| Predicted mutation | |||||||
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| MC JC | NZ_CP034943 | 3,191,671 | (ATTATAATT)2→1 | 100% | intergenic (+3/‑66) | EO946_RS16520 → / → mrgA | oxidoreductase/metalloregulation DNA‑binding stress protein MgrA |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| * | * | ÷ | NZ_CP034943 | 3191671 | 3191679 | 9 | 253 [0] | [0] 258 | EO946_RS16520/mrgA | oxidoreductase/metalloregulation DNA‑binding stress protein MgrA |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NZ_CP034943 | = 3191670 | 0 (0.000) | 216 (0.500) | 67/234 | NT | 100% | intergenic (+2/‑75) | EO946_RS16520/mrgA | oxidoreductase/metalloregulation DNA‑binding stress protein MgrA |
| ? | NZ_CP034943 | 3191680 = | 0 (0.000) | intergenic (+12/‑65) | EO946_RS16520/mrgA | oxidoreductase/metalloregulation DNA‑binding stress protein MgrA | |||||
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
ACAAAACAGCACGTAAAGAAATTGCGATACCCGATCGGAAAAGGCATCAAGCTTACCTTGTTATTCCGATCGCTTTTTCCTTGGTCTGCGTGGGAATCTATCCTGAAGAAAAAACTATTCAGTTCATCTAAATTATAATTATTATAATTTAGTATTGATTTTTAATTAATACGTGGTATAATTAAATTAACAGATCACAAGGAGGACGTAACTTATGAAAACTGAAAATGCAAAAACAAATCAAACATTAGTTGAGAATTCAATGAACACACAATTAT > NZ_CP034943/3191531‑3191808 | acaaAACAGCACGTAAAGAAATTGCGATACCCGATCGGAAAAGGCATCAAGCTTACCTTGTTATTCCGATCGCTTTTTCCTTGGTCTGCGTGGGAATCTATCCTGAAGAAAAAACTATTCAGTTCATCTAAATTATAATT < 1:4981010‑M1/140‑1 (MQ=255) aGCACGTAAAGAAATTGCGATACCCGATCGGAAAAGGCATCAAGCTTACCTTGTTATTCCGATCGCTTTTTCCTTGGTCTGCGTGGGAATCTATCCTGAAGAAAAAACTATTCAGTTCATCTAAATTATAATTtagtatt < 1:603923‑M1/140‑8 (MQ=255) cACGTAAAGAAATTGCGATACCCGATCGGAAAAGGCATCAAGCTTACCTTGTTATTCCGATCGCTTTTTCCTTGGTCTGCGTGGGAATCTATCCTGAAGAAAAAACTATTCAGTTCATCTAAATTATAATTtagtattga > 2:3014178‑M1/1‑131 (MQ=255) cACGTAAAGAAATTGCGATACCCGATCGGAAAAGGCATCAAGCTTACCTTGTTATTCCGATCGCTTTTTCCTTGGTCTGCGTGGGAATCTATCCTGAAGAAAAAACTATTCAGTTCATCTAAATTATAATTtagtattga > 1:1880313‑M1/1‑131 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |