Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | CP009974 | 1,901,507 | Δ2,603 bp | [RPPX_08485]–RPPX_08495 | [RPPX_08485], RPPX_08490, RPPX_08495 |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | CP009974 | 1901507–1904102 | 1904109 | 8–2603 | 277 [0] | [0] 273 | [RPPX_08485]–RPPX_08495 | [RPPX_08485],RPPX_08490,RPPX_08495 |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009974 | = 1901506 | 0 (0.000) | 265 (1.060) | 158/286 | 0.2 | 100% | coding (409/426 nt) | RPPX_08485 | hypothetical protein |
? | CP009974 | 1904110 = | 0 (0.000) | intergenic (+113/‑1737) | RPPX_08495/RPPX_08505 | ATPase AAA/hemolysin secretion protein D |
Only 100 of 288 total aligned reads displayed.
CCGGCCATGCTGCTGCTCAAGGAGGGCCGCAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009974/1901350‑1901506 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttcttcgCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAACCTGATCGCCTTGGCCGCGC > CP009974/1904110‑1904259 CCGGCCATGCTGCTGCTCAAGGAGGGCCGCAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGT > 1:3825316/1‑151 CCGGCCATGCTGCTGCTCAAGGAGGGCCGCAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGT < 1:89223/151‑1 CCGGCCATGCTGCTGCTCAAGGAGGGCCGCAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGT < 2:2362854/151‑1 ATGCTGCTGCTCAAGGAGGGCCGCAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCG > 1:15234/1‑151 ATGCTGCTGCTCAAGGAGGGCCGCAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCG > 2:5061860/1‑151 TGCTGCTGCTCAAGGAGGGCCGCAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGC < 1:2858593/151‑1 TGCTGCTGCTCAAGGAGGGCCGCAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGC < 2:1671893/151‑1 GCTGCTGCTCAAGGAGGGCCGCAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCG > 1:5237874/1‑151 GCTCAAGGAGGGCCGCAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCG > 2:1252863/1‑151 CTCAAGGAGGGCCGCAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGC > 1:5018665/1‑151 AAGGAGGGCCGCAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGC > 2:4237076/1‑151 AAGGAGGGCCGCAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACCCAGCGAGCGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCCAAGCGACTACAGCCGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGC > 2:2304307/1‑151 GCCGCAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTT > 2:2075506/1‑151 GCCGCAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTT < 2:2969163/151‑1 GCCGCAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTT < 1:4208821/151‑1 CGCAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCG < 1:714101/151‑1 GCAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGA > 2:2683887/1‑151 CAGCGCCGTACTGCTCGGCGGGGAGAACGGTCACACGACGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGACGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGAT < 2:4091221/151‑1 AGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATG < 1:2261236/151‑1 GCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGT < 2:1300809/151‑1 CGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTC < 1:5092540/151‑1 GCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTAGATGTCA > 2:3217918/1‑151 TCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCA < 1:2593898/151‑1 CCTGCTCGGCTGGGAGAGCGATGACGCCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCAT < 2:3541171/151‑1 CCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCAT < 1:3656895/151‑1 CTGGTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATG < 2:793185/151‑1 GCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGC < 1:1059201/151‑1 CTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCA < 1:1898052/151‑1 TCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAA < 1:3062741/151‑1 CGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAAC < 2:3425196/151‑1 GGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACC < 1:3377135/151‑1 GCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCT > 2:1154341/1‑151 GCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCT < 1:39122/151‑1 GGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATC < 1:1212985/151‑1 AGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCC < 2:1356779/151‑1 GAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCA < 2:427353/151‑1 AACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCAC < 2:4402841/151‑1 ACGATGACACCGCGCGGCTGCTACTCAGCGAGGGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCGGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTGGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACG < 2:5230584/151‑1 TGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCGCATCCCACGAGCG > 2:4753150/1‑151 CACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAG < 1:3235123/151‑1 CCGAGCGCCAGCTACTCAGCGAGAGCGATGCTGGCGCGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCTGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATGCCACGAGCGAAGTC < 2:3956357/151‑1 CGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCG > 2:2222733/1‑151 CGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCTACGAGCGAAGTCGTG > 2:1558954/1‑151 CGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTG < 1:3567208/151‑1 CGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTG > 2:3911933/1‑151 CGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCCAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCACCCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTG > 2:2771981/1‑151 GCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGG < 1:4914294/151‑1 CGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGT > 2:2854267/1‑151 CGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCACCCCACGAGCGAAGTCGTGGT > 2:4014575/1‑151 GCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTT < 1:831586/151‑1 CTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCG > 1:2995403/1‑151 ACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGAC < 1:5160351/151‑1 CTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACA < 1:407293/151‑1 TCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACAC < 1:1272375/151‑1 CAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCCGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGCGCGAAGTCGTGGTTCCGCCACACC > 2:1995238/1‑151 CAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACC > 2:1607018/1‑151 CAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCCATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACC < 2:4909011/151‑1 GCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCT < 2:4141869/151‑1 CGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTG < 2:743406/151‑1 gGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACGGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGC < 2:3813971/150‑1 CGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGC > 1:1891307/1‑151 GACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCA < 1:1665881/151‑1 ACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAG > 2:5043853/1‑151 ACGGCGGCGCGGTGCCTCTCAGCCGCGCACCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACCAGTACGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAG < 2:92344/151‑1 GGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCc > 2:2669431/1‑150 GCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTG < 1:2141432/151‑1 GCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTG < 1:2613487/151‑1 GAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGT > 1:3679232/1‑151 AGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTT > 1:2025281/1‑151 AGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTT < 2:4627916/151‑1 GTGCGTGTCAGCCGCGAGCCGCTTGTAGGCGACTACAGCGGCCGCGTGGTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGTGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGT < 2:4039629/151‑1 GTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGT < 1:3354145/151‑1 CATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATA > 1:731647/1‑151 TCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGA < 2:558211/151‑1 GCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGC > 1:3396164/1‑151 GCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCG < 1:1102553/151‑1 GCACGGCTAAGCGACTACAGCGTCCGCGTGTGCTTCTCGCAGCCGCAGGACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGCGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAATTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCG < 2:3758831/151‑1 CACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGC < 1:3168885/151‑1 TAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCGGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCat < 2:3269186/151‑3 TAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCT > 1:2387339/1‑151 AAGCGACTAGAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTG < 2:1120544/151‑1 AAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTG < 1:4769195/151‑1 AAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTG < 1:4652238/151‑1 TACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCA > 2:2802056/1‑151 CAGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAAC < 2:1030013/151‑1 AGCGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAACC < 1:624179/151‑1 CGGCCGCGTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAACCTG < 1:2055796/151‑1 CGCGTGATCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAACCTGATCG < 2:667976/151‑1 GTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAACCTGATCGCCT > 1:1792097/1‑151 GTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAACCTGATCGCCT > 1:4817209/1‑151 GTGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAACCTGATCGCCT > 1:4480553/1‑151 TGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAACCTGATCGCCTT < 2:3695635/151‑1 TGTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAACCTGATCGCCTT > 1:2770115/1‑151 GTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAACCTGATCGCCTTG > 1:2332750/1‑151 GTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAACCTGATCGCCTTG < 2:1044316/151‑1 GTTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGCTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAACCTGATCGCCTTG < 2:3121782/151‑1 TCTTCGCGTAGCCGTAGCAGAAGTGCGATGTCCCCCGTGGCAACCTCATCCCCCGCGCGAAGTCGTGGTGCCGCGTGACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGGATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAACCTGATCGCCTTGGC < 2:5155340/151‑1 CTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAACCTGATCGCCTTGGCC > 1:282925/1‑151 CTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAACCTGATCGCCTTGGCC > 1:1364926/1‑151 TCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAACCTGATCGCCTTGGCCGC > 2:3843342/1‑151 CCGGCCATGCTGCTGCTCAAGGAGGGCCGCAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009974/1901350‑1901506 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttcttcgCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAACCTGATCGCCTTGGCCGCGC > CP009974/1904110‑1904259 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |