| Predicted mutation | |||||||
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| MC JC | NZ_CP034943 | 3,191,671 | (ATTATAATT)2→1 | 100% | intergenic (+3/‑66) | EO946_RS16520 → / → mrgA | oxidoreductase/metalloregulation DNA‑binding stress protein MgrA |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| * | * | ÷ | NZ_CP034943 | 3191671 | 3191679 | 9 | 253 [0] | [0] 258 | EO946_RS16520/mrgA | oxidoreductase/metalloregulation DNA‑binding stress protein MgrA |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NZ_CP034943 | = 3191670 | 0 (0.000) | 216 (0.500) | 67/234 | NT | 100% | intergenic (+2/‑75) | EO946_RS16520/mrgA | oxidoreductase/metalloregulation DNA‑binding stress protein MgrA |
| ? | NZ_CP034943 | 3191680 = | 0 (0.000) | intergenic (+12/‑65) | EO946_RS16520/mrgA | oxidoreductase/metalloregulation DNA‑binding stress protein MgrA | |||||
Only 100 of 258 total aligned reads displayed.
AAGAAATTGCGATACCCGATCGGAAAAGGCATCAAGCTTACCTTGTTATTCCGATCGCTTTTTCCTTGGTCTGCGTGGGAATCTATCCTGAAGAAAAAACTATTCAGTTCATCTAAATTATAATTATTATAATTTAGTATTGATTTTTAATTAATACGTGGTATAATTAAATTAACAGATCACAAGGAGGACGTAACTTATGAAAACTGAAAATGCAAAAACAAATCAAACATTAGTTGAGAATTCAATGAACACACAATTATCAAACTGGTTC > NZ_CP034943/3191546‑3191819 | cagcacgtaaagaaattgcgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactatacagttcatctaaattataattTAGTAt < 1:5993375‑M2/6‑1 (MQ=255) cacgtaaagaaattgcgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGa > 1:1880313‑M2/132‑140 (MQ=255) agaaattgcgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGATTTttaa < 1:2881612‑M2/16‑1 (MQ=255) ttgcgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGATTTTtaattaat > 1:2108506‑M2/120‑140 (MQ=255) tgcgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaacactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGATTTTTAATTAATa > 2:4573453‑M2/119‑140 (MQ=255) tgcgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGATTTTTAATTAATa < 2:6297975‑M2/22‑1 (MQ=255) tgcgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGATTTTTAATTAATa > 2:6104703‑M2/119‑140 (MQ=255) tgcgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGATTTTTAATTAATa < 1:2726851‑M2/22‑1 (MQ=255) tgcgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGATTTTTAATTAATa < 2:5232907‑M2/22‑1 (MQ=255) cgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGATTTTTAATTAATACg < 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1:4535565‑M2/9‑139 (MQ=255) taattTAGTATTGATTTTTAATTAATACGTGGTATAATTAAATTAACAGATCACAAGGAGGACGTAACTTATGAAAACTGAAAATGCAAAAACAAATCAAACATTAGTTGAGAATTCAATGAACACACAATTATCAAACt > 2:4617326‑M2/6‑140 (MQ=255) taattTAGTATTGATTTTTAATTAATACGTGGTATAATTAAATTAACAGATCACAAGGAGGACGTAACTTATGAAAACTGAAAATGCAAAAACAAATCAAACATTAGTTGAGAATTCAATGAACACACAATTATCAAACt > 2:2069422‑M2/6‑140 (MQ=255) attTAGTATTGATTTTTAATTAATACGTGGTATAATTAAATTAACAGATCACAAGGAGGACGTAACTTATGAAAACTGAAAATGCAAAAACAAATCAAACATTAGTTGAGAATTCAATGAACACACAATTATCAAACTgg > 1:1853459‑M2/4‑140 (MQ=255) ttTAGTATTGATTTTTAATTAATACGTGGTATAATTAAATTAACAGATCACAAGGAGTACGTAACTTATGAAAACTGAAAATGCAAAAACAAATCAAACATTAGTTGAGAATTCAATGAACACACAATTATCAAACTGGt < 2:6768914‑M2/138‑1 (MQ=255) ttTAGTATTGATTTTTAATTAATACGTGGTATAATTAAATTAACAGATCACAAGGAGGACGTAACTTATGAAAACTGAAAATGCAAAAACAAATCAAACATTAGTTGAGAATTCAATGAACACACAATTATCAAACTGGt < 1:6216534‑M2/138‑1 (MQ=255) 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2:3336182/140‑1 (MQ=255) tAGTATTGATTTTTAATTAATACGTGGTATAATTAAATTAACAGATCACAAGGAGGACGTAACTTATGAAAACTGAAAATGCAAAAACAAATCAAACATTAGTTGAGAATTCAATGAACACACAATTATCAAACTGGTTc < 1:439748/140‑1 (MQ=255) tAGTATTGATTTTTAATTAATACATGGTATAATTAAATTAACAGATCACAAGGAGGACGTAACTTATGAAAACTGAAAATGCAAAAACAAATCAAACATTAGTTGAGAATTCAATGAACACACAATTATCAAACTGGTTc < 1:3097214/140‑1 (MQ=255) | AAGAAATTGCGATACCCGATCGGAAAAGGCATCAAGCTTACCTTGTTATTCCGATCGCTTTTTCCTTGGTCTGCGTGGGAATCTATCCTGAAGAAAAAACTATTCAGTTCATCTAAATTATAATTATTATAATTTAGTATTGATTTTTAATTAATACGTGGTATAATTAAATTAACAGATCACAAGGAGGACGTAACTTATGAAAACTGAAAATGCAAAAACAAATCAAACATTAGTTGAGAATTCAATGAACACACAATTATCAAACTGGTTC > NZ_CP034943/3191546‑3191819 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |