Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
6081 |
0.0 |
0 |
0.0% |
0 |
0.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATTTCGACGAATAATTTTACCTCTCTTGGTGGAAAGCCTTCCCTCCCCCTGGCGGAACCCATCATCCCGTCGAACAACTAAACCGTCAGCGTTGCCGCACCGACGGACGTCTCTCTAGAGGTCGTCTCTCCGTCTGAACATACGCACTGTTGGTACGATGCAGCGGCAGTCTGGCCGCATTTTTGACAGCGATCTTTTTTTGTATCAAGACTTCTTCCAATGTCAGGATTTA‑T‑TTTCATGATGTATGGGTGTATCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAGAGAATGCTATGGAAAATA‑‑ATA‑‑TGTAGCAACATAGCCAACTAATTGCCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAAGTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAAAAGATTAAAAAAAGTCAAAGCTACACTGGCATACTTTG > BK006934/382862‑383436
|
ATTTCGACGAATAATTCTACCTCTCTTGGTGGAAAGCCGTCCCTCCCCCTGGTGGAACCCATCAGCCCGTCGAACAACTAAACCGTCAGCGTTGCCGCACCGACGAACGTCTCTCTAGAGGTCGTCTCTCCGTCTGAACATACGCACTGTTGGTACGATGCAGCGGCGGTCTGACTGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAA < SRR13385771.1709295/301‑1 (MQ=60)
CGACGAATAATTCTACCTCTCTTGGTGGAAAGCCTTCCCTCCCCCTGGCGGAACCCATCATCCCGTCGAACAACTAAACCGTCAGCGTTGCCGCACCGACGAACGTCTCTCTAGAGGTCGTCTCTCCGTCTGAACATACGCACTGTTGGTACGATGCAGCGGCGGTCTGACTGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAAT > SRR13385771.205024/1‑301 (MQ=60)
TACCTCTCTTGGTGGAAAGCCTTCCCTCCCCCTGGCGGAACCCATCATCCCGTCGAACAACTAAACCGTCAGCGTTGCCGCACCGACGAACGTCTCTCTAGAGGTCGTCTCTCCGTCTGAACATACGCACTGTTGGTACGATGCAGCGGCGGTCTGACTGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCACGACTTCTACCAATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAAT > SRR13385771.1499048/1‑300 (MQ=60)
CTTGGTGTAAAGCCTTCCCTCCCCCTGGCGGAACCCATCATCCCGTCGAACAACTAAACCGTCAGCGGTGCCGCACCGACGAACGTCTCTCGAGAGGTCGTCTCTCCGTCTGAACATACTCACTGTTGGTACGATGCAGCGGCGGTCTTACTGCATTTTTGACATCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCATGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGGGACAAAGAATGCTATGGAAAATA‑‑ATA‑‑TG < SRR13385771.1626980/299‑1 (MQ=60)
GGTGGAAAGCCTTCCCTCCCCCTGGCGGAACCCATCATCCCGTCGAACAACTAAACCGTCAGCGTTGCCGCACCGACGAACGTCTCTCTAGAGGTCGTCTCTCCGTCTGAACATACGCACTGTTGGTACGATGCAGCGGCGGTCTGACTGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATA‑‑ATA‑‑TGTgta < SRR13385771.775054/300‑4 (MQ=60)
CCTCCCCCTGGCGGAACCCATCCTCCCGTCGAACAACTAAACCGTCAGCGTTGCCGCACCGACGAACGTCTCTCTAGAGGTCGTCTCTCCGTCTGAACATACGCACTGTTGGTACGATGCAGCGGCGGTCTGACTGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATA‑‑ATATGTGTAGCAACATAACCAATT < SRR13385771.1601842/301‑1 (MQ=60)
GGCGGAACCCATCATCCCTTCGAACAACTAAACCGTCAGCGTTGCCGCACCGACGAACGTCTCTCTAGAGGTCGTCTCTCCGTCTGAACATACGCACTGTTGGTACGATGCAGCGGCGGTCTGACTGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATA‑‑ATATGTGTAGCAACATAACCAATTAATTatcat < SRR13385771.535238/301‑6 (MQ=60)
GAACCCATCATCCCGTCGAACAACTAAACCGTCAGCGTTGCCGCACCGACGAACGTCTCTCTAGAGGTCGTCTCTCCGTCTGAACATACGCACTGTTGGTACGATGCAGCGGCGGTCTGACTGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATA‑‑ATATGTGTAGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCA < SRR13385771.1908207/301‑1 (MQ=60)
CGAACAACTAAACCGTCAGCGTTGCCGCACCGACGAACGTCTCTCTAGAGGTCGTCTCTCCGTCTGAACATACGCACTGTTGGTACGATGCAGCGGCGGTCTGACTGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATA‑‑ATATGTGTAGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGT > SRR13385771.770619/1‑300 (MQ=60)
AACTAAACCGTCAGCGTTGCCGCACCGACGAACGTCTCTCTAGAGGTCGTCTCTCCGTCTGAACATACGCACTGTTGGTACGATGCAGCGGCGGTCTGACTGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTTATT‑TTTCATAATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATA‑‑ATATGTGTAGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATT > SRR13385771.625372/1‑301 (MQ=60)
GTCGGCGTTGCCGCACCGACGAACGTCTCTCGAGAGGTCGTCTCTCCGTCTGAACATACGCACGGTTGGTACGATGCAGCGGCGGTCTGACTGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATA‑‑ATATGTGTAGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCC < SRR13385771.21684/301‑1 (MQ=60)
GCGTTGCCGCACCGACGAACGTCTCTCTAGAGGTCGTCTCTCCGTCTGAACATACGCACTGTTGGTACGATGCAGCGGCGGTCTGACTGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATA‑‑ATATGTGTAGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGT < SRR13385771.751256/301‑1 (MQ=60)
TGCCGCACCGACGAACGTCTCTCTAGAGGTCGTCTCTCCGTCTGAACATACGCACTGTTGGTACGATGCAGCGGCGGTCTGACTGCATTTTTGACAGCGCTATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGACACTACTATG‑‑TGTAGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAACTTTTGGAAGTACTATTTACAATGCCATGTTTTT > SRR13385771.1822220/1‑301 (MQ=60)
GCCGCACCGACGAACGTCTCTCTAGAGGTCGTCTCTCCGTCTGAACATACGTACTGTTGGTACGATGCAGCGGCGGTCTGACTGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATA‑‑ATATGTGTAGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTA < SRR13385771.1870422/300‑1 (MQ=60)
GGACCGACGAACGTCTCTCTAGAGGTCGTCTCTCCGTCTGAACATACGCACTGTTGGTACGATGCAGCGGCGGTCTGACTGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATA‑‑ATATGTGTAGCAACATAACCAAGTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTT < SRR13385771.1183758/301‑1 (MQ=60)
CACCGACGAACGTCTCTCTAGAGGTCGTCTCTCCGTCTGAACATACGCACTGTTGGTACGATGCAGCGGCGGTCTGACTGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATA‑‑ATATGTGTAGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTG < SRR13385771.572639/301‑1 (MQ=60)
GACGAACGTCTCTCTAGAGGTCGTCTCTCCGTCTGAACATACGCACTGTTGGTACGATGCAGCGGCGGTCTGACTGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGTATGCTATGGAAAATA‑‑ATATGTGTAGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTAC > SRR13385771.1172204/1‑301 (MQ=60)
GAACGTCTCTCTAGAGGTCGTCTCTCCGTCTGAACATACGCACTGTTGGTACGATGCAGCGGCGGTCTGACTGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATA‑‑ATATGTGTAGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCA < SRR13385771.946568/251‑1 (MQ=60)
CGTCTCTCTAGAGGTCGTCTCTCCGTCTGAACATACGCACTGTTGGTACGATGCAGCGGCGGTCTGACTGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATA‑‑ATATGTGTAGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGATTTATGTTGTTACAGTAgt > SRR13385771.855843/1‑299 (MQ=60)
TCTCTAGAGGTCGTTTCTCCGTCTGAACATACGGACTGTTGGTACGATGCAGCGGCGGTCTGACTGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTAAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATA‑‑ATATGTGTAGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAgttta < SRR13385771.1609668/300‑6 (MQ=60)
TCCGTCTGAACATACGCACTGTTGGTACGATGCAGCGGCGGTCTGACTGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATA‑‑ATATGTGTAGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCA > SRR13385771.303071/1‑240 (MQ=60)
ATACGCACTGTTGGTACGATGCAGCGGCGGTCTGACTGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATA‑‑ATATGTGTAGCAACATAACCAATAAATTAGCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCG < SRR13385771.279629/301‑1 (MQ=60)
TGTTGGTACGATGCAGCGGCGGTCTGACTGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATA‑‑ATATGTGTAGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTACAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTT > SRR13385771.649508/1‑300 (MQ=60)
ggtaaaatgaagaggaagtctgactGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTGTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATA‑‑ATATGTGTAGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTCTATGTTGGTACAGTAGTTTATTGACATCCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAAC > SRR13385771.1340125/26‑301 (MQ=60)
GGTACGATGCAGCGGCGGTCTGACTGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTGCTACCAATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGGCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATA‑‑ATATGTGTAGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAAC < SRR13385771.892479/301‑1 (MQ=60)
CATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATA‑‑ATATGTGTAGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACA > SRR13385771.881365/1‑300 (MQ=60)
TTTTGACAGCGATCTTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCACTGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATA‑‑ATATGTGTAGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAACCGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGAC > SRR13385771.1872306/1‑301 (MQ=60)
GATATTTTTTTTTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATA‑‑ATATGTGTAGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAA < SRR13385771.1518510/301‑1 (MQ=60)
GATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATA‑‑ATATGTGTAGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCA > SRR13385771.1340719/1‑300 (MQ=60)
TTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATA‑‑ATATGTGTAGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATC < SRR13385771.1765117/300‑1 (MQ=60)
GTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTTA‑TGTTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATTTAAAATA‑‑ATATGTGTAGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATGGTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTGCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATAGTGAAAAAGTTACACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCAT < SRR13385771.1121276/301‑1 (MQ=60)
TTCTACCAATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTAACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATA‑‑ATATGTGTAGCAACATAA > SRR13385771.1820779/1‑125 (MQ=60)
TCTACCAATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATA‑‑ATATGTGTAGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAACGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAA > SRR13385771.1281932/1‑300 (MQ=60)
CAATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATA‑‑ATATGTGTAGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAG < SRR13385771.1506931/301‑1 (MQ=60)
ATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCCCTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATA‑‑ATATGTGTAGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGC > SRR13385771.1434300/1‑300 (MQ=60)
atT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATA‑‑ATATGTGTAGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACT > SRR13385771.1289665/3‑301 (MQ=60)
CATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATA‑‑ATATGTGTAGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTA < SRR13385771.322955/301‑1 (MQ=60)
TGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGCAAATA‑‑ATATGTGTCGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGACATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAAA > SRR13385771.1727058/1‑299 (MQ=60)
ATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATA‑‑ATATGTGTAGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAATTGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAAAAGATT > SRR13385771.829925/1‑301 (MQ=60)
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ATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATA‑‑ATATGTGTAGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCAGTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTGCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAAAAGATTAAAAAAAGTCAAA < SRR13385771.588435/301‑1 (MQ=60)
GGATGTCACTTTCTTTTATTTTGAAGTTTGGTACAAAGAATGCTATGGAAAATA‑‑ATATGTGTAGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATTCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAAAAGATTAAAAAAAGTCAAAGCTACA < SRR13385771.373119/301‑1 (MQ=60)
TGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATA‑‑ATATGTGTAGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTG > SRR13385771.250706/1‑161 (MQ=60)
GTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATA‑‑ATATGTGTAGCAACATAACCAAGTAATTATCATGGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTGCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTTGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAAAAGATTAAAAAAAGTCAAAGCTACACTG < SRR13385771.173217/300‑1 (MQ=60)
TTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGATATGGAAAATA‑‑ATATGTGTAGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAAAAGATTAAAAAAAGTCAAAGCTACACTGGCATACTTTG > SRR13385771.1465970/1‑301 (MQ=60)
TTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATA‑‑ATATGTGTAGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTT < SRR13385771.903167/174‑1 (MQ=60)
|
ATTTCGACGAATAATTTTACCTCTCTTGGTGGAAAGCCTTCCCTCCCCCTGGCGGAACCCATCATCCCGTCGAACAACTAAACCGTCAGCGTTGCCGCACCGACGGACGTCTCTCTAGAGGTCGTCTCTCCGTCTGAACATACGCACTGTTGGTACGATGCAGCGGCAGTCTGGCCGCATTTTTGACAGCGATCTTTTTTTGTATCAAGACTTCTTCCAATGTCAGGATTTA‑T‑TTTCATGATGTATGGGTGTATCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAGAGAATGCTATGGAAAATA‑‑ATA‑‑TGTAGCAACATAGCCAACTAATTGCCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAAGTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAAAAGATTAAAAAAAGTCAAAGCTACACTGGCATACTTTG > BK006934/382862‑383436
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
