Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
6081 |
0.0 |
0 |
0.0% |
0 |
0.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GGCCAGGTATTGGTTTATGCCTTCTCTACACAAATTTGTGAAGGGTTCAAGCACTACTTAGATGGCCTCTTTTTTGGAAGCATCTGTAATGTGTTCACATTAATGATGGTTTACAAGACTTGGGATATGACTACCGACGACGACTTGGAATTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTCTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAAGTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTAAGATGACAAATTATCCTTCTTTAGTCAATTGAAAACAAAACTTCTTAATCTGTTTCCAATGTTTTAAAGTCGCTCATATGTTCATGACTACTTTTCCATGAGAGGGTTCTACGAAAAGCATCATCTTATTTTCGCAACGCTGCGGGTTTAGGCCTTTCCGCTGGTCTCTT > BK006934/384282‑384881
|
GGCCAGGTATTGGTTTATGCCTTCTCTACACAAATCTGTGAAGGGTTCAAGCACTACTTAGATGGCCTCTTTTTTGGAAGCATCTGTAATGTGTTCACATTAATGATGGTTTACAAGAGTTGGGATATGACTACCGACGACGACTTGGAATTGGGTGTAAGCGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGGATGATATTGGATTTATGTGAATTGCTTCTTTTTTGTATTACCATATCTAGAACATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAAC > SRR13385771.437190/1‑301 (MQ=60)
TTATGCCTTCTCTACACAAATCTGTGAAGGGTTCAAGCACTACTTAGATGGCCTCTTTTTTGGAAGCATCTGTAATGTGTTCACATTAATGATGGTTTACAAGACTTGGGATATGACTACCGACGACGACTTGGAATTTGGTGTACGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACG > SRR13385771.1743980/1‑301 (MQ=60)
TTATGCCTTCTCTACACAAATCTGTGAAGGGTTCAAGCACTACTTAGATGGCCTCTTTTTTGGAAGCATCTGTAATGTGTTCACATTAATGATGGTTTACAAGACTTGGGATATGACTACCGACGACGACTTGGAATTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCAC < SRR13385771.885473/300‑1 (MQ=60)
GGTTCAAGCACTACTTAGATGGCCTCTTTTTTGGAAGCATCTGTAATGTGTTCACATTAATGATGGTTTACAAGACTTGGGATATGACTACCGACGACGACTTGGAATTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCG > SRR13385771.576754/1‑264 (MQ=60)
GCACTACTTAGATGGCCTCTTTTTTGGAAGCATCTGTAATGTGTTCACATTAATGATGGTTTACAAGACTTGGGATATGACTACCGGCGACGACTTGGAATTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAG < SRR13385771.581506/301‑1 (MQ=60)
GCCTCTTTTTTGGAAGCATCTGTAATGTGTTCACATTAATGATGGTTTACAAGACTTGGGATATGACTACCGACGACGACTTGGAATTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTT < SRR13385771.1123302/301‑1 (MQ=60)
CTCTTTTTTGGAAGCATCTGTAATGTGTTCACATTAATGATGGTTTACAAGACTTGGGATATGACTACCGACGACGACTTGGAATTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTGTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTGCTGTT > SRR13385771.1854975/1‑301 (MQ=60)
TTTTTGGAAGCATCTGTAATGTGTTCACATTAATGATGGTTTACAAGACTTGGGATATGACTACCGACGACGACTTGGAATTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATC > SRR13385771.1248607/1‑300 (MQ=60)
TTGGAAGCATCTGTAATGTGTTCACATTAATGATGGTTTACAAGACTTGGGATATGACTACCGACGACGACTTGGAATTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCG > SRR13385771.1569176/1‑301 (MQ=60)
GTGTTCACATTAATGATGGTTTACAAGACTTGGGATATGACTACCGACGACGACTTGGAATTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCA < SRR13385771.255918/300‑1 (MQ=60)
CACATTAATGATGGTTTACAAGACTTGGGATATGACTACCGACGACGACTTGGAATTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGA > SRR13385771.143266/1‑245 (MQ=60)
ATTAATGATGTTTTAAAAGACTTGTGATATGACTACCGACGACGACTTGGAATTTGTTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTTACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAA < SRR13385771.1814530/301‑1 (MQ=60)
AATGATGGTTTACAAGACTTGGGATATGACTACCGACGACGACTTGGAATTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAACATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATCAAAGAAACGT > SRR13385771.224353/1‑301 (MQ=60)
ATGGTTTACAAGACTTGGGATATGACTACCGACGACGACTTGGAATTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATG < SRR13385771.387925/301‑1 (MQ=60)
tgtcttccgacgacgactttggatttggtgtatttgtttgcaagctcgttttctTGGTGTATGATAATGGATTTGTGTGAAATTCTTCTTTTTGTTATTGCCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCTGGACTATTACGAACCAAAGAGTTAAACTCGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTTTACGCTTTAACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCTGTAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAA < SRR13385771.1546175/246‑1 (MQ=60)
TACCGACGACGACTTGGAATTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTA > SRR13385771.1574218/1‑299 (MQ=60)
CGACGACTTGGAATTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTAAGATGACA < SRR13385771.1387042/301‑1 (MQ=60)
GACGACTTGGAAGTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGCTAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACCTCTGTTATCAGCGGAAACAACCCGATCCATAAAAGAAACGTGATGGTAGTTCCCGTAGGTTAGTAAGTAAGATGACA > SRR13385771.1715578/1‑300 (MQ=60)
GGAATTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTAAGATGACAAATTATCC < SRR13385771.366306/300‑1 (MQ=60)
GGAATTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTACGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTAAGATGACAAATTATCCT > SRR13385771.1292768/1‑301 (MQ=60)
GTGTAAGGGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTAAGATGACAAATTATCCTTCTTTAGC < SRR13385771.1513534/301‑1 (MQ=60)
TAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTAAGATGACAAAATATCCTTCTTTAGCCA > SRR13385771.368735/1‑300 (MQ=60)
GTTAGCAAGGACGGTTACGTTGTGTATGATAATGGATTTAAGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTAAGATGACAAATTATCCTTCTTTAGCCAATTGA < SRR13385771.442819/300‑1 (MQ=60)
TAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTAAGATGACAAATTATCCTTCTTTAGCCAATTGAAA > SRR13385771.237476/1‑300 (MQ=60)
GACGTTGACGTGTTTTATGATAATTGATTTTTGTGAGATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATAGAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCATGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTAAGATGACAAATTATCCTTCTTTAGCCAATTGAAAACAAAACT < SRR13385771.55220/301‑1 (MQ=60)
GTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTAAGATGACAAATTATCCTTCTTTAGCCAATTGAAAACAAAACTTCTTAATCT < SRR13385771.1266985/301‑1 (MQ=60)
ATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTCCACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTATTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGAAGTTTAATAAGTAAGATGAAAAATTATCCTTCTTTAGCAAATTGAAAACAAAAATTCTTAATCTGTTTCCAATT > SRR13385771.1681749/1‑301 (MQ=60)
GGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGCACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTAAGATGACAAATTATCCTTCTTTAGCCAATTGAAAACAAAACTTCTTAATCTGTTTCCAATGTTTT > SRR13385771.806731/1‑300 (MQ=60)
TTTTGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTAAGATGACAAATTATCCTTCTTTAGCCAATTGAAAACAAAACTTCTTAATCTGTTTCCAATGTTTTAAAG < SRR13385771.103380/300‑1 (MQ=60)
TGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGCAGTTTATTAAGTAAGATGACAAATTATCCTTCTTTAGCCAATTGAAAACAAAACTTCTTAATCTGTTTCCACTGTTTTAAAGTCGCTC > SRR13385771.1740693/1‑301 (MQ=60)
AATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTAAGATGACAAATTATCCTTCTTTAGCCAATTGAAAACAAAACTTCTTAATCTGTTTCCAATGTTTTAAAGTCGCTCAT > SRR13385771.1602149/1‑300 (MQ=60)
ATGATTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTAAGATGACAAATTATCCTTCTTTAGCCAATTGAAAACAAAACTTCTTAATCTGTTTCCAATGTTTTAAAGTCGCTCATAT < SRR13385771.706042/301‑1 (MQ=60)
CTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTAAACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTAAGATGACAAATTATCCTTCTTTAGCCAATTGAAAACAAAAATTCTTAATCTGTTTCCAATGTTTTAAAGTCGCTCATATGTTCAT > SRR13385771.1258495/1‑301 (MQ=60)
CTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCAACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTAAGATGACAAATTATACTTCTTTAGCCAATTGAAAACAAAACTTCTTAATCAGTTTCCAATGTTTTAAAGTCGCTCATATGTTCAT > SRR13385771.640205/1‑301 (MQ=60)
TTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTAAGATGACAAATTATCCTTCTTTAGCCAATTGAAAACAAAACTTCTTAATCTGTTTCCAATGTTTTAAAGTCGCTCATATGTTCA < SRR13385771.1860357/298‑1 (MQ=60)
TTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAATCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACT < SRR13385771.1814111/140‑1 (MQ=60)
ATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTAAGATGACAAATTATCCTTCTTTAGCCAATTGAAAACAAAACTTCTTAATCTGTTTCCAATGTTTTAAAGTCGCTCATATGTTCATGACTACTTTTCCATGAG < SRR13385771.1049421/301‑1 (MQ=60)
AGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTAAGATGACAAATTATCCTTCTTTAGCCAATTGAAAACAAAACTTCTTAATCTGTTTCCAATGTTTTAAAGTCGCTCATATGTTCATGACTACTTTTCCATGAGAGGG > SRR13385771.444790/1‑301 (MQ=60)
AGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTAAGATGACAAATTATCCTTCTTTAGCCAATTGAAAACAAAACTTCTTAATCTGTTTCCAATGTTTTAAAGTCGCTCATATGTTCATGACTACTTTTCCATGAGAGG < SRR13385771.782346/300‑1 (MQ=60)
AAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTAAGATGACAAATTATCCTTCTTTAGCCAATTGAAAACAAAACTTCTTAATCTGTTTCCAATGTTTTAAAGTCGCTCATATGTTCATGACTACTTTTCCATGAGAGGGTT > SRR13385771.1336388/1‑301 (MQ=60)
ATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTAAGATGACAAATTATCCTTCTTTAGCCAATTGAAAACAAAACTTCTTAATCTGTTTCCAATGTTTTAAAGTCGCTCATATGTTCATGACTACTTTTCCATGAGAG < SRR13385771.505946/294‑1 (MQ=60)
GTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTAAGATGACAAATTATCCTTCTTTAGCCAATTGAAAACAAAACTTCTTAATCTGTTTCCAATGTTTTAAAGTCGCTCATATGTTCATGACTACTTTTCCATGAGAGGGTTCTATGAAA < SRR13385771.712481/300‑1 (MQ=60)
TAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCCCGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTAAGATGACAAATTATCCTTCTTTAGCCAATTGCAAACAAAACTTCTTAATCTGTTTCCAATGTTTTAAAGTAGCTAATCTGTTCATGACTACTTTTCACTGCGAGGGTTCTATGAAAAGCATCATCTTATTT > SRR13385771.1540561/1‑301 (MQ=60)
AAGCAGTACTATGACAAACCAAAAAGAGAAACTAGCCGTTTCCACGTTGTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTGATCAGCGTAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCC < SRR13385771.1459073/146‑1 (MQ=60)
GACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTAAGATGACAAATTATCCTTCTTTAGCCAATTGAAAACAAAACTTCTTAATCTGTTTCCAATGTTTTAAAGTCGCTCATATGTTCATGACTACTTTTCCATGAGAGGGTTCTATGAAAAGCATCATCTTATTTTCGCAACGCTGCGGGTTTAG < SRR13385771.286277/300‑1 (MQ=60)
AGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTAAGATGACAAATTATCCTTCTTTAGCCAATTGAAAACAAAACTTCTTAATCTGTTTCCAATGTTTTAAAGTCGCTCATATGTTCATGACTACTTTTCCATGAGAGGGTTCTATGAAAAGCATCATCTTATTTTCGCAACGCTGCGGGTTTAGGCTTTTCCGCT > SRR13385771.1141002/1‑301 (MQ=60)
ACTAGCCGTTTCCACGGTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTAAGATGACAAATTATCCTTCTTTAGCCAATTGAAAACAAAACTTCTTAATCTGTTTCCAATGTTTTAAAGTCGCTCATATGTTCATGACTACTTTTCCATGAGAGGGTTCTATGAAAAGCATCATCTTATTTTCGCAACGCTGCGGGTTTAGGCTTTTCCGCTGGTCTCTT < SRR13385771.1884351/301‑1 (MQ=60)
|
GGCCAGGTATTGGTTTATGCCTTCTCTACACAAATTTGTGAAGGGTTCAAGCACTACTTAGATGGCCTCTTTTTTGGAAGCATCTGTAATGTGTTCACATTAATGATGGTTTACAAGACTTGGGATATGACTACCGACGACGACTTGGAATTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTCTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAAGTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTAAGATGACAAATTATCCTTCTTTAGTCAATTGAAAACAAAACTTCTTAATCTGTTTCCAATGTTTTAAAGTCGCTCATATGTTCATGACTACTTTTCCATGAGAGGGTTCTACGAAAAGCATCATCTTATTTTCGCAACGCTGCGGGTTTAGGCCTTTCCGCTGGTCTCTT > BK006934/384282‑384881
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
