Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
256 |
507.2 |
22121016 |
99.2% |
21944047 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
757,675 |
A→G |
T671A (ACC→GCC) |
fusA → |
elongation factor G |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 757,675 | 0 | A | G | 100.0%
| 1435.2
/ NA
| 374 | T671A (ACC→GCC) | fusA | elongation factor G |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (136/238); total (136/238) |
Only 100 of 389 total aligned reads displayed.
AGGTAGAGGTGGTGACTCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTACTGTCGTGGC > NC_008463/757526‑757820
|
aGGTAGAGGTGGTGACTCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGcga < 1:2068840/150‑1 (MQ=255)
tAGAGGTGGTGACTCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGcggccg > 2:9394894/1‑150 (MQ=255)
agagGTGGTGACTCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGcggccga > 2:4011558/1‑150 (MQ=255)
gagGTGGTGACTCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGcggccgac > 2:10826720/1‑150 (MQ=255)
gtgACTCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGt > 1:9788696/1‑150 (MQ=255)
aCTCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTcc > 2:9633319/1‑150 (MQ=255)
cTCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCa < 1:8467248/150‑1 (MQ=255)
cTCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCa < 2:4268703/150‑1 (MQ=255)
ccTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATg < 2:4324274/150‑1 (MQ=255)
aGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTccc > 1:4303853/1‑150 (MQ=255)
ggACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCa < 1:2429575/150‑1 (MQ=255)
tACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGt < 1:1874732/150‑1 (MQ=255)
aCATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTc < 1:10081095/150‑1 (MQ=255)
aCATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTc < 2:6875529/150‑1 (MQ=255)
aTGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTcgc > 2:9336070/1‑150 (MQ=255)
gggTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTcgcgc > 1:1460897/1‑150 (MQ=255)
gTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCAATGTCCCAGGGTCGCGCGa > 2:3888592/1‑150 (MQ=255)
gACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGc < 2:8650825/150‑1 (MQ=255)
gACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGc < 1:5915133/150‑1 (MQ=255)
gACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGc < 2:4176629/150‑1 (MQ=255)
gTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTAc > 2:7757304/1‑150 (MQ=255)
tGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACt < 1:7774705/150‑1 (MQ=255)
gATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTc > 2:6372706/1‑150 (MQ=255)
aTGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTcc < 2:7350377/150‑1 (MQ=255)
aTGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTcc > 1:10007388/1‑150 (MQ=255)
ggCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTGTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATg < 2:8206305/150‑1 (MQ=255)
gCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATgg > 2:4660525/1‑150 (MQ=255)
tGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATtct > 1:3516478/1‑150 (MQ=255)
aCCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCa > 1:3664974/1‑150 (MQ=255)
ccGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCaa > 2:2008375/1‑150 (MQ=255)
cgtcgtcgtGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCaaa > 1:8942435/1‑150 (MQ=255)
tcgtcgtGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATa < 2:1664265/150‑1 (MQ=255)
tcgtcgaGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGTTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGTGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATa > 2:3767540/1‑150 (MQ=255)
cgtcgtGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATAc < 1:7394744/150‑1 (MQ=255)
gtcgtGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACg < 2:9153523/150‑1 (MQ=255)
tcgtGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGc < 1:10339501/150‑1 (MQ=255)
tcgtGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGc > 1:900743/1‑150 (MQ=255)
tcgtGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGc > 1:9071020/1‑150 (MQ=255)
cgtGGTCTTATTCAGTGGATGGATGACACGGTTTCCGGTAATGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGcc < 2:6170663/150‑1 (MQ=255)
cgtGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGcc < 2:5740251/150‑1 (MQ=255)
ggTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTTCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGaa < 2:3134485/150‑1 (MQ=255)
ggTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGaa < 1:8109133/150‑1 (MQ=255)
gTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAg > 1:4844026/1‑150 (MQ=255)
ttCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGt < 2:2763272/150‑1 (MQ=255)
gggATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAAc < 1:523767/150‑1 (MQ=255)
tGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACAtcg < 2:727182/150‑1 (MQ=255)
tGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACAtcg < 1:6267610/150‑1 (MQ=255)
aggaCACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACAtcgtcg < 2:10163483/150‑1 (MQ=255)
ggaCACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGa < 1:10937078/150‑1 (MQ=255)
acacGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAg < 2:1847381/150‑1 (MQ=255)
cacGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAgc < 2:6011221/150‑1 (MQ=255)
cGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAgcgc > 2:7643452/1‑150 (MQ=255)
ggTTTCGGGTAAGGTTATTCGTGCAGAGGTTCCGCTGGGTGTGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTACATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCt < 2:8780600/150‑1 (MQ=255)
ggTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCt > 2:9839603/1‑150 (MQ=255)
ggTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCt > 1:6813911/1‑150 (MQ=255)
gTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGCTGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTg < 1:7466614/150‑1 (MQ=255)
gTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTg < 2:832980/150‑1 (MQ=255)
gTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTg < 2:354805/150‑1 (MQ=255)
tttCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTgg < 1:866220/150‑1 (MQ=255)
tCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGtt < 2:2376472/150‑1 (MQ=255)
ccGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTa > 2:2625956/1‑150 (MQ=255)
caggTAAGTTTATTCGTGCCGAGGTACCGCTGGTTTAGATGTTCTGTTATGCGGACGACGTGCGTTCCATTTCCAAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCTAATCGCTGGTTa > 2:4991703/3‑150 (MQ=255)
ggTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTaaa < 2:5842495/150‑1 (MQ=255)
gTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTaaaa < 2:713239/150‑1 (MQ=255)
ggTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACa < 1:384129/150‑1 (MQ=255)
tATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAgg < 2:1458275/150‑1 (MQ=255)
aTTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGTTGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGt > 2:4529089/1‑150 (MQ=255)
aTTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGt < 1:1292615/150‑1 (MQ=255)
ttCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGACCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGtt > 1:3112120/1‑150 (MQ=255)
tCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCTTGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTg < 2:7415819/150‑1 (MQ=255)
cGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGa < 1:9893789/150‑1 (MQ=255)
cGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGa > 2:7970853/1‑150 (MQ=255)
gCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTc > 2:5954516/1‑150 (MQ=255)
gCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTc < 1:224791/150‑1 (MQ=255)
ccGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCa < 1:7873759/150‑1 (MQ=255)
aGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGcc > 1:7583175/1‑150 (MQ=255)
ggTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGccc < 2:9014661/150‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCt < 2:10474771/150‑1 (MQ=255)
ttCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCtt < 2:750803/150‑1 (MQ=255)
tCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCttt > 1:2172582/1‑150 (MQ=255)
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cGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTtaa < 1:10723521/150‑1 (MQ=255)
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CGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAG < SRR18135078.10769028/151‑1 (MQ=60)
CGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAG < SRR18135078.3004982/151‑1 (MQ=60)
GCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGT > SRR18135078.6811190/1‑151 (MQ=60)
GCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGT < SRR18135078.4211885/151‑1 (MQ=60)
GCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGT < SRR18135078.8593754/151‑1 (MQ=60)
GCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGT < SRR18135078.8593755/151‑1 (MQ=60)
GCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGT < SRR18135078.8593774/151‑1 (MQ=60)
GTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAG < SRR18135078.6674206/151‑1 (MQ=60)
TGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGG > SRR18135078.3831506/1‑151 (MQ=60)
GATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTT > SRR18135078.4237135/1‑151 (MQ=60)
GATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTT < SRR18135078.2185747/151‑1 (MQ=60)
ATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTA < SRR18135078.10086033/151‑1 (MQ=60)
ATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTA < SRR18135078.7688513/151‑1 (MQ=60)
ATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTA > SRR18135078.9480181/1‑151 (MQ=60)
TGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTAC > SRR18135078.9807680/1‑151 (MQ=60)
TCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTACTGT < SRR18135078.4517064/151‑1 (MQ=60)
GTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTACTGTCGT < SRR18135078.341814/151‑1 (MQ=60)
GTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTACTGTCGT < SRR18135078.612037/151‑1 (MQ=60)
TTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTACTGTCGTG < SRR18135078.7538029/151‑1 (MQ=60)
TATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTACTGTCGTGG < SRR18135078.4586467/151‑1 (MQ=60)
TATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTACTGTCGTGG < SRR18135078.1594763/151‑1 (MQ=60)
ATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTACTGTCGTGGC > SRR18135078.8027139/1‑151 (MQ=60)
ATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTACTGTCGTGGC < SRR18135078.6542732/151‑1 (MQ=60)
TGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTACTGTCGTGGCT < SRR18135078.3910678/151‑1 (MQ=60)
TGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTACTGTCGTGGCT < SRR18135078.924317/151‑1 (MQ=60)
TGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTACTGTCGTGGCT < SRR18135078.923085/151‑1 (MQ=60)
TGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTACTGTCGTGGCT < SRR18135078.2630137/151‑1 (MQ=60)
CGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTACTGTCGTGGCTAA > SRR18135078.10872925/1‑151 (MQ=60)
GGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTACTGTCGTGGCTAAG < SRR18135078.9326567/151‑1 (MQ=60)
GGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTACTGTCGTGGCTAAG < SRR18135078.1972180/151‑1 (MQ=60)
GGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTACTGTCGTGGCTAAG < SRR18135078.7251331/151‑1 (MQ=60)
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AGGTAGAGGTGGTGACTCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTACTGTCGTGGCTAAG > NC_008463/757526‑757824
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
