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TTTAGTATTGATTTTTAATTAATACGTGGTATAATTAAATTAACAGATCACAAGGAGGACGTAACTTATGAAAACTGAAAATGCAAAAACAAATCAAACATTAGTTGAGAATTCAATGAACACACAATTATCAAACTGGT < 1:3880476/140‑1 TTTAGTATTGATTTTTAATTAATACGTGGTATAATTAAATTAACAGATCACAAGGAGGACGTAACTTATGAAAACTGAAAATGCAAAAACAAATCAAACATTAGTTGAGAATTCAATGAACACACAATTATCAAACTGGT < 2:4269798/140‑1 AATTGGCAACAAAACAGCACGTAAAGAAATTGCGATACCCGATCGGAAAAGGCATCAAGCTTACCTTGTTATTCCGATCGCTTTTTCCTTGGTCTGCGTGGGAATCTATCCTGAAGAAAAAACTATTCAGTTCATCTAAATTATAATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NZ_CP034943/3191523‑3191670‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑attataattTAGTATTGATTTTTAATTAATACGTGGTATAATTAAATTAACAGATCACAAGGAGGACGTAACTTATGAAAACTGAAAATGCAAAAACAAATCAAACATTAGTTGAGAATTCAATGAACACACAATTATCAAACTGGT > NZ_CP034943/3191680‑3191817 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |