Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F1 I1 R1
|
256 |
530.7 |
22949956 |
99.3% |
22789306 |
151.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
757,675 |
A→G |
T671A (ACC→GCC) |
fusA → |
elongation factor G |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 757,675 | 0 | A | G | 100.0%
| 1472.5
/ NA
| 371 | T671A (ACC→GCC) | fusA | elongation factor G |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (164/207); total (164/207) |
Only 100 of 378 total aligned reads displayed.
GGTAGAGGTGGTGACTCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTACTGTCGTGGCTA > NC_008463/757527‑757822
|
ggTAGAGGTGGTGACTCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGcggcc < 1:9222332/151‑1 (MQ=255)
gtggtgACTCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGc > 1:10322739/1‑151 (MQ=255)
tggtgACTCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCg < 2:7098994/151‑1 (MQ=255)
tggtgACTCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCg < 2:1372173/151‑1 (MQ=255)
ggtgACTCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGt < 2:869077/151‑1 (MQ=255)
aCTCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCa > 2:5688962/1‑151 (MQ=255)
cTCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCAt > 2:4855629/1‑151 (MQ=255)
tCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATg < 2:9577709/151‑1 (MQ=255)
tCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATg < 2:8969410/151‑1 (MQ=255)
tGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTcc > 2:2133685/1‑151 (MQ=255)
gAGGAATACATGGGTGCCGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCTTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTccc < 2:1775756/151‑1 (MQ=255)
aGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCa < 1:6908810/151‑1 (MQ=255)
tACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTc < 2:808064/151‑1 (MQ=255)
aCATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTcg < 2:7172042/151‑1 (MQ=255)
cATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTcgc > 2:10254197/1‑151 (MQ=255)
aTGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTcgcg > 1:4855331/1‑151 (MQ=255)
ggTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGa < 1:8800434/151‑1 (MQ=255)
gACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCt < 1:10049880/151‑1 (MQ=255)
gACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCt > 1:8991126/1‑151 (MQ=255)
aCGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTa > 2:6888868/1‑151 (MQ=255)
tGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTc < 2:10502189/151‑1 (MQ=255)
gATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTcc > 1:5508009/1‑151 (MQ=255)
ggCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATgg < 1:10996291/151‑1 (MQ=255)
ggCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATgg < 1:5247456/151‑1 (MQ=255)
cGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGaa < 1:6714354/151‑1 (MQ=255)
cTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATtct > 2:3136243/1‑151 (MQ=255)
cTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATtct < 2:3423310/151‑1 (MQ=255)
aCCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCaa < 1:6069679/151‑1 (MQ=255)
cgtcgtcgtGTTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTCAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAAt > 2:5369603/1‑151 (MQ=255)
cgtcgtGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACg > 2:916767/1‑151 (MQ=255)
cgtcgtGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACg > 2:10127413/1‑151 (MQ=255)
gtcgtGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGc > 1:10696897/1‑151 (MQ=255)
gtcgtGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGc < 2:432800/151‑1 (MQ=255)
cgtGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCg < 2:3019186/151‑1 (MQ=255)
gtGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGa < 2:4132840/151‑1 (MQ=255)
tGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGaa > 1:3706259/1‑151 (MQ=255)
ggTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGCCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAg < 1:5085136/151‑1 (MQ=255)
tCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCt > 1:2084826/1‑151 (MQ=255)
tGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTTAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTcc < 2:10049919/151‑1 (MQ=255)
aTTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGt < 2:8182609/151‑1 (MQ=255)
ttCAGGGGATGGATGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTc < 2:11105305/151‑1 (MQ=255)
gATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACAtc < 1:7501802/151‑1 (MQ=255)
aTGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACAtcg > 2:6187095/1‑151 (MQ=255)
aTGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACAtcg > 1:673997/1‑151 (MQ=255)
tGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACAtcgt < 2:5955398/151‑1 (MQ=255)
ggaggaCACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACAtcgtc < 2:7921932/151‑1 (MQ=255)
acGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGCCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAgcgc > 1:6335292/1‑151 (MQ=255)
ggTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTg > 1:175003/1‑151 (MQ=255)
ggTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTg < 1:7341218/151‑1 (MQ=255)
gTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTgg < 1:5139457/151‑1 (MQ=255)
gTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTgg < 1:6542921/151‑1 (MQ=255)
tttCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGt < 2:7228736/151‑1 (MQ=255)
ttCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATNGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGtt < 1:6021979/151‑1 (MQ=255)
ttCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCAGGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGtt < 1:3536307/151‑1 (MQ=255)
tCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTa > 1:2597236/1‑151 (MQ=255)
tCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTa > 1:1714485/1‑151 (MQ=255)
ccGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTaa < 1:3238082/151‑1 (MQ=255)
cGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTaaa < 1:9116120/151‑1 (MQ=255)
cGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTaaa > 1:4439654/1‑151 (MQ=255)
cGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGGTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTaaa < 2:7553897/151‑1 (MQ=255)
ggTAAGGTTATTCGTGCCTTGGTTGCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGAAGTGCGTTCCATGTCCGAGGGTCGCGCGAGCTACTCCTTGGTTTTCTCCTATTACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTaaaa < 1:8706244/151‑1 (MQ=255)
tAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTaaaaaa < 1:2774328/151‑1 (MQ=255)
ggtATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGACTTCTCCAAATCCGCCGAAGCTCCGTCGAACAACGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAg > 2:10885812/3‑151 (MQ=255)
aTTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGtt < 2:1802666/151‑1 (MQ=255)
aTTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGtt > 1:2651131/1‑151 (MQ=255)
ttCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTg > 1:9727651/1‑151 (MQ=255)
ttCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAAAACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTg < 2:5162101/151‑1 (MQ=255)
gTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGAtt > 2:4705917/1‑151 (MQ=255)
tGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTc < 1:336992/151‑1 (MQ=255)
tGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTc > 2:8026685/1‑151 (MQ=255)
cGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGc > 2:2383922/1‑151 (MQ=255)
cGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGc < 2:1871255/151‑1 (MQ=255)
gAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGcc < 2:3988114/151‑1 (MQ=255)
gAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGcc < 1:1916020/151‑1 (MQ=255)
gAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGcc < 1:2554048/151‑1 (MQ=255)
gAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGcc > 1:10821371/1‑151 (MQ=255)
ggTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCt < 1:10447787/151‑1 (MQ=255)
gTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCtt > 2:6610190/1‑151 (MQ=255)
ccGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTtaa < 2:5245368/151‑1 (MQ=255)
ccGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTtaa < 1:7978960/151‑1 (MQ=255)
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cGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTtaag < 2:3734772/151‑1 (MQ=255)
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CCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAG > SRR18135076.6025520/1‑151 (MQ=60)
CCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAG > SRR18135076.10864324/1‑151 (MQ=60)
CGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGC > SRR18135076.635857/1‑151 (MQ=60)
GAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCC > SRR18135076.10868673/1‑151 (MQ=60)
GAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCC < SRR18135076.2692222/151‑1 (MQ=60)
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GAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCC < SRR18135076.1924920/151‑1 (MQ=60)
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AGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCC < SRR18135076.3980106/151‑1 (MQ=60)
GGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCT < SRR18135076.10493407/151‑1 (MQ=60)
GTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTT > SRR18135076.9814817/1‑151 (MQ=60)
GTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTT > SRR18135076.9816185/1‑151 (MQ=60)
TTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTT < SRR18135076.6780087/151‑1 (MQ=60)
GTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTT < SRR18135076.10692761/151‑1 (MQ=60)
CCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAA > SRR18135076.3852922/1‑151 (MQ=60)
CCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAA < SRR18135076.8014920/151‑1 (MQ=60)
CCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAA > SRR18135076.1970635/1‑151 (MQ=60)
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CGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAG < SRR18135076.2122730/151‑1 (MQ=60)
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ATGTTCGGTTATGCGGCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTA > SRR18135076.11377275/1‑151 (MQ=60)
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GCCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTACTGTCGTGGCTAAGG < SRR18135076.11407612/151‑1 (MQ=60)
|
GGTAGAGGTGGTGACTCCTGAGGACTACATGGGTGACGTGATGGGCGACCTGAACCGTCGTCGTGGTCTGATTCAGGGGATGGAGGACACGGTTTCCGGTAAGGTTATTCGTGCCGAGGTTCCGCTGGGTGAGATGTTCGGTTATGCGACCGACGTGCGTTCCATGTCCCAGGGTCGCGCGAGCTACTCCATGGAATTCTCCAAATACGCCGAAGCTCCGTCGAACATCGTCGAAGCGCTGGTTAAAAAACAAGGTTGATTCAGCCCTTTAAGTAAGAGGTTTACTGTCGTGGCTAAGG > NC_008463/757527‑757825
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
