Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
256 |
507.2 |
22121016 |
99.2% |
21944047 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
5,198,405 |
T→C |
intergenic (+31/+37) |
PA14_RS23800 → / ← mdpA |
ABC transporter substrate‑binding protein/metallopeptidase MdpA |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 5,198,405 | 0 | T | C | 100.0%
| 1418.2
/ NA
| 371 | intergenic (+31/+37) | PA14_RS23800/mdpA | ABC transporter substrate‑binding protein/metallopeptidase MdpA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (176/195); total (176/195) |
Only 100 of 371 total aligned reads displayed.
TGCCCTGGTTGCCGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCTTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATGTAGAAGTGATCCTCCAGGCGAATGCCGAACTCGC > NC_008463/5198259‑5198551
|
gCCCTGGTTGCCGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGc < 2:6720242/150‑1 (MQ=255)
cccTGGTTGCCGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCATGcc > 1:1053662/1‑150 (MQ=255)
tGGTTGCCGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTc > 2:10535087/1‑150 (MQ=255)
tGGTTGCCGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCGGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTc > 2:8151122/1‑150 (MQ=255)
ggtGCCGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGTTGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTccc < 1:1946124/148‑1 (MQ=255)
tGCCGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCcgc < 2:3786439/150‑1 (MQ=255)
tGCCGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCcgc < 1:2472765/150‑1 (MQ=255)
ccGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGt < 1:4757295/150‑1 (MQ=255)
cGCTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTg < 1:9572958/150‑1 (MQ=255)
cTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTgcg < 2:10826063/150‑1 (MQ=255)
cTGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTgcg < 2:4664490/150‑1 (MQ=255)
tGGCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTgcgg > 1:1180780/1‑150 (MQ=255)
ggCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTgcggc > 1:6177385/1‑150 (MQ=255)
ggCGCATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCGTACCGCGTgcggc > 2:1846269/1‑150 (MQ=255)
gcATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCCAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAGGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGtt > 1:1347868/1‑150 (MQ=255)
cATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTa > 2:3407044/1‑150 (MQ=255)
cATCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTACGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGACGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTa > 1:6709188/1‑150 (MQ=255)
aTCCGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAATCCCTGGCCCGTGCCTTACCGCGTGCGGCGTTAt > 1:2125244/1‑150 (MQ=255)
ccGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCATGCCATCCCGCGGGCGGCGGTAtag > 1:9252756/1‑148 (MQ=255)
cGTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGt > 2:5737933/1‑150 (MQ=255)
gTTGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGtt < 2:7590658/150‑1 (MQ=255)
atGATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCGGCGACGCACGCGGGCAGCCCTGGCCCTTGCCGTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTc > 2:1722217/2‑150 (MQ=255)
gATGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTcgg > 2:5152438/1‑150 (MQ=255)
tGTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTcggcc < 1:5493342/150‑1 (MQ=255)
gTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTcggccg < 2:7951189/150‑1 (MQ=255)
gTTCGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGGTATCGTTccgccg > 1:6916935/1‑150 (MQ=255)
cGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCt < 2:1570284/150‑1 (MQ=255)
cGACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCt < 2:4235115/150‑1 (MQ=255)
gACGCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTc > 1:7061140/1‑150 (MQ=255)
cgcgCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAg < 1:8420098/150‑1 (MQ=255)
gcgcAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAgc < 2:3056006/150‑1 (MQ=255)
cgcaacgcaaGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGGAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGGTATCGTTCGGCCGGCTCAgcc > 1:3547651/1‑150 (MQ=255)
cgcaacgcaaGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAgcc < 2:6001454/150‑1 (MQ=255)
caacgcaaGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAgccgc > 2:6412611/1‑150 (MQ=255)
caacgcaaGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAgccgc < 2:8966502/150‑1 (MQ=255)
aacgcaaGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAgccgcc < 1:5230400/150‑1 (MQ=255)
acgcaaGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGccgccg < 2:10721209/150‑1 (MQ=255)
gcaaGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAg < 2:8075752/150‑1 (MQ=255)
gcaaGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAg > 1:9682526/1‑150 (MQ=255)
aaGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGc < 1:1531784/150‑1 (MQ=255)
aGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGcc > 1:3760343/1‑150 (MQ=255)
aaCGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGa < 2:11047269/150‑1 (MQ=255)
tCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCGTGCCGTCCCGCGTGCGGCGGTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAggg > 1:5087583/1‑150 (MQ=255)
cAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGa < 1:10994694/150‑1 (MQ=255)
aGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGAt < 1:3671006/150‑1 (MQ=255)
ggCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGGAGCCCAGGCCCGTGGCTTGCCGCGTGGGGGGGTTTCGTGGGGCCGGCGCAGCCGCCGAGGCCGACGGGGtcgt > 1:5609834/1‑150 (MQ=255)
ggCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGAtcgt < 1:2878136/150‑1 (MQ=255)
ggCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTGCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGAtcgt > 2:6140680/1‑150 (MQ=255)
ccGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATg < 1:3380577/150‑1 (MQ=255)
ccGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATg < 1:1073292/150‑1 (MQ=255)
cGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATgg > 2:909663/1‑150 (MQ=255)
cGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATgg < 1:6477195/150‑1 (MQ=255)
cGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGGTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATgg > 1:4509976/1‑150 (MQ=255)
gCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATgga < 1:9120151/150‑1 (MQ=255)
gaTGAGCCCGATTTAGGCGCGGGACTTTTAGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCAACCGGGAAACCCATGCCCATTCCATCCCCCGTGCGGCGTTATCGGTCGGCCCGCTCAACCCCCCACGCCGAACGGATCGTCGAAggac > 2:2077797/2‑150 (MQ=255)
cATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCAGGCCCTTGCCTTCCCCCGTGCGGCGTTATCGTTAGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATggac > 1:6582734/1‑150 (MQ=255)
gAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATggacgga < 1:9928252/150‑1 (MQ=255)
aGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATggacggac > 2:8425845/1‑150 (MQ=255)
aGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATggacggac < 1:5431925/150‑1 (MQ=255)
cccGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTc < 2:10135386/150‑1 (MQ=255)
aTGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGGTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGCCTCGGtt > 1:10044082/1‑150 (MQ=255)
aTGTCGGCGCGGGACATTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGtt < 2:6497983/150‑1 (MQ=255)
gggACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCa < 1:7925734/150‑1 (MQ=255)
gACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGGGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATAGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGc > 2:8295976/1‑150 (MQ=255)
aCTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGGAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTTTAGTTAGGCCGGGTGAGCCGCCGCGGGCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTTGGTGAACCAGCg > 1:2226775/1‑150 (MQ=255)
aCTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCg < 1:4231645/150‑1 (MQ=255)
aCTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACGCGGGTGGGTGAACCAGCg > 2:1412636/1‑150 (MQ=255)
tttCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTgg < 1:5911/150‑1 (MQ=255)
gggTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGAACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGtccttc > 2:548074/1‑150 (MQ=255)
gTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGtccttcct > 2:780915/1‑150 (MQ=255)
gAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCAGGCCCGTGCCATCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTAGGGCGGCTCAGCCCCCGAGGCCGAAGGGATAGGCGATGGACGGACTCGGTTTGGTGAACCAGCGTGGGGCTtactcc > 1:2346326/1‑150 (MQ=255)
aaGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCg < 2:8535643/150‑1 (MQ=255)
aaGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCg < 1:4297628/150‑1 (MQ=255)
aGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGGGGTCCTTCCTCCGt > 2:7071964/1‑150 (MQ=255)
gCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGGTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTc < 2:864339/150‑1 (MQ=255)
gCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCAGGCCCATGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGTTCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGTACCAGCGTGGTCCTTACTCCGTc > 1:8244475/1‑150 (MQ=255)
ggACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCCGCCGCCGAGGCCGTAGGGATCGTCGATGGACGGACGCGGTTGGGTGTACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATg > 2:3161590/1‑150 (MQ=255)
ggACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATg < 1:7337255/150‑1 (MQ=255)
ggACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATg < 1:1806938/150‑1 (MQ=255)
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aTCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATGTAGAAg < 1:2718136/150‑1 (MQ=255)
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GCGCAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGAACGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCC < SRR18135078.3719857/151‑1 (MQ=60)
CAACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCC < SRR18135078.6522993/151‑1 (MQ=60)
AACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCG < SRR18135078.5254346/151‑1 (MQ=60)
ACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGACGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGGTATCGTTCGGCCGGCGCAGCCGGCGA > SRR18135078.2348447/1‑151 (MQ=60)
ACGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGA < SRR18135078.5343238/151‑1 (MQ=60)
CGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGGAGCCCTGGCCCGTGCCTTACCGCGTGGGGCGGTATCGTTAGGCCGGCTCAGCCGCCGAG > SRR18135078.7535851/1‑151 (MQ=60)
CGCAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAG > SRR18135078.9723909/1‑151 (MQ=60)
CAAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGATCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGAATGATCGCTGCGCCGCACCCGGGAAACCCTGGCCCTTGCCTTCCCCCGTTCGGCGTTATAGATCGGCCGGCTAAGCCGCCGTGGC > SRR18135078.6028662/1‑151 (MQ=60)
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AAGAACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCC < SRR18135078.1538992/151‑1 (MQ=60)
AACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCAGGGCCGTGCCGTCCCGCGGGCGGGGGTTTCGTTAGGCCGGCGCAGCCGCCGAGGCCGAA > SRR18135078.2839098/1‑151 (MQ=60)
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ACGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAG < SRR18135078.5122597/151‑1 (MQ=60)
CGTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGG < SRR18135078.4540317/151‑1 (MQ=60)
GTCAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCGTGCCGTCCCGCGTGCGGCGGTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGG > SRR18135078.5110903/1‑151 (MQ=60)
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CAGCGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGAT < SRR18135078.11041180/151‑1 (MQ=60)
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CGGCTACCGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGT < SRR18135078.8400897/151‑1 (MQ=60)
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CGCATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGA < SRR18135078.6506126/151‑1 (MQ=60)
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CATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACG < SRR18135078.9180204/151‑1 (MQ=60)
CTGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGCAGCCCTGGCCCGTGCCTTCCCGCGGGCGGGGGTTTCGGTGGGGCGGCGAAGCCGCCGAGGCCGACGGGGTCGTCGATGGAAGG > SRR18135078.7519702/1‑151 (MQ=60)
ATGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAACCCCAGGGCCATGCCGTGACCCGGGCGGCGTTATAGTTAGGGCGGGTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGGTCGTCGGTGGGCGG > SRR18135078.980685/1‑151 (MQ=60)
TGAGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCGTGCCATCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGGCGAGGCCGTAGGGATCGTCGATGGACGGT > SRR18135078.5218300/1‑151 (MQ=60)
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AGCCCGATGTCGGCGCGGGACTTTTCGCGGGTGAAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACT < SRR18135078.5456666/151‑1 (MQ=60)
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AAGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCAAGCGGGAAGGCCTGGCCCCTGCCTTGCCGCGTTCGGCGGTATAGTTGGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGGAGGGAAGGTCGATTGGAGGACTCGGGTGGGTGGACCAGCGTGGTgcttacgtcgt > SRR18135078.6554147/1‑140 (MQ=48)
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AGCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCAGGCCCATGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGTTCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGTACCAGCGTGGTCCTTACTCCGTC > SRR18135078.8280227/1‑151 (MQ=60)
GCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCA < SRR18135078.9793169/151‑1 (MQ=60)
GCTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCA < SRR18135078.8849343/151‑1 (MQ=60)
CTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCAT < SRR18135078.2407695/151‑1 (MQ=60)
CTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCAT < SRR18135078.7088301/151‑1 (MQ=60)
CTGGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCAGGCCCATGCCGTCCCGCGGGCGTCGTTATACTTAGCCCGGCTAAGCCCCCGATGCCGAAGGGATCGTCcattgaaggacaagggtgggggaaacagccgggtccatactccgtcat > SRR18135078.10878475/1‑103 (MQ=28)
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GGACTGATCGCTGCGCCGCACGCGGGAAGCCCTGGCCCTTGCCTTCCCGCGTGCGGCGTTATCGTTCGGCCGGCTCAGCCGCCGAGGCCGAAGGGATCGTCGATGGACGGACTCGGTTGGGTGAACCAGCGTGGTCCTTCCTCCGTCATGT < SRR18135078.1815265/151‑1 (MQ=60)
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|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |