Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A5 F1 I1 R1
|
9 |
298.5 |
8041170 |
98.4% |
7912511 |
149.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
AP012306 |
1,611,137 |
G→T |
E37D (GAG→GAT) |
purT → |
phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2 |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | AP012306 | 1,611,137 | 0 | G | T | 100.0%
| 948.9
/ NA
| 239 | E37D (GAG→GAT) | purT | phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (120/119); total (120/119) |
Only 100 of 250 total aligned reads displayed.
TTATACTGCGCGCGGAATTAATCAGGGGATATTCGTTATGACGTTATTAGGCACTGCGCTGCGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGAGGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAATATGCTTGATGGTGATGCATTACGCCGTGTGGTTGAACTGGAAAAACCACATTATATCGTGCCGGAGATCGAAGCTAT > AP012306/1610990‑1611283
|
ttATACTGCGCGCGGAATTAATCAGGGGATATTCGTTATGACGTTATTAGGCACTGCGCTGCGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGt > 2:1314152/1‑150 (MQ=255)
aCTGCGCGCGGAATTAATCAGGGGATATTCGTTATGACGTTATTAGGCACTGCGCTGCGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGAtt > 1:3073997/1‑150 (MQ=255)
ggAATTAATCAGGGGATATTCGTTATGACGTTATTAGGCACTGCGCTGCGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGAt > 1:2987694/1‑150 (MQ=255)
ggAATTAATCAGGGGATATTCGTTATGACGTTATTAGGCACTGCGCTGCGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGAt > 2:2679966/1‑150 (MQ=255)
ggAATTAATCAGGGGATATTCGTTATGACGTTATTAGGCACTGCGCTGCGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGAt > 2:718401/1‑150 (MQ=255)
gAATTAATCAGGGGATATTCGTTATGACGTTATTAGGCACTGCGCTGCGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATc < 1:3195247/150‑1 (MQ=255)
ttAATCAGGGGATATTCGTTATGACGTTATTAGGCACTGCGCTGCGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCt < 1:778987/150‑1 (MQ=255)
tAATCAGGGGATATTCGTTATGACGTTATTAGGCACTGCGCTGCGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTa < 1:49487/150‑1 (MQ=255)
aaTCAGGGGATATTCGTTATGACGTTATTAGGCACTGCGCTGCGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTAt < 2:2787917/150‑1 (MQ=255)
cAGGGGATATTCGTTATGACGTTATTAGGCACTGCGCTGCGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGcc < 2:448391/150‑1 (MQ=255)
cAGGGGATATTCGTTATGACGTTATTAGGCACTGCGCTGCGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGcc < 2:561906/150‑1 (MQ=255)
aGGGGATATTCGTTATGACGTTATTAGGCACTGCGCTGCGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCg > 1:3672713/1‑150 (MQ=255)
ggggATATTCGTTATGACGTTATTAGGCACTGCGCTGCGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTCAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGa < 1:1326694/150‑1 (MQ=255)
gggATATTCGTTATGACGTTATTAGGCACTGCGCTGCGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGAc > 1:3505158/1‑150 (MQ=255)
atatTCGTTATGACGTTATTAGGCACTGCGCTGCGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCa < 2:1995458/150‑1 (MQ=255)
atatTCGTTATGACGTTATTAGGCACTGCGCTGCGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCa > 1:3711465/1‑150 (MQ=255)
atatTCGTTATGACGTTATTAGGCACTGCGCTGCGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCa > 2:628046/1‑150 (MQ=255)
atatTCGTTATGACGTTATTAGGCACTGCGCTGCGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCa < 2:2388701/150‑1 (MQ=255)
tatTCGTTATGACGTTATTAGGCACTGCGCTGCGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCAc < 1:1573288/150‑1 (MQ=255)
atTCGTTATGACGTTATTAGGCACTGCGCTGCGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCAcc > 1:3292380/1‑150 (MQ=255)
ttCGTTATGACGTTATTAGGCACTGCGCTGCGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCa > 2:222226/1‑150 (MQ=255)
cGTTATGACGTTATTAGGCACTGCGCTGCGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGc < 1:3440059/150‑1 (MQ=255)
gTTATGACGTTATTAGGCACTGCGCTGCGTCCGGCAGCCACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGCTAAAGAAGTGGCAATCGCGTGTCAGCGTCTCGGCCTACATGTGATTGCCGTCGCTCGCTATGCCGCCGCACCCGcc < 2:1452905/150‑1 (MQ=255)
gTTATGACGTTATTAGGCACTGCGCTGCGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGcc < 2:1736642/150‑1 (MQ=255)
ttATGACGTTATTAGGCACTGCGCTGCGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCca > 1:1850854/1‑150 (MQ=255)
ttATGACGTTATTAGGCACTGCGCTGCGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCca > 2:3848973/1‑150 (MQ=255)
tATGACGTTATTAGGCACTGCGCTGCGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCcat > 2:1100553/1‑150 (MQ=255)
tGACGTTATTAGGCACTGCGCTGCGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCcatgc > 2:3890312/1‑150 (MQ=255)
gACGTTATTAGGCACTGCGCTGCGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCcatgca > 1:1357478/1‑150 (MQ=255)
gTTATTAGGCACTGCGCTGCGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGt > 1:402815/1‑150 (MQ=255)
gTTATTAGGCACTGCGCTGCGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGt < 2:2145513/150‑1 (MQ=255)
gTTATTAGGCACTGCGCTGCGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGACCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGt < 2:3746014/150‑1 (MQ=255)
tattaGGCACTGCGCTGCGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTcg < 2:504714/150‑1 (MQ=255)
tattaGGCACTGCGCTGCGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTcg > 2:3976551/1‑150 (MQ=255)
tattaGGCACTGCGCTGCGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTcg > 2:2639946/1‑150 (MQ=255)
attaGGCACTGCGCTGCGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTcgc > 1:327032/1‑150 (MQ=255)
attaGGCACTGCGCTGCGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTcgc > 2:2275263/1‑150 (MQ=255)
cACTGCGCTGCGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCg > 1:2098750/1‑150 (MQ=255)
cACTGCGCTGCGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCg < 1:1209413/150‑1 (MQ=255)
aCTGCGCTGCGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGc > 1:3553016/1‑150 (MQ=255)
ctgcgctgcgTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCt < 2:619282/150‑1 (MQ=255)
ctgcgctgcgTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCt < 2:805657/150‑1 (MQ=255)
tgcgctgcgTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTc > 2:3001280/1‑150 (MQ=255)
tgcgctgcgTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTc < 1:3575437/150‑1 (MQ=255)
ctgcgTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCAt < 1:2572600/150‑1 (MQ=255)
tgcgTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATg < 1:1482116/150‑1 (MQ=255)
gcgTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGt < 1:3772590/150‑1 (MQ=255)
cgTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTc > 1:1652406/1‑150 (MQ=255)
ccGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCAtt > 2:1057693/1‑150 (MQ=255)
cGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTa < 1:2208816/150‑1 (MQ=255)
ggCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTaa > 2:3051781/1‑150 (MQ=255)
cagcaACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAata > 1:175967/1‑150 (MQ=255)
cagcaACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAata < 1:1425293/150‑1 (MQ=255)
aCTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAATATGCtt > 2:3194070/1‑150 (MQ=255)
cgTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAATATGCTTGATgg < 2:3382585/150‑1 (MQ=255)
gTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAATATGCTTGATGGt < 1:573991/150‑1 (MQ=255)
tGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAATATGCTTGATGGTg < 2:478936/150‑1 (MQ=255)
gATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAATATGCTTGATGGTGa < 2:1222491/150‑1 (MQ=255)
gTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAATATGCTTGATGGTGATGc > 1:1227547/1‑150 (MQ=255)
ttattaGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAATATGCTTGATGGTGATGCa < 1:2512020/150‑1 (MQ=255)
gCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAATATGCTTGATGGTGATGCATTACGcc < 2:3475412/150‑1 (MQ=255)
ggTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAATATGCTTGATGGTGATGCATTACGCCGtgtg > 1:1967544/1‑150 (MQ=255)
tGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCAACGCTCCCATGTCATTAATATGCTTGATGGTGATGCATTACGCCGTGTGGt > 1:1363707/1‑150 (MQ=255)
aaCTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAATATGCTTGATGGTGATGCATTACGCCGTGTGGTTg > 2:89963/1‑150 (MQ=255)
cTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAATATGCTTGATGGTGATGCATTACGCCGTGTGGTTGaa > 1:611760/1‑150 (MQ=255)
tGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAATATGCTTGATGGTGATGCATTACGCCGTGTGGTTGAAc < 2:2067200/150‑1 (MQ=255)
gggTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAATATGCTTGATGGTGATGCATTACGCCGTGTGGTTGAACt < 2:1237680/150‑1 (MQ=255)
gggTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAATATGCTTGATGGTGATGCATTACGCCGTGTGGTTGAACt > 1:2325121/1‑150 (MQ=255)
ggTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAATATGCTTGATGGTGATGCATTACGCCGTGTGGTTGAACTg < 1:2661210/150‑1 (MQ=255)
tAAAG‑AGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAATATGCTTGATGGTGATGCATTACGCCGTGTGGTTGAACTGGaa < 1:365169/150‑1 (MQ=255)
aaaGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAATATGCTTGATGGTGATGCATTACGCCGTGTGGTTGAACTGGaa < 2:2171332/150‑1 (MQ=255)
aagaagTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAATATGCTTGATGGTGATGCATTACGCCGTGTGGTTGAACTGGaaa > 1:110994/1‑150 (MQ=255)
aagaagTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAATATGCTTGATGGTGATGCATTACGCCGTGTGGTTGAACTGGaaa > 2:1808556/1‑150 (MQ=255)
gaagTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAATATGCTTGATGGTGATGCATTACGCCGTGTGGTTGAACTGGaaaaa > 2:1956245/1‑150 (MQ=255)
aagTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAATATGCTTGATGGTGATGCATTACGCCGTGTGGTTGAACTGGAAAAAc > 2:2935533/1‑150 (MQ=255)
gTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAATATGCTTGATGGTGATGCATTACGCCGTGTGGTTGAACTGGAAAAACca < 2:1116039/150‑1 (MQ=255)
tGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAATATGCTTGATGGTGATGCATTACGCCGTGTGGTTGAACTGGAAAAACcac > 1:971821/1‑150 (MQ=255)
gCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAATATGCTTGATGGTGATGCATTACGCCGTGTGGTTGAACTGGAAAAACCACAt < 2:1345947/150‑1 (MQ=255)
gCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAATATGCTTGATGGTGATGCATTACGCCGTGTGGTTGAACTGGAAAAACCACAt < 2:1166607/150‑1 (MQ=255)
gCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAATATGCTTGATGGTGATGCATTACGCCGTGTGGTTGAACTGGAAAAACCACAt > 2:3800666/1‑150 (MQ=255)
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CGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTC > DRR075703.1690549/1‑150 (MQ=60)
TCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCAT > DRR075703.1412320/1‑150 (MQ=60)
CCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATT < DRR075703.3657959/150‑1 (MQ=60)
CGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTA < DRR075703.2260650/150‑1 (MQ=60)
GCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAAT < DRR075703.3538947/150‑1 (MQ=60)
GCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAAT < DRR075703.3093739/150‑1 (MQ=60)
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CAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAATA > DRR075703.179798/1‑150 (MQ=60)
AGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAATAT > DRR075703.3623762/1‑150 (MQ=60)
GCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTGGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAATATG < DRR075703.1512688/150‑1 (MQ=60)
CGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAATATGCTTGAT < DRR075703.3324894/150‑1 (MQ=60)
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ATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAATATGCTTGATGGTGATGCATT < DRR075703.154564/150‑1 (MQ=60)
ATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAATATGCTTGATGGTGATGCATT > DRR075703.2016717/1‑150 (MQ=60)
TTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAATATGCTTGATGGTGATGCATTA < DRR075703.99305/150‑1 (MQ=60)
TCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAATATGCTTGATGGTGATGCATTACGCCGT < DRR075703.3340430/150‑1 (MQ=60)
TCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAATATGCTTGATGGTGATGCATTACGCCGT < DRR075703.2072292/150‑1 (MQ=60)
GGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAATATGCTTGATGGTGATGCATTACGCCGTGTG > DRR075703.2013957/1‑150 (MQ=60)
TGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCAACGCTCCCATGTCATTAATATGCTTGATGGTGATGCATTACGCCGTGTGGT > DRR075703.1395512/1‑150 (MQ=60)
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gtgctcttccgatctAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGATGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAATATGCTTGATGGTGATGCATTACGCCGTGTGGTTGAACT < DRR075703.2406697/135‑1 (MQ=60)
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GTTTATACTGCGCGCGGAATTAATCAGGGGATATTCGTTATGACGTTATTAGGCACTGCGCTGCGTCCGGCAGCAACTCGCGTGATGTTATTAGGCTCCGGTGAACTGGGTAAAGAAGTGGCAATCGAGTGTCAGCGTCTCGGCGTAGAGGTGATTGCCGTCGATCGCTATGCCGACGCACCAGCCATGCATGTCGCGCATCGCTCCCATGTCATTAATATGCTTGATGGTGATGCATTACGCCGTGTGGTTGAACTGGAAAAACCACATTATATCGTGCCGGAGATCGAAGCTATTG > AP012306/1610988‑1611285
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
