| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| MC JC | CP009273 | 4,303,167 | Δ450 bp | 100% | coding (1‑450/450 nt) | rpiB → | ribose 5‑phosphate isomerase B/allose 6‑phosphate isomerase |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | CP009273 | 4303167 | 4303616 | 450 | 60 [0] | [0] 60 | rpiB | ribose 5‑phosphate isomerase B/allose 6‑phosphate isomerase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 4303166 | 0 (0.000) | 55 (0.980) | 52/270 | NT | 100% | intergenic (‑358/‑1) | alsR/rpiB | d‑allose‑inducible als operon transcriptional repressor; autorepressor; repressor of rpiR/ribose 5‑phosphate isomerase B/allose 6‑phosphate isomerase |
| ? | CP009273 | 4303617 = | 0 (0.000) | intergenic (+1/‑68) | rpiB/yjdP | ribose 5‑phosphate isomerase B/allose 6‑phosphate isomerase/putative periplasmic protein | |||||
GATGGTGAGTGTCTTTAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/4303016‑4303166‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgaGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCACCGTTCCGGCCCAGGCCGATATTATCGACGA > CP009273/4303617‑4303764 GATGGTGAGTGTCTTTAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGAT < 1:328866/149‑1 TGGTGAGTGTCTTTAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAG < 2:125998/150‑1 GTGAGTGTCTTTAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGAT < 1:967193/150‑1 TGTCTTTAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCATGAAGGCGTATTTCATCGATTTGGGGCGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGTGGAAGCTGTGATTCATC > 2:354284/1‑150 TGTCTTTAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATC > 1:202926/1‑150 GTCTTTAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATC > 1:386561/1‑149 CTTTAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTTACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCAC > 2:511482/1‑150 TAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTAC > 1:508287/1‑150 AACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACT > 1:428941/1‑150 TATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCAT > 1:490587/1‑150 TTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCAT < 1:78383/148‑1 CGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGAT < 2:664846/149‑1 GCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGAT > 1:56019/1‑148 CTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAG < 1:712263/150‑1 TGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAG > 2:418553/1‑149 TGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAG > 1:27568/1‑149 GTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGT > 1:859457/1‑149 GTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGT > 2:414945/1‑149 TCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTA < 2:214438/149‑1 ATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGAT < 2:944112/150‑1 TAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAA > 1:212306/1‑150 TGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGA > 1:548507/1‑150 GTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGA > 1:688349/1‑149 TAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATA < 1:67512/150‑1 TAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGG < 2:217756/147‑1 AGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTT > 1:987366/1‑150 AGGAAGGCGTAATTAATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTT < 1:354284/150‑1 GGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTT < 2:859457/150‑1 AAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGA < 1:847210/150‑1 GTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTG > 2:799819/1‑150 ATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAAT > 1:191524/1‑149 GATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAA > 2:464005/1‑150 ATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAAC < 2:822660/150‑1 TTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGC > 1:351346/1‑150 TTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCT > 1:76204/1‑150 GGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTT < 2:140824/149‑1 GGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTC > 2:191648/1‑150 TGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCG < 1:1835/150‑1 TAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATT < 2:386561/149‑1 AATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTT < 2:52530/149‑1 TTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTT > 2:701074/1‑150 CATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTT < 2:132692/149‑1 ATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTA < 2:548507/150‑1 ATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTT < 1:749181/149‑1 TTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTAT < 2:202926/150‑1 AACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATT > 2:851503/1‑149 TCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCC < 1:418553/150‑1 AAATGGTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCT > 2:363548/1‑150 AATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTC < 1:191648/150‑1 TGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCAC < 2:212306/150‑1 TTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGC > 2:140630/1‑150 GATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCA > 2:565395/1‑150 ATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCA < 2:56019/149‑1 TTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCACCGTTCCGGCC < 2:688349/149‑1 TGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCACCGTTCCGGCC > 2:504097/1‑148 GCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCACCGTTCCGGCCCA < 2:76204/149‑1 ACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCACCGTTCCGGCCCAGGCCGAT < 2:27568/150‑1 GGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCACCGTTCCGGCCCAGGCCGATAT > 2:968038/1‑150 AAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCACCGTTCCGGCCCAGGCCGATATTATC < 1:504097/150‑1 AGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCACCGTTCCGGCCCAGGCCGATATTATCG < 2:428941/150‑1 AGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCACCGTTCCGGCCCAGGCCGATATTATCGACGA < 2:278357/149‑1 GATGGTGAGTGTCTTTAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/4303016‑4303166‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgaGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCACCGTTCCGGCCCAGGCCGATATTATCGACGA > CP009273/4303617‑4303764 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |