Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F1 I1 R1
|
256 |
520.0 |
22514234 |
99.3% |
22356634 |
151.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
5,198,405 |
T→C |
intergenic (+31/+37) |
PA14_RS23800 → / ← mdpA |
ABC transporter substrate‑binding protein/metallopeptidase MdpA |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 5,198,405 | 0 | T | C | 99.5%
| 1439.0
/ NA
| 381 | intergenic (+31/+37) | PA14_RS23800/mdpA | ABC transporter substrate‑binding protein/metallopeptidase MdpA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (154/224); minor base A (0/2); total (155/226) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.17e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 385 total aligned reads displayed.
GATGCCCTGGTTGCCGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCTTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATGTAGAAGTGATCCTCCAGGCGAATGCCGAACTCGCC > NC_008463/5198257‑5198552
|
tGCCCTGGTTGCCGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGc < 1:8438537/151‑1 (MQ=255)
gCCCTGGTTGCCGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGcc > 1:8321056/1‑151 (MQ=255)
cccTGGTTGCCGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCt > 1:4378023/1‑151 (MQ=255)
cccTGGTTGCCGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCt < 2:1461613/151‑1 (MQ=255)
cccTGGTTGCCGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCt > 2:508657/1‑151 (MQ=255)
cTGGGTGCCGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTc < 2:6835413/151‑1 (MQ=255)
tGGTTGCCGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGACGCTGGACTGATCGCGGCGCCGCACGCGGGTAGCCCTGGCCCTTGCCTTcc > 2:2516180/1‑151 (MQ=255)
gTTGCCGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCcg > 1:8871061/1‑151 (MQ=255)
gCCGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGt < 1:1126407/151‑1 (MQ=255)
tGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTgcggc < 1:9779208/151‑1 (MQ=255)
ttGATGTGCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGCAGCCCTGGGCCGTGCCGTCCCGCGTGCGGCGTTATCGGTcg > 1:1887419/1‑151 (MQ=255)
aTGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCGGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTcggcc < 2:4582252/151‑1 (MQ=255)
gTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTcggccgg > 2:10386631/1‑151 (MQ=255)
ttCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTcggccggc > 1:4184946/1‑151 (MQ=255)
cGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTc > 2:2820067/1‑151 (MQ=255)
gACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGCAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCa > 2:4931216/1‑151 (MQ=255)
cgcgCAACGCAAGCACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAgc < 2:5850787/151‑1 (MQ=255)
gcgcAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAgcc < 2:3066294/151‑1 (MQ=255)
gcgcAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAgcc < 2:6757301/151‑1 (MQ=255)
cgcaacgccaGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAgccg < 1:6618524/151‑1 (MQ=255)
cgcaacgcaaGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAgccg < 2:9586323/151‑1 (MQ=255)
gcaacgcaaGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAgccgc > 2:3246394/1‑151 (MQ=255)
acgcaaGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGGGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGa > 2:9001726/1‑151 (MQ=255)
cgcaaGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAg < 1:10156035/151‑1 (MQ=255)
gcaaGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCCCGCGGGCAGCCCTTGCCCGTGCCGTCCCGCGGGCGGCGGTTTAGGTCGGGCGGCGAAGCCGCCgggg > 1:10312276/1‑151 (MQ=255)
gAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGa < 2:779677/151‑1 (MQ=255)
aCGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAg < 1:7415558/151‑1 (MQ=255)
aCGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCGGGCCCGTGCCGTCCCGCGTGCGGCGGTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAg > 1:3424706/1‑151 (MQ=255)
cGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAgg < 2:723572/151‑1 (MQ=255)
cAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGAt < 1:3913173/151‑1 (MQ=255)
aGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGAtc > 1:8300940/1‑151 (MQ=255)
aGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGGTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGCAGGGCtc > 1:7786069/1‑151 (MQ=255)
ggCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGAtcgtc > 2:8211220/1‑151 (MQ=255)
gCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGAtcgtcg < 1:1355844/151‑1 (MQ=255)
cTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGCAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGGTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGa > 2:4403416/1‑151 (MQ=255)
ccGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATgg < 1:6483643/151‑1 (MQ=255)
gCAAGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGAGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATggac < 2:6360506/151‑1 (MQ=255)
tGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATggacgga < 1:2758493/151‑1 (MQ=255)
tGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCGTGCCTTCCCGCGGGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATggacgga > 1:5996862/1‑151 (MQ=255)
agAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCATTGCCTTCCCGCTTGCGGCGATATCGTTCGGCAGGCTCAGCCGCCGAGGCAGAAGGGATCGTCGATggacgga < 2:2730411/150‑1 (MQ=255)
aGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGGTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACt > 2:177800/1‑151 (MQ=255)
cccGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCg < 2:7949242/151‑1 (MQ=255)
cccGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCg > 2:7403358/1‑151 (MQ=255)
cccGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGGTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGCTCGTCGTTGGTCGGGCTCg > 1:4565029/1‑151 (MQ=255)
cGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCCGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGAAGGACGGACTCGGt > 1:1738116/1‑151 (MQ=255)
gctGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCGTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTGTCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGCAGGGATCGTCGTGGGACGGACTCgggt > 1:7992105/3‑149 (MQ=255)
tCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGt < 1:2358701/151‑1 (MQ=255)
cgcgGGACTTTTCGCGGGTGAAGATGGAATGATCGCTGCGCCGAACGCGGGAAGCAATGGCCGTTGCGTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGACGCCGAGGCCGAATGGATCGTCGATGGACGGACACGGTTGGGTGAAc > 2:4253400/1‑151 (MQ=255)
gcgGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAAcc < 1:10981672/151‑1 (MQ=255)
gcgGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCAGGCCCGTGCCATCCCGCGTGCGGGGTTATAGTTCGGGCGGCGCAGCCGCCGCGGCCGAAGGGGAAGTCGATGGTAGGACTCGGTTTGGTgtaac > 1:2304234/1‑147 (MQ=255)
gcgGGACATTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCAGGCCCTGGCCGTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTACGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAAcc < 2:2766652/151‑1 (MQ=255)
cgGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGGAGCCCAGGCCCATGCCTTCCCGCGTGCGGCGGTATAGTTCGGCCGGCTCCGCCCCCGAGGCCGAAGGGGTCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGGGTACCa > 1:2208574/1‑151 (MQ=255)
cgGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCa < 2:6115655/151‑1 (MQ=255)
cgGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCa < 2:6266097/151‑1 (MQ=255)
ggACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCCCGCGGGAAGCCCAGGCCCTTGCCTTCCCCCGTGCGGCGGTAACGTTCGGCCGGGGCAGCCGCCGAGGCCGAACGGATCGTCGATGGACGGCAGCGGGTGGGTGTAccccc > 1:5254718/1‑148 (MQ=255)
aCTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGt < 1:9466838/151‑1 (MQ=255)
cTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTg < 1:731458/151‑1 (MQ=255)
tCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGtcc < 2:7768214/151‑1 (MQ=255)
gcgGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGtcctt < 1:2842563/151‑1 (MQ=255)
gcgGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGtcctt < 1:7078081/151‑1 (MQ=255)
gcgGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCGTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGtcctt < 1:361771/151‑1 (MQ=255)
gggTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGtccttcc < 1:5594410/151‑1 (MQ=255)
gggTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGAGCGGCGTTATCGTACGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGtccttcc < 2:3400636/151‑1 (MQ=255)
gTGACGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTACGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTtcctc < 2:10257087/151‑1 (MQ=255)
gTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCCTCCGCCGAGGCCGAAGGGCTCGTCGATGGACGGCCTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGtccttccta > 2:5581019/1‑150 (MQ=255)
gTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTtcctc < 1:1262481/151‑1 (MQ=255)
gTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTtcctc < 1:9937658/151‑1 (MQ=255)
tGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTtcctcc < 2:6686348/151‑1 (MQ=255)
aaGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTTCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGGACTTCCTCCGt > 2:2168614/1‑151 (MQ=255)
aaGCAGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGAGCGCCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCGGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGt < 2:2944444/151‑1 (MQ=255)
cTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATGTAGa < 1:1799209/151‑1 (MQ=255)
tGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATGTAGaa > 2:1575877/1‑151 (MQ=255)
tGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCAGGTAGaa > 2:10142623/1‑151 (MQ=255)
gATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATGTAGAAg < 1:10773517/151‑1 (MQ=255)
gATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATGTAGAAg < 1:9064585/151‑1 (MQ=255)
tCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATGTAGAAGTg < 1:8569225/151‑1 (MQ=255)
gcgcCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATGTAGAAGTGAtcct < 1:6267199/151‑1 (MQ=255)
ccgcACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATGTAGAAGTGATCCTCCa < 2:10612259/151‑1 (MQ=255)
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cgcACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATGTAGAAGTGATCCTCCAg > 1:5087684/1‑151 (MQ=255)
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ACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGGTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGA > SRR18135074.5990986/1‑151 (MQ=60)
CGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAG < SRR18135074.10193852/151‑1 (MQ=60)
AAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCC < SRR18135074.8596157/151‑1 (MQ=60)
AAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCC < SRR18135074.8581015/151‑1 (MQ=60)
AGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCG < SRR18135074.1764336/151‑1 (MQ=60)
AGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCG < SRR18135074.9747196/151‑1 (MQ=60)
AACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATAGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAA > SRR18135074.509889/1‑151 (MQ=60)
ACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAG < SRR18135074.7444109/151‑1 (MQ=60)
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ACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCGTTCCTTCCCGCGGGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAG > SRR18135074.3438551/1‑151 (MQ=60)
ACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCGGGCCCGTGCCGTCCCGCGTGCGGCGGTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAG > SRR18135074.3438528/1‑151 (MQ=60)
GTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGG < SRR18135074.8059252/151‑1 (MQ=60)
GTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCGTCCCGCGTGCGGCGGTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGG > SRR18135074.482702/1‑151 (MQ=60)
CAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGAT < SRR18135074.3929006/151‑1 (MQ=60)
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GCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCG < SRR18135074.1361603/151‑1 (MQ=60)
TACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCAGGCCCTTGCCTTCCCGCGGGCGGCGGTATAGTTCGGGCGGCGCAGCCGCCGAGGGCGAAGGGATCGTCGAT > SRR18135074.4129489/1‑151 (MQ=60)
CCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGG < SRR18135074.6509233/151‑1 (MQ=60)
CCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCGGGCCCTTGCCGTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGCAGGGATCGTCGATGG > SRR18135074.11247189/1‑151 (MQ=60)
CGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGA < SRR18135074.2289095/151‑1 (MQ=60)
CGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGA < SRR18135074.10785560/151‑1 (MQ=60)
GCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGAC < SRR18135074.6938690/151‑1 (MQ=60)
TGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGA < SRR18135074.2769658/151‑1 (MQ=60)
TGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCGTGCCTTCCCGCGGGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGA > SRR18135074.6020962/1‑151 (MQ=60)
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GAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGAC < SRR18135074.10522516/151‑1 (MQ=60)
AGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACCCGGGTAGCCCAGGCCCGTGCCGTACCCCGGGCGGCGTTATCGTTCGGGCGGCGCACCCCCCCAGGCCCAAGGGATCGGCGATGGACGGACA > SRR18135074.6672585/1‑151 (MQ=60)
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GTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTC < SRR18135074.7436203/151‑1 (MQ=60)
GTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTC < SRR18135074.6899582/151‑1 (MQ=60)
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GAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCG < SRR18135074.121602/151‑1 (MQ=60)
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GATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATGTAGAAG < SRR18135074.9098790/151‑1 (MQ=60)
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ATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATGTAGAAGT < SRR18135074.762727/151‑1 (MQ=60)
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ATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCATTGCCTTCCCGCGTTCGGCGTTATCTTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGATGGCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATGTAGTAGT < SRR18135074.6521639/151‑1 (MQ=60)
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CTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATGTAGAAGTGATC < SRR18135074.8653259/151‑1 (MQ=60)
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CAGATGCCCTGGTTGCCGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCTTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATGTAGAAGTGATCCTCCAGGCGAATGCCGAACTCGCCGGG > NC_008463/5198255‑5198555
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |