Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F1 I1 R1
|
254 |
498.2 |
21552474 |
99.3% |
21401606 |
151.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
2,594,659 |
Δ1 bp |
coding (1007/1350 nt) |
nuoF ← |
NADH‑quinone oxidoreductase subunit NuoF |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 2,594,657 | 0 | G | . | 99.5%
| 2653.8
/ 3.8
| 543 | coding (1009/1350 nt) | nuoF | NADH‑quinone oxidoreductase subunit NuoF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/3); new base . (282/256); total (284/259) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.09e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 560 total aligned reads displayed.
GCCTTCGCCACGCTCTAGGGCGCGCAGCAGCTTCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCAGGGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCAGGGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCATGGGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGCCTTGAGCTGGAAGCCGTCGCGCATGCCGCCGG > NC_008463/2594505‑2594803
|
ccTTCGCCACGCTCTAGGGCGCGCAGCAGCTTCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCATgg < 1:9384270/151‑1 (MQ=255)
cTTCGCCACGCTCTAGGGCGCGCAGCAGCTTCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCATggc > 1:5257528/1‑150 (MQ=255)
cTTCGCCACGCTCTAGGGCGCGCAGCAGCTTCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCATggc < 1:9205586/151‑2 (MQ=255)
tCGCCACGCTCTAGGGCGCGCAGCAGCTTCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCATggcca < 2:10346057/151‑4 (MQ=255)
cGCCACGCTCTAGGGCGCGCAGCAGCTTCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCATggccag > 1:419374/1‑147 (MQ=255)
ccACGCTCTAGGGCGCGCAGCAGCTTCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACACTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGc < 1:7286581/151‑1 (MQ=255)
cACGCTCTAGGGCGCGCAGCAGCTTCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGcc < 1:6302510/151‑1 (MQ=255)
aCGCTCTAGGGCGCGCAGCAGCTTCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCg < 1:3443721/151‑1 (MQ=255)
cGCTCTAGGGCGCGCAGCAGCTTCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCgg < 1:10464974/151‑1 (MQ=255)
cGCTCTAGGGCGCGCAGCAGCTTCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCA‑AGGCCAGGCCgg > 1:1772296/1‑151 (MQ=255)
tctAGGGCGCGCAGCAGCTTCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGc > 1:4672543/1‑151 (MQ=255)
tAGGGCGCGCAGCAGCTTCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGccc < 1:2863871/151‑1 (MQ=255)
gggCGCGCAGCAGCTTCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGATGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCAt < 1:894812/151‑1 (MQ=255)
gcgcgcAGCAGCTTCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCTTcc < 2:745482/151‑1 (MQ=255)
cagcagCTTCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTg > 2:1572973/1‑151 (MQ=255)
gcagcTTCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGcc < 2:6013391/151‑1 (MQ=255)
cagcTTCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCg > 1:10571095/1‑151 (MQ=255)
agcTTCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGa < 2:7750462/151‑1 (MQ=255)
agcTTCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGa > 2:463293/1‑151 (MQ=255)
ttCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCt > 2:4128704/1‑151 (MQ=255)
ttCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCt > 2:215953/1‑151 (MQ=255)
ttCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCt > 1:9028753/1‑151 (MQ=255)
tCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCtt < 2:8257869/151‑1 (MQ=255)
cGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGc < 1:7926269/151‑1 (MQ=255)
tCCACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGAt < 1:9768810/151‑1 (MQ=255)
ccACGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATg < 2:8581007/151‑1 (MQ=255)
aCGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATgcc < 2:1993253/151‑1 (MQ=255)
aCGGCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATgcc < 2:93220/151‑1 (MQ=255)
ggCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATgccgc < 1:3626817/151‑1 (MQ=255)
ggCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATgccgc < 2:3219709/151‑1 (MQ=255)
gCAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGCCCTTGGCGATgccgcc < 2:8407742/151‑1 (MQ=255)
cAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGCAACCCTGTTGATGCGGTCGGCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGAGGccgccg < 2:1290968/151‑1 (MQ=255)
cAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGccgccg > 1:4396520/1‑151 (MQ=255)
cAGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCAGGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGccgccg < 1:9953788/151‑1 (MQ=255)
aGGCCGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGACCTCTTCCATGTTGCGCACCA‑GGGAAACCATGTTGAGGCTGTCGTCCACCGCCA‑AGGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCgg > 2:4409412/1‑151 (MQ=255)
cGTCGCGGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGaa < 2:6780599/151‑1 (MQ=255)
cgGCA‑GGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCt > 1:1310770/1‑151 (MQ=255)
agggggTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTgcgc > 2:4734932/2‑151 (MQ=255)
ggggTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCAt < 2:10080157/151‑1 (MQ=255)
ggggTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCAt < 1:1008780/151‑1 (MQ=255)
ggTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATcc < 2:499838/151‑1 (MQ=255)
ggTGCACCAGCCGCACGACTCGCGGGCGAAGACCTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATcc < 1:3130700/151‑1 (MQ=255)
cACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGt < 2:10720071/151‑1 (MQ=255)
ccAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGc > 1:2129059/1‑151 (MQ=255)
aGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTc < 2:525114/151‑1 (MQ=255)
aGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTc > 2:9580243/1‑151 (MQ=255)
ccGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCg > 1:7166936/1‑151 (MQ=255)
cAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGa > 2:3971221/1‑151 (MQ=255)
cTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAgg < 2:2416022/151‑1 (MQ=255)
tCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGa < 1:5191691/151‑1 (MQ=255)
cgcgGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGaa < 2:6457358/151‑1 (MQ=255)
gcgGGCGAAGAACTCTTCCATGATGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAg < 1:6000844/151‑1 (MQ=255)
cgGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGc < 1:5078434/151‑1 (MQ=255)
gggCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGcc > 1:8084775/1‑151 (MQ=255)
gggCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGcc > 1:10737238/1‑151 (MQ=255)
ggCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCg > 1:6800048/1‑151 (MQ=255)
cGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGt < 2:8862143/151‑1 (MQ=255)
cGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGt > 1:6568808/1‑151 (MQ=255)
gaagaaCTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTa > 2:3530838/1‑151 (MQ=255)
gaaCTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCg > 1:3946621/1‑151 (MQ=255)
aaCTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCgg > 2:6311231/1‑151 (MQ=255)
tctctTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACTTCTGAGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGgc > 1:6448627/2‑151 (MQ=255)
aCTCTTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGgc < 1:2254333/151‑1 (MQ=255)
tctTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGgcgc > 1:8354710/1‑151 (MQ=255)
tctTCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGgcgc > 2:3045529/1‑151 (MQ=255)
cgtCCATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCCGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGcgcc < 1:5399622/149‑1 (MQ=255)
aTGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCgg > 1:251066/1‑151 (MQ=255)
tGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTg > 2:3632777/1‑151 (MQ=255)
tGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACAACTGCGCATCCACGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTAACCGCGCCGCCGGGCTg > 1:2630855/1‑151 (MQ=255)
gcgcAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGc < 2:10508553/151‑1 (MQ=255)
gcagca‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCa < 2:7803707/151‑1 (MQ=255)
cagca‑gGGAATCCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGATCATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGATGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAg < 2:5204125/151‑1 (MQ=255)
cagggAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGcc < 1:6197453/149‑1 (MQ=255)
cagggAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGcc > 1:7645680/3‑151 (MQ=255)
cagggAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGcc < 1:7545640/149‑1 (MQ=255)
agggAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGCCt < 1:1865536/150‑1 (MQ=255)
ggAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGCCTTg > 2:917320/1‑151 (MQ=255)
ggAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGCCTTg < 1:5608074/151‑1 (MQ=255)
aaaCCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGCCTTGAg > 2:3734452/1‑151 (MQ=255)
aCCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGATCATCTGCGCATCCTGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGCCTTGAGCt < 1:1538839/151‑1 (MQ=255)
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ATGTTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGG > SRR18135094.68160/1‑151 (MQ=60)
TTGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCT > SRR18135094.6149354/1‑151 (MQ=60)
TGCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACAACTGCGCATCCACGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTAACCGCGCCGCCGGGCTG > SRR18135094.2642424/1‑151 (MQ=60)
GCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGC < SRR18135094.1533129/151‑1 (MQ=60)
GCGCAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGC > SRR18135094.8262630/1‑151 (MQ=60)
CAGCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAG > SRR18135094.1473549/1‑151 (MQ=60)
GCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGC > SRR18135094.4235191/1‑151 (MQ=60)
GCA‑GGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGC > SRR18135094.7412875/1‑151 (MQ=60)
caGGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGCC < SRR18135094.6224441/149‑1 (MQ=60)
caGGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGCC < SRR18135094.7577717/149‑1 (MQ=60)
AGGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGCCT < SRR18135094.10021113/151‑1 (MQ=60)
AGGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGCCT < SRR18135094.1873760/151‑1 (MQ=60)
AGGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGCCT > SRR18135094.1464346/1‑151 (MQ=60)
AGGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGCCT > SRR18135094.6351541/1‑151 (MQ=60)
GGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGCCTTG < SRR18135094.5632909/151‑1 (MQ=60)
GAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGCCTTGA > SRR18135094.1309644/1‑151 (MQ=60)
AACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGCCTTGAGC < SRR18135094.72605/151‑1 (MQ=60)
AACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGCCTTGAGC > SRR18135094.5221879/1‑151 (MQ=60)
AACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGCCTTGAGC > SRR18135094.5727133/1‑151 (MQ=60)
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ACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGCCTTGAGCT > SRR18135094.7143095/1‑151 (MQ=60)
ACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGCCTTGAGCT > SRR18135094.7104251/1‑151 (MQ=60)
CCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGCCTTGAGCTG < SRR18135094.3984374/151‑1 (MQ=60)
ATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGCCTTGAGCTGGA > SRR18135094.3665286/1‑151 (MQ=60)
ATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGCCTTGAGCTGGA > SRR18135094.10031018/1‑151 (MQ=60)
TGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGCCTTGAGCTGGAA < SRR18135094.387060/151‑1 (MQ=60)
TGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGCCTTGAGCTGGAA < SRR18135094.1623682/151‑1 (MQ=60)
TGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGCCTTGAGCTGGAA < SRR18135094.385898/151‑1 (MQ=60)
tgtttctgctgtagtcatcctccatGGCCAGGCCGGTGCCCATCCTGGAGCAGACCTTGGCGATGCCGACGTCGATCATATGCGCATCCTGGTGCTCGGGGTGCTTGAAGACGGTACCGGGTCCGCCGGGCTGCCAGGCCTTGAGCTGGAA < SRR18135094.1109137/126‑1 (MQ=45)
TGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGCCTTGAGCTGGAAGCC > SRR18135094.9264621/1‑151 (MQ=60)
TGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGCCTTGAGCTGGAAGCC < SRR18135094.7967880/151‑1 (MQ=60)
TGATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGCCTTGAGCTGGAAGCC < SRR18135094.9626307/151‑1 (MQ=60)
GATGCTGTCGTCCACCGCCAT‑GGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGCCTTGAGCTGGAAGCCG < SRR18135094.7094698/151‑1 (MQ=60)
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GCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGCCTTGAGCTGGAAGCCGTCGCGCATGCCGCCGGCGTAGT > SRR18135094.1851112/1‑151 (MQ=60)
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CTTCGCCACGCTCTAGGGCGCGCAGCAGCTTCACGCTCCACGGCAGGCCGTCGCGGCAGGGGGGTGCACCAGCCGCAGGACTCGCGGGCGAAGAACTCTTCCATGTTGCGCAGCAGGGGAAACCATGTTGATGCTGTCGTCCACCGCCATGGGCCAGGCCGGTGCCCATCCGGGTGCCGACCTTGGCGATGCCGCCGGCGAACATCTGCGCATCCAGGTGCTCCGGGAGCAGGAAGCCGGTACCGGCGCCGCCGGGCTGCCAGGCCTTGAGCTGGAAGCCGTCGCGCATGCCGCCGGCGTAGT > NC_008463/2594507‑2594809
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
