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New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 277 total aligned reads displayed.
ATGCTGCTGCTCAAGGAGGGCCGCAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGTGCGGATTCCACGCTGACTCGGACACCCATTCCACGCGCATCCGGACAGTGATTCCACGCTGATCCGGACACTCATTCCACGAGCATCCGGACACCGACTCCACGGTCATCCGGACACTTTTCTGGCAGGCAGCCACGCAGGATTTATTC > CP009974/1901356‑1901656 | aTGCTGCTGCTCAAGGAGGGCCGCAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCG > 2:5061860‑M1/1‑151 (MQ=255) tgctgctgcTCAAGGAGGGCCGCAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGc < 1:2858593‑M1/151‑2 (MQ=255) tgctgctgcTCAAGGAGGGCCGCAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGc < 2:1671893‑M1/151‑2 (MQ=255) 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tAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcct < 2:1023484‑M1/151‑122 (MQ=255) tAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcct < 1:4929713‑M1/151‑122 (MQ=255) aaGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctg < 1:4769195‑M1/151‑123 (MQ=255) aaGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctg < 1:4652238‑M1/151‑123 (MQ=255) aGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctgg > 2:2373060‑M1/1‑28 (MQ=255) cGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtg > 1:1893514‑M1/1‑26 (MQ=255) gACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtga > 1:2320118‑M1/1‑25 (MQ=255) ccgcgGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaac < 1:2129694‑M1/149‑132 (MQ=255) aGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaacc < 1:624179‑M1/151‑133 (MQ=255) cGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaacctg < 1:4268202‑M1/151‑135 (MQ=255) gCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaacctgat > 1:2661606‑M1/1‑15 (MQ=255) cgcgTGATCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaacctgatcg < 2:667976‑M1/151‑139 (MQ=255) gcgTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaacctgatcgc > 1:5180157‑M1/1‑12 (MQ=255) gtgtTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaacctgatcgcct > 1:4480553‑M1/1‑10 (MQ=255) gtgtTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaacctgatcgcct > 1:4817209‑M1/1‑10 (MQ=255) tgtTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaacctgatcgcctt > 1:2770115‑M1/1‑9 (MQ=255) gtTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtgcttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaacctgatcgccttg < 2:3121782‑M1/151‑144 (MQ=255) cttcGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaacctgatcgccttggcc > 1:282925‑M1/1‑5 (MQ=255) cttcGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaacctgatcgccttggcc > 1:1364926‑M1/1‑5 (MQ=255) tcGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaacctgatcgccttggccgc > 2:3843342‑M1/1‑3 (MQ=255) gcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaacctgatcgccttggccgcgc < 1:1651345‑M1/151‑151 (MQ=255) gcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaacctgatcgccttggccgcgc > 2:3589426‑M1/1‑1 (MQ=255) | ATGCTGCTGCTCAAGGAGGGCCGCAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGTGCGGATTCCACGCTGACTCGGACACCCATTCCACGCGCATCCGGACAGTGATTCCACGCTGATCCGGACACTCATTCCACGAGCATCCGGACACCGACTCCACGGTCATCCGGACACTTTTCTGGCAGGCAGCCACGCAGGATTTATTC > CP009974/1901356‑1901656 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |