| Predicted mutation | ||||||
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| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 273 total aligned reads displayed.
GACGCAGAAATTGACGACGCCAGCCAACCCGGACTAACAATGCCACCCCTGCGTCGCTGCGCTCCGACTGCCTGTCCGAATGAGCGTGGAACAGGTGTCCGGATCAGCGTGGGCTGAGTGTCCGAATGGCGTGGAATCCGCATTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAACCTGATCGCCTTGGCCGCGCC > CP009974/1903961‑1904260 | gctgctgctcaaggagggccgcagcgccgtcctgctcggctgggagaacgatgacaccgcgcgcctgctactcagcgagagcgacggtggcgaggtgcatgtcagccgcgaagcactgctaagcgactacagcggccgcgtgttcttcgcg < 1:277733‑M2/2‑1 (MQ=255) tgctgctcgaggagggccgcagcgcggtcctgctcggctgggagaacgatgacaccgcgcgccggctactcagcgagagcgacggtggcgaggtgcatgtcagccgcgaagcactgctaagcgactacagcggccgcgtgtgcttcgcgca < 2:2897429‑M2/4‑1 (MQ=255) tgctgctcaaggagggccgcagcgccgtcctgctcggctgggagaacgatgacaccgcgcgcctgctactcagcgagagcgacggtggcgaggtgcatgtcagccgcgaagcactgctaagcgactacagcggccgcgtgttcttcgcgca < 1:248432‑M2/4‑1 (MQ=255) 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cgtcctcagcgactacagcggccgcgtgtgctgcgCCCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGGAGTCCTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCgccgcc < 2:4826137‑M2/116‑1 (MQ=255) tgctaagcgactacagcggccgcgtgttcttcgCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAg > 2:1412773‑M2/34‑151 (MQ=255) ctaagcgactacagcggccgcgtgttcttcgCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGcc < 1:5216330‑M2/120‑1 (MQ=255) taagcgactacagcggccgcgtgttcttcgCGCAGCGGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCagcat < 2:3269186‑M2/121‑3 (MQ=255) aagcgactagagcggccgcgtgttcttcgCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTg < 2:1120544‑M2/122‑1 (MQ=255) aagccactacagcggccgcgtgttcttcgCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTg < 1:4769113‑M2/122‑1 (MQ=255) agcgactacagcggccgcgtgttcttcgCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTgg > 2:2373060‑M2/29‑151 (MQ=255) agcgactacagcggccgcgtgttcttcgCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTgg > 2:4017932‑M2/29‑151 (MQ=255) cgactacagcggccgcgtgttcttcgCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTg < 1:3846752‑M2/125‑1 (MQ=255) gactacagcggccgcgtgttcttcgCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGa > 1:2999141‑M2/26‑151 (MQ=255) ctacagcggccgcgtgttcttcgCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATc < 1:4955479‑M2/128‑1 (MQ=255) tacagcggccgcgtgttcttcgCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCa > 2:2801802‑M2/23‑151 (MQ=255) cagcggccgcgtgttcttcgCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAAc < 2:1030013‑M2/131‑1 (MQ=255) agcggccgcgtgttcttcgCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAAcc > 1:2292313‑M2/20‑151 (MQ=255) gcggccgcgtgttcttcgCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAACCt > 2:5091331‑M2/19‑151 (MQ=255) cggccgcgtgttcttcgCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAACCTg < 1:4268202‑M2/134‑1 (MQ=255) gtgttcttcgCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAACCTGATCGCCt > 1:2059276‑M2/11‑151 (MQ=255) gtgttcttcgCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAACCTGATCGCCt < 1:749955‑M2/141‑1 (MQ=255) gttcttcgCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAACCTGATCGCCTTg < 2:1044043‑M2/143‑1 (MQ=255) cttcgCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAACCTGATCGCCTTGGcc > 1:282925‑M2/6‑151 (MQ=255) gCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAACCTGATCGCCTTGGCCgcgc > 2:3589426‑M2/2‑151 (MQ=255) cgcagccgcagcACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAACCTGATCGCCTTGgccgcgcc < 1:2336244/151‑1 (MQ=255) | GACGCAGAAATTGACGACGCCAGCCAACCCGGACTAACAATGCCACCCCTGCGTCGCTGCGCTCCGACTGCCTGTCCGAATGAGCGTGGAACAGGTGTCCGGATCAGCGTGGGCTGAGTGTCCGAATGGCGTGGAATCCGCATTCTTCGCGCAGCCGCAGCACAAGTTCGATGTCAACCATGGCAACCTCATCCCACGAGCGAAGTCGTGGTTCCGCGACACCCTGCTGCGCAGCAAGTGGTTGTATATCGACGCCATCGCCGCCAGCCTGGTGATCAACCTGATCGCCTTGGCCGCGCC > CP009974/1903961‑1904260 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |