Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
6081 |
0.0 |
0 |
0.0% |
0 |
0.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GGTAGTTGCCAAACATTTAATACGATCCTCTGTAATATTTCTATGAATAATTATCACAGCAACGTTCAATTATCTTCAATTCGGCTTCAGTACTGTATGAAATACTCGCTAACATTTTCTTTATTCTATAATAGCACAGTGACACTTAAACGTCAAACGTGGCGCACATTAATATACGATGTATGCATTTGGCTTGACACTGCTGTAATAAGGAACATCATCATCCGTCAACTAGTAGTCACATTAGTAGTGTATTATCACATGGTGTGTAAGAACATTACGTAAAGATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCTGAAACGCAAGGACTAGTAGTGTAATAGAATAATATTGTGTAAAAGTATCGATACCCTTTTTGGAATTATTGTATCTTCGAGGGTGGCTTTTAATATATTTTTGAAAACCTAATATTATAACCTTTCACAACAACGAAATCCCAACTGTTGTGTAATAATTTTACTCAATTCTTACTATTGCTTTACCAATCCTTGTATTTGAGCTCTCATAAAGTTCGCTGACTACTTCTCACGACTCATGTCATCTCCTTA > BK006934/358879‑359450
|
tgtatTTGCCAAACATTTAATACTATCCTCTGTAAGATTTCTATTAATAATTATCACAGCAACGTTCAATTATCTTCAATTCGGCTTCAGTACTGCATGAAATACTCGCTAACATTTTCTTTATTCTATAATAGCACAGTGACACTTAAACGTCAAACTTGGCGCACATTAATATACGATGTATGCATTTGGCTTGACACTGCTGTAATAAGGAACATCATCATCCATCAACTAGTAGTCACATTAGTAGTGTATTATCACATGGTGTGTAAGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGT < SRR13385771.1071503/295‑1 (MQ=60)
TAGTTTCCAAACATTTAATACGATCCTCTGTAATATTTCTATGAATAATTATCACAGCAACTTTCAATTATCTTCAATTCGGCTTCAGTACTGCATGAAATACTCGCTAACATTTTCTTTATTCTAGAATAGCACAGTGACACTTAAACGTCAAACTTGGCGCACAGTAATATACGATGTATGCATGTGGCTTGACACTGCTGTAAGAAGGAACATCATCATCCATCAACTAGTAGTCACATTAGTAGTGTATTATCACATGGTGTGTAAGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGTCA < SRR13385771.272819/300‑1 (MQ=60)
CCTCTGTAATATTTCTATGAATAATTATCACAGCAACGTTCAATTATCTTCAATTCGGCTTCAGTACTGCATGAAATACTCGCTAACATTTTCTTTATTCTATAATAGCACAGTGACACTTAAACGTCAAACTTGGCGCACATTAATATACGATGTATGCATTTGGCTTGACACTGCTGTAATAAGGAACATCATCATCCATCAACTAGTAGTCACATTAGTAGTGTATTATCACATGGTGTGTAAGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCTGAAATGC > SRR13385771.1473532/1‑301 (MQ=60)
GTAATATTTCTATGAATAATTATCACAGCAACGTTCAATTATCTTCAATTCGGCTTCAGTACTGCATGAAATACTCGCTAACATTTTCTTTATTCTATAATAGCACAGTGACACTTAAACGTCAAACTTGGCGCACATTAATATACGATGTATGCATTTGGCTTGACACTGCTGTAATAAGGAACATCATCATCCATCAACTAGTAGTCACATTAGTAGTGTATTATCACATGGTGTGTAAGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCTGAAATGCAAG < SRR13385771.1377675/299‑1 (MQ=60)
AATATTTCTATGAATAATTAACACAGCAACGTTCAATTATCTTCAATTCGGCTTCAGTACTGAATGAAATACTCGCTAACATTTTCTTTCTTCTATAATAGCACAGTGACACTTAAACGTCAAACTTGGCGAACATTAATATACGATGTATGAATTTGGCTTGAAACTGCTGTAATAAGGAACATCATCATCCATCAAATAGTAGTCACATTAGTAGTGTATTATCAAATGGTGTGTAAGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCTGAAATGCAAGGAC < SRR13385771.743706/300‑1 (MQ=60)
ATTTCTATGAATAATTATCACAGCAACGTTCAATTATCTTCAATTCGGCTTCAGTACTGCATGAAATACTCGCTAACATTTTCTTTATTCTATAATAGCACAGTGACACTTAAACGTCAAACTTGGCGCACATTATTATACGATGTATGCATTTGGCTTGAAACTGCTGTAATAAGGAACATCATCATCCATCAACTAGTAGTCACATTAGTAGTGTATTATCACATGGTGTGTAAGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCTGAAATGCAAGGACTAGT > SRR13385771.814518/1‑301 (MQ=60)
TCTATGAATAATTATCACAGCAACGTTCAATTATCTTCAATTCGGCTTCAGTACTGCATGAAATACTCGCTAACATTTTCTTTATGCTATAATAGCACAGTGACTCTTAAACGTCAAACTTGGCGCACATTAATATACGATGTATGCATTTGGCTTGACACTGCTGTAATAAGGAACATCATCATCCATCAACTAGTAGTCACATTAGTAGTGTATTATCACATGGTGTGTAAGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCTGAAATGCAAGGACTAGTAG < SRR13385771.1321617/300‑1 (MQ=60)
AATAATTATCACAGCAACGTTCAATTATCTTCAATTCGGCTTCAGTACTGCATGAAATACTCGCTAACATTTTCTTTATTCTATAATAGCACAGTGACACTTAAACGTCAAACTTGGCGCACATTAATATACGATGTATGCATTTGGCTTGACACTGCTGTAATAAGGAACATCATCATCCATCAACTAGTAGTCACATTAGTAGTGTATTATCACATGGTGTGTAAGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCTGAAATGCAAGGACTAGTAGTGTAAT > SRR13385771.557933/1‑300 (MQ=60)
ATTATCACAGCAACGTTCAATTATCTTCAATTCGGCTTCAGTACTGCATGAAATACTCGCTAACATTTTCTTTATTCTATAATAGCACAGTGACACTTAAACGTCAAACTTGGCGCACATTAATATACGATGTATGCATTTGGCTTGACACTGCTGTAATAAGGAACATCATCATCCATCAACTAGTAGTCACATTAGTAGTGTATTATCACATGGTGTGTAAGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCTGAAATGCAAGGACTAGTAGTGTAATATAAT < SRR13385771.1576090/301‑1 (MQ=60)
ATCACAGCAACGTTCAATTATCTTCATTTCGGCTTCAGTACTGCATGAAATACTCGCTAACATTTTCTTTATTCTATAATAGCACAGTTACACTTAAACGTCAAACTTGGCGCACATTAATATACGATGTATGCATTTGGCTTGACACTGCTGTAATAAGGAACATCATCATCCATCAACTAGTAGTCACATTAGTAGTGTATTATCACATGGTGTGTAAGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCTGAAATGCAAGGACTAGTAGTGTAATATAATAA < SRR13385771.1686650/300‑1 (MQ=60)
CAATTATCTTCAATTCGGCTTCAGTACTGCATGAAATACTCGCTAACATTTTCTTTATTCTATAATAGCACAGTGACACTTAAACGTCAAACTTGGCGCACATTAATATACGATGTATGCATTTGGCTTGACACTGCTGTAATAAGGAACATCATCATCCATCAACTAGTAGTCACATTAGTAGTGTATTATCACATGGTGTGTAAGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCTGAAATGCAAGGACTAGTAGTGTAATATAATAATATTGTGTAAAAGTA < SRR13385771.574978/301‑1 (MQ=60)
CTTCAATTCGGCTTCAGTACTGCATGAAATACTCGCTAACATTTTCTTTATTCTATAATAGCACAGTGACACTTAAACGTCAAACTTGGCGCACATTAATATACGATGTATGCATTTGGCTTGACACTGCTGTAATAAGGAACATCATCATCCATCAACTAGTAGTCACATTAGTAGTGTATTATCACATGGTGTGTAAGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCTGAAATGCAAGGACTAGTAGTGTAATATAATAATATTGTGTAAAAGTATCGATAC > SRR13385771.1278036/1‑301 (MQ=60)
AATTCGGCTTCAGTACTGCATGAAATACTCGCTAACATTTTCTTTAATCTATAATAGCAAAGTGACACTTAAACGTCAAACTTGGCGCACATTAATATACGATGTATGCATTTGGCTTGACACTGCTGTAATAAGGAACATCATCATCCATCAACTAGTAGTCACATTAGTAGTGTAATATCACATGGTGGGTAAGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCTGAAATGCAAGGACTAGTAGTGTAATATAATAATATTGTGTAAAAGTATCGATACCCTT < SRR13385771.313648/301‑1 (MQ=60)
ATTCGGCTTCAGTACTGCATGAAATACTCGCTAACATTTTCTTTATTCTATAATAGCACAGTGACACTTAAACGTCAAACTTGGCGCACATTAATATACGATGTATGCATTTGGCTTGACACTGCTGTAATAAGGAACATCATCATCCATCAACTAGTAGTCACATTAGTAGTGTATTATCACATGGTGTGTAAGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCTGAAATGCAAGGACTAGTAGTGTAATATAATAATATTGTGTAAACGTATCGATACCCTTT > SRR13385771.1266055/1‑301 (MQ=60)
CTTCAGTACTGCATGAAATACTCGCTAACATTTTCTTTATTCTATAATAGCACAGTGACACTTAAACGTCAAACTTGGCGCACATTAATATACGATGTATGCATTTGGCTTGACACTGCTGTAATAAGGAACATCATCATCCATCAACTAGTAGTCACATTAGTAGTGTATTATCACATGGTGTGTAAGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCTGAAATGCAAGGACTAGTAGTGTAATATAATAATATTGTGTAAAAGTATCGATACACTTTTTGGA > SRR13385771.172940/1‑300 (MQ=60)
TCAGTACTGCATGAAATACTCGCTAACATTTTCTTTATTCTATAATAGCACAGTGACACTTAAACGTCAAACTTGGCGCACATTAATATACGATGTATGCATTTGGCTTGACACTGCTGTAATAAGGAACATCATCATCCATCAACTAGTAGTCACATTAGTAGTGTATTATCACATGGTGTGTAAGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCTGAAATGCAAGGACTAGTAGTGTAATATAATAATATTGTGTAAAAGTATCGATACCCTTTTTGGAAT < SRR13385771.185288/300‑1 (MQ=60)
TGAAATACTCGCTAACATTTTCTTTATTCTATAATAGCACAGTGACACTTAAACGTCAAACTTGGCGCACATTAATATACGATGTATGCATTTGGCTTGACACTGCTGTAATAAGGAACATCATCATCCATCAACTAGTAGTCACATTAGTAGTGTATTATCACATGGTGTGTAAGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCTGAAATGCAAGGACTAGTAGTGTACTATAATAATATTGTGTAAAAGTATCGATACCCTTTTTGGACTTATTGTATCTTC > SRR13385771.1867424/1‑301 (MQ=60)
GCTAACATTTTCTTTATTCTATAATAGCACAGTGACACTTAAACGTCAAACTTGGCGCACATTAATATACGATGTATGCATTTGGCTTGACACTGCTGTAATAAGGAACATCATCATCCATCAACTAGTAGTCACATTAGTAGTGTATTATCACATGGTGTGTAAGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCTGAAATGCAAGGACTAGTAGTGTAATATAATAATATTGTGTAAAAGTATCGATACCCTTTTTGGAATTATTGTATCTTCGAGGGTGGCT > SRR13385771.1096992/1‑301 (MQ=60)
TCTTTATGCTATAATAGCACAGTGACACTTAAACGTCAAACTTGGCGCACATTAATATACGAGGTATGCATTTTGCTTGACACTGCTGTAATAAGGAACATCATCATCCATCAACTAGTAGTCACATTAGTAGTGTATTATCACATGGTGTGTAAGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCGGAAATGCAAGGACTAGTAGTGTAATATAATAATAGTGTGTAAAAGTATCGATACCCTTTTTGGAATTATTGTATCTTCGAGGGTGGCTTTTAATATA < SRR13385771.1539590/300‑1 (MQ=60)
TTATTCTATAATAGCACAGTGACACTTAAACGTCAAACTTGGCGCACATTAATATACGATGTATGCATTTGGCTTGACACTGCTGTAATAAGGAACATCATCATCCATCAACTAGTAGTCACATTAGTAGTGTATTATCACATGGTGTGTAAGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCTGAAATGCAAGGACTAGTAGTGTAATATAATAATATTGTGTAAAAGTATCGATACCCTTTTTGGAATTATTGTATCTTCGAGGGTGGCTTTTAATATATTT < SRR13385771.1475594/300‑1 (MQ=60)
TATAATAGCACAGTGACACTCAAACGTCAAACTTGGCGCACATTAATATACGATGTATGCATTTGGCTTGACACTGCTGTAATAAGGAACATCATCATCCATCAACTAGTAGTCACATTAGTAGTGTATTATCACATGGTGTGTAAGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCTGAAATGCAAGGACTAGTAGTGTAATATAATAATATTGTGTAAAAGTATCGATACCCTTTTTGGAATTATTGTATCTTCGAGGGTGGCTTTTAATATATTTTTGAAA > SRR13385771.729834/1‑300 (MQ=60)
CACAGTGACACTTAAACGTCAAACTTGGCGCACATTAATATACGATGTATGCATTTGGCTTGACACTGCTGTAATAAGGAACATCATCATCCATCAACTAGTAGTCACATTAGTAGTGTATTATCACATGGTGTGTAAGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCTGAAATGCAAGGACTAGTAGTGTAATATAATAATATTGTGTAAAAGTATCGATACCCTTTTTGGAATTATTGTATCTTCGAGGGTGGCTTTTAATATATTTTTGAAAACCTAATAT > SRR13385771.1010733/1‑301 (MQ=60)
ACTTAAACGTCAAACTTGGCGCACATTAATATCCGATGTATGCATTTGGCTTGACACTGCTGTAATAAGGAACATCATCATCCATCAACTAGTAGTCACATTAGTAGTGTATTATCACATGGTGTGTAAGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCTGAAATGCAAGGACTAGTAGTGTAATATAATAATATTTTGTAAAAGTATCGATACCCTTTTTGGAATTATCGTATCTTCGAGGGTGGCTTTTAATATATTTGTGAAAACCTAATATTATAACCTT > SRR13385771.1432325/1‑301 (MQ=60)
GTCAAACTTGGCGCACATTAATATACGATGTATGCATTTGGCTTGACACTGCTGTAATAAGGAACATCATCATCCATCAACTAGTAGTCACATTAGTAGTGTATTATCACATGGTGTGTAAGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCTGAAATGCAAGGACTAGTAGTGTAATATAATAATATTGTGTAAAAGTATCGATACCCTTTTTGGAATTATTGTATCTTCGAGGGTGGCTTTTAATATATTTTTGAAAACCTAATATTATAACCTTTCACAAC > SRR13385771.307653/1‑300 (MQ=60)
TAATATACGATGTATGCATTTGGCTTGACACTGCTGTAATAAGGAACATCATCATCCATCAACTAGTAGTCACATTAGTAGTGTATTATCACATGGTGTGTAAGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCTGAAATGCAAGGACTAGTAGTGTAATATAATAATATTGTGTAAAAGTATCGATACCCTTTTTGGAATTATTGTATCTTCGAGGGTGGCTTTTAATATATTTTTGAAAACCTAATATTATAACCTTTCACAACAACGAAATCCCAACTGTTT > SRR13385771.146950/1‑301 (MQ=60)
TATGCATTTGGCTTGACACTGCTGTAATAAGGAACATCATCATCCATCAACTAGTAGTCACATTAGTAGTGTATTATCACATGGTGTGTAAGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCTGAAATGCAAGGACTAGTAGTGTAATATAATAATATTGTGTAAAAGTATCGATACCCTTTTTGGAATTATTGTATCTTCGAGGGTGGCTTTTAATATATTTTTGAAAACCTAATATTATAACCTTTCACAACAACGAAATCCCAACTGTTGTGTAATAATTTT > SRR13385771.1628219/1‑301 (MQ=60)
GCATTTGGCTTGACACTGCTGTAATAAGGAACATCATCATCCATCAACTAGTAGTCACATTAGTAGTGTATTATCACATGGTGTGTAAGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCTGAAATGCAAGGACTAGTAGTGTAATATAATAATATTGTGTAAAAGTATCGATACCCTTTTTGGAATTATTGTATCTTCGAGGGTGGCTTTTAATATATTTTTGAAAACCTAATATTATAACCTTTCACAACAACGAAATCCCAACTGTTGTGTAATAATTTTAC < SRR13385771.147342/300‑1 (MQ=60)
ATTTGGCTTGACACTGCTGTAATAAGGAACATCATCATCCATCAACTAGTAGTCACATTAGTAGTGTATTATCACATGGTGTGTAAGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCTGAAATGCAAGGACTAGTAGTGTAATATAATAATATTGTGTAAAAGTATCGATACCCTTTTTGGAATTATTGTATCTTCGAGGGTGGCTTTTAATATATTTTTGAAAACCTAATATTATAACCTTTCACAACAACGAAATCCCAACTGTTGTGTAATAATTTTACTCA < SRR13385771.1521602/301‑1 (MQ=60)
GGCTTGACACTGCTGTAATAAGGAACATCATCATCCATCAACTAGTAGTCACATTAGTAGTGTATTATCACATGGTGTGTAAGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCTGAAATGCAAGGACTAGTAGTGTAATATAATAATATTGTGTAAAAGTATCGATACCCTTTTTGGAATTATTGTATCTTCGAGGGTGGCTTTTAATATATTTTTGAAAACCTAATATTATAACCTTTCACAACAACGAAATCCCAACTGTTGTGTAATAATTTTACTCAATTC < SRR13385771.945097/301‑1 (MQ=60)
GACACTGCTGTAATAAGGAACATCATCATCCATCAACTAGTAGTCACATTAGTAGTGTATTATCACATGGTGTGTAAGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCTGAAATGCAAGGACTAGTAGTGTAATATAATAATATTGTGTAAAAGTATCGATACCCTTTTTGGAATTATTGTATCTTCGAGGGTGGCTTTTAATATATTTTTGAAAACCTAATATTATAACCTTTCACAACAACGAAATCCCAACTGTTGTGTAATAATTTTACTCAATTCTTAC < SRR13385771.387594/300‑1 (MQ=60)
ACACTGCTGTAATAAGGAACATCATCATCCATCAACTATTAGTCACATTAGTAGTGTATTATCACATGGTGTGTAAGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCGGAAATGCAAGGACTAGTAGTGTAATATAATAATATTGTGTAAAAGTATCGATACCCTTTTTGGAATTATTGTATCTTCGAGGGTGGCTTTTAATATATTTTTGAAAACCTAATATTATAACCTTGCACAACAACGAAATCCCAACTGTTGTGTAATAATTTTACTCAATTCTTACT < SRR13385771.140946/300‑1 (MQ=60)
CACTGCTGTAATAAGGAACATCATCATCCATCAACTAGTAGTCACATTAGTAGTGTATTATCACATGGTGTGTAAGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCTGAAATGCAAGGACTAGTAGTGTAATATAATAATATTGTGTAAAAGTATCGATACACTTTTTGGAATTATTGTATCTTCGAGGGTGGCTTTTAATATATTTTTGACAACCTAATATTATAACCTTTCACAACAACGAAATCCCAACTGTTGTGTAATAATTTTACTCAATTCTTACTAT > SRR13385771.641917/1‑301 (MQ=60)
GTAATAATGAACATCATCAGCCATCAACGAGTAGTCACATTAGTAGGTTATTATCACATTGTTGGTAAGAACATTACATATAAAGTGAAAAAAAGTCATCTAAAATAAAGTAAGCTGAAATGCAAGGACTAGTAGTGTAATATAGTAATATTGTTTAAAAGTATCTATACCCTTTTTGGAATTATTGTATCTTCGATGGTGTCTTTTAATATTTTTTTGAATATCTAGTATTATAGCCTTTCTCTGCAACGAAATCCCAACTGTTGTGTAATAATTTTACGCAATTCTTACGATTGCTT < SRR13385771.1542368/299‑1 (MQ=60)
ATAAGGAACATCATCATCCATCAACTAGTAGTCACATTAGTAGTGTATTATCACATGGTGTGTAAGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCTGAAATGCAAGGACTAGTAGTGTAATATAATAATATTGTGTAAAAGTATCGATACCCTTTTTGGAATTATTGTATCTTCGAGGGTGGCTTTTAATATATTTTTGAAAACCTAATATTATAACCTTTCACAACAACGAAATCCCAACTGTTGTGTAATAATTTTACTCAATTCTTACTATTGCTTTACC > SRR13385771.1723930/1‑300 (MQ=60)
AAGGAACATCATCATCCATCAACTAGTAGTCACATTAGTAGTGTATTATCACATGGTGTGTAAGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCTGAAATGCAAGGACTAGTAGTGTAATATAATAATATTGTGTAAAAGTATCGATACCCTTTTTGGAATTATTGTATCTTCGAGGGTGGCTTTTAATATATTTTTGAAAACCTAATATTATAACCTTTCACAACAACGAAATCCCAACTGTTGTGTAATAATTTTACTCAATTCTTACTATTGCTTTACCAAT > SRR13385771.1359299/1‑301 (MQ=60)
ATCATCATCCATCAACTAGTAGTCACATTAGTAGTGTATTATCACATGGTGTGTAAGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCTGAAATGCAAGGACTAGTAGTGTAATATAATAATATTGTGTAAAAGTATCGATACCCTTTTTGGAATTATTGTATCTTCGAGGGTGGCTTTTAATATATTTTTGAAAACCTAATATTATAACCTTTCACAACAACGAAATCCCAACTGTTGTGTAATAATTTTACTCAATTCTTACTATTGCTTTACCAATCCTTGTT > SRR13385771.92037/1‑301 (MQ=60)
CAACTAGTAGTCACATTAGTAGTGTATTATCACATGGTGTGTAAGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCTGAAATGCAAGGACTAGTAGTGTAATATAATAATATTGTGTAAAAGTATCGATACCCTTTTTGGAATTATTGTATCTTCGAGGGTGGCTTTTAATATATTTTTGAAAACCTAATATTATAACCTTTCACAACAACGAAATCCCAACTGTTGTGTAATAATTTTACTCAATTCTTACTATTGCTTTACCAATCCTTGTATTTGAGCTCTCA < SRR13385771.737067/301‑1 (MQ=60)
GTAGTCACATTAGTAGTGTATTATCACATGGTGTGTAAGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCTGAAATGCAAGGACTAGTAGTGTAATATAATAATATTGTGTAAAAGTATCGATACCCTTTTTGGAATTATTGTATCTTCGAGGGTGGCTTTTAATATATTTTTGAAAACCTAATATTATAACCTTTCACAACAACGAAATCCCAACTGTTGTGTAATAATTTTACTCAATTCTTACTATTGCTTTACCAATCCTTGTATTTGAGCTCTCATAAAGT > SRR13385771.601393/1‑301 (MQ=60)
GTAGTCACATGAGTAGTGTATTATCACATGGTGTGTAAGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCTGAAATGCAAGGACTAGTAGTGTAATATAATAATATTGTGTAAAAGTATCGATACCCGTTTTGGAATTATTGTATCTTCGAGGGTGGCTTTTAATATATTTTTGAAAACCTAATATTATAACCTTTCACAACAACGAAATCCCAACTGTTGTGTAATAATTTTACTCAATTCTTACTATTGCTTTACCAATCCTTGTATTTGAGCTCTCATAAAGT < SRR13385771.114342/301‑1 (MQ=60)
CACATTAGTAGTGTATTATCACATGGTGTGTAAGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCTGAAATGCAAGGACTAGTAGTGTAATATAATAATATTGTGTAAAAGTATCGATACCCTTTTTGGAATTATTGTATCTTCGAGGGTGGCTTTTAATATATTTTTGAAAACCTAATATTATAACCTTTCACAACAACGAAATCCCAACTGTTGTGTAATAATTTTACTCAATTCTTACTATTGCTTTACCAATCCTTGTATTTGAGCTCTCATACAGTTCGCT > SRR13385771.1890157/1‑301 (MQ=60)
ACATGGTGTGTAAGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCTGAAATGCAAGGACTCGTAGTGTAATATAATAATATTGTGTAAAAGTATCGATACCCTTTTTGGAATTATTGTATCTTCGAGGGTGGCTTTTAATATATTTTTGAAAACCTAATATTAT > SRR13385771.1301462/1‑179 (MQ=60)
ATGGTGTGTAAGAACATGACATAAAAATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCTGAAATGCAAGGACTAGTAGTGTAATATAATAATATTGTGTAAAAGTATCGATACCCTTTTTGGAATTATTGTATCTTCGAGGGTGGCTTTTAATATATTTTTGAAAACCTAATAGTATAACCTTTCACAACAACGAAATCCCAACTGTTGTGTAATAATTTTACTCAATTCTTACTATTGCTTTACCAATCCTTGTATTTGAGCTCTCATAAAGTTCGCTGACTACTTCTCACGACTCATGT < SRR13385771.1022298/301‑1 (MQ=60)
GTGTGTAAGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGGCATCAAAAGTAAAGGAAGCTGAAATGCAAGGACTAGTAGTGTAATATAATAATAGTGTGTAAAAGTATCGATACCCTTTTTGGAATTATTGTATCTTCGAGGGTGGCTTTTAATATATTTTTGAAAACCTAATATTATAACCTTTCACAACAACGAAATCCCAACTGTTGTGTAATAATTTTACTCAATTCTTACTATTGCTTTACCAATCCTTGTATTTGAGCTCTCATAAAGTTCGCTGACTACTTCTCACGACTCATGTCAT < SRR13385771.1258621/301‑1 (MQ=60)
AGAACATTACATAAAAATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCTGAAATGCAAGGACTAGTAGTGTAATATAATAATATTGTGTAAAAGTATCGATACCCTTTTTGGAATTATTGTATCTTCGAGGGTGGCTTTTAATATATTTTTGAAAACCTAATATTATAACCTTTCACAACAACGAAATCCCAACTGTTGTGTAATAATTTTACTCAATTCTTACTATTGCTTTACCAATCCTTGTATTTGAGCTCTCATAAAGTTCGCTGACTACTTCTCACGACTCATGTCATCTCCTTA < SRR13385771.1465709/301‑1 (MQ=60)
|
GGTAGTTGCCAAACATTTAATACGATCCTCTGTAATATTTCTATGAATAATTATCACAGCAACGTTCAATTATCTTCAATTCGGCTTCAGTACTGTATGAAATACTCGCTAACATTTTCTTTATTCTATAATAGCACAGTGACACTTAAACGTCAAACGTGGCGCACATTAATATACGATGTATGCATTTGGCTTGACACTGCTGTAATAAGGAACATCATCATCCGTCAACTAGTAGTCACATTAGTAGTGTATTATCACATGGTGTGTAAGAACATTACGTAAAGATTGAAAAAAAGTCATCAAAAATAAAGGAAGCTGAAACGCAAGGACTAGTAGTGTAATAGAATAATATTGTGTAAAAGTATCGATACCCTTTTTGGAATTATTGTATCTTCGAGGGTGGCTTTTAATATATTTTTGAAAACCTAATATTATAACCTTTCACAACAACGAAATCCCAACTGTTGTGTAATAATTTTACTCAATTCTTACTATTGCTTTACCAATCCTTGTATTTGAGCTCTCATAAAGTTCGCTGACTACTTCTCACGACTCATGTCATCTCCTTA > BK006934/358879‑359450
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
