BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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MC JC	NZ_CP034943	3,191,671	(ATTATAATT)_2→1	100%	intergenic (+3/‑66)	EO946_RS16520 → / → mrgA	oxidoreductase/metalloregulation DNA‑binding stress protein MgrA

Missing coverage evidence...
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AAGAAATTGCGATACCCGATCGGAAAAGGCATCAAGCTTACCTTGTTATTCCGATCGCTTTTTCCTTGGTCTGCGTGGGAATCTATCCTGAAGAAAAAACTATTCAGTTCATCTAAATTATAATTATTATAATTTAGTATTGATTTTTAATTAATACGTGGTATAATTAAATTAACAGATCACAAGGAGGACGTAACTTATGAAAACTGAAAATGCAAAAACAAATCAAACATTAGTTGAGAATTCAATGAACACACAATTATCAAACTGGTTC  >  NZ_CP034943/3191546‑3191819

cagcacgtaaagaaattgcgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactatacagttcatctaaattataattTAGTAt                                                                                                                                        <  1:5993375‑M2/6‑1 (MQ=255)

   cacgtaaagaaattgcgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGa                                                                                                                                     >  1:1880313‑M2/132‑140 (MQ=255)

          agaaattgcgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGATTTttaa                                                                                                                              <  1:2881612‑M2/16‑1 (MQ=255)

               ttgcgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGATTTTtaattaat                                                                                                                         >  1:2108506‑M2/120‑140 (MQ=255)

                tgcgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaacactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGATTTTTAATTAATa                                                                                                                        >  2:4573453‑M2/119‑140 (MQ=255)

                tgcgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGATTTTTAATTAATa                                                                                                                        <  2:6297975‑M2/22‑1 (MQ=255)

                tgcgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGATTTTTAATTAATa                                                                                                                        >  2:6104703‑M2/119‑140 (MQ=255)

                tgcgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGATTTTTAATTAATa                                                                                                                        <  1:2726851‑M2/22‑1 (MQ=255)

                tgcgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGATTTTTAATTAATa                                                                                                                        <  2:5232907‑M2/22‑1 (MQ=255)

                  cgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGATTTTTAATTAATACg                                                                                                                      <  2:750585‑M2/24‑1 (MQ=255)

                  cgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGATTTTTAATTAATACg                                                                                                                      <  2:1581168‑M2/24‑1 (MQ=255)

                  cgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGATTTTTAATTAATACg                                                                                                                      <  1:3912387‑M2/24‑1 (MQ=255)

                  cgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGATTTTTAATTAATACg                                                                                                                      <  1:3777134‑M2/24‑1 (MQ=255)

                         cgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGATTTTTAATTAATACGTGGtata                                                                                                               <  1:3271116‑M2/31‑1 (MQ=255)

                            tcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGATTTTTAATTAATACGTGGTCTaatt                                                                                                            >  1:5390752‑M2/107‑140 (MQ=255)

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                                                              atcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGATTTTTAATTAATACGTGGTATAATTAAATTAACAGATCACAAGGAGGACGTAACTTATg                                                                          >  1:3191631‑M2/73‑140 (MQ=255)

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                                                                                                                  agttcatctaaattataattTAGTATTGATTTTTAATTAATACGTGGTATAATTAAATTAACAGATCACAAGGAGGACGTAACTTATGAAAACTGAAAATGCAAAAACAAATCAAACATTAGTTGAGAATTCAATGAaca                      <  2:2530273‑M2/120‑1 (MQ=255)

                                                                                                                  agttcatctaaattataattTAGTATTGATTTTTAATTAATACGTGGTATAATTAAATTAACAGATCACAAGGAGGACGTAACTTATGAAAACTGAAAATGCAAAAACAAATCAAACATTACTTGAGAATTCAATGAaca                      <  2:1831990‑M2/120‑1 (MQ=255)

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                                                                                                                        tctaaagtatactgTAGTCTTGATTTTTAATTAATACGTGGTATAATTAAATTAACAGATCACAAGGAGGACGTAACTTATGAAAACTGAAAATGCAAAAACAAATCAACCATTAGTTGAGAATTCAATGAACACACAAt                <  2:4191547‑M2/126‑1 (MQ=255)

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                                                                                                                              ttataattTAGTATTGATTTTTAATTAATACGTGGTATAATTAAATTAACAGATCACAAGGAGGACGTAACTTATGAAAACTGAAAATGCAAAAACAAATCAAACATTAGTTGAGAATTCAATGAACACACAATTATCaa          >  1:5147251‑M2/9‑140 (MQ=255)

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                                                                                                                                 taattTAGTATTGATTTTTAATTAATACGTGGTATAATTAAATTAACAGATCACAAGGAGGACGTAACTTATGAAAACTGAAAATGCAAAAACAAATCAAACATTAGTTGAGAATTCAATGAACACACAATTATCAAACt       >  2:4617326‑M2/6‑140 (MQ=255)

                                                                                                                                 taattTAGTATTGATTTTTAATTAATACGTGGTATAATTAAATTAACAGATCACAAGGAGGACGTAACTTATGAAAACTGAAAATGCAAAAACAAATCAAACATTAGTTGAGAATTCAATGAACACACAATTATCAAACt       >  2:2069422‑M2/6‑140 (MQ=255)

                                                                                                                                   attTAGTATTGATTTTTAATTAATACGTGGTATAATTAAATTAACAGATCACAAGGAGGACGTAACTTATGAAAACTGAAAATGCAAAAACAAATCAAACATTAGTTGAGAATTCAATGAACACACAATTATCAAACTgg     >  1:1853459‑M2/4‑140 (MQ=255)

                                                                                                                                    ttTAGTATTGATTTTTAATTAATACGTGGTATAATTAAATTAACAGATCACAAGGAGTACGTAACTTATGAAAACTGAAAATGCAAAAACAAATCAAACATTAGTTGAGAATTCAATGAACACACAATTATCAAACTGGt    <  2:6768914‑M2/138‑1 (MQ=255)

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                                                                                                                                      tAGTATTGATTTTTAATTAATACGTGGTATAATTAAATTAACAGATCACAAGGAGGACGTAACTTATGAAAACTGAAAATGCAAAAACAAATCAAACATTAGTTGAGAATTCAATGAACACACAATTATCAAACTGGTTc  <  1:439748/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                                                      tAGTATTGATTTTTAATTAATACATGGTATAATTAAATTAACAGATCACAAGGAGGACGTAACTTATGAAAACTGAAAATGCAAAAACAAATCAAACATTAGTTGAGAATTCAATGAACACACAATTATCAAACTGGTTc  <  1:3097214/140‑1 (MQ=255)

AAGAAATTGCGATACCCGATCGGAAAAGGCATCAAGCTTACCTTGTTATTCCGATCGCTTTTTCCTTGGTCTGCGTGGGAATCTATCCTGAAGAAAAAACTATTCAGTTCATCTAAATTATAATTATTATAATTTAGTATTGATTTTTAATTAATACGTGGTATAATTAAATTAACAGATCACAAGGAGGACGTAACTTATGAAAACTGAAAATGCAAAAACAAATCAAACATTAGTTGAGAATTCAATGAACACACAATTATCAAACTGGTTC  >  NZ_CP034943/3191546‑3191819

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 11 ≤` `ATCG/ATCG` `< 25 ≤` `ATCG/ATCG` `< 37 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`