCTTCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCg > 2:2418962/1‑150 (MQ=255)
gcgcAGCAGCTTCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCg < 1:8167699/150‑1 (MQ=255)
gcagcTTCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGc > 1:4653370/1‑150 (MQ=255)
cagcTTCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCACCCGGGTGcc > 1:1128264/1‑150 (MQ=255)
agcTTCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCg < 1:8684266/150‑1 (MQ=255)
gcTTCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGa < 1:9562384/150‑1 (MQ=255)
cTTCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGAc > 2:3356003/1‑150 (MQ=255)
ttCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGAcc < 2:4918890/150‑1 (MQ=255)
tCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCt < 2:8359443/150‑1 (MQ=255)
tCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCt < 2:1970307/150‑1 (MQ=255)
tCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCt < 1:4428343/150‑1 (MQ=255)
cACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGTAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCCT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCtt < 2:7240947/150‑1 (MQ=255)
cACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCtt > 2:4565062/1‑150 (MQ=255)
tCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGa < 2:3640993/150‑1 (MQ=255)
ccACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGAt > 1:5837467/1‑150 (MQ=255)
ccACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGAt > 2:6153317/1‑150 (MQ=255)
ccACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGAt > 2:8686676/1‑150 (MQ=255)
aCGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATgc < 2:9374193/150‑1 (MQ=255)
ggCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATgccg > 1:7222662/1‑150 (MQ=255)
gCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATgccgc > 2:3717406/1‑150 (MQ=255)
gCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATgccgc < 1:2927415/150‑1 (MQ=255)
cAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATgccgcc > 1:5631466/1‑150 (MQ=255)
cAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATgccgcc < 2:5838060/150‑1 (MQ=255)
aGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGccgccg > 1:10199413/1‑150 (MQ=255)
aGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGccgccg > 1:246267/1‑150 (MQ=255)
ggCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCgg < 1:6476098/150‑1 (MQ=255)
ccGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCg < 2:6452971/150‑1 (MQ=255)
ccGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCg > 1:7031505/1‑150 (MQ=255)
tCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAAc > 1:6409934/1‑150 (MQ=255)
ggcagggggTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCt < 2:9726267/146‑1 (MQ=255)
ggcagggggTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCt > 1:3213738/5‑150 (MQ=255)
gcagggggTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTg < 1:2049323/147‑1 (MQ=255)
gcagggggTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTg < 1:384576/147‑1 (MQ=255)
cagggggTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTgc > 2:8440083/3‑150 (MQ=255)
gggTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCAt < 2:5719966/150‑1 (MQ=255)
cAGCCGCAGGTCTCGCGGGCGTAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGc < 2:5943980/150‑1 (MQ=255)
cGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCg > 2:7496596/1‑150 (MQ=255)
cAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGATGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCggg < 1:1276134/150‑1 (MQ=255)
cAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCGTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCggg < 2:10685586/150‑1 (MQ=255)
ggtcTCGCGGGCGAAGATCTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAg < 2:5399128/147‑1 (MQ=255)
gACACGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGc > 1:7402744/1‑150 (MQ=255)
tCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCCT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAgg > 2:123132/1‑150 (MQ=255)
cgcgGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGa < 2:6771670/150‑1 (MQ=255)
cgGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAg < 1:3702689/150‑1 (MQ=255)
gggCGAAGAACTCTTCCATGTAGCGCAGCA‑GGGAAACCCTGTTGCTGCTGTCGTCCACCGCCA‑GTGCCAGGCCGGTGCCCCTCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGACCATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGc < 1:1857297/150‑1 (MQ=255)
aaCTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCg > 1:5022317/1‑150 (MQ=255)
aaCTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCg > 1:10826308/1‑150 (MQ=255)
ctctTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGgc < 1:8548234/150‑1 (MQ=255)
ctctTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGgc < 1:9089176/150‑1 (MQ=255)
tctTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGgcg > 2:2572799/1‑150 (MQ=255)
tctTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGgcg > 2:855652/1‑150 (MQ=255)
ttCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGcgcc < 2:4710084/150‑1 (MQ=255)
tCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGAGACGACCTAGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGcgccg > 2:6003135/1‑150 (MQ=255)
cctggtGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCGTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGATGCCGGTACCGGCgcctcc < 2:8080250/145‑1 (MQ=255)
cATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCgccgcc < 2:10525361/150‑1 (MQ=255)
ttGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGc < 2:6342500/150‑1 (MQ=255)
tGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGAGCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCt > 2:7919263/1‑150 (MQ=255)
tGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCt > 1:7310285/1‑150 (MQ=255)
tGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCt < 1:7765606/150‑1 (MQ=255)
gcgcAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTg > 2:6493166/1‑150 (MQ=255)
gcagca‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGcc > 1:6034634/1‑150 (MQ=255)
gcagca‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCGGcc > 2:10307214/1‑150 (MQ=255)
agcatgtaaaCCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAg < 2:39760/143‑1 (MQ=255)
gcagggAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAgg < 1:10946808/147‑1 (MQ=255)
gggAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGCCt > 1:10463421/1‑150 (MQ=255)
ggAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGCCtt > 1:2144475/1‑150 (MQ=255)
ggAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCAAGGCCtt > 2:6932171/1‑150 (MQ=255)
gAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGCCTTg > 2:7723024/1‑150 (MQ=255)
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TTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCT < SRR18135095.729355/151‑1 (MQ=60)
TTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCT < SRR18135095.1197831/151‑1 (MQ=60)
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GCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGC > SRR18135095.4294813/1‑151 (MQ=60)
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ATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTAGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGCCTAGAGCTGGAAGCCGT > SRR18135095.3074374/1‑151 (MQ=60)
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TCGCCACGCTCTAGGGCGCGCAGCAGCTTCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCAGGGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCAGGGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCATGGGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGCCTTGAGCTGGAAGCCGTCGCGCATGCCGCCGGCGTAGT > NC_008463/2594509‑2594809
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |